Ортонаировирус | |
---|---|
Вирион и геном ортонаировируса Крымско-Конголезской геморрагической лихорадки | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область : | Рибовирус |
Королевство: | Орторнавирусы |
Тип: | Негарнавирикота |
Сорт: | Эллиовирицеты |
Заказ: | Буньявирусные |
Семья: | Наировириде |
Род: | Ортонаировирус |
Orthonairovirus — род вирусов семейства Nairoviridae порядка Bunyavirales , включающий вирусы с кольцевой одноцепочечной РНК с отрицательной полярностью . [1] Название происходит от болезни овец Найроби, которая поражает желудочно-кишечный тракт овец и коз. [1] Все вирусы этого рода являются вирусами, переносимыми клещами, хозяевами которых являются человек или другие позвоночные. [2]
Вирионы вирусов этого рода имеют сферическую форму. [3] Их размер варьируется от примерно 80 до 120 нм в диаметре, при этом 50% их веса приходится на белки и 20–30% их веса приходится на липиды. [ 1] Рибонуклеокапсид нитевидный, имеет длину около 200–300 нм и ширину около 2–2,5 нм. [1] Эти нуклеокапсиды окружены одной оболочкой, которая имеет выступы из гликопротеинов, выступающие из ее поверхности. Эти выступы равномерно покрывают поверхность вириона и имеют длину около 5–10 нм. [1] Они помогают в прикреплении к рецептору хозяина при репликации .
Геномы наировирусов представляют собой одноцепочечную РНК с отрицательным смыслом . Полный геном имеет длину около 17 100–22 800 нуклеотидов и делится на три сегмента: большой, средний и малый. [2] Большой сегмент имеет длину около 11 000–14 400 нуклеотидов (11–14,4 кб) и кодирует вирусную полимеразу. [1] [3] Средний сегмент имеет длину около 4 400–6 300 нуклеотидов (4,4–6,3 кб) и кодирует гликопротеины G¬n и Gc. [1] [3] Малый сегмент имеет длину около 1 700–2 100 нуклеотидов (1,7–2,1 кб) и кодирует белок нуклеокапсида . [2] < [1] [3]
Геном имеет терминально избыточные последовательности, причем последовательности повторяются на обоих концах. Концевые нуклеотиды являются парными основаниями, образующими нековалентно замкнутую кольцевую РНК . [1] Оба конца 5' и 3' имеют консервативные области длиной 9 нуклеотидов. Последовательности следующие: 5'-конец: UCUCAAAGA и 3'-конец: AGAGUUUCU. [1]
Наировирусы прикрепляются к рецептору хозяина с помощью своего димера гликопротеина Gn-Gc. [3] Затем вирус эндоцитируется в клетку хозяина через везикулу . Сегменты рибонуклеокапсида высвобождаются в цитоплазму , начиная транскрипцию . [3] Транскрипция и репликация происходят внутри клетки, и вновь синтезированные вирионы высвобождаются путем почкования .
Представители этого вирусного рода заражают многих позвоночных и передаются через клещей. [1]
Представители рода Nairovirus могут быть обнаружены по всему миру, везде, где их членистоногие переносчики и позвоночные хозяева встречаются вместе. [3]
По состоянию на 2020 год род включает 41 вид: [4]
В 2021 году в Японии был описан вирус Yezo [5], обнаружен наировирус Beji [6] , а в Китае — вирус клещей Tacheng [ 7] . В 2024 году были описаны вирус Songling [8] и вирус Wetland [9] .
Члены этого вирусного рода, которые инфицируют людей, включают [9] Крымско-Конголезскую геморрагическую лихорадку , вирус Дагбе , вирус болезни овец Найроби , вирус Сонглинг, вирус Йезо , вирус клещей Таченг, ортонаировирус Бейджи и вирус водно-болотных угодий . За исключением первого, они вызывают относительно легкое заболевание. [9]
Вирус Касокеро [10] и вирус Эрве, вероятно, также патогенны для человека. [8]
Филогенетический анализ показал, что эти вирусы делятся на две основные монофилетические группы: группы, переносимые твердыми клещами ( Ixodidae ) и мягкими клещами ( Argasidae ). [11] Ископаемые и филогенетические данные помещают расхождение между твердыми и мягкими клещами между 120 миллионами лет назад и 92 миллионами лет назад . Это говорит о том, что наировирусы были связаны с этими клещами более 100 миллионов лет.
Кроме того, наировирусы, переносимые клещами родов Argas , Carios и Ornithodoros , образуют три отдельные монофилетические линии, что снова подтверждает предположение о совместном видообразовании хозяина и вируса.
Серогруппы твердотелых клещей:
Серогруппы мягкотелых клещей:
Переносчики клещей серогрупп Kasokero и Thiafora в настоящее время неизвестны.