Эмбековирус
| Эмбековирус | |
|---|---|
 | |
| Электронная микрофотография вириона мышиного коронавируса (MHV) , схематическая структура и геном. | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирус |
| Королевство: | Орторнавирусы |
| Тип: | Писувирикота |
| Сорт: | Пизонивирицеты |
| Заказ: | Нидовирусы |
| Семья: | Коронавирусы |
| Род: | бетакоронавирус |
| Подрод: | Эмбековирус |
| Виды [1] | |
Embecovirus — подрод коронавирусоврода Betacoronavirus . [1] Вирусы этого подрода, в отличие от других коронавирусов , имеют ген гемагглютининэстеразы (HE). [2] Вирусы этого подрода ранее были известны как коронавирусы группы 2a . [3] [ 4]
Структура
Вирусы этого подрода, как и другие коронавирусы, имеют липидную двухслойную оболочку , в которой закреплены структурные белки мембраны (M), оболочки (E) и шипа (S) . [5] В отличие от других коронавирусов, вирусы этого подрода также имеют дополнительный более короткий шиповидный структурный белок, называемый гемагглютининэстеразой (HE). [2] [6]
Рекомбинация
Генетическая рекомбинация может происходить, когда два или более вирусных генома присутствуют в одной и той же клетке-хозяине. Бета-коронавирус верблюда -дромадера (Beta-CoV HKU23) демонстрирует генетическое разнообразие в популяции африканских верблюдов . [7] Это разнообразие обусловлено несколькими событиями рекомбинации, которые имели место в прошлом между близкородственными Beta-CoV подрода Embecovirus. [7]
Смотрите также
- Сарбековирус (группа 2b)
- Мербековирус (группа 2с)
- Нобековирус (группа 2d)
Ссылки
- ^ ab "Virus Taxonomy: 2018 Release". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Октябрь 2018 г. Архивировано из оригинала 4 марта 2018 г. Получено 24 января 2019 г.
- ^ ab Woo, Patrick CY; Huang, Yi; Lau, Susanna KP; Yuen, Kwok-Yung (2010-08-24). "Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis". Viruses . 2 (8): 1804– 1820. doi : 10.3390/v2081803 . ISSN 1999-4915. PMC 3185738. PMID 21994708. У
всех членов подгруппы A Betacoronavirus ген гемагглютининэстеразы (HE), который кодирует гликопротеин с активностью нейраминовой О-ацетилэстеразы и активным сайтом FGDS, присутствует ниже ORF1ab и выше гена S (рисунок 1).
- ^ Woo, Patrick CY; Wang, Ming; Lau, Susanna KP; Xu, Huifang; Poon, Rosana WS; Guo, Rongtong; Wong, Beatrice HL; Gao, Kai; Tsoi, Hoi-wah; Huang, Yi; Li, Kenneth SM (февраль 2007 г.). «Сравнительный анализ двенадцати геномов трех новых коронавирусов группы 2c и группы 2d выявил уникальные особенности групп и подгрупп». Journal of Virology . 81 (4): 1574– 1585. doi :10.1128/JVI.02182-06. ISSN 0022-538X. PMC 1797546 . PMID 17121802.
См. рисунок 2.
- ^ Вонг, Антонио CP; Ли, Синь; Лау, Сюзанна КП; Ву, Патрик Сай (20 февраля 2019 г.). «Глобальная эпидемиология коронавирусов летучих мышей». Вирусы . 11 (2): 174. дои : 10.3390/v11020174 . ISSN 1999-4915. ПМК 6409556 . PMID 30791586.
CoV подразделяются на четыре рода: Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus и Deltacoronavirus. Внутри бетакоронавируса их можно подразделить на линии A, B, C и D [1]. В 2018 году эти четыре линии были переклассифицированы как подроды Betacoronavirus и переименованы в Embecovirus (предыдущая линия A), Sarbecovirus (предыдущая линия B), Merbecovirus (предыдущая линия C) и Nobecovirus (предыдущая линия D) [2]. Кроме того, был также включен пятый подрод, Hibecovirus (рисунок 1) [2].
- ^ Лай, Майкл MC; Каванаг, Дэвид (1997-01-01), Мараморош, Карл; Мерфи, Фредерик А.; Шаткин, Аарон Дж. (ред.), «Молекулярная биология коронавирусов; III. Структура вирионов; A. Морфология вирионов», Advances in Virus Research , 48 , Academic Press: 5– 6, doi :10.1016/S0065-3527(08)60286-9, PMC 7130985 , PMID 9233431
- ^ Woo, Patrick CY; Huang, Yi; Lau, Susanna KP; Yuen, Kwok-Yung (2010-08-24). «Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis». Viruses . 2 (8): 1804–1820 . doi : 10.3390/v2081803 . ISSN 1999-4915. PMC 3185738. PMID 21994708. Наличие
генов HE исключительно у членов подгруппы Betacoronavirus A, но не у членов подгрупп Betacoronavirus B, C и D предполагает, что рекомбинация, вероятно, произошла у предка членов подгруппы Betacoronavirus A после расхождения с предком других подгрупп Betacoronavirus.
- ^ ab Разнообразие коронавируса верблюда-дромадера HKU23 у африканских верблюдов выявило множественные события рекомбинации среди близкородственных бетакоронавирусов подрода Embecovirus. So RTY, et al. J Virol. 2019. PMID 31534035
