2 фунта стерлингов
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
2 фунта стерлингов
Идентификаторы
ПсевдонимыGBP2 , гуанилатсвязывающий белок 2
Внешние идентификаторыОМИМ : 600412; МГИ : 102772; гомологен : 10289; GeneCards : 2 фунта стерлингов; OMA :GBP2 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

2634

14469

Ансамбль

ENSG00000162645

ENSMUSG00000028270

UniProt

Р32456

Q9Z0E6

РефСек (мРНК)

NM_004120

NM_010260

RefSeq (белок)

NP_004111

NP_034390

Местоположение (UCSC)Хр 1: 89.11 – 89.15 МбХр 3: 142.33 – 142.34 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Интерферон-индуцированный гуанилатсвязывающий белок 2 — это белок , который у людей кодируется геном GBP2 . [5] [6] GBP2 — это ген, относящийся к суперсемейству больших ГТФаз, которые могут индуцироваться в основном гамма-интерфероном. [7]

 Локализация

Ген GBP2 локализуется в различных отделах клетки: ядре , цитозоле и цитоскелете , а также димер GBP2-GBP5 локализуется в аппарате Гольджи . [8]

Кроме того, изопренилирование необходимо для регуляции внутриклеточной локализации и мембранной ассоциации GBP2. [9]

 Активация

Ген GBP2 у мышей не только сильно активируется интерфероном-гамма во время активации макрофагов , но и стимуляцией Toll-подобных рецепторов , фактора некроза опухоли (ФНО) и интерлейкина 1 бета . [10]

Выражение

После стимуляции интерфероном гамма, мышиный GPB2 экспрессируется в клетках врожденного и адаптивного иммунитета . [11]

Структура

Анализ последовательности GBP2 показал наличие домена связывания РНК , который включает три мотива распознавания РНК (RRM) и домен SR. Аминоконец GBp2 разделяет четыре повторяющихся мотива Arg-Gly-Gly (RGG) и девять остатков серина в контексте мотивов аргинина/серина. [12]

Домен SR GBP2 является местом фосфорилирования для специфической для SR протеинкиназы SRPK (sky1), которая приводит к ядерной локализации GBP2. [12]

Свиной GBP2 имеет высокое сходство относительно N-конца, который представляет собой глобулярный домен и содержит функцию ГТФазы . Однако C-конец представляет собой спиральный домен, который менее консервативен. [13]

Взаимодействие

Ген GBP2 может взаимодействовать с РНК через домены RRM1 и RRM2. Домен RRM2 может распознавать основной мотив GGUC, присутствующий в РНК. Кроме того, идентифицирован новый тип домена RRM, который может взаимодействовать с комплексом THO/TREX. [14]

Ген GBp2 может взаимодействовать с комплексом TREX (транскрипция-экспорт); мультимерный комплекс имеет другой фактор транскрипции и экспортирует факторы, такие как Yra1 и Sub2. [14]

Функция

Интерфероны — это цитокины , которые обладают противовирусным действием и подавляют пролиферацию опухолевых клеток . Они индуцируют большое количество генов в своих целевых клетках, включая те, которые кодируют гуанилатсвязывающие белки (GBP). GBP характеризуются способностью специфически связывать гуаниновые нуклеотиды ( GMP , GDP и GTP ). Белок, кодируемый этим геном, представляет собой GTPase , которая преобразует GTP в GDP и GMP. [6] Кроме того, ген GBP2 может быть связью между рецептором клеточной поверхности и внутриклеточными эффекторами, которые могут передавать внеклеточную информацию в клетки, а также внутриклеточным белком передачи сигнала . [15]

Исследование гена GBP2 крупного рогатого скота показало важность GBP2 в регуляции пролиферации клеток и устойчивости к патогенной инфекции, такой как демонстрация противовирусной активности против вируса гриппа. [11]

GPB2 Способствует окислительному уничтожению и доставляет антимикробные пептиды в аутофаголизосому l, обеспечивая широкую защиту хозяина от различных классов патогенов . Во время вирусной инфекции семейство GBP (GBP1, GBP2 и GBP5) играет жизненно важную роль в активации канонических и неканонических инфламмасом для ответа на патогенную инфекцию через chlamydia muridarum . [16]

Клиническое значение

Генная мутация

У пациентов с мигренью была выявлена ​​миссенс-мутация гена GBP2 (A907G). На первом этапе может привести к вазомоторной дисфункции, а затем к головным болям. [15]

Рак молочной железы

GBP2 считается фактором контроля пролиферации и распространения в опухолевой клетке. Высокая экспрессия GBP2 связана с лучшей диагностикой рака груди. P53 может повышать регуляцию GBP2 и играть важную роль в развитии опухоли путем ингибирования металлопротеиназы MM9, а также NF-Kappa B и белка Rac. [17]

Уровень транскрипции GBP2 также регулируется двумя факторами транскрипции STAT1 и IRF1 . Экспрессия GBP2 имеет сильную корреляцию с метагеном Т-клеток, что, по-видимому, связано с инфильтрацией Т-клеток в рак молочной железы . [17]

Однако недавнее исследование показало, что GBP2 может регулировать белок 1, связанный с динамином (Drp1), блокируя транслокацию Drp1 в митохондрии , что приводит к ослаблению зависимого от Drp1 деления митохондрий , а также к инвазии клеток рака молочной железы. [18]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000162645 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028270 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Cheng YS, Patterson CE, Staeheli P (сентябрь 1991 г.). «Индуцированные интерфероном белки, связывающие гуанилат, не имеют консенсусного мотива N(T)KXD и ​​связывают GMP в дополнение к GDP и GTP». Molecular and Cellular Biology . 11 (9): 4717– 25. doi :10.1128/mcb.11.9.4717. PMC 361367 . PMID  1715024. 
  6. ^ ab "Ген Entrez: GBP2 гуанилатсвязывающий белок 2, индуцируемый интерфероном".
  7. ^ Kim BH, Shenoy AR, Kumar P, Bradfield CJ, MacMicking JD (октябрь 2012 г.). «IFN-индуцируемые GTPases в защите клеток-хозяев». Cell Host & Microbe . 12 (4): 432– 44. doi :10.1016/j.chom.2012.09.007. PMC 349020 . PMID  23084913. 
  8. ^ "Ген GBP2". База данных генов человека GeneCards . Получено 07.11.2018 .
  9. ^ Britzen-Laurent N, Bauer M, Berton V, Fischer N, Syguda A, Reipschläger S, Naschberger E, Herrmann C, Stürzl M (декабрь 2010 г.). «Внутриклеточный транспорт гуанилатсвязывающих белков регулируется гетеродимеризацией иерархическим образом». PLOS ONE . ​​5 (12): e14246. Bibcode :2010PLoSO...514246B. doi : 10.1371/journal.pone.0014246 . PMC 2998424 . PMID  21151871. 
  10. ^ Degrandi D, Kravets E, Konermann C, Beuter-Gunia C, Klümpers V, Lahme S, Wischmann E, Mausberg AK, Beer-Hammer S, Pfeffer K (январь 2013 г.). «Мышиный гуанилатсвязывающий белок 2 (mGBP2) контролирует репликацию Toxoplasma gondii». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (1): 294– 9. Bibcode : 2013PNAS..110..294D . doi : 10.1073/pnas.1205635110 . PMC 3538222. PMID  23248289. 
  11. ^ ab Praefcke GJ (ноябрь 2017 г.). «Регуляция врожденных иммунных функций гуанилатсвязывающими белками». Международный журнал медицинской микробиологии . 308 (1): 237–245 . doi : 10.1016/j.ijmm.2017.10.013 . PMID  29174633.
  12. ^ ab Windgassen M, Krebber H (март 2003 г.). «Идентификация Gbp2 как нового поли(A)+ РНК-связывающего белка, участвующего в цитоплазматической доставке матричных РНК в дрожжах». EMBO Reports . 4 (3): 278– 83. doi :10.1038/sj.embor.embor763. PMC 1315891. PMID  12634846 . 
  13. ^ Ma G, Huang J, Sun N, Liu X, Zhu M, Wu Z, Zhao S (май 2008). «Молекулярная характеристика генов GBP1 и GBP2 свиньи». Молекулярная иммунология . 45 (10): 2797– 807. doi :10.1016/j.molimm.2008.02.007. PMID  18346789.
  14. ^ ab Martínez-Lumbreras S, Taverniti V, Zorrilla S, Séraphin B, Pérez-Cañadillas JM (январь 2016 г.). "Gbp2 взаимодействует с THO/TREX через новый тип домена RRM". Nucleic Acids Research . 44 (1): 437– 48. doi :10.1093/nar/gkv1303. PMC 4705658 . PMID  26602689. 
  15. ^ ab Jiang, Yue (январь 2016 г.). «Шесть новых редких несинонимичных мутаций при мигрени без ауры, выявленных с помощью экзомного секвенирования». Журнал нейрогенетики . 29 (4): 188– 194. doi : 10.3109/01677063.2015.1122787. PMID  26814133. S2CID  207441191.
  16. ^ Man SM, Place DE, Kuriakose T, Kanneganti TD (январь 2017 г.). «Индуцируемые интерфероном белки связывания гуанилата на границе клеточно-автономного иммунитета и активации инфламмасомы». Журнал биологии лейкоцитов . 101 (1): 143–150 . doi :10.1189/jlb.4MR0516-223R. PMC 6608036. PMID  27418355. 
  17. ^ ab Godoy P, Cadenas C, Hellwig B, Marchan R, Stewart J, Reif R, Lohr M, Gehrmann M, Rahnenführer J, Schmidt M, Hengstler JG (июль 2014 г.). «Индуцируемый интерфероном белок связывания гуанилата (GBP2) связан с лучшим прогнозом при раке молочной железы и указывает на эффективный ответ Т-клеток». Breast Cancer . 21 (4): 491– 9. doi :10.1007/s12282-012-0404-8. PMID  23001506. S2CID  8338232.
  18. ^ Zhang J, Zhang Y, Wu W, Wang F, Liu X, Shui G, Nie C (октябрь 2017 г.). «Гуанилатсвязывающий белок 2 регулирует деление митохондрий, опосредованное Drp1, для подавления инвазии клеток рака молочной железы». Cell Death & Disease . 8 (10): e3151. doi :10.1038/cddis.2017.559. PMC 5680924 . PMID  29072687. 

Дальнейшее чтение

  • Маруяма К, Сугано С (январь 1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Neun R, Richter MF, Staeheli P, Schwemmle M (июль 1996 г.). "Свойства ГТФазы интерферон-индуцированного человеческого гуанилатсвязывающего белка 2". FEBS Letters . 390 (1): 69– 72. doi :10.1016/0014-5793(96)00628-X. PMID  8706832. S2CID  30513363.
  • Nitsche EM, Moquin A, Adams PS, Guenette RS, Lakins JN, Sinnecker GH, Kruse K, Tenniswood MP (май 1996). "Дифференциальная RT-ПЦР-анализ общей РНК из фибробластов крайней плоти человека для исследования андроген-зависимой экспрессии генов". American Journal of Medical Genetics . 63 (1): 231– 8. doi :10.1002/(SICI)1096-8628(19960503)63:1<231::AID-AJMG40>3.0.CO;2-M. PMID  8723115.
  • Vestal DJ, Gorbacheva VY, Sen GC (ноябрь 2000 г.). «Различные субклеточные локализации для родственных интерферон-индуцированных GTPases, MuGBP-1 и MuGBP-2: последствия для различных функций?». Journal of Interferon & Cytokine Research . 20 (11): 991– 1000. doi :10.1089/10799900050198435. PMID  11096456.
  • Lukasiewicz R, Velazquez-Dones A, Huynh N, Hagopian J, Fu XD, Adams J, Ghosh G (август 2007 г.). «Структурно уникальные дрожжевые и млекопитающие серин-аргининовые протеинкиназы катализируют эволюционно консервативные реакции фосфорилирования». Журнал биологической химии . 282 (32): 23036– 43. doi : 10.1074/jbc.M611305200 . PMID  17517895.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=GBP2&oldid=1223641144"