Ортонаировирус

Род вирусов

Ортонаировирус
Вирион и геном ортонаировируса Крымско-Конголезской геморрагической лихорадки
Классификация вирусов Редактировать эту классификацию
(без рейтинга):Вирус
Область :Рибовирус
Королевство:Орторнавирусы
Тип:Негарнавирикота
Сорт:Эллиовирицеты
Заказ:Буньявирусные
Семья:Наировириде
Род:Ортонаировирус

Orthonairovirus — род вирусов семейства Nairoviridae порядка Bunyavirales , включающий вирусы с кольцевой одноцепочечной РНК с отрицательной полярностью . [1] Название происходит от болезни овец Найроби, которая поражает желудочно-кишечный тракт овец и коз. [1] Все вирусы этого рода являются вирусами, переносимыми клещами, хозяевами которых являются человек или другие позвоночные. [2]

Структура

Вирионы вирусов этого рода имеют сферическую форму. [3] Их размер варьируется от примерно 80 до 120 нм в диаметре, при этом 50% их веса приходится на белки и 20–30% их веса приходится на липиды. [ 1] Рибонуклеокапсид нитевидный, имеет длину около 200–300 нм и ширину около 2–2,5 нм. [1] Эти нуклеокапсиды окружены одной оболочкой, которая имеет выступы из гликопротеинов, выступающие из ее поверхности. Эти выступы равномерно покрывают поверхность вириона и имеют длину около 5–10 нм. [1] Они помогают в прикреплении к рецептору хозяина при репликации .

Геном

Геном вируса Крымско-Конголезской геморрагической лихорадки

Геномы наировирусов представляют собой одноцепочечную РНК с отрицательным смыслом . Полный геном имеет длину около 17 100–22 800 нуклеотидов и делится на три сегмента: большой, средний и малый. [2] Большой сегмент имеет длину около 11 000–14 400 нуклеотидов (11–14,4 кб) и кодирует вирусную полимеразу. [1] [3] Средний сегмент имеет длину около 4 400–6 300 нуклеотидов (4,4–6,3 кб) и кодирует гликопротеины G¬n и Gc. [1] [3] Малый сегмент имеет длину около 1 700–2 100 нуклеотидов (1,7–2,1 кб) и кодирует белок нуклеокапсида . [2] < [1] [3]

Геном имеет терминально избыточные последовательности, причем последовательности повторяются на обоих концах. Концевые нуклеотиды являются парными основаниями, образующими нековалентно замкнутую кольцевую РНК . [1] Оба конца 5' и 3' имеют консервативные области длиной 9 нуклеотидов. Последовательности следующие: 5'-конец: UCUCAAAGA и 3'-конец: AGAGUUUCU. [1]

Репликация

Жизненный цикл наировируса

Наировирусы прикрепляются к рецептору хозяина с помощью своего димера гликопротеина Gn-Gc. [3] Затем вирус эндоцитируется в клетку хозяина через везикулу . Сегменты рибонуклеокапсида высвобождаются в цитоплазму , начиная транскрипцию . [3] Транскрипция и репликация происходят внутри клетки, и вновь синтезированные вирионы высвобождаются путем почкования .

Передача и распределение

Представители этого вирусного рода заражают многих позвоночных и передаются через клещей. [1]

Представители рода Nairovirus могут быть обнаружены по всему миру, везде, где их членистоногие переносчики и позвоночные хозяева встречаются вместе. [3]

Таксономия

По состоянию на 2020 год род включает 41 вид: [4]

В 2021 году в Японии был описан вирус Yezo [5], обнаружен наировирус Beji [6] , а в Китае — вирус клещей Tacheng [ 7] . В 2024 году были описаны вирус Songling [8] и вирус Wetland [9] .

Клиническое значение

Члены этого вирусного рода, которые инфицируют людей, включают [9] Крымско-Конголезскую геморрагическую лихорадку , вирус Дагбе , вирус болезни овец Найроби , вирус Сонглинг, вирус Йезо , вирус клещей Таченг, ортонаировирус Бейджи и вирус водно-болотных угодий . За исключением первого, они вызывают относительно легкое заболевание. [9]

Вирус Касокеро [10] и вирус Эрве, вероятно, также патогенны для человека. [8]

Эволюция

Филогенетический анализ показал, что эти вирусы делятся на две основные монофилетические группы: группы, переносимые твердыми клещами ( Ixodidae ) и мягкими клещами ( Argasidae ). [11] Ископаемые и филогенетические данные помещают расхождение между твердыми и мягкими клещами между 120 миллионами лет назад и 92 миллионами лет назад . Это говорит о том, что наировирусы были связаны с этими клещами более 100 миллионов лет.

Кроме того, наировирусы, переносимые клещами родов Argas , Carios и Ornithodoros , образуют три отдельные монофилетические линии, что снова подтверждает предположение о совместном видообразовании хозяина и вируса.

Серогруппы твердотелых клещей:

  • Крымско-Конголезская геморрагическая лихорадка
  • Болезнь овец Найроби
  • Сахалин
  • Тэмди

Серогруппы мягкотелых клещей:

  • Хьюз
  • Дера Гази Хан
  • Кальюб

Переносчики клещей серогрупп Kasokero и Thiafora в настоящее время неизвестны.

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abcdefghijk Кун Дж.Х., Альховский С.В., Авшич-Жупанц Т., Бержерон Э., Берт Ф., Эргюнай К. и др. (апрель 2024 г.). «Профиль таксономии вируса ICTV: Nairoviridae 2024». Журнал общей вирусологии . 105 (4). дои : 10.1099/jgv.0.001974. ПМЦ  11094370 . ПМИД  38687001.
  2. ^ abc Crabtree MB, Sang R, Miller BR (февраль 2009 г.). «Вирус Купе, новый вирус в семействе буньявирусов, род наировирус, Кения». Emerging Infectious Diseases . 15 (2): 147– 154. doi :10.3201/eid1502.080851. PMC 2657624. PMID  19193256 . 
  3. ^ abcdefg "Найровирус". Вирусная зона . Группа Swiss-Prot Швейцарского института биоинформатики SIB.
  4. ^ "Virus Taxonomy: 2020 Release". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Получено 19 мая 2021 г.
  5. ^ Кодама Ф., Ямагути Х., Пак Э., Татемото К., Сашика М., Накао Р. и др. (сентябрь 2021 г.). «Новый найровирус, связанный с острым лихорадочным заболеванием на Хоккайдо, Япония». Природные коммуникации . 12 (1): 5539. doi : 10.1038/s41467-021-25857-0. ПМЦ 8452618 . ПМИД  34545081. 
  6. ^ Wang YC, Wei Z, Lv X, Han S, Wang Z, Fan C и др. (декабрь 2021 г.). «Новый вирус, похожий на наиро, связанный с лихорадочным заболеванием человека в Китае». Emerging Microbes & Infections . 10 (1): 1200– 1208. doi :10.1080/22221751.2021.1936197. PMC 8212832. PMID  34044749 . 
  7. ^ Dong Z, Yang M, Wang Z, Zhao S, Xie S, Yang Y и др. (Февраль 2021 г.). «Инфекция вирусом клеща Tacheng Tick Virus 2, Китай, 2019 г.». Emerging Infectious Diseases . 27 (2): 594– 598. doi :10.3201/eid2702.191486. ​​PMC 7853585. PMID  33496245 . 
  8. ^ ab Ma J, Lv XL, Zhang X, Han SZ, Wang ZD, Li L, et al. (март 2021 г.). «Идентификация нового ортонаировируса, связанного с лихорадочным заболеванием человека в Китае». Nature Medicine . 27 (3): 434– 439. doi :10.1038/s41591-020-01228-y. PMID  33603240.
  9. ^ abc Zhang XA, Ma YD, Zhang YF, Hu ZY, Zhang JT, Han S и др. (сентябрь 2024 г.). «Новый ортонаировирус, связанный с лихорадочным заболеванием человека». The New England Journal of Medicine . 391 (9): 821– 831. doi : 10.1056/NEJMoa2313722. PMID  39231344.
  10. ^ Schuh AJ, Amman BR, Patel K, Sealy TK, Swanepoel R, Towner JS (декабрь 2020 г.). «Вирус Касокеро, патогенный для человека, у клещей, собранных в полевых условиях». Emerging Infectious Diseases . 26 (12): 2944– 2950. doi :10.3201/eid2612.202411. PMC 7706932. PMID  33219649 . 
  11. ^ Honig JE, Osborne JC, Nichol ST (январь 2004 г.). «Высокая генетическая изменчивость вирусов рода Nairovirus отражает разнообразие их преобладающих хозяев-клещей». Вирусология . 318 (1): 10– 16. doi :10.1016/j.virol.2003.09.021. PMID  14972529.
  • Отчет ICTV: Nairoviridae
  • Вирусная зона: Найровирус
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Orthonairovirus&oldid=1249439031"