Лидер SPEF

лидер spef
лидер spef
	Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности speF
Идентификаторы
Символ	спеФ
Рфам	РФ00518
Другие данные
Тип РНК	Цис-рег; лидер
Домены	Бактерии
ТАК	SO:0005836
Структуры PDB	ПДБе

Цис-действующий элемент

РНК-семейство

SpeF — предполагаемый цис -действующий элемент, идентифицированный в нескольких грамотрицательных альфа-протеобактериях. Предполагается, что он участвует в регуляции экспрессии генов, вовлеченных в биосинтез полиамида .

SpeF — один из пяти предполагаемых регуляторных элементов, идентифицированных с помощью вычислительного скрининга геномов Agrobacterium tumefaciens и других альфа-протеобактерий для консервативных мотивов последовательности в лидерах оперона . ^[1] У большинства проанализированных видов он расположен в лидере оперона, содержащего ген speF, фермент орнитиндекарбоксилазы , который катализирует один из первых этапов биосинтеза полиаминов . Однако авторы не обнаружили связывания метаболитов, связанных с этим путем ( L-орнитин , L-лизин , мезо-диаминопимелат, путресцин , кадаверин или спермидин ), с лидером SpeF. ^[1]

Другие некодирующие РНК, обнаруженные в том же анализе, включают: suhB , ybhL , metA и serC. ^[1]

Ссылки

^ abc Corbino KA, Barrick JE, Lim J, et al. (2005). "Доказательства второго класса S-аденозилметиониновых рибопереключателей и других регуляторных мотивов РНК у альфа-протеобактерий". Genome Biol . 6 (8): R70. doi : 10.1186/gb-2005-6-8-r70 . PMC 1273637. PMID 16086852 .

Внешние ссылки

Страница лидера speF в Rfam

Эта статья по молекулярной или клеточной биологии — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[Cor05-1] Corbino KA, Barrick JE, Lim J, et al. (2005). "Доказательства второго класса S-аденозилметиониновых рибопереключателей и других регуляторных мотивов РНК у альфа-протеобактерий". Genome Biol . 6 (8): R70. doi : 10.1186/gb-2005-6-8-r70 . PMC 1273637. PMID 16086852 .