Атипичные SLC
 | Эта статья может быть слишком технической для понимания большинства читателей . ( Август 2017 ) |
Семейства атипичных переносчиков растворенных веществ (Atypical SLC) — это новые вероятные вторичные активные или фасилитативные транспортные белки, которые имеют общую родословную с известными семействами переносчиков растворенных веществ (SLC) . Однако им не было присвоено название в соответствии с корневой системой SLC, и они не были отнесены ни к одному из существующих семейств SLC. [1] [2]
Нетипичный главный посредник суперсемейный транспорт семьи
Большинство атипичных SLC являются семействами в пределах главного суперсемейства фасилитаторов (MFS). [3] Эти атипичные SLC являются вероятными вторичными активными или фасилитирующими транспортными белками, которые имеют общее происхождение с известными переносчиками растворенных веществ . [1] [2] [4] Однако они не названы в соответствии с корневой системой SLC и не классифицированы ни в одно из существующих семейств SLC. [1] ATMF классифицируются на основе сходства их последовательностей и филогенетической близости. [3]
| АМТФ | Члены семьи | Семья SLC |
|---|---|---|
| АМТФ1 | МФСД9, МФСД10, МФСД14А, МФСД14Б | SLC46 |
| АМТФ2 | МФСД8 | |
| АМТФ3 | МФСД4А, МФСД4Б | |
| АМТФ4 | CLN3 | |
| АМТФ5 | МФСД7 | SLC49 |
| АМТФ6 | МФСД1, МФСД5 | |
| АМТФ7 | МФСД12 | |
| АМТФ8 | МФСД2А, МФСД2Б | |
| АМТФ9 | SV2A, SV2B, SV2C, СВОП, СВОПЛ | SLC22 |
| АМТФ10 | МФСД11, UNC93A, UNC93B1 | |
| АМТФ11 | СПНС1, СПНС2, СПНС3 | |
| АМТФ12 | МФСД13А | |
| АМТФ13 | МФСД6 | |
| АМТФ14 | МФСД6Л | |
| АМТФ15 | МФСД3 |
Некоторые атипичные SLC типа MFS: OCA2 , CLN3 , SPNS1, SPNS2 , SPNS3 , SV2A , SV2B , SV2C, SVOP, SVOPL, MFSD1 , MFSD2A , MFSD2B, MFSD3 , MFSD4A, [5] MFSD4B, MFSD5 , MFSD6, MFSD6L, MFSD8 , MFSD9 , [ 5 ] MFSD10, MFSD11 , MFSD12, MFSD13A, MFSD14A , MFSD14B , UNC93A [6] и UNC93B1 . Все это атипичные SLC, обнаруженные в суперсемействе Major facilitator . Также TMEM104 (клан APC), OCA2 (клан IT) и CLN3 (не имеющий клана) являются атипичными SLC у людей. [7] [8] [9]
Семейства транспортных средств, не входящих в MFS
Хотя большинство атипичных SLC принадлежат к главному суперсемейству посредников, существуют исключения: TMEM104 ( суперсемейство APC ), OCA2 (суперсемейство IT) и CLN3 (неизвестное суперсемейство). [1]
Ссылки
- ^ abcd Perland E, Fredriksson R (март 2017). «Системы классификации вторичных активных транспортеров». Тенденции в фармакологических науках . 38 (3): 305– 315. doi :10.1016/j.tips.2016.11.008. PMID 27939446.
- ^ ab Sreedharan S, Stephansson O, Schiöth HB, Fredriksson R (июнь 2011 г.). «Длительная эволюционная консервация и значительная тканевая специфичность нескольких атипичных переносчиков растворенных веществ». Gene . 478 ( 1– 2): 11– 18. doi :10.1016/j.gene.2010.10.011. PMID 21044875.
- ^ ab Perland E, Bagchi S, Klaesson A, Fredriksson R (сентябрь 2017 г.). «Характеристики 29 новых атипичных переносчиков растворенных веществ типа суперсемейства основных фасилитаторов: эволюционная консервация, предсказанная структура и нейрональная коэкспрессия». Open Biology . 7 (9): 170142. doi :10.1098/rsob.170142. PMC 5627054 . PMID 28878041.
- ^ Höglund PJ, Nordström KJ, Schiöth HB, Fredriksson R (апрель 2011 г.). «Семейства переносчиков растворенных веществ имеют удивительно длинную эволюционную историю, при этом большинство человеческих семейств существовало до расхождения видов Bilaterian». Molecular Biology and Evolution . 28 (4): 1531– 1541. doi :10.1093/molbev/msq350. PMC 3058773. PMID 21186191 .
- ^ ab Perland E, Hellsten SV, Schweizer N, Arapi V, Rezayee F, Bushra M, Fredriksson R (2017). "Структурное предсказание двух новых человеческих атипичных транспортеров SLC, MFSD4A и MFSD9, и их нейроанатомическое распределение у мышей". PLOS ONE . 12 (10): e0186325. Bibcode :2017PLoSO..1286325P. doi : 10.1371/journal.pone.0186325 . PMC 5648162 . PMID 29049335.
- ^ Ceder MM, Lekholm E, Hellsten SV, Perland E, Fredriksson R (2017). "Нейрональный и периферический экспрессируемый связанный с мембраной UNC93A реагирует на доступность питательных веществ у мышей". Frontiers in Molecular Neuroscience . 10 : 351. doi : 10.3389/fnmol.2017.00351 . PMC 5671512. PMID 29163028 .
- ^ "Трансмембранный белок TMEM104 104 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 14.03.2022 .
- ^ "OCA2 OCA2 меланосомный трансмембранный белок [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 2022-03-14 .
- ^ "CLN3 CLN3 лизосомальный/эндосомальный трансмембранный белок, баттенин [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 14.03.2022 .
 | Эта статья по генетике — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее. |
