Домен WH1

Домен белка
Домен WH1
Идентификаторы
СимволWH1
ПфамПФ00568
ИнтерПроIPR000697
УМНЫЙWH1
СКОП21evh / SCOPe / SUPFAM
CDDcd01205
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры

Домены WH1, также известные как домены EVH1, представляют собой эволюционно консервативные белковые домены , обнаруженные в белках WASP (VASP), которые часто участвуют в полимеризации актина. [1] [2]

Функция

Домены WH1 важны для всех клеточных процессов, в которых участвует актин, включая подвижность клеток, перемещение клеток, деление клеток и цитокинез, передачу сигналов клетками, а также установление и поддержание клеточных соединений и формы клеток. [2]

Структура

Третичная структура домена WH1 белка Mena выявила структурное сходство с доменом плекстрина (PH). Общая складка состоит из компактного параллельного бета-сэндвича, закрытого вдоль одного края длинной альфа-спиралью . Высококонсервативный кластер из трех поверхностно-экспонированных ароматических боковых цепей образует сайт распознавания для целевых лигандов молекулы . [3]

Взаимодействия

Семейство белков WASP контролирует полимеризацию актина, активируя комплекс Arp2/3. WASP дефектен при синдроме Вискотта-Олдрича (WAS), при котором у большинства пациентов большинство точечных мутаций происходит в N-концевом домене WH1. Метаботропные глутаматные рецепторы mGluR1alpha и mGluR5 связывают белок, называемый гомер, который является гомологом домена WH1. [4] [5]

Белки семейства WASP содержат EVH1 (WH1) в своих N-концах, которые связывают богатые пролином последовательности во взаимодействующем белке WASP. Белки семейства RanBP1 содержат домен WH1 в своей N-концевой области, который, по-видимому, связывает другой мотив последовательности, присутствующий в C-концевой части белка RanGTP. [6] [7]

Третичная структура домена WH1 белка Mena выявила структурное сходство с доменом плекстриновой гомологии (PH). Общая складка состоит из компактного параллельного бета-сэндвича, закрытого вдоль одного края длинной альфа-спиралью. Высококонсервативный кластер из трех поверхностно-экспонированных ароматических боковых цепей образует сайт распознавания для молекул-мишеней лигандов. [3]

EVH1

Семейство белков
EVH1
структура комплекса домена n-wasp evh1-wip
Идентификаторы
СимволEVH1
ПфамПФ00568
Клан ПФАМCL0266
ИнтерПроIPR000697
УМНЫЙWH1
СКОП21evh / SCOPe / SUPFAM
CDDcd00837
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры

Подмножество доменов WH1 было названо доменом EVH1 , связывающим полипролиновый мотив. Домен EVH1 (также известный как WH1 , RanBP1-WASP или домен enabled/VASP homology 1 ) также является эволюционно консервативным белковым доменом . Домены EVH1 распознают и связывают богатый пролином мотив FPPPP с низкой аффинностью, затем формируются дальнейшие взаимодействия между фланкирующими остатками. [5] [8]

Домен EVH1 обнаружен в многодоменных белках гомологии Ena/Vasp, вовлеченных в широкий спектр сигналов, ядерного транспорта и цитоскелетных событий. Этот домен из примерно 115 аминокислот присутствует у видов от дрожжей до млекопитающих . Многие белки, содержащие EVH1, ассоциируются со структурами на основе актина и играют роль в организации цитоскелета . Домены EVH1 распознают и связывают богатый пролином мотив FPPPP с низкой аффинностью, затем формируются дальнейшие взаимодействия между фланкирующими остатками. [8] [9] [10]

Примеры

Гены человека, кодирующие белки, содержащие домен WH1 (EVH1), включают:

Ссылки

  1. ^ Symons M, Derry JM, Karlak B, Jiang S, Lemahieu V, McCormick F, Francke U, Abo A (март 1996). "Белок синдрома Вискотта-Олдрича, новый эффектор для ГТФазы CDC42Hs, участвует в полимеризации актина". Cell . 84 (5): 723– 34. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81050-8 . PMID  8625410. S2CID  17838931.
  2. ^ ab Veltman DM, Insall RH (2010). «Семейство белков WASP: их эволюция и ее физиологические последствия». Mol Biol Cell . 21 (16): 2880– 93. doi :10.1091/mbc.E10-04-0372. PMC 2921111. PMID  20573979 . 
  3. ^ ab Prehoda KE, Lee DJ, Lim WA (май 1999). «Структура комплекса домена-пептида enabled/VASP homology 1: ключевой компонент пространственного контроля сборки актина». Cell . 97 (4): 471– 80. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80757-6 . PMID  10338211. S2CID  17078939.
  4. ^ Ponting CP, Phillips C (1997). «Идентификация homer как гомолога белка синдрома Вискотта-Олдрича предполагает рецептор-связывающую функцию для доменов WH1». J. Mol. Med . 75 ( 11– 12): 769– 71. doi :10.1007/s001090050166. PMID  9428607. S2CID  39958754.
  5. ^ ab Niebuhr K, Ebel F, Frank R, Reinhard M, Domann E, Carl UD, Walter U, Gertler FB, Wehland J, Chakraborty T (сентябрь 1997 г.). «Новый богатый пролином мотив, присутствующий в ActA Listeria monocytogenes и цитоскелетных белках, является лигандом для домена EVH1, белкового модуля, присутствующего в семействе Ena/VASP». EMBO J . 16 (17): 5433– 44. doi :10.1093/emboj/16.17.5433. PMC 1170174 . PMID  9312002. 
  6. ^ Callebaut I, Cossart P, Dehoux P (декабрь 1998 г.). «Домены EVH1/WH1 белков VASP и WASP принадлежат к большому семейству, включающему Ran-связывающие домены семейства RanBP1». FEBS Lett . 441 (2): 181– 5. doi :10.1016/S0014-5793(98)01541-5. PMID  9883880. S2CID  8527080.
  7. ^ Beddow AL, Richards SA, Orem NR, Macara IG (апрель 1995 г.). «Домен связывания ГТФазы Ran/TC4: идентификация с помощью клонирования экспрессии и характеристика консервативного мотива последовательности». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (8): 3328– 32. doi : 10.1073/pnas.92.8.3328 . PMC 42159 . PMID  7724562. 
  8. ^ ab Ball LJ, Jarchau T, Oschkinat H, Walter U (февраль 2002 г.). "EVH1-домены: структура, функция и взаимодействия". FEBS Lett . 513 (1): 45– 52. doi : 10.1016/S0014-5793(01)03291-4 . PMID  11911879. S2CID  10368115.
  9. ^ Поусон Т. "Домен EVH1". Лаборатория Поусона . Получено 09.06.2011 .
  10. ^ PDB : 1QC6 ​; Fedorov AA, Fedorov E, Gertler F, Almo SC (июль 1999). «Структура EVH1, нового богатого пролином лиганд-связывающего модуля, участвующего в динамике цитоскелета и нейронной функции». Nat. Struct. Biol . 6 (7): 661– 5. doi :10.1038/10717. PMID  10404224. S2CID  22881412.
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR000697
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR007875
Получено с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=WH1_domain&oldid=1252051444"