Гепацивирус
Род вирусов

Гепацивирус
Структура и геном гепацивируса
Структура и геном гепацивируса
Классификация вирусов Редактировать эту классификацию
(без рейтинга):Вирус
Область :Рибовирус
Королевство:Орторнавирусы
Тип:Китриновирикота
Сорт:Фласувирицеты
Заказ:Амарилловирусные
Семья:Флавивирусы
Род:Гепацивирус
Синонимы
  • Вирусы, подобные вирусу гепатита С [1]
  • Вирус гепатита С группы [2]

Гепацивирус — род вирусов с положительной цепью РНК в семействе Flaviviridae . [3] Вирус гепатита С (HCV), вид Hepacivirus C , поражает людей и связан с гепатитом и гепатоцеллюлярной карциномой . [3] [4] В этом роде насчитывается четырнадцать видов, которые поражают ряд других позвоночных . [3]

История

Вирус гепатита С (HCV), который является возбудителем гепатита С у людей и относится к виду Hepacivirus C , был открыт в 1989 году. [5] Было названо семь генотипов (1–7) и восемьдесят шесть подтипов (1a, 1b и т. д.) вируса гепатита С. [6]

Вирус GBV-B (также известный как вирус GB B), открытый в 1995 году, способен инфицировать обезьян Нового Света , в частности тамаринов . Как и вирус гепатита С, он передается через кровь и, подобно вирусу гепатита С, связан с вирусным гепатитом . Однако вирус GBV-B никогда не был выявлен у диких животных, и его естественный хозяин неизвестен. [5]

Структура

Вирусы рода Hepacivirus имеют оболочку и сферическую икосаэдрическую геометрию с псевдосимметрией T=3. Диаметр вирусной частицы составляет около 50 нм. Геномы линейные, не сегментированные и имеют длину около 10 000 нуклеотидов. [3] [4]

Жизненный цикл

Проникновение в клетку-хозяина достигается путем прикрепления белка оболочки вируса E к рецепторам хозяина, что опосредует эндоцитоз , опосредованный клатрином . Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК является методом транскрипции. Трансляция происходит путем вирусной инициации. Люди и другие позвоночные служат естественным хозяином. Пути передачи — половой, кровяной и контактный. [3] [4]

Таксономия

Филогенетическое древо гепацивирусов и пегивирусов с их хозяином

В роду Hepacvirus насчитывается 14 видов: [7] [3]

  • Гепацивирус А ( собачий гепацивирус , лошадиный гепацивирус)
  • Гепацивирус B (GBV-B)
  • Гепацивирус С (вирус гепатита С)
  • Гепацивирус D (гепацивирус Гереза)
  • Гепацивирус E (гепацивирус грызунов-339)
  • Гепацивирус F (гепацивирус грызунов-NLR07-oct70)
  • Гепацивирус G (норвежский крысиный гепацивирус 1)
  • Гепацивирус H (норвежский крысиный гепацивирус 2)
  • Гепацивирус I (гепацивирус грызунов-SAR-3/RSA/2008)
  • Гепацивирус J (гепацивирус грызунов-RMU10-3382/GER/2010)
  • Гепацивирус К (гепацивирус летучих мышей-PDB-829)
  • Гепацивирус L (гепацивирус летучих мышей-PDB-112)
  • Гепацивирус М (гепацивирус летучих мышей-PDB-491.1)
  • Гепацивирус N (бычий гепацивирус)

Дополнительная информация

Дополнительные гепацивирусы были описаны у летучих мышей, грызунов, включая рыжих полевок, лошадей и собак. [8] [9] [10] Гепацивирус грызунов обнаружен у оленьей мыши ( Peromyscus maniculatus ). [5] Вирус, родственный гепацивирусам, обнаружен у бамбуковой крысы ( Rhizomys pruinosus ). [11] Вирус, родственный гепацивирусам, поражает длиннохвостого суслика Spermophilus undulatus . [12]

Крупный рогатый скот является хозяином вирусов вида Hepacivirus N. [ 13] [14] Вирусы, наиболее тесно связанные с Hepacivirus C, — это лошадиные гепацивирусы вида Hepacivirus A. [15] Существует по крайней мере два подтипа лошадиного гепацивируса. [ 16] Гепацивирус A, поражающий лошадей, также был обнаружен у ослов. [17]

Вирус, родственный гепацивирусам, был выделен из белоголовых орланов ( Haliaeetus leucocephalus ). [18] Другим неклассифицированным вирусом в этом таксоне является вирус, подобный гепацивирусу уток. [19] Вирус, родственный гепацивирусам, был выделен из грациозной кошачьей акулы ( Proscyllium habereri ). [20] Был описан вирус — вирус Джогалонга, который, по-видимому, принадлежит к другому виду этого рода. [21]

Ссылки

  1. ^ Pringle, CR (1996). "Virus Taxonomy 1996 - A Bulletin from the Xth International Congress of Virology in Jerusalem" (PDF) . Архивы вирусологии . 141 (11): 2251– 6. doi :10.1007/BF01718231. ISSN  1432-8798. OCLC  76349762. PMC  7086844 . PMID  8992952 . Получено 13 марта 2019 г. Назвать род, включающий вирусы, подобные гепатиту С, родом Hepacivirus .
  2. ^ 1ICTV 6-й отчет Murphy, FA, Fauquet, CM, Bishop, DHL, Ghabrial, SA, Jarvis, AW Martelli, GP Mayo, MA & Summers, MD (редакторы) (1995). Таксономия вирусов. Шестой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Приложение к Архивам вирусологии 10, стр. 424 https://ictv.global/ictv/proposals/ICTV%206th%20Report.pdf
  3. ^ abcdef "Flaviviridae". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) .
  4. ^ abc "Viral Zone". ExPASy . Получено 15 июня 2015 г. .
  5. ^ abc Stapleton, J. T; Foung, S; Muerhoff, A. S; Bukh, J; Simmonds, P (2010). "Вирусы GB: обзор и предлагаемая классификация GBV-A, GBV-C (HGV) и GBV-D в роде Pegivirus в пределах семейства Flaviviridae". Журнал общей вирусологии . 92 (2): 233– 46. doi : 10.1099/vir.0.027490-0. PMC 3081076. PMID  21084497 . 
  6. ^ "Классификация вируса гепатита С". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) .[ мертвая ссылка ‍ ]
  7. ^ Смит, Дональд Б.; Бехер, Пол; Бух, Йенс; Гулд, Эрнест А.; Мейерс, Грегор; Монат, Томас; Мюрхофф, А. Скотт; Плетнев, Александр; Рико-Хессе, Ребекка; Стэплтон, Джек Т.; Симмондс, Питер (2016). «Предлагаемое обновление таксономии родов Hepacivirus и Pegivirus в семействе Flaviviridae». Журнал общей вирусологии . 97 (11): 2894– 2907. doi :10.1099/jgv.0.000612. PMC 5770844. PMID 27692039  . 
  8. ^ Капур, А; Симмондс, П; Шил, ТК Х; Хьелле, Б; Каллен, Дж. М.; Бурбело, П.Д.; Чаухан, Л.В.; Дурайсами, Р; Санчес Леон, М; Джайн, К; Вандегрифт, К.Дж.; Калишер, CH ; Райс, CM; Липкин, В.И. (2013). «Идентификация гомологов вируса гепатита С и пегивирусов у грызунов». мБио . 4 (2): e00216–13. doi : 10.1128/mBio.00216-13. ПМЦ 3622934 . ПМИД  23572554. 
  9. ^ Дрекслер, Ян Феликс; Корман, Виктор Макс; Мюллер, Марсель Александер; Лукашев, Александр Н; Гмыль, Анатолий; Кутар, Бруно; Адам, Александр; Ритц, Дэниел; Лейтен, Лоннеке М; Ван Риель, Дебби; Каллис, Рене; Клозе, Стефан М; Глоза-Рауш, Флориан; Бингер, Табеа; Аннан, Августина; Аду-Саркодие, Яу; Оппонг, Сэмюэл; Бургарель, Матье; Рупп, Дэниел; Хоффманн, Бернд; Шлегель, Матиас; Кюммерер, Беате М; Крюгер, Детлев Х; Шмидт-Чанасит, Йонас; Сетьен, Альваро Агилар; Коттонтейл, Вероника М; Хемачуда, Тирават; Вачараплуэсади, Супапорн; Остерридер, Клаус; и др. (2013). «Доказательства новых гепацивирусов у грызунов». PLOS Pathogens . 9 (6): e1003438. doi : 10.1371/journal.ppat.1003438 . PMC 3688547. PMID  23818848 . 
  10. ^ Lauck, M; Sibley, S. D; Lara, J; Purdy, M. A; Khudyakov, Y; Hyeroba, D; Tumukunde, A; Weny, G; Switzer, W. M; Chapman, C. A; Hughes, A. L; Friedrich, T. C; O'Connor, D. H; Goldberg, T. L (2013). "Новый гепацивирус с необычно длинным и внутренне нарушенным белком NS5A у дикого примата Старого Света". Journal of Virology . 87 (16): 8971– 81. doi :10.1128/JVI.00888-13. PMC 3754081 . PMID  23740998. 
  11. ^ Ван Нгуен, Дунг; Ван Нгуен, Куонг; Бонсалл, Дэвид; Нго, Туэ; Каррике-Мас, Хуан; Фам, Ань; Брайант, Джульетта; Туэйтс, Гай; Бейкер, Стивен; Вулхаус, Марк; Симмондс, Питер (2018). «Обнаружение и характеристика гомологов вирусов гепатита человека и пегивирусов у грызунов и летучих мышей во Вьетнаме». Вирусы . 10 (3): 102. doi : 10.3390/v10030102 . PMC 5869495 . PMID  29495551. 
  12. ^ Li LL, Liu MM, Shen S, Zhang YJ, Xu YL, Deng HY, Deng F, Duan ZJ (2019) Обнаружение и характеристика нового гепацивируса у длиннохвостых сусликов ( Spermophilus undulatus ) в Китае. Arch Virol
  13. ^ Корман, Виктор Макс; Грундхофф, Адам; Бехляйн, Кристин; Фишер, Николь; Гмил, Анатолий; Воллни, Роберт; Дей, Диксон; Ритц, Даниэль; Бингер, Табеа; Аданква, Эрнест; Марфо, Квадво Сарфо; Эннисон, Лоуренс; Аннан, Августина; Аду-Саркоди, Яв; Оппонг, Сэмюэл; Бехер, Пол; Дростен, Кристиан ; Дрекслер, Ян Феликс (2015). "Сильно расходящиеся гепацивирусы африканского крупного рогатого скота". Журнал вирусологии . 89 (11): 5876– 82. doi :10.1128/JVI.00393-15. PMC 4442428. PMID  25787289 . 
  14. ^ Baechlein, Christine; Fischer, Nicole; Grundhoff, Adam; Alawi, Malik; Indenbirken, Daniela; Postel, Alexander; Baron, Anna Lena; Offinger, Jennifer; Becker, Kathrin; Beineke, Andreas; Rehage, Juergen; Becher, Paul (2015). "Идентификация нового гепацивируса у домашнего скота из Германии". Journal of Virology . 89 (14): 7007– 15. doi :10.1128/JVI.00534-15. PMC 4473572 . PMID  25926652. 
  15. ^ Thézé, Julien; Lowes, Sophia; Parker, Joe; Pybus, Oliver G (2015). «Эволюционный и филогенетический анализ гепацивирусов и пегивирусов». Genome Biology and Evolution . 7 (11): 2996– 3008. doi :10.1093/gbe/evv202. PMC 5635594. PMID  26494702 . 
  16. ^ Pronost, S; Hue, E; Fortier, C; Foursin, M; Fortier, G; Desbrosse, F; Rey, F. A; Pitel, P.-H; Richard, E; Saunier, B (2017). «Распространенность инфекций лошадиного гепацивируса во Франции и доказательства двух подтипов вируса, циркулирующих по всему миру». Transboundary and Emerging Diseases . 64 (6): 1884–1897 . doi : 10.1111/tbed.12587 . PMID  27882682. S2CID  19064165.
  17. ^ Уолтер С, Раше А, Морейра-Сото А, Пфаендер С, Блетса М, Корман ВМ, Агилар-Сетьен А, Гарсиа-Лейси Ф, Ханс А, Тодт Д, Шулер Г, Шнайдерман-Торбан А, Штайнман А, Ронкорони С , Венециано В, Русенова Н12, Сандев Н12, Русенов А, Запрянова Д, Гарсиа-Боканегра I, Хорес Дж., Карлуччио А., Веронези MC, Каваллери Дж.М.В., Дростен С. , Леми П., Стейнманн Е., Дрекслер Дж.Ф. (2016)Дифференциальные модели инфекций и недавнее эволюционное происхождение лошадиных гепацивирусов у ослов. Дж Вирол 91(1)
  18. ^ Goldberg TL, Sibley SD, Pinkerton ME, Dunn CD, Long LJ, White LC, Strom SM (2019) Многодесятилетняя смертность и гомолог вируса гепатита С у белоголовых орланов (Haliaeetus leucocephalus), национальной птицы США. Sci Rep 9(1):14953
  19. ^ Чу Л., Цзинь М., Фэн С., Ван Х., Чжан Д. (2019) Сильно дивергентный гепацивирусоподобный флавивирус у домашних уток. J Gen Virol
  20. ^ Ши, Манг; Линь, Сянь-Дань; Василакис, Никос; Тянь, Цзюнь-Хуа; Ли, Цы-Сю; Чэнь, Лян-Цзюнь; Иствуд, Джиллиан; Дяо, Сю-Нянь; Чэнь, Мин-Хуэй; Чэнь, Сяо; Цинь, Синь-Чэн; Уайден, Стивен Г; Вуд, Томас Г; Теш, Роберт Б; Сюй, Цзяньго; Холмс, Эдвард С; Чжан, Юн-Чжэнь (2016). «Дивергентные вирусы, обнаруженные у членистоногих и позвоночных, пересматривают эволюционную историю флавивирусов и родственных им вирусов». Журнал вирусологии . 90 (2): 659– 69. doi :10.1128/JVI.02036-15. PMC 4702705 . PMID  26491167. 
  21. ^ Уильямс SH, Леви A, Йейтс RA, Сомавира N, Невилл PJ, Николсон J, Линдсей MDA, Маккензи JS, Джейн K, Имри A, Смит DW, Липкин WI (2020) Открытие вируса Джогалонг, нового гепацивируса, идентифицированного у комара Culex annulirostris (Skuse) из региона Кимберли в Западной Австралии. PLoS One 15(1):e0227114
  • Отчет ICTV: Flaviviridae
  • Вирусная зона: Гепацивирус
  • База данных патогенов вирусов и аналитический ресурс (ViPR): Flaviviridae
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Hepacivirus&oldid=1216178011"