Домен FERM
| N-концевой домен FERM | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура домена фермена мерлина, белка-супрессора опухолей нейрофиброматоза 2. | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ФЕРМ_Н | ||||||||
| Пфам | ПФ09379 | ||||||||
| Клан ПФАМ | CL0072 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR018979 | ||||||||
| СКОП2 | 1gc7 / ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ / SUPFAM | ||||||||
| суперсемейство OPM | 49 | ||||||||
| белок ОПМ | 1гк6 | ||||||||
| Мембраном | 161 | ||||||||
| |||||||||
| Центральный домен FERM | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура домена связывания мембраны белка 4.1r | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ФЕРМ_М | ||||||||
| Пфам | ПФ00373 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR019748 | ||||||||
| СКОП2 | 1gc7 / ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd14473 | ||||||||
| |||||||||
| С-концевой PH-подобный домен FERM | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура домена фермина радиксина в комплексе с цитоплазматическим хвостом nep | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ФЕРМ_С | ||||||||
| Пфам | ПФ09380 | ||||||||
| Клан ПФАМ | CL0266 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR018980 | ||||||||
| СКОП2 | 1ef1 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd00836 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии домен FERM (F для белка 4.1 , E для эзрина , R для радиксина и M для моэсина ) является широко распространенным белковым модулем, участвующим в локализации белков в плазматической мембране . [1] Домены FERM обнаружены в ряде цитоскелетно -ассоциированных белков , которые связываются с различными белками на границе между плазматической мембраной и цитоскелетом . Домен FERM расположен на N-конце в большинстве белков, в которых он обнаружен. [1] [2]
Структура и функции
Эзрин, моэзин и радиксин являются высокородственными белками ( семейство белков ERM ), но другие белки, в которых обнаружен домен FERM, не имеют никаких областей сходства за пределами этого домена. Белки ERM состоят из трех доменов: домена FERM, центрального спирального домена и домена C-концевого хвоста, который связывает F-актин . Аминокислотная последовательность домена FERM высококонсервативна среди белков ERM и отвечает за ассоциацию с мембраной путем прямого связывания с цитоплазматическим доменом или хвостом интегральных мембранных белков . Белки ERM регулируются внутримолекулярной ассоциацией доменов FERM и C-концевого хвоста , которая маскирует их сайты связывания для других молекул . Для сшивания цитоскелета с мембраной спящие молекулы активируются, и домен FERM прикрепляется к мембране путем связывания специфических мембранных белков, в то время как последние 34 остатка хвоста связывают актиновые филаменты . Помимо связывания с мембранами, активированный домен FERM белков ERM может также связывать ингибитор диссоциации гуаниновых нуклеотидов Rho GTPase (RhoGDI), что предполагает, что в дополнение к функционированию в качестве сшивающего агента белки ERM могут влиять на сигнальные пути Rho . Кристаллическая структура домена FERM показывает, что он состоит из трех структурных модулей (F1, F2 и F3), которые вместе образуют компактную структуру в форме клевера . [3] N-концевой модуль подобен убиквитину . C-концевой модуль представляет собой PH -подобный домен.
Домен FERM также называют аминоконцевым доменом, доменом 30 кДа, 4.1N30, доменом, связывающим мембрану и цитоскелет, доменом, подобным ERM, эзриноподобным доменом суперсемейства полосы 4.1, консервативной N-концевой областью и доменом прикрепления к мембране. [1]
Примеры
Белки, содержащие домен FERM, включают:
- Полоса 4.1 , которая связывает спектрин - актиновый цитоскелет эритроцитов с плазматической мембраной .
- Эзрин, компонент подслоя плазматической мембраны микроворсинок .
- Моэзин, вероятно, участвует в связывании основных структур цитоскелета с плазматической мембраной.
- Радиксин, который участвует в связывании зазубренного конца актиновых филаментов с плазматической мембраной в подслое межклеточного адгезивного соединения .
- Талин — цитоскелетный белок, концентрирующийся в областях контакта клеток с субстратом, а в лимфоцитах — в областях контактов клеток с клетками.
- Филоподин — белок слизевика , связывающий актин и участвующий в регуляции подвижности клеток и хемотаксиса .
- Мерлин (или шванномин).
- Белок NBL4.
- Необычные миозины X, VIIa и XV, которые мутируют при врожденной глухоте .
- Фокально-адгезионные киназы (FAK), цитоплазматические протеинтирозинкиназы, участвующие в передаче сигналов через интегрины .
- Янус-тирозинкиназы (JAK) — цитоплазматические тирозинкиназы , которые нековалентно связаны с цитоплазматическими хвостами рецепторов цитокинов или полипептидных гормонов .
- Нерецепторная тирозин-протеинкиназа TYK2 .
- Протеин-тирозиновые фосфатазы PTPN3 и PTPN4 — ферменты , которые, по-видимому, действуют на стыках между мембраной и цитоскелетом.
- Протеин-тирозиновые фосфатазы PTPN14 и PTP-D1, PTP-RL10 и PTP2E.
- Протеиновая фосфатаза Caenorhabditis elegans ptp-1.
Ссылки
- ^ abc Chishti AH, Kim AC, Marfatia SM, Lutchman M, Hanspal M, Jindal H, Liu SC, Low PS, Rouleau GA, Mohandas N, Chasis JA, Conboy JG, Gascard P, Takakuwa Y, Huang SC, Benz EJ, Bretscher A, Fehon RG, Gusella JF, Ramesh V, Solomon F, Marchesi VT, Tsukita S, Tsukita S, Hoover KB (август 1998 г.). «Домен FERM: уникальный модуль, участвующий в связывании цитоплазматических белков с мембраной». Trends Biochem. Sci . 23 (8): 281–2. doi :10.1016/S0968-0004(98)01237-7. PMID 9757824.
- ^ Pearson MA, Reczek D, Bretscher A, Karplus PA (апрель 2000 г.). «Структура белка ERM moesin раскрывает складку домена FERM, замаскированную расширенным доменом связывания актина». Cell . 101 (3): 259–70. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80836-3 . PMID 10847681. S2CID 7119092.
- ^ Хамада К, Шимизу Т, Мацуи Т, Цукита С, Хакошима Т (сентябрь 2000 г.). «Структурная основа механизмов мембранного нацеливания и демаскировки домена радиксина FERM». EMBO J . 19 (17): 4449–62. doi :10.1093/emboj/19.17.4449. PMC 302071 . PMID 10970839.
