Хризеобактерии

Хризеобактерии
Бактерии Chryseobacterium oleae DSM25575, выращенные на твердой среде LB
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Бактероидота
Сорт:	Флавобактерии
Заказ:	Флавобактерии
Семья:	Weeksellaceae
Род:	Chryseobacterium Vandamme и др . 1994
Разновидность
См. текст
Синонимы [1]
Халперния Николсон и др . 2020 г. Эпилитонимонас О'Салливан и др . 2006 Planobacterium Пэн и др. 2009 Сунвуа Йонг и др . 2010 Кайстелла Ким и др . 2004 г. Седжонгия Йи и др . 2005 г.

Chryseobacterium — род грамотрицательных бактерий . Виды Chryseobacterium — хемоорганотрофные, палочковидные грамотрицательные бактерии. Chryseobacterium образуют типичные желто-оранжевые колонии из-за пигмента типа флексирубина. Род содержит более 100 описанных видов из различных мест обитания, включая пресноводные источники, почву, морских рыб и людей-хозяев. ^[2]

Род Chryseobacterium был первоначально создан в 1994 году Вандамом и др . ^[3] для шести бактериальных таксонов, которые в то время классифицировались как члены рода Flavobacterium : F. balustinum , F. indologenes , F. gleum , F. meningosepticum , F. indoltheticum и F. scophthalmum . В 2005 году был создан дополнительный род Elizabethkingia для двух видов в пределах рода Chryseobacterium , а именно, C. meningosepticum и C. miricola. ^[4] В 2002 году стандарты и руководства по описанию новых таксонов в семействе Flavobacteriaceae были опубликованы Бернарде и др. ^[5] К 2006 году род Chryseobacterium расширился до 10 видов, к 2014 году — более чем до 60 видов ^[6] и в настоящее время их число превышает 100.

Chryseobacterium spp. были извлечены из почв, корней растений, цветов, гниющего растительного материала и кленового сока. Некоторые штаммы Chryseobacterium , связанные с растениями , способны подавлять патогенные грибы растений. Chryseobacterium spp. были также извлечены из пресноводных ручьев, озер, их отложений, систем охлаждения воды, питьевой воды, молочнокислых напитков, заводов по розливу пива, ила биореакторов, загрязненной почвы, морских отложений и вечной мерзлоты . ^[6] Chryseobacterium spp. связаны со множеством животных - они были обнаружены в средней кишке комаров, в кишечнике тараканов, фекалиях многоножек и гуано пингвинов, гомогенатах кишечника пресноводных веслоногих рачков, перьях птиц, коровьем молоке, сыром мясе и курице. Chryseobacterium spp. были извлечены из слизи, казалось бы, здоровой рыбы, однако иногда их считают организмом, вызывающим порчу. ^[6] Три новых устойчивых к холоду вида Chryseobacterium , C. oranimense , C. haifense и C. bovis , были обнаружены в сыром молоке в Израиле. ^[7]

Наиболее патогенный Flavobacterium spp., Chryseobacterium meningosepticum , вызывающий многочисленные инфекции, был переклассифицирован в род Elizabethkingia . ^[4] Chryseobacterium indologenes, хотя и повсеместно распространен в природе, в основном встречается в почве и воде, является редким человеческим патогеном. Однако в редких случаях он может вызывать серьезные инфекции, особенно среди людей с ослабленным иммунитетом. ^[8] В большинстве случаев инфекции приобретаются в больнице, часто связаны с иммуносупрессией или постоянными катетерами. Сообщалось, что он является возбудителем бактериемии , перитонита , пневмонии , эмпиемы , пиелонефрита , цистита , менингита и инфекций, связанных с центральным венозным катетером. Число зарегистрированных случаев заражения C. indologenes растет. Большинство зарегистрированных случаев заражения было зарегистрировано на Тайване, и только около 10% — за пределами Азии. Несколько сообщений поступило из Австралии, Индии, Европы и США. ^[8] C. indologenes также патогенен для мягкого клеща, тогда как другие виды Chryseobacterium spp. были обнаружены у больных черепах, лягушек и рыб, в частности C. scophthalmum, C. joostei, C. piscicola, C. chaponense, C. viscerum и C. oncorhynchi, C. aahli, C. hominis, C. shigense, а также C. indologenes , который связан с заболеваниями человека. ^[6]

Сообщалось, что некоторые виды Chryseobacterium обладают необычными свойствами переваривания матрицы, способными разрушать самые сложные коллагеновые матрицы, такие как перья или экзоскелеты. Эти свойства, вероятно, опосредованы действием специфических хитиназ и коллагеназоподобных металлопротеаз . Было показано, что некоторые виды, такие как Chryseobacterium nematophagum , способны инфицировать, убивать и в конечном итоге потреблять все ткани нематод, включая обычно крайне нерастворимый кутикулярный экзоскелет. [ ^9] Активность хитиназы, желатиназы и коллагеназы металлопротеазы связана со скользящей подвижностью Chryseobacterium , осуществляемой через системы секреции типа IX. Действительно, некоторые из этих ферментов обладают С-концевыми сигналами секреции типа IX. ^{[10] Сами} Chryseobacterium не имеют ни коллагеновых, ни хитиновых белков или структур. Вид Chryseobacterium принадлежит к типу Bacteriodetes , представители которого все чаще описываются как имеющие необычно связанную подвижность и секреторную систему. ^{[9] [10]}

Токсины, подобные нейротоксину ботулина (BoNT-подобные), были обнаружены в геноме Chryseobacterium piperi str. CTM, и они представляют собой весьма дивергентную группу токсинов, подобных BoNT. Один из предсказанных токсинов, подобных BoNT C. piperi, вызывал некротическую гибель клеток в клетках почек человека, но не расщеплял общие субстраты SNARE BoNT. ^[11]

Chryseobacterium spp. по своей природе устойчивы к широкому спектру антибиотиков , включая тетрациклины , эритромицин , линезолид , полимиксины , аминогликозиды , хлорамфеникол и многие бета-лактамы , а также обладают промежуточной чувствительностью к ванкомицину и клиндамицину и различаются по чувствительности к триметоприму-сульфаметоксазолу . ^[6]

Виды включают: ^[1]