Домен WH1 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
Символ | WH1 | ||||||||
Пфам | ПФ00568 | ||||||||
ИнтерПро | IPR000697 | ||||||||
УМНЫЙ | WH1 | ||||||||
СКОП2 | 1evh / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
CDD | cd01205 | ||||||||
|
Домены WH1, также известные как домены EVH1, представляют собой эволюционно консервативные белковые домены , обнаруженные в белках WASP (VASP), которые часто участвуют в полимеризации актина. [1] [2]
Домены WH1 важны для всех клеточных процессов, в которых участвует актин, включая подвижность клеток, перемещение клеток, деление клеток и цитокинез, передачу сигналов клетками, а также установление и поддержание клеточных соединений и формы клеток. [2]
Третичная структура домена WH1 белка Mena выявила структурное сходство с доменом плекстрина (PH). Общая складка состоит из компактного параллельного бета-сэндвича, закрытого вдоль одного края длинной альфа-спиралью . Высококонсервативный кластер из трех поверхностно-экспонированных ароматических боковых цепей образует сайт распознавания для целевых лигандов молекулы . [3]
Семейство белков WASP контролирует полимеризацию актина, активируя комплекс Arp2/3. WASP дефектен при синдроме Вискотта-Олдрича (WAS), при котором у большинства пациентов большинство точечных мутаций происходит в N-концевом домене WH1. Метаботропные глутаматные рецепторы mGluR1alpha и mGluR5 связывают белок, называемый гомер, который является гомологом домена WH1. [4] [5]
Белки семейства WASP содержат EVH1 (WH1) в своих N-концах, которые связывают богатые пролином последовательности во взаимодействующем белке WASP. Белки семейства RanBP1 содержат домен WH1 в своей N-концевой области, который, по-видимому, связывает другой мотив последовательности, присутствующий в C-концевой части белка RanGTP. [6] [7]
Третичная структура домена WH1 белка Mena выявила структурное сходство с доменом плекстриновой гомологии (PH). Общая складка состоит из компактного параллельного бета-сэндвича, закрытого вдоль одного края длинной альфа-спиралью. Высококонсервативный кластер из трех поверхностно-экспонированных ароматических боковых цепей образует сайт распознавания для молекул-мишеней лигандов. [3]
EVH1 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
Символ | EVH1 | ||||||||
Пфам | ПФ00568 | ||||||||
Клан ПФАМ | CL0266 | ||||||||
ИнтерПро | IPR000697 | ||||||||
УМНЫЙ | WH1 | ||||||||
СКОП2 | 1evh / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
CDD | cd00837 | ||||||||
|
Подмножество доменов WH1 было названо доменом EVH1 , связывающим полипролиновый мотив. Домен EVH1 (также известный как WH1 , RanBP1-WASP или домен enabled/VASP homology 1 ) также является эволюционно консервативным белковым доменом . Домены EVH1 распознают и связывают богатый пролином мотив FPPPP с низкой аффинностью, затем формируются дальнейшие взаимодействия между фланкирующими остатками. [5] [8]
Домен EVH1 обнаружен в многодоменных белках гомологии Ena/Vasp, вовлеченных в широкий спектр сигналов, ядерного транспорта и цитоскелетных событий. Этот домен из примерно 115 аминокислот присутствует у видов от дрожжей до млекопитающих . Многие белки, содержащие EVH1, ассоциируются со структурами на основе актина и играют роль в организации цитоскелета . Домены EVH1 распознают и связывают богатый пролином мотив FPPPP с низкой аффинностью, затем формируются дальнейшие взаимодействия между фланкирующими остатками. [8] [9] [10]
Гены человека, кодирующие белки, содержащие домен WH1 (EVH1), включают: