LU-домен
Домен белка
Домен белка
домен u-PAR/Ly-6
Кристаллографическая структура негликозилированного человеческого CD59 . [1]
Идентификаторы
СимволUPAR_LY6
ПфамПФ00021
ИнтерПроIPR001526
ПРОСИТPDOC00756
КАТ1эрг
СКОП21erg / SCOPe / SUPFAM
CDDcd00117
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры
ПДБ1cds :28-95 1cdr :28-95 1cdq :28-95 1erg :28-95 1ywh C:25-99 1vye A:23-80

Домен LU ( антиген Ly-6 / uPAR ) является эволюционно консервативным белковым доменом суперсемейства трехпалых белков . Этот домен обнаружен во внеклеточных доменах рецепторов клеточной поверхности и в GPI-заякоренных или секретируемых глобулярных белках , например, в семействе Ly-6, CD59 и Sgp-2. [2] [3]

Различные гликопротеины клеточной поверхности, связанные с GPI, состоят из одной или нескольких копий консервативного домена LU, состоящего примерно из 100 аминокислотных остатков. [4] [5] Среди этих белков большинство содержат только один домен LU, хотя известно небольшое количество исключений; хорошо изученный член семейства uPAR имеет три тандемных домена LU. [3]

Структура

Этот домен сворачивается в пять антипараллельных бета-слоев , структуру, общую для семейства трехпальцевых белков . Домен обычно содержит десять хорошо сохранившихся остатков цистеина , участвующих в пяти дисульфидных связях , хотя некоторые примеры, такие как два из трех доменов uPAR , имеют меньше. [3]

Примеры

Помимо uPAR, другие рецепторы с доменами LU включают членов суперсемейства рецепторов трансформирующего фактора роста бета (TGF-бета), таких как рецептор активина типа 2 ; [6] и рецептор костного морфогенетического белка, тип IA . [7] Другие белки домена LU представляют собой небольшие глобулярные белки, такие как антиген CD59 , LYNX1 , SLURP1 и SLURP2. [2] [8]

Подсемейства

Белки человека, содержащие этот домен

ARS; CD177 ; CD59 ; LY6D; LY6E ; LY6H; LYNX1 ; LYPD2; LYPD3 ; LYPD4; LYPD5; LYPD6; PLAUR ; PSCA ; SLURP2; SLURP1 ; SPACA4; TEX101;

Функции

Многие белки, содержащие домен LU, участвуют в холинергической сигнализации и связывают ацетилхолиновые рецепторы, в частности, связывая их функцию с общим механизмом токсичности 3FTx. [2] [3] [9] Считается, что члены семейства Ly6/uPAR являются эволюционными предками трехпальцевого токсина (3FTx). [10] Другие белки LU, такие как антиген CD59 , имеют хорошо изученные функции в регуляции иммунной системы . [9]

Ссылки

  1. ^ PDB : 2J8B ​; Leath KJ, Johnson S, Roversi P, Hughes TR, Smith RA, Mackenzie L, Morgan BP, Lea SM (август 2007 г.). «Высокоразрешающие структуры бактериально экспрессируемого растворимого человеческого CD59». Acta Crystallographica. Раздел F, Structural Biology and Crystallization Communications . 63 (Pt 8): 648– 52. doi :10.1107/S1744309107033477. PMC  2335151 . PMID  17671359.
  2. ^ abc Kessler P, Marchot P, Silva M, Servent D (август 2017). «Трехпальцевая токсиновая складка: многофункциональный структурный каркас, способный модулировать холинергические функции». Journal of Neurochemistry . 142 (Suppl 2): ​​7– 18. doi : 10.1111/jnc.13975 . PMID  28326549.
  3. ^ abcd Loughner CL, Bruford EA, McAndrews MS, Delp EE, Swamynathan S, Swamynathan SK (апрель 2016 г.). «Организация, эволюция и функции генов семейства Ly6/uPAR у человека и мыши». Human Genomics . 10 : 10. doi : 10.1186/s40246-016-0074-2 . PMC 4839075 . PMID  27098205. 
  4. ^ Берендт Н., Плауг М., Патти Л., Хоуэн Г., Блази Ф., Дано К. (апрель 1991 г.). «Лиганд-связывающий домен рецептора клеточной поверхности для активатора плазминогена урокиназного типа». Журнал биологической химии . 266 (12): 7842– 7. doi : 10.1016/S0021-9258(20)89526-X . PMID  1850423.
  5. ^ Ploug M, Kjalke M, Rønne E, Weidle U, Høyer-Hansen G, Danø K (август 1993 г.). «Локализация дисульфидных связей в NH2-терминальном домене клеточного рецептора для активатора плазминогена типа урокиназы человека. Структура домена, принадлежащая новому суперсемейству мембранных белков, закрепленных на гликолипидах». Журнал биологической химии . 268 (23): 17539– 46. doi : 10.1016/S0021-9258(19)85366-8 . PMID  8394346.
  6. ^ Greenwald J, Fischer WH, Vale WW, Choe S (январь 1999). "Трехпальцевая токсиновая складка для внеклеточного лигандсвязывающего домена активинового рецептора сериновой киназы типа II". Nature Structural Biology . 6 (1): 18– 22. doi :10.1038/4887. PMID  9886286. S2CID  26301441.
  7. ^ Kirsch T, Sebald W, Dreyer MK (июнь 2000 г.). «Кристаллическая структура комплекса эктодомена BMP-2-BRIA». Nature Structural Biology . 7 (6): 492– 6. doi :10.1038/75903. PMID  10881198. S2CID  19403233.
  8. ^ Галат А (ноябрь 2008 г.). «Трехпалый белковый домен генома человека». Клеточные и молекулярные науки о жизни . 65 (21): 3481– 93. doi :10.1007/s00018-008-8473-8. PMC 11131612. PMID 18821057.  S2CID 19931506  . 
  9. ^ ab Цетлин VI (февраль 2015). «Трехпалые змеиные нейротоксины и белки Ly6, воздействующие на никотиновые ацетилхолиновые рецепторы: фармакологические инструменты и эндогенные модуляторы». Тенденции в фармакологических науках . 36 (2): 109– 23. doi :10.1016/j.tips.2014.11.003. PMID  25528970.
  10. ^ Fry BG (март 2005 г.). «От генома к «яду»: молекулярное происхождение и эволюция протеома змеиного яда, выведенные из филогенетического анализа последовательностей токсинов и связанных с ними белков тела». Genome Research . 15 (3): 403– 20. doi :10.1101/gr.3228405. PMC 551567 . PMID  15741511. 
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR001526
Получено с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=LU_domain&oldid=1227034509"