Вирус трансмиссивного гастроэнтерита
Виды вируса

Вирус трансмиссивного гастроэнтерита
Электронная микрофотография коронавируса трансмиссивного гастроэнтерита (TGEV)
Классификация вирусов Редактировать эту классификацию
(без рейтинга):Вирус
Область :Рибовирус
Королевство:Орторнавирусы
Тип:Писувирикота
Сорт:Пизонивирицеты
Заказ:Нидовирусы
Семья:Коронавирусы
Род:Альфакоронавирус
Подрод:Тегаковирус
Разновидность:
Альфакоронавирус 1
Вирус:
Вирус трансмиссивного гастроэнтерита
Изоляты [1]
  • Вирус трансмиссивного гастроэнтерита вирулентный Пердью

Вирус трансмиссивного гастроэнтерита или коронавирус трансмиссивного гастроэнтерита ( TGEV ) — это коронавирус , который заражает свиней. Это оболочечный вирус с положительной полярностью , содержащий одноцепочечную РНК , который проникает в клетку-хозяина, связываясь с рецептором APN . [2] Вирус является членом рода Alphacoronavirus , подрода Tegacovirus, вида Alphacoronavirus 1. [ 3] [4]

Белки, которые вносят вклад в общую структуру TGEV, включают шип (S), оболочку (E), мембрану (M) и нуклеокапсид (N). Геномный размер коронавирусов колеблется от приблизительно 28,6 килобаз . [5] Другие коронавирусы, которые принадлежат к виду Alphacoronavirus 1 , - это коронавирус кошек , коронавирус собак и вирус инфекционного перитонита кошек .

Биология

TGEV принадлежит к семейству Coronaviridae , роду Alphacoronavirus , виду Alphacoronavirus 1. Это оболочечный вирус с положительным одноцепочечным РНК-геномом. TGEV имеет три основных структурных белка: фосфопротеин (N), интегральный мембранный белок (E1) и большой гликопротеин (E2). Белок N инкапсулирует геномную РНК, а белок S образует вирусные выступы.

3'-сегмент длиной около 8000 нуклеотидов кодирует субгеномные РНК. Оставшаяся часть генома кодирует вирусную репликазу. Три самых больших генных последовательности от 5' до 3' находятся в порядке E2-E1-N. Существует около семи других открытых рамок считывания, которые структурно не связаны. Между генами очень мало перекрытий, и они плотно упакованы. Синтезируется отрицательная цепь, которая служит шаблоном для транскрипции РНК одного размера генома и нескольких РНК размера субгенома.

Белок E2 образует лепесткообразный выступ длиной 20 нм с поверхности вируса. Считается, что белок E2 участвует в патогенезе, помогая вирусу проникать в цитоплазму хозяина. Белок E2 изначально имеет 1447 остатков, а затем расщепляется короткая гидрофобная последовательность. После гликозилирования белка в аппарате Гольджи белок затем включается в новый вирус. В белке E2 есть несколько функциональных доменов. Гидрофобный сегмент из 20 остатков на C-конце закрепляет белок в липидной мембране. Остальная часть белка разделена на две части: гидрофильный участок, который находится внутри вируса, и участок, богатый цистеином, которые, возможно, являются участками жирного ацилирования. Белок E1 в основном встроен в липидную оболочку и, следовательно, играет важную роль в архитектуре вируса. Постулируется, что белок E1 взаимодействует с мембраной лимфоцитов, что приводит к индукции генов, кодирующих IFN.

Коронавирусы проникают в хозяина, сначала прикрепляясь к клетке хозяина с помощью гликопротеина спайка. Белок S взаимодействует со свиной аминопептидазой N (pAPN), клеточным рецептором, чтобы помочь ему проникнуть. Тот же клеточный рецептор также является точкой контакта для коронавирусов человека. Домен в белке спайка S распознается pAPN, и трансфекция pAPN происходит в непермиссивных клетках и заражает их TGEV.

Морфология

Морфология TGEV в основном определялась методами электронной микроскопии. Морфология похожа на миксовирус и онкогенный вирус тем, что у них есть поверхностные выступы и оболочка. Вирусы в основном имеют круглую форму с диаметром от 100 до 150 нм, включая поверхностные выступы. Выступы в основном имели форму лепестков, прикрепленных очень узкой ножкой. Выступы, по-видимому, очень легко отделялись от вируса и были обнаружены только на отдельных участках.

Патология

TGEV заражает свиней. У поросят в возрасте менее 1 недели уровень смертности близок к 100%. Патология TGEV похожа на патологию других коронавирусов. После заражения хозяина вирус размножается в клеточной оболочке тонкого кишечника, что приводит к потере абсорбирующих клеток, что в свою очередь приводит к укорочению ворсинок . Затем инфицированные свиньи теряют способность переваривать пищу и умирают от обезвоживания. [6]

Происшествие

TGE был распространен в США, когда он был первоначально обнаружен в начале 20-го века. Он стал более редким в конце 80-х годов с ростом свиного респираторного коронавируса (PRCV). Считается, что PRCV обеспечивает некоторый иммунитет к TGE. [7]

Инженерный TGEV коронавирус

Вирус трансмиссивного гастроэнтерита был разработан как вектор экспрессии. Вектор был сконструирован путем замены несущественных ORF 3a и 3b, которые управляются последовательностями, регулирующими транскрипцию (TRS), на зеленый флуоресцентный белок. Полученная конструкция все еще была энтеропатогенной, но с уменьшенным ростом. Инфицирование клеток этим измененным вирусом вызывает специфический лактогенный иммунный ответ против гетерологичного белка. Применение этого вектора заключается в разработке вакцины или даже генной терапии. Мотивацией для разработки генома TGEV является то, что коронавирусы имеют большие геномы, поэтому у них есть место для вставки чужеродных генов. Коронавирусы также заражают дыхательные пути , и их можно использовать для нацеливания антигенов на эту область и создания некоторого иммунного ответа.

Ссылки

  1. ^ "ICTV 9th Report (2011) Coronaviridae". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Получено 26 января 2019 г. Alphacoronavirus 1 Transmissible gastroenteritis virus Transmissible gastroenteritis virus virulent Purdue [AJ271965] (TGEV virulent Purdue) Названия видов выделены курсивом; названия подвидов и изолятов выделены латиницей. Также перечислены номера последовательностей [ ] и присвоенные сокращения ( ).
  2. ^ Fehr AR, Perlman S (2015). «Коронавирусы: обзор их репликации и патогенеза». В Maier HJ, Bickerton E, Britton P (ред.). Коронавирусы . Методы в молекулярной биологии. Т. 1282. Springer. стр.  1– 23. doi :10.1007/978-1-4939-2438-7_1. ISBN 978-1-4939-2438-7. PMC  4369385 . PMID  25720466. См. Таблицу 1.
  3. ^ Woo, Patrick CY; Huang, Yi; Lau, Susanna KP; Yuen, Kwok-Yung (24 августа 2010 г.). "Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis". Viruses . 2 (8): 1804– 1820. doi : 10.3390/v2081803 . ISSN  1999-4915. PMC 3185738 . PMID  21994708. Рисунок 2. Филогенетический анализ РНК-зависимых РНК-полимераз (Pol) коронавирусов с доступными полными геномными последовательностями. Дерево было построено методом присоединения соседей и укоренено с использованием полипротеина вируса Бреда. 
  4. ^ "Taxonomy Browser (Alphacoronavirus 1)". www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 29 февраля 2020 г. .
  5. ^ Thiel V, ред. (2007). Коронавирусы: молекулярная и клеточная биология (1-е изд.). Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-16-5.[ нужна страница ]
  6. ^ Харрис, Д. Л. Хэнк. «Трансмиссивный гастроэнтерит у свиней». Ветеринарный справочник Merck . Merck . Получено 7 июля 2019 г.
  7. ^ Трансграничные и новые заболевания животных . Университет штата Айова. 2016. ISBN 978-0-9846270-5-9.
  • Laude H, Rasschaert D, Delmas B, Godet M, Gelfi J, Charley B (июнь 1990 г.). «Молекулярная биология трансмиссивного вируса гастроэнтерита». Ветеринарная микробиология . 23 ( 1– 4): 147– 54. doi : 10.1016/0378-1135(90)90144-K. PMC  7117338. PMID  2169670 .
  • Сола И, Алонсо С, Суньига С, Балаш М, Плана-Дуран Х, Энхуанес Л (апрель 2003 г.). «Инженерия генома вируса трансмиссивного гастроэнтерита как вектора экспрессии, индуцирующего лактогенный иммунитет». Журнал вирусологии . 77 (7): 4357–69 . doi :10.1128/JVI.77.7.4357-4369.2003. ПМК  150661 . ПМИД  12634392.
  • Tajima M (март 1970 г.). «Морфология вируса трансмиссивного гастроэнтерита свиней». Архивы вирусологии . 29 (1): 105– 8. doi :10.1007/BF01253886. PMC  7086923. PMID  4195092 .
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Трансмиссивный_вирус_гастроэнтерита&oldid=1140506946"