Гаммаретровирус | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область : | Рибовирус |
Королевство: | Параннавиры |
Тип: | Artverviricota |
Сорт: | Ревтравирицеты |
Заказ: | Ortervirales |
Семья: | Ретровирусы |
Подсемейство: | Орторетровирусы |
Род: | Гаммаретровирус |
Разновидность | |
|
Gammaretrovirus — род семейства Retroviridae . Примерами видов являются вирус лейкемии мышей и вирус лейкемии кошек . Они вызывают различные саркомы, лейкемии и иммунодефициты у млекопитающих, рептилий и птиц. [1]
Многие эндогенные ретровирусы , тесно связанные с экзогенными гаммаретровирусами, присутствуют в ДНК млекопитающих (включая людей), птиц, рептилий и амфибий. [2] Многие также имеют общий консервативный структурный элемент РНК, называемый сигналом инкапсидации ядра . [3]
Вирусы ретикулоэндотелиоза птиц не являются строго птичьими вирусами — по-видимому, вирусы ретикулоэндотелиоза являются вирусами млекопитающих, которые были случайно занесены в птиц в 1930-х годах во время исследований малярии. [4]
Как потенциальный вектор для генной терапии , гаммаретровирусы имеют некоторые преимущества перед ВИЧ как лентивирусным вектором . В частности, система упаковки гаммаретровирусов не требует включения каких-либо последовательностей, перекрывающихся с кодирующими последовательностями генов gag, pol или аксессуаров. [5]
Гаммаретровирусы имеют широкий спектр последствий для животных. Они были связаны с несколькими заболеваниями, включая рак, в частности лейкемии и лимфомы, различными неврологическими заболеваниями и некоторыми иммунодефицитами у многих различных видов. Гаммаретровирусы похожи на другие ретровирусы и осуществляют обратную транскрипцию положительной одноцепочечной РНК в двухцепочечную ДНК. Двухцепочечная ДНК очень стабильна и легко интегрируется в геном хозяина. Несколько примеров вируса - вирус лейкемии мышей Молони, ксенотропный вирус, связанный с MuLB, вирус лейкемии кошек и вирус саркомы кошек. [6] [7] [8]
Гаммаретровирусы являются очень популярными ретровирусными векторами в лабораторных исследованиях. Эти векторы имеют решающее значение для генной терапии и переноса генов. Причина, по которой они так полезны, заключается в том, что их геномы очень просты и удобны в использовании. Ретровирусы обладают способностью очень хорошо интегрироваться в геномы клеток-хозяев, что обеспечивает долгосрочную экспрессию их генома. Одним из специфических гаммаретровирусов, который обычно используется в качестве ретровирусного вектора, является вирус лейкемии мышей Молони. [7] [9]
Было обнаружено, что специфический гаммаретровирус, называемый ксенотропным вирусом, связанным с вирусом лейкемии мышей (XMRV), инфицирует ткань рака простаты в лабораториях. XMRV — это рекомбинантный вирус, обнаруженный случайно в результате рекомбинации между двумя эндогенными ретровирусами мышей исследователями рака простаты в середине 1990-х годов. Хотя он может инфицировать ткани человека, ни одно известное заболевание не связано с этой инфекцией [10] [11] [12] , и маловероятно, что он существует за пределами лабораторий. [13] Предполагаемое открытие XMRV в клетках крови пациентов с синдромом хронической усталости в 2009 году вызвало споры и в конечном итоге опровержение. [13] [14] Было более 50 линий клеток рака человека, которые, как утверждалось, были связаны с вирусом, связанным с вирусом лейкемии мышей, или вирусом лейкемии мышей. Также были заявлены открытия гаммаретровирусов мышей в линиях клеток рака легких. Хотя было неясно, какую роль эти вирусы играют в развитии рака, считалось, что они наиболее распространены на стадии развития опухоли, ингибируя гены, подавляющие опухоль. [8]
Гаммаретровирус является частью семейства ретровирусов . Гаммаретровирусы считаются зоонозными вирусами, поскольку они встречаются у многих различных видов млекопитающих, таких как мыши, кошки, свиньи, приматы, коровы и птицы. Однако летучие мыши являются основным резервуаром для многих гаммаретровирусов. Летучие мыши могут подвергаться длительному воздействию различных патогенов без проявления каких-либо предупреждающих признаков, что приводит к спорному мнению о том, что летучие мыши обладают способностью вырабатывать иммунитет к вирусам, которые могут нанести вред другим видам. Таким образом, летучие мыши могут быть носителями не только одного, но и нескольких типов гаммаретровирусов. Это утверждение подтверждается методом секвенирования транскриптомного профилирования и полимеразной цепной реакцией. Исследователи также изучили несколько различных видов летучих мышей, чтобы подтвердить утверждение о том, что летучие мыши являются основным резервуаром гаммаретровирусов. Гаммаретровирусы могут распространяться горизонтально, от животного к животному, или вертикально от родителя к потомству. [15]
Другой резервуар гаммаретровируса был обнаружен в геноме дельфина-афалина . Этот гаммаретровирус, называемый Tursiops truncates эндогенный ретровирус, как считалось, произошел от существующих эндогенных гаммаретровирусов млекопитающих. Первоначальное вторжение Tursiops truncates эндогенного ретровируса датируется примерно 10–19 миллионов лет назад и было идентифицировано в эндогенном гаммаретровирусе косатки, который вторгся более 3 миллионов лет назад. В 2009 году еще один эндогенный гаммаретровирус был обнаружен у вида косатки, а также в девяти других геномах китообразных. Таким образом, геномы гаммаретровируса присутствуют как у водных, так и у наземных видов млекопитающих. [16]
Гаммаретровирус — сферический, покрытый оболочкой вирион диаметром от 80 до 100 нм. Он содержит нуклеокапсид, обратную транскриптазу, интегразу, капсид, протеазу, оболочку и поверхностные единицы. Нуклеокапсид — это сборка белка нуклеиновой кислоты внутри вирусной частицы, это субструктура вириона. Обратная транскриптаза — это фермент, отвечающий за преобразование РНК в ДНК во время цикла репликации вириона. Интеграза работает с обратной транскриптазой для преобразования РНК в ДНК. Капсид — это белковая оболочка, которая окружает геном вирусной частицы, ее основные функции — защита и доставка генома в клетку-хозяина. Вирусная оболочка — это мембрана, которая окружает вирусный капсид, это липидный бислой, полученный из клетки-хозяина. [6] [17]
Геном гаммаретровируса представляет собой одноцепочечный РНК (+) геном размером приблизительно 8,3 кб. Он имеет 5' кэп с 3' поли-А хвостом и содержит две длинные концевые области повторения на обоих концах 5' и 3'. Эти длинные концевые области повторения имеют области U5, R и U3, а также полипуриновый тракт на 3' конце и сайт связывания праймера на 5' конце. Типичный геном гаммаретровируса содержит ген gag , ген pol и ген env . [6]
Гаммаретровирус будет действовать как паразит, используя клеточные факторы хозяина для доставки генома в ядро клетки хозяина, где он будет использовать клеточный аппарат для репликации вирусного генома и продолжения распространения по всему организму хозяина. Поскольку это одноцепочечная РНК(+) с промежуточным геномом ДНК, он имеет возможность копировать свой вирусный геном РНК непосредственно в мРНК. Вопреки центральной догме биологии, он также обратно транскрибирует свой геном РНК в ДНК. [17]
Вирион прикрепляется к рецепторам клетки-хозяина через гликопротеин SU, затем гликопротеин TM помогает в слиянии с клеточной мембраной. Затем вирус начнет снимать оболочку, и из одноцепочечной РНК(+) генома посредством обратной транскрипции образуется линейная двухцепочечная молекула ДНК. Фермент, отвечающий за обратную транскрипцию, — обратная транскриптаза . Ядерная мембрана хозяина разбирается во время митоза, и вирусная двухцепочечная ДНК может проникнуть в ядро хозяина. Затем вирусная двухцепочечная ДНК интегрируется в геном клетки-хозяина через вирусную интегразу, фермент, который обеспечивает интеграцию вирусной ДНК в ДНК хозяина. Теперь вирус называют провирусом , что означает, что ДНК гаммаретровируса интегрировалась в геном клетки-хозяина и теперь является матрицей для образования вирусной мРНК и геномной РНК. Двухцепочечная ДНК транскрибируется Pol II и будет производить как сплайсированные, так и несплайсированные нити РНК, эти сплайсированные нити РНК покинут ядро клетки-хозяина. Несплайсированная вирусная РНК-трансляция производит полипротеины env, gag и gag-pol. Env становится предшественником полипептида и будет расщепляться, чтобы произвести поверхность связывания рецептора. Затем вирион собирается в мембране клетки-хозяина, и геном вирусной РНК упаковывается. Вирионы отпочковываются от плазматической мембраны и высвобождаются в хозяина. После того, как вирионы высвобождаются из клеток-хозяев, процесс повторяется в следующей клетке, через которую проходит активная вирусная частица. [6] [17]
Вспышки гаммаретровируса распространены среди коал. Фактически, они были связаны с синдромом иммунодефицита коал (KIDS), который похож на синдром иммунодефицита человека. Синдром иммунодефицита коал влияет на иммунную систему различных популяций коал, делая их более склонными к заражению болезнями или диагностированию рака. Подобно ВИЧ, синдром иммунодефицита коал может передаваться потомству, а также другим коалам или видам животных. Вирус распространен среди коал, содержащихся в неволе. Фактически, в популяции коал, содержащихся в неволе в Квинсленде, 80% смертей связаны с гаммаретровирусами. Эта колония находится в состоянии повышенной готовности, поскольку их популяции коал могут исчезнуть в ближайшем будущем, исследователи обеспокоены тем, что в Квинсленде может вспыхнуть эпидемия. [18] [19]
Были обнаружены и предоставлены вакцины от различных гаммаретровирусов. В Намибии обитает самая большая популяция диких гепардов в мире, что делает ее жизненно важной для понимания биологии и естественного поведения этого вида. В июне 2002 года исследователи начали тестировать животных на наличие вируса лейкемии кошек, поскольку возникли опасения, что вирусная инфекция может вызвать серьезную проблему со здоровьем у популяции гепардов в Намибии. В ходе этого тестирования были собраны антитела для разработки вакцины против вируса лейкемии кошек. Эта вакцина оказалась успешной для намибийских гепардов, поскольку 86% вакцинированных гепардов дали положительный результат на антитела к вирусу лейкемии кошек. При таком высоком проценте вакцинации гепарды находятся в состоянии, когда вакцинированной популяции более чем достаточно, чтобы предотвратить вспышку гаммаретровируса, такого как вирус лейкемии кошек. [20]
Наряду с вакцинацией, ограничение хозяина гаммаретровирусов и других типов ретровирусов распространено среди животных. У многих хозяев есть ген, который блокирует цикл репликации ретровирусов, включая гаммаретровирус. Этот ген был обнаружен с использованием невирулентного белка вируса лейкемии мышей. Этот белок блокирует репликацию некоторых штаммов вируса лейкемии мышей после обратной транскрипции. Ограничение вируса зависит от взаимодействия белка и вторгающегося вируса. [ необходима цитата ]