ДРАП1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ДРАП1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыDRAP1 , NC2-альфа, ассоциированный с DR1 белок 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 602289; МГИ : 1913806; гомологен : 4703; GeneCards : DRAP1; OMA :DRAP1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_006442

NM_001291080
NM_024176

RefSeq (белок)

NP_006433

NP_001278009
NP_077138

Местоположение (UCSC)Хр 11: 65.92 – 65.92 МбХр 19: 5.47 – 5.48 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Корепрессор, ассоциированный с Dr1, — это белок , который у людей кодируется геном DRAP1 . [ 5] [6]

Транскрипционная репрессия является общим механизмом регулирования инициации транскрипции в организмах от дрожжей до человека. Точная инициация транскрипции с генов, кодирующих эукариотические белки, требует сборки большого мультипротеинового комплекса, состоящего из РНК-полимеразы II и общих факторов транскрипции, таких как TFIIA, TFIIB и TFIID. DR1 является репрессором, который взаимодействует с белком связывания TATA (TBP) TFIID и предотвращает образование активного транскрипционного комплекса, исключая проникновение TFIIA и/или TFIIB в преинициативный комплекс. Белок, кодируемый этим геном, является корепрессором транскрипции, который взаимодействует с DR1 для усиления репрессии, опосредованной DR1. Взаимодействие между этим корепрессором и DR1 необходимо для функции корепрессора и, по-видимому, стабилизирует комплекс TBP-DR1-ДНК. [6]

Взаимодействия

Было показано, что DRAP1 взаимодействует с FOXH1 [7] и DR1 . [8] [9]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000175550 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000024914 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Mermelstein F, Yeung K, Cao J, Inostroza JA, Erdjument-Bromage H, Eagelson K и др. (апрель 1996 г.). «Необходимость корепрессора для репрессии транскрипции, опосредованной Dr1». Genes & Development . 10 (8): 1033–48. doi : 10.1101/gad.10.8.1033 . PMID  8608938.
  6. ^ ab "Ген Entrez: DRAP1 DR1-ассоциированный белок 1 (отрицательный кофактор 2 альфа)".
  7. ^ Iratni R, Yan YT, Chen C, Ding J, Zhang Y, Price SM и др. (декабрь 2002 г.). «Ингибирование избыточной узловой сигнализации во время гаструляции у мышей транскрипционным корепрессором DRAP1». Science . 298 (5600): 1996–9. Bibcode :2002Sci...298.1996I. doi :10.1126/science.1073405. PMID  12471260. S2CID  22923124.
  8. ^ Mermelstein F, Yeung K, Cao J, Inostroza JA, Erdjument-Bromage H, Eagelson K и др. (апрель 1996 г.). «Необходимость корепрессора для репрессии транскрипции, опосредованной Dr1». Genes & Development . 10 (8): 1033–48. doi : 10.1101/gad.10.8.1033 . PMID  8608938.
  9. ^ Yeung K, Kim S, Reinberg D (январь 1997). «Функциональное препарирование комплекса репрессора Dr1-DRAP1 человека». Молекулярная и клеточная биология . 17 (1): 36–45. doi :10.1128/MCB.17.1.36. PMC 231727. PMID  8972183 . 

Дальнейшее чтение

  • Goppelt A, Stelzer G, Lottspeich F, Meisterernst M (июнь 1996 г.). "Механизм подавления транскрипции генов класса II посредством специфического связывания NC2 с комплексами TBP-промотор через гетеродимерные домены гистоновой складки". The EMBO Journal . 15 (12): 3105–16. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00673.x. PMC  450253 . PMID  8670811.
  • Yeung K, Kim S, Reinberg D (январь 1997 г.). «Функциональное препарирование комплекса репрессора Dr1-DRAP1 человека». Молекулярная и клеточная биология . 17 (1): 36–45. doi :10.1128/MCB.17.1.36. PMC  231727. PMID  8972183 .
  • Ikeda K, Halle JP, Stelzer G, Meisterernst M, Kawakami K (январь 1998 г.). "Участие отрицательного кофактора NC2 в активной репрессии транскрипционным фактором AREB6 с гомеодоменом цинкового пальца". Молекулярная и клеточная биология . 18 (1): 10–8. doi :10.1128/mcb.18.1.10. PMC 121442.  PMID 9418848  .
  • Castaño E, Gross P, Wang Z, Roeder RG, Oelgeschläger T (июнь 2000 г.). «Фосфорилированная форма IIO C-концевого домена РНК-полимеразы II связана с репрессором транскрипции NC2 (Dr1/DRAP1) и необходима для активации транскрипции в ядерных экстрактах человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (13): 7184–9. Bibcode : 2000PNAS...97.7184C. doi : 10.1073/pnas.140202297 . PMC  16520. PMID  10852970 .
  • Kamada K, Shu F, Chen H, Malik S, Stelzer G, Roeder RG и др. (Июль 2001 г.). «Кристаллическая структура отрицательного кофактора 2, распознающего транскрипционный комплекс TBP-ДНК». Cell . 106 (1): 71–81. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00417-2 . PMID  11461703. S2CID  11064090.
  • Iratni R, Yan YT, Chen C, Ding J, Zhang Y, Price SM и др. (декабрь 2002 г.). «Ингибирование избыточной узловой сигнализации во время гаструляции у мышей транскрипционным корепрессором DRAP1». Science . 298 (5600): 1996–9. Bibcode :2002Sci...298.1996I. doi :10.1126/science.1073405. PMID  12471260. S2CID  22923124.
  • Denko N, Wernke-Dollries K, Johnson AB, Hammond E, Chiang CM, Barton MC (февраль 2003 г.). «Гипоксия активно подавляет транскрипцию, индуцируя отрицательный кофактор 2 (Dr1/DrAP1) и блокируя сборку преинициативного комплекса». Журнал биологической химии . 278 (8): 5744–9. doi : 10.1074/jbc.M212534200 . PMID  12477712.
  • Leonard D, Ajuh P, Lamond AI, Legerski RJ (сентябрь 2003 г.). "hLodestar/HuF2 взаимодействует с CDC5L и участвует в сплайсинге пре-мРНК". Biochemical and Biophysical Research Communications . 308 (4): 793–801. CiteSeerX  10.1.1.539.8359 . doi :10.1016/S0006-291X(03)01486-4. PMID  12927788.
  • Klejman MP, Pereira LA, van Zeeburg HJ, Gilfillan S, Meisterernst M, Timmers HT (ноябрь 2004 г.). «NC2alpha взаимодействует с BTAF1 и стимулирует его АТФ-зависимую ассоциацию с белком, связывающим TATA». Молекулярная и клеточная биология . 24 (22): 10072–82. doi :10.1128/MCB.24.22.10072-10082.2004. PMC  525489. PMID  15509807 .
  • Lewis BA, Sims RJ, Lane WS, Reinberg D (май 2005 г.). «Функциональная характеристика основных элементов промотора: DPE-специфическая транскрипция требует протеинкиназы CK2 и коактиватора PC4». Molecular Cell . 18 (4): 471–81. doi : 10.1016/j.molcel.2005.04.005 . PMID  15893730.
  • Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H и др. (сентябрь 2005 г.). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Cell . 122 (6): 957–68. doi :10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID  16169070. S2CID  8235923.
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N и др. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белков человека». Nature . 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Assmann EM, Alborghetti MR, Camargo ME, Kobarg J (апрель 2006 г.). «Димеризация FEZ1 и взаимодействие с белками, регулирующими транскрипцию, вовлекают его спирально-спиральный регион». Журнал биологической химии . 281 (15): 9869–81. doi : 10.1074/jbc.M513280200 . PMID  16484223.
  • Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF и др. (май 2006 г.). «Сеть взаимодействия белок-белок при наследственных атаксиях и расстройствах дегенерации клеток Пуркинье у человека». Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID  16713569. S2CID  13709685.
  • Albert TK, Grote K, Boeing S, Stelzer G, Schepers A, Meisterernst M (июнь 2007 г.). «Глобальное распределение отрицательной субъединицы кофактора 2-альфа на человеческих промоторах». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (24): 10000–5. Bibcode : 2007PNAS..10410000A. doi : 10.1073/pnas.0703490104 . PMC  1891239. PMID  17548813 .


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=DRAP1&oldid=1142716622"