Домен фибронектина типа III
| Домен фибронектина типа III | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Десятый домен типа III фибронектина | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | фн3 | ||||||||
| Пфам | ПФ00041 | ||||||||
| Клан ПФАМ | CL0159 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR003961 | ||||||||
| УМНЫЙ | ФН3 | ||||||||
| ПРОСИТ | PDOC00214 | ||||||||
| СКОП2 | 1ttf / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd00063 | ||||||||
| Мембраном | 66 | ||||||||
| |||||||||
Домен фибронектина типа III — это эволюционно консервативный белковый домен , который широко распространен в животных белках. Белок фибронектина , в котором этот домен был впервые идентифицирован, содержит 16 копий этого домена. Длина домена составляет около 100 аминокислот , и он имеет структуру бета-сэндвича . Из трех доменов типа фибронектина, тип III — единственный, в котором отсутствуют дисульфидные связи . Домены фибронектина встречаются в самых разных внеклеточных белках. Они широко распространены у животных видов, но также спорадически встречаются в дрожжевых, растительных и бактериальных белках.
Белки человека, содержащие этот домен
АБИ3BP ; АНКФН1; АСТН2 ; АХL ; БОК ; БЗРАП1; С20орф75; КДОН ; КХЛ1 ; CMYA5; ЦНТФР ; CNTN1 ; CNTN2 ; CNTN3 ; CNTN4 ; CNTN5; CNTN6 ; КОЛ12А1 ; КОЛ14А1 ; КОЛ20А1 ; COL7A1 ; CRLF1 ; CRLF3 ; КСФ2РБ ; КСФ3Р ; ДКК ; ДСКАМ ; ДСКАМЛ1 ; ЭБИ3 ; ЭГФЛАМ ; ЭФА1 ; ЭФА10 ; ЭФА2 ; ЭФА3 ; ЭФА4 ; ЭФА5 ; ЭФА6 ; ЭФА7 ; ЭФА8 ; ЭПХБ1 ; ЭПХБ2 ; ЭПХБ3 ; ЭПХБ4 ; ЭПХБ6 ; ЭПОР ; ФАНК1; ФЛРТ1 ; ФЛРТ2 ; ФЛРТ3 ; ФН1 ; ФНДЦ1; ФНДЦ3А ; ФНДЦ3Б; ФНДЦ4; ФНДЦ5 ; ФНДЦ7; ФНДЦ8; ФСД1; ФСД1Л; ФСД2; ГГР ; ГХФУ1 ; ГХФУ2; ГЮГО; ИФНГР2 ; ИФР1Р ; ИГСФ22; IGSF9; ИГСФ9Б; ИЛ4Р ; ИЛ11РА ; ИЛ12Б ; ИЛ12РБ1 ; ИЛ12РБ2 ; ИЛ20РБ ; ИЛ23Р ; Ил27РА ; Ил31РА ; ИЛ6Р ; ИЛ6СТ ; ИЛ7Р ; ИНСР ; ИНСРР ; ITGB4 ; KAL1 ; KALRN ; L1CAM ; LEPR ; LIFR ; LRFN2; LRFN3; LRFN4 ; LRFN5; LRIT1; LRRN1 ; LRRN3 ; MERTK ; MID1 ; MID2; MPL ; MYBPC1 ; MYBPC2 ; MYBPC3 ; MYBPH; MYBPHL; MYLK ; MYOM1 ; MYOM2 ; MYOM3; NCAM1 ; NCAM2 ; NEO1 ; NFASC ; NOPE; NPHS1 ; NRCAM ; OBSCN ; OBSL1 ; OSMR ; PHYHIP ; PHYHIPL ; PRLR ; PRODH2; PTPRB ; PTPRC ; PTPRD ; PTPRF ; PTPRG ; PTPRH ; PTPRJ ; PTPRK ; PTPRM ; PTPRO ; PTPRS ; PTPRT ; PTPRU ; PTPRZ1 ; PTPsigma; PUNC; RIMBP2 ; ROBO1 ; ROBO2 ; ROBO3 ; РОБО4 ; РОС1 ; SDK1 ; SDK2 ; СНЕД1 ; СОРЛ1 ; СПЭГ ; ТЭК ; СВЯЗЬ1 ; ТНК ; ТНН ; ТНР ; ТНХБ ; ТРИМ36; ТРИМ42; ТРИМ46; ТРИМ67; ТРИМ9 ; ТТН ; ТИРО3 ; УМОДЛ1; УШ2А ; ВАСН; ВВА1; dJ34F7.1; ФМИ;
Смотрите также
- Монотела — это сконструированные (синтетические) миметики антител на основе домена фибронектина типа III (в частности, 10-го домена FN3 человеческого фибронектина). Монотела имеют либо диверсифицированные петли, либо диверсифицированные нити плоской поверхности бета-слоя, которые служат эпитопами взаимодействия. Связующие монотела были выбраны из широкого спектра целевых молекул и вышли за пределы потенциального диапазона интерфейсов связывания, наблюдаемых как в природных, так и в синтетических антителах.
Ссылки
- Базан Дж. Ф. (сентябрь 1990 г.). «Структурный дизайн и молекулярная эволюция суперсемейства рецепторов цитокинов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (18): 6934–8. Bibcode : 1990PNAS...87.6934B. doi : 10.1073/pnas.87.18.6934 . PMC 54656. PMID 2169613 .
- Little E, Bork P, Doolittle RF (декабрь 1994 г.). «Отслеживание распространения доменов фибронектина типа III в бактериальных гликогидролазах». Journal of Molecular Evolution . 39 (6): 631–43. Bibcode : 1994JMolE..39..631L. doi : 10.1007/bf00160409. PMID 7528812. S2CID 11909704.
- Kornblihtt AR, Umezawa K, Vibe-Pedersen K, Baralle FE (июль 1985 г.). «Первичная структура человеческого фибронектина: дифференциальный сплайсинг может генерировать не менее 10 полипептидов из одного гена». The EMBO Journal . 4 (7): 1755–9. doi :10.1002/j.1460-2075.1985.tb03847.x. PMC 554414 . PMID 2992939.
