ортонаировирус Купе
| ортонаировирус Купе | |
|---|---|
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирус |
| Королевство: | Орторнавирусы |
| Тип: | Негарнавирикота |
| Сорт: | Эллиовирицеты |
| Заказ: | Буньявирусные |
| Семья: | Наировириде |
| Род: | Ортонаировирус |
| Разновидность: | ортонаировирус Купе |
Ортонаировирус Купе , также называемый вирусом Купе , представляет собой разновидность вируса рода Orthonairovirus . [1]
История
Вирус был выделен из популяции клещей ( Amblyomma gemma и Rhipicephalus pulchellus ), собранных со шкур крупного рогатого скота в Найроби , Кения , в октябре 1999 года. [2] Слово «Kupe» на языке суахили означает «клещ».
Геном
Геном состоит из одной цепи отрицательной РНК, состоящей из трех частей — малой (S), средней (M0) и большой (L).
Длина сегмента L РНК составляет 12 330 нуклеотидов (нт), и он кодирует одну открытую рамку считывания (ORF) из 4050 аминокислот. Существуют некодирующие области: 5′-область из 40 нт и 3′-область из 137 нт. Эта открытая рамка считывания кодирует несколько модулей, включая РНК-зависимую РНК-полимеразу. Вероятно, он посттрансляционно расщепляется на несколько белков, но это еще предстоит показать.
Длина сегмента РНК M составляет 4818 нуклеотидов, и он содержит одну открытую рамку считывания, окруженную 5′ и 3′ некодирующими областями из 47 и 121 нуклеотида соответственно. ORF кодирует белок из 1549 аминокислот с 8 потенциальными сайтами для N-связанного гликозилирования. Он содержит уникальный потенциальный сайт N-gly в областях гликопротеинов Gn и Gc на аминокислотах 612 и 1514 соответственно.
Сегмент S имеет 1694 нт и кодирует ORF из 483 аминокислот. Некодирующие области 5′ и 3′ имеют длину 49 нт и 193 нт соответственно.
Ссылки
- ^ "Virus Taxonomy: 2020 Release". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Получено 25 мая 2021 г.
- ^ Санг Р., Оньянго С., Гачоя Дж., Мабинда Э., Кононгой С., Офула В., Данстер Л., Окот Ф., Колдрен Р., Теш Р., да Росса А.Т., Финкбайнер С., Ван Д., Крэбтри М., Миллер Б. (2006) Тикборн надзор за арбовирусами среди товарного скота, Найроби, Кения. Экстренное заражение Dis. Июль 2006 г.;12(7):1074–1080
