ЭФБ3

ЭФБ3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3P1I, 3ZFY
Идентификаторы
Псевдонимы	EPHB3 , ETK2, HEK2, TYRO6, EPH-рецептор B3, EK2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 601839; МГИ : 104770; гомологен : 20938; GeneCards : EPHB3; OMA :EPHB3 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 3 (человек)
Конец	184,582,408 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 16 (мышь)
Конец	21,042,055 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	протоковая клетка поджелудочной железы; ; кожа ноги; ; кожа живота; ; эпителий десны; ; околоушная железа; ; слизистая оболочка поперечно-ободочной кишки; ; периодонтальное волокно; ; кожа руки; ; волосяной фолликул; ; прямая кишка;
	Верх выражен в
	мешочек; ; слуховая плакода; ; слуховой пузырек; ; губа; ; язык; ; строма роговицы; ; молярный; ; кожа живота; ; пищевод; ; кальвария;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание нуклеотидов; трансмембранный рецептор протеинтирозинкиназная активность; активность протеинкиназы; активность киназы; Связывание АТФ; трансферазная активность; активность рецептора эфрина; активность рецептора наведения аксонов; активность протеинтирозинкиназы; рецептор тирозинкиназы; трансмембранная сигнальная активность рецептора; трансмембранная активность рецептора эфрина;
Клеточный компонент	внеклеточная область; дендрит; неотъемлемый компонент мембраны; проекция клетки; мембрана; цитозоль; плазматическая мембрана; неотъемлемый компонент плазматической мембраны; цитоплазма; проекция нейрона; рецепторный комплекс;
Биологический процесс	фосфорилирование; пептидил-тирозиновое фосфорилирование; развитие нервной системы; развитие многоклеточного организма; регуляция межклеточной адгезии; фосфорилирование белков; Распространённость клеток, зависящая от адгезии субстрата; трансмембранный рецепторный протеинтирозинкиназный сигнальный путь; регуляция активности ГТФазы; аутофосфорилирование белков; ангиогенез; сигнальный путь рецептора эфрина; развитие мочеполовой системы; аксонное руководство; аксональная фасцикуляция; миграция клеток; центральная нервная система проекция нейрон аксоногенез; развитие мозолистого тела; руководство аксоном ганглиозных клеток сетчатки; развитие тимуса; морфогенез пищеварительного тракта; регуляция аксоногенеза; позитивная регуляция сборки синапсов; развитие нёба; развитие дендритных шипиков; морфогенез дендритных шипиков; негативная регуляция передачи сигнала; дифференциация клеток; негативная регуляция процесса апоптоза; позитивная регуляция каскада ERK1 и ERK2;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	2049
	13845
	ENSG00000182580
	ENSMUSG00000005958
	Р54753
	Р54754
	NM_004443
	NM_010143
	NP_004434
	NP_034273
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Рецептор эфрина типа B 3 — это белок , который у людей кодируется геном EPHB3 . ^[5]^[6]

Функция

Рецепторы эфрина и их лиганды, эфрины, опосредуют многочисленные процессы развития, особенно в нервной системе. На основе их структур и взаимосвязей последовательностей эфрины делятся на класс эфрин-A (EFNA), которые прикреплены к мембране гликозилфосфатидилинозитоловой связью, и класс эфрин-B (EFNB), которые являются трансмембранными белками. Семейство рецепторов Eph делится на 2 группы на основе сходства последовательностей их внеклеточных доменов и их сродства к связыванию лигандов эфрина-A и эфрина-B. Рецепторы эфрина составляют самую большую подгруппу семейства рецепторных тирозинкиназ (RTK). Белок, кодируемый этим геном, является рецептором для членов семейства эфрина-B. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что EPHB3 взаимодействует с MLLT4 ^[7] и активатором белка RAS p21 1 ^[8] .

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000182580 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000005958 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Бёме Б., Холтрих У., Вольф Г., Люциус Х., Гржешик К. Х., Стребхардт К., Рюбсамен-Вайгманн Х. (октябрь 1993 г.). «ПЦР-опосредованное обнаружение нового человеческого рецептора-тирозинкиназы, HEK 2». Онкоген . 8 (10): 2857– 62. PMID 8397371.
^ ab "Ген Энтреза: EPHB3 EPH рецептор B3".
^ Hock B, Böhme B, Karn T, Yamamoto T, Kaibuchi K, Holtrich U, Holland S, Pawson T, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (август 1998 г.). "PDZ-domain-mediated interaction of the Eph-related receptor tyrosine kinase EphB3 and the ras-binding protein AF6 depends on the kinase activity of the receptor". Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95 (17): 9779– 84. Bibcode :1998PNAS...95.9779H. doi : 10.1073/pnas.95.17.9779 . PMC 21413 . PMID 9707552.
^ Hock B, Böhme B, Karn T, Feller S, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (июль 1998 г.). «Тирозин-614, основной сайт автофосфорилирования рецепторной тирозинкиназы HEK2, функционирует как сайт множественной стыковки для взаимодействий, опосредованных доменом SH2». Онкоген . 17 (2): 255– 60. doi : 10.1038/sj.onc.1201907 . PMID 9674711.

Дальнейшее чтение

Flanagan JG, Vanderhaeghen P (1998). «Эфрины и рецепторы Eph в развитии нейронов» (PDF) . Annu. Rev. Neurosci . 21 : 309– 45. doi :10.1146/annurev.neuro.21.1.309. PMID 9530499. S2CID 1278600. Архивировано из оригинала (PDF) 21.02.2019.
Чжоу Р. (1998). «Рецепторы и лиганды семейства Eph». Pharmacol. Ther . 77 (3): 151– 81. doi :10.1016/S0163-7258(97)00112-5. PMID 9576626.
Холдер Н, Кляйн Р (1999). «Рецепторы ЭФ и эфрины: эффекторы морфогенеза». Развитие . 126 (10): 2033– 44. doi :10.1242/dev.126.10.2033. PMID 10207129.
Wilkinson DG (2000). "Eph рецепторы и эфрины: регуляторы руководства и сборки". Int. Rev. Cytol . Международный обзор цитологии. 196 : 177– 244. doi :10.1016/S0074-7696(00)96005-4. ISBN 9780123646002. PMID 10730216.
Xu Q, Mellitzer G, Wilkinson DG (2001). «Роли рецепторов Eph и эфринов в сегментном паттернировании». Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci . 355 (1399): 993– 1002. doi :10.1098/rstb.2000.0635. PMC 1692797 . PMID 11128993.
Wilkinson DG (2001). «Множественные роли рецепторов EPH и эфринов в развитии нервной системы». Nat. Rev. Neurosci . 2 (3): 155– 64. doi :10.1038/35058515. PMID 11256076. S2CID 205014301.
Böhme B, VandenBos T, Cerretti DP, Park LS, Holtrich U, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (1996). "Межклеточная адгезия, опосредованная связыванием лиганда LERK-2, закрепленного на мембране, с рецептором эмбриональной киназы человека EPH 2 стимулирует активность тирозинкиназы". J. Biol. Chem . 271 (40): 24747– 52. doi : 10.1074/jbc.271.40.24747 . PMID 8798744.
Ephnomenclaturecommittee (1997). "Унифицированная номенклатура рецепторов семейства Eph и их лигандов, эфринов. Eph Nomenclature Committee". Cell . 90 (3): 403– 4. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80500-0 . PMID 9267020. S2CID 26773768.
Bergemann AD, Zhang L, Chiang MK, Brambilla R, Klein R, Flanagan JG (1998). "Эфрин-B3, лиганд для рецептора EphB3, экспрессируемый на средней линии развивающейся нервной трубки". Oncogene . 16 (4): 471– 80. doi : 10.1038/sj.onc.1201557 . PMID 9484836.
Hock B, Böhme B, Karn T, Feller S, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (1998). "Тирозин-614, основной сайт автофосфорилирования рецепторной тирозинкиназы HEK2, функционирует как сайт множественной стыковки для взаимодействий, опосредованных доменом SH2". Oncogene . 17 (2): 255– 60. doi : 10.1038/sj.onc.1201907 . PMID 9674711.
Hock B, Böhme B, Karn T, Yamamoto T, Kaibuchi K, Holtrich U, Holland S, Pawson T, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (1998). "PDZ-домен-опосредованное взаимодействие Eph-связанной рецепторной тирозинкиназы EphB3 и ras-связывающего белка AF6 зависит от киназной активности рецептора". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (17): 9779– 84. Bibcode :1998PNAS...95.9779H. doi : 10.1073/pnas.95.17.9779 . PMC 21413 . PMID 9707552.
Ciossek T, Monschau B, Kremoser C, Löschinger J, Lang S, Müller BK, Bonhoeffer F, Drescher U (1998). «Взаимодействия рецептора Eph и лиганда необходимы для управления аксонами ганглиозных клеток сетчатки in vitro». Eur. J. Neurosci . 10 (5): 1574– 80. doi :10.1046/j.1460-9568.1998.00180.x. PMID 9751130. S2CID 20470923.
Adams RH, Wilkinson GA, Weiss C, Diella F, Gale NW, Deutsch U, Risau W, Klein R (1999). "Роли лигандов ephrinB и рецепторов EphB в развитии сердечно-сосудистой системы: разграничение артериальных/венозных доменов, сосудистый морфогенез и прорастающий ангиогенез". Genes Dev . 13 (3): 295–306 . doi :10.1101/gad.13.3.295. PMC 316426. PMID 9990854 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P54753 (рецептор эфрина типа B 3) на сайте PDBe-KB .

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 3 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000182580 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000005958 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8397371-5] Бёме Б., Холтрих У., Вольф Г., Люциус Х., Гржешик К. Х., Стребхардт К., Рюбсамен-Вайгманн Х. (октябрь 1993 г.). «ПЦР-опосредованное обнаружение нового человеческого рецептора-тирозинкиназы, HEK 2». Онкоген . 8 (10): 2857– 62. PMID 8397371.

[entrez-6] "Ген Энтреза: EPHB3 EPH рецептор B3".

[pmid9707552-7] Hock B, Böhme B, Karn T, Yamamoto T, Kaibuchi K, Holtrich U, Holland S, Pawson T, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (август 1998 г.). "PDZ-domain-mediated interaction of the Eph-related receptor tyrosine kinase EphB3 and the ras-binding protein AF6 depends on the kinase activity of the receptor". Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95 (17): 9779– 84. Bibcode :1998PNAS...95.9779H. doi : 10.1073/pnas.95.17.9779 . PMC 21413 . PMID 9707552.

[pmid9674711-8] Hock B, Böhme B, Karn T, Feller S, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (июль 1998 г.). «Тирозин-614, основной сайт автофосфорилирования рецепторной тирозинкиназы HEK2, функционирует как сайт множественной стыковки для взаимодействий, опосредованных доменом SH2». Онкоген . 17 (2): 255– 60. doi : 10.1038/sj.onc.1201907 . PMID 9674711.