ВПС28

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ВПС28
Идентификаторы
ПсевдонимыVPS28 , субъединица ESCRT-I, субъединица VPS28 ESCRT-I
Внешние идентификаторыОМИМ : 611952; МГИ : 1914164; гомологен : 69205; Генные карты : VPS28; OMA :VPS28 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_016208
NM_183057

NM_025842
NM_001305668

RefSeq (белок)

НП_057292
НП_898880
НП_057292.1

NP_001292597
NP_080118

Местоположение (UCSC)Хр 8: 144.42 – 144.43 МбХр 15: 76.51 – 76.51 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Гомолог белка 28, ассоциированного с сортировкой вакуолярных белков, представляет собой белок , который у людей кодируется геном VPS28 . [5]

Функция

Этот ген кодирует белок, участвующий в эндосомальной сортировке рецепторов клеточной поверхности через путь мультивезикулярного тельца/поздней эндосомы. Кодируемый белок является одной из трех субъединиц комплекса ESCRT-I (эндосомальные комплексы, необходимые для транспорта), участвующих в сортировке убиквитинированного белка . Две другие субъединицы ESCRT-I — это сортировка вакуолярного белка 23 (VPS23), также известная как ген восприимчивости к опухолям 101 (TSG101), и сортировка вакуолярного белка 37 (VPS37). Были описаны два альтернативных транскрипта, кодирующих различные изоформы. Могут существовать дополнительные альтернативные транскрипты, но белки, кодируемые этими транскриптами, не были проверены экспериментально. [5]

Взаимодействия

Было показано, что VPS28 взаимодействует с TSG101 . [6] [7] [8]

Ссылки

  1. ^ abc ENSG00000285339 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000160948, ENSG00000285339 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000115987 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ ab "Ген Entrez: гомолог сортировки 28 вакуолярного белка VPS28 (S. cerevisiae)".
  6. ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н, Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедесу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  7. ^ Stuchell MD, Garrus JE, Müller B, Stray KM, Ghaffarian S, McKinnon R, Kräusslich HG, Morham SG, Sundquist WI (август 2004 г.). «Комплекс сортировки эндосом человека, необходимый для транспорта (ESCRT-I), и его роль в почковании ВИЧ-1». J. Biol. Chem . 279 (34): 36059– 71. doi : 10.1074/jbc.M405226200 . PMID  15218037.
  8. ^ Bishop N, Woodman P (апрель 2001 г.). «TSG101/VPS23 млекопитающих и VPS28 млекопитающих взаимодействуют напрямую и привлекаются к эндосомам, индуцированным VPS4». J. Biol. Chem . 276 (15): 11735– 42. doi : 10.1074/jbc.M009863200 . PMID  11134028.

Дальнейшее чтение

  • Raiborg C, Rusten TE, Stenmark H (2004). «Сортировка белков в мультивезикулярные эндосомы». Curr. Opin. Cell Biol . 15 (4): 446–55 . doi :10.1016/S0955-0674(03)00080-2. PMID  12892785.
  • Bishop N, Woodman P (2001). «TSG101/VPS23 млекопитающих и VPS28 млекопитающих взаимодействуют напрямую и привлекаются к эндосомам, индуцированным VPS4». J. Biol. Chem . 276 (15): 11735– 42. doi : 10.1074/jbc.M009863200 . PMID  11134028.
  • Suzuki H, Fukunishi Y, Kagawa I, Saito R, Oda H, Endo T, Kondo S, Bono H, Okazaki Y, Hayashizaki Y (2001). «Панель взаимодействия белок–белок с использованием полноразмерных кДНК мыши». Genome Res . 11 (10): 1758– 65. doi :10.1101/gr.180101. PMC  311163. PMID  11591653 .
  • Bishop N, Horman A, Woodman P (2002). «VPS-белки класса E млекопитающих распознают убиквитин и участвуют в удалении конъюгатов эндосомального белка и убиквитина». J. Cell Biol . 157 (1): 91– 101. doi :10.1083/jcb.200112080. PMC  2173266. PMID  11916981 .
  • Martin-Serrano J, Zang T, Bieniasz PD (2003). "Роль ESCRT-I в ретровирусном почковании". J. Virol . 77 (8): 4794– 804. doi :10.1128/JVI.77.8.4794-4804.2003. PMC  152150 . PMID  12663786.
  • Tanzi GO, Piefer AJ, Bates P (2003). «Вирус инфекционной анемии лошадей использует механизм сортировки везикулярных белков хозяина во время высвобождения частиц». J. Virol . 77 (15): 8440– 7. doi :10.1128/JVI.77.15.8440-8447.2003. PMC  165230. PMID  12857913 .
  • Martin-Serrano J, Yarovoy A, Perez-Caballero D, Bieniasz PD, Yaravoy A (2003). "Расходящиеся ретровирусные домены позднего почкования рекрутируют факторы сортировки вакуолярных белков с помощью альтернативных адаптерных белков". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (21): 12414– 9. Bibcode :2003PNAS..10012414M. doi : 10.1073/pnas.2133846100 . PMC  218772 . PMID  14519844.
  • Stuchell MD, Garrus JE, Müller B, Stray KM, Ghaffarian S, McKinnon R, Kräusslich HG, Morham SG, Sundquist WI (2005). "Комплекс сортировки эндосом человека, необходимый для транспорта (ESCRT-I), и его роль в почковании ВИЧ-1". J. Biol. Chem . 279 (34): 36059– 71. doi : 10.1074/jbc.M405226200 . PMID  15218037.
  • Bache KG, Slagsvold T, Cabezas A, Rosendal KR, Raiborg C, Stenmark H (2005). "Регулятор роста HCRP1/hVps37A является субъединицей млекопитающего ESCRT-I и опосредует подавление рецептора". Mol. Biol . Cell . 15 (9): 4337– 46. doi :10.1091/mbc.E04-03-0250. PMC  515363. PMID  15240819.
  • Eastman SW, Martin-Serrano J, Chung W, Zang T, Bieniasz PD (2005). "Идентификация человеческого VPS37C, компонента комплекса эндосомальной сортировки, необходимого для транспорта-I, важного для вирусного почкования". J. Biol. Chem . 280 (1): 628–36 . doi : 10.1074/jbc.M410384200 . PMID  15509564.
  • Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.Ю., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=VPS28&oldid=1192419105"