Звонок MDL

Звонок MDL
Оригинальный автор(ы)	Эльзевир
Разработчик(и)	Технологии Symyx
Первоначальный выпуск	1996 (0.9 Beta) 1997 (1.0 Полная версия) (1996); (1997)
Стабильный релиз	2.6 SP7 / 31 июля 2007 г .; 17 лет назад (2007-07-31)
Операционная система	Классическая Mac OS , Microsoft Windows
Платформа	Internet Explorer , Mozilla Firefox
Веб-сайт	http://accelrys.com/products/collaborative-science/biovia-discovery-studio/

Плагин, используемый веб-браузерами для отображения трехмерной структуры молекул.

MDL Chime — бесплатный плагин , используемый веб-браузерами для отображения трехмерных структур молекул . ^[2] Он был основан на коде RasMol . ^[3]

Плагин

Chime использовался широким кругом биохимических веб-сайтов для визуализации макромолекул , многие из которых были связаны с мировым индексом ресурсов молекулярной визуализации MolVisIndex.Org. Chime также использовался до 2006 года в Protein Data Bank (PDB) для изучения структур, хранящихся там.

Хотя Chime был доступен в 1996 году как в Windows 95 , так и в классических версиях Mac OS для браузеров Netscape и Internet Explorer , разработка Chime не последовала за переходом на Mac OS X для Mac, а поддержка браузеров на базе Windows, отличных от Internet Explorer, была ограничена (хотя он хорошо работает в Mozilla Firefox ). Одной из важных функций, добавленных в 1997 году, была возможность отображать спектроскопические данные в форме протоколов IUPAC JCAMP-DX. Помимо этого, большинство последующих обновлений были направлены на то, чтобы установочный пакет следовал за развитием Windows и Internet Explorer. Accelrys объявила в 2012 году, что Chime больше не поддерживается и будет оставаться доступной для загрузки до конца 2012 года. ^[4] Chime был частью линейки продуктов ISIS, приобретенной Symyx Technologies у научного издателя Elsevier в октябре 2007 года. Теперь Chime принадлежит Dassault Systemes BIOVIA (ранее Accelrys) и был объединен с Discovery Studio , но больше не существует как бесплатный плагин для браузера.

Chime в значительной степени был вытеснен Jmol [ ^{5] —} непатентованным Java-приложением с открытым исходным кодом для молекулярной визуализации и JavaScript-апплетом, который сохранил большую часть совместимости с командами Chime, добавив при этом многочисленные функции.

Смотрите также

Ссылки

^ «История версий Chime».
^ Дорланд, Лиз (2002). «Новости из Интернета: что нового в Chime?». J. Chem. Educ. 79 (7): 778. Bibcode :2002JChEd..79..778D. doi :10.1021/ed079p778.
^ Ходжсон, Джон (1996). «GlaxoWellcome и MDL запутались в сети». Nature Biotechnology . 14 (6): 690. doi : 10.1038/nbt0696-690 . S2CID 32321207.
^ CHIME - No Fee, архивировано из оригинала 2012-04-24
^ Herráez, A (2006), «Биомолекулы в компьютере: Jmol спешит на помощь», Biochemistry and Molecular Biology Education , 34 (4): 255–61, doi : 10.1002/bmb.2006.494034042644 , PMID 21638687, S2CID 36319720

Внешние ссылки

Скриншот Chime в действии.
Звонок Акселриса
Chime Download ^{[ постоянная мертвая ссылка ‍ ]}
Банк данных белков RCSB
MolviZ.Org: Ресурсы молекулярной визуализации с богатой коллекцией молекул
Страницы CHIME и Jmol Дублинского городского университета

[1] «История версий Chime».

[2] Дорланд, Лиз (2002). «Новости из Интернета: что нового в Chime?». J. Chem. Educ. 79 (7): 778. Bibcode :2002JChEd..79..778D. doi :10.1021/ed079p778.

[3] Ходжсон, Джон (1996). «GlaxoWellcome и MDL запутались в сети». Nature Biotechnology . 14 (6): 690. doi : 10.1038/nbt0696-690 . S2CID 32321207.

[4] CHIME - No Fee, архивировано из оригинала 2012-04-24

[Herraez2006-5] Herráez, A (2006), «Биомолекулы в компьютере: Jmol спешит на помощь», Biochemistry and Molecular Biology Education , 34 (4): 255–61, doi : 10.1002/bmb.2006.494034042644 , PMID 21638687, S2CID 36319720