СРПК1

СРПК1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1WAK, 1WBP, 3BEG, 4WUA
Идентификаторы
Псевдонимы	SRPK1 , SFRSK1, протеинкиназа 1 SRSF
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 601939; МГИ : 106908; гомологен : 110962; Генные карты : СРПК1; ОМА :СРПК1 - ортологи
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 17 (мышь)
Конец	28,841,683 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	сперма; ; трабекулярная кость; ; костный мозг; ; вторичный ооцит; ; эндотелиальная клетка; ; кровь; ; клетки костного мозга; ; человеческий пенис; ; прямая кишка; ; тимус;
	Верх выражен в
	хвост эмбриона; ; генитальный бугорок; ; морула; ; вторичный ооцит; ; сперматид; ; зигота; ; сперматоцит; ; первичный ооцит; ; примитивная черта; ; семенной каналец;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	трансферазная активность; активность протеинкиназы; связывание нуклеотидов; активность киназы; активность протеин серин/треонин киназы; связывание белков; Связывание АТФ; связывание ионов магния; Связывание РНК;
Клеточный компонент	цитоплазма; внутриклеточная мембранно-связанная органелла; ядерная матрица; плазматическая мембрана; эндоплазматический ретикулум; ядро; цитозоль;
Биологический процесс	дифференциация клеток; внутриклеточная передача сигнала; фосфорилирование; регуляция процессинга мРНК; расхождение хромосом; процессинг мРНК; регуляция сплайсинга мРНК через сплайсосому; фосфорилирование белков; негативная регуляция репликации вирусного генома; Сплайсинг РНК; позитивная регуляция репликации вирусного генома; врожденный иммунный ответ; вирусный процесс; конденсация ДНК сперматозоидов; сборка сплайсосомного комплекса; регуляция экспрессии генов;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	6732
	20815
	н/д
	ENSMUSG00000004865
	Q96SB4
	О70551
	NM_003137
	NM_016795
	NP_003128
	NP_058075
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Фактор сплайсинга, богатый серином/аргинином (SRSF), протеинкиназа-1 SRPK1 — это фермент , который у людей кодируется геном SRPK1 . ^[4]^[5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует серин/аргининовую протеинкиназу, специфичную для семейства факторов сплайсинга SR (домен, богатый серином/аргинином). Белок локализуется в ядре и цитоплазме. Считается, что он играет роль в регуляции как конститутивного, так и альтернативного сплайсинга, регулируя внутриклеточную локализацию факторов сплайсинга. Описан второй вариант альтернативно сплайсированного транскрипта для этого гена, но его полная длина не определена. ^[6]

SRPK1 обеспечивает ангиогенез , который регулируется VEGF, который либо инициирует, либо ингибирует образование сосудов в зависимости от альтернативного сплайсинга.

Медицинские приложения

Некоторые виды рака зависят от фактора роста эндотелия сосудов (VEGF) (для ангиогенеза ). SRPK1 активирует (фосфорилирует) фактор сплайсинга VEGF. Ингибиторы SRPK1 (например, «соединения SPHINX» ^[7] ) исследуются в качестве методов лечения рака предстательной железы, острого миелоидного лейкоза и неоваскулярного заболевания глаз. ^[8]^[9]^[10]^[11]

Взаимодействия

Было показано, что SRPK1 взаимодействует с:

АЧС/СФ2 ^[12]^[13]^[14]^[15] и
SNRP70 . ^[12]^[16]
C6orf201 ^[17]

Ссылки

^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000004865 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Gui JF, Lane WS, Fu XD (июль 1994). «Сериновая киназа регулирует внутриклеточную локализацию факторов сплайсинга в клеточном цикле». Nature . 369 (6482): 678–82. Bibcode :1994Natur.369..678G. doi :10.1038/369678a0. PMID 8208298. S2CID 4275539.
^ Wang HY, Arden KC, Bermingham JR, Viars CS, Lin W, Boyer AD, Fu XD (май 1999). «Локализация сериновых киназ, SRPK1 (SFRSK1) и SRPK2 (SFRSK2), специфичных для семейства факторов сплайсинга SR в мышиных и человеческих хромосомах». Genomics . 57 (2): 310–5. doi :10.1006/geno.1999.5770. PMID 10198174.
^ ab "Ген Entrez: SRPK1 SFRS протеинкиназа 1".
^ «Разработка новых антиангиогенных ингибиторов SRPK1» (PDF) .
^ «Молекулярный прорыв может остановить распространение рака простаты». ScienceDaily .
^ Mavrou A, Brakspear K, Hamdollah-Zadeh M, Damodaran G, Babaei-Jadidi R, Oxley J, Gillatt DA, Ladomery MR, Harper SJ, Bates DO, Oltean S (2014). «Ингибирование серин-аргининовой протеинкиназы 1 (SRPK1) как потенциальная новая целевая терапевтическая стратегия при раке простаты». Oncogene . 34 (33): 4311–9. doi :10.1038/onc.2014.360. PMC 4351909 . PMID 25381816.
^ Batson, Jennifer; Toop, Hamish D.; Redondo, Clara; Babaei-Jadidi, Roya; Chaikuad, Apirat; Wearmouth, Stephen F.; Gibbons, Brian; Allen, Claire; Tallant, Cynthia (17 марта 2017 г.). «Разработка эффективных селективных ингибиторов SRPK1 в качестве потенциальных местных терапевтических средств для неоваскулярных заболеваний глаз». ACS Chemical Biology . 12 (3): 825–832. doi : 10.1021/acschembio.6b01048 . hdl : 1983/805bd6f0-5220-4592-a3d2-9a58543c0bd9 . ISSN 1554-8937. PMID 28135068.
^ Василиу, Джордж С.; Кузаридес, Тони; Юса, Косуке; Бейтс, Дэвид О.; Джеремиас, Ирмела; Брэдли, Аллан; Пина, Кристина; Моррис, Джонатан К.; Батсон, Дженнифер (19.12.2018). "SRPK1 поддерживает острый миелоидный лейкоз посредством воздействия на использование изоформ эпигенетических регуляторов, включая BRD4". Nature Communications . 9 (1): 5378. Bibcode :2018NatCo...9.5378T. doi :10.1038/s41467-018-07620-0. ISSN 2041-1723. PMC 6300607 . PMID 30568163.
^ ab Wang HY, Lin W, Dyck JA, Yeakley JM, Songyang Z, Cantley LC, Fu XD (февраль 1998 г.). "SRPK2: дифференциально экспрессируемая специфическая к белку SR киназа, участвующая в опосредовании взаимодействия и локализации факторов сплайсинга пре-мРНК в клетках млекопитающих". J. Cell Biol . 140 (4): 737–50. doi :10.1083/jcb.140.4.737. PMC 2141757. PMID 9472028 .
^ Lukasiewicz R, Velazquez-Dones A, Huynh N, Hagopian J, Fu XD, Adams J, Ghosh G (август 2007 г.). «Структурно уникальные дрожжевые и млекопитающие серин-аргининовые протеинкиназы катализируют эволюционно консервативные реакции фосфорилирования». J. Biol. Chem . 282 (32): 23036–43. doi : 10.1074/jbc.M611305200 . PMID 17517895.
^ Умехара Х, Нишии Ю, Моришима М, Какехи Ю, Киока Н, Амачи Т, Коидзуми Дж, Хагивара М, Уэда К (февраль 2003 г.). «Влияние лечения цисплатином на пятнистое распределение богатого серином/аргинином ядерного белка CROP/Luc7A». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 301 (2): 324–9. дои : 10.1016/s0006-291x(02)03017-6. ПМИД 12565863.
^ Koizumi J, Okamoto Y, Onogi H, Mayeda A, Krainer AR, Hagiwara M (апрель 1999 г.). «Субклеточная локализация SF2/ASF регулируется прямым взаимодействием с протеинкиназами SR (SRPK)». J. Biol. Chem . 274 (16): 11125–31. doi : 10.1074/jbc.274.16.11125 . PMID 10196197.
^ Kamachi M, Le TM, Kim SJ, Geiger ME, Anderson P, Utz PJ (ноябрь 2002 г.). «Человеческие аутоиммунные сыворотки как молекулярные зонды для идентификации сигнального пути аутоантигенкиназы». J. Exp. Med . 196 (9): 1213–25. doi :10.1084/jem.20021167. PMC 2194102. PMID 12417631 .
^ Варьосало, Маркку; Кескитало, Салла; Ван Дроген, Одри; Нурккала, Хелка; Вичалковский, Антон; Эберсольд, Руди; Гстайгер, Матиас (апрель 2013 г.). «Пейзаж белкового взаимодействия группы киназ CMGC человека». Отчеты по ячейкам . 3 (4): 1306–1320. дои : 10.1016/j.celrep.2013.03.027 . hdl : 20.500.11850/70524 . ПМИД 23602568.

Дальнейшее чтение

Colwill K, Feng LL, Yeakley JM, Gish GD, Cáceres JF, Pawson T, Fu XD (1996). "Протеинкиназы SRPK1 и Clk/Sty демонстрируют различную субстратную специфичность для факторов сплайсинга, богатых серином/аргинином". J. Biol. Chem . 271 (40): 24569–75. doi : 10.1074/jbc.271.40.24569 . PMID 8798720.
Wang HY, Lin W, Dyck JA, Yeakley JM, Songyang Z, Cantley LC, Fu XD (1998). "SRPK2: Дифференциально экспрессируемая специфическая к белку SR киназа, участвующая в опосредовании взаимодействия и локализации факторов сплайсинга пре-мРНК в клетках млекопитающих". J. Cell Biol . 140 (4): 737–50. doi :10.1083/jcb.140.4.737. PMC 2141757. PMID 9472028 .
Папусопулу С., Николакаки Э., Джаннакоурос Т. (1999). «Протеинкиназы SRPK1 и LBR обладают одинаковой субстратной специфичностью». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 255 (3): 602–7. дои : 10.1006/bbrc.1999.0249. ПМИД 10049757.
Koizumi J, Okamoto Y, Onogi H, Mayeda A, Krainer AR, Hagiwara M (1999). «Субклеточная локализация SF2/ASF регулируется прямым взаимодействием с SR-протеинкиназами (SRPK)». J. Biol. Chem . 274 (16): 11125–31. doi : 10.1074/jbc.274.16.11125 . PMID 10196197.
Paillard F (1999). «Новая растворимая химера для лечения семейной гиперхолестеринемии». Hum. Gene Ther . 10 (7): 1093–4. doi :10.1089/10430349950018085. PMID 10340541.
Papoutsopoulou S, Nikolakaki E, Chalepakis G, Kruft V, Chevaillier P, Giannakouros T (1999). "SR-протеин-специфическая киназа 1 высоко экспрессируется в яичках и фосфорилирует протамин 1". Nucleic Acids Res . 27 (14): 2972–80. doi :10.1093/nar/27.14.2972. PMC 148514. PMID 10390541 .
Nikolakaki E, Kohen R, Hartmann AM, Stamm S, Georgatsou E, Giannakouros T (2001). «Клонирование и характеристика альтернативно сплайсированной формы SR-протеинкиназы 1, которая специфически взаимодействует с фактором прикрепления каркаса-B». J. Biol. Chem . 276 (43): 40175–82. doi : 10.1074/jbc.M104755200 . PMID 11509566.
Daub H, Blencke S, Habenberger P, Kurtenbach A, Dennenmoser J, Wissing J, Ullrich A, Cotten M (2002). «Идентификация SRPK1 и SRPK2 как основных клеточных протеинкиназ, фосфорилирующих основной белок вируса гепатита B». J. Virol . 76 (16): 8124–37. doi :10.1128/JVI.76.16.8124-8137.2002. PMC 155132 . PMID 12134018.
Kamachi M, Le TM, Kim SJ, Geiger ME, Anderson P, Utz PJ (2003). «Человеческие аутоиммунные сыворотки как молекулярные зонды для идентификации сигнального пути аутоантигенкиназы». J. Exp. Med . 196 (9): 1213–25. doi :10.1084/jem.20021167. PMC 2194102. PMID 12417631 .
Mylonis I, Giannakouros T (2003). «Протеинкиназа CK2 фосфорилирует и активирует специфическую для белка SR киназу 1». Biochem. Biophys. Res. Commun . 301 (3): 650–6. doi :10.1016/S0006-291X(02)03055-3. PMID 12565829.
Aubol BE, Chakrabarti S, Ngo J, Shaffer J, Nolen B, Fu XD, Ghosh G, Adams JA (2004). "Процессивное фосфорилирование альтернативного фактора сплайсинга/фактора сплайсинга 2". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (22): 12601–6. Bibcode :2003PNAS..10012601A. doi : 10.1073/pnas.1635129100 . PMC 240664 . PMID 14555757.
Li J, Hawkins IC, Harvey CD, Jennings JL, Link AJ, Patton JG (2003). «Регулирование альтернативного сплайсинга с помощью SRrp86 и его взаимодействующих белков». Mol. Cell. Biol . 23 (21): 7437–47. doi :10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC 207616. PMID 14559993 .
Mylonis I, Drosou V, Brancorsini S, Nikolakaki E, Sassone-Corsi P, Giannakouros T (2004). «Временная ассоциация протамина 1 с рецептором белка внутренней ядерной мембраны ламина B во время спермиогенеза». J. Biol. Chem . 279 (12): 11626–31. doi : 10.1074/jbc.M311949200 . PMID 14701833.
Lee CG, Hague LK, Li H, Donnelly R (2004). «Идентификация топосомы, нового многосубъединичного комплекса, содержащего топоизомеразу IIальфа». Cell Cycle . 3 (5): 638–47. doi : 10.4161/cc.3.5.825 . PMID 15034300.
Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (2004). "Протеомный, функциональный и основанный на доменах анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации". Curr. Biol . 14 (16): 1436–50. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660. S2CID 2371325.

[refGRCm38Ensembl-1] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000004865 – Ensembl , май 2017 г.

[2] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8208298-4] Gui JF, Lane WS, Fu XD (июль 1994). «Сериновая киназа регулирует внутриклеточную локализацию факторов сплайсинга в клеточном цикле». Nature . 369 (6482): 678–82. Bibcode :1994Natur.369..678G. doi :10.1038/369678a0. PMID 8208298. S2CID 4275539.

[pmid10198174-5] Wang HY, Arden KC, Bermingham JR, Viars CS, Lin W, Boyer AD, Fu XD (май 1999). «Локализация сериновых киназ, SRPK1 (SFRSK1) и SRPK2 (SFRSK2), специфичных для семейства факторов сплайсинга SR в мышиных и человеческих хромосомах». Genomics . 57 (2): 310–5. doi :10.1006/geno.1999.5770. PMID 10198174.

[entrez-6] "Ген Entrez: SRPK1 SFRS протеинкиназа 1".

[7] «Разработка новых антиангиогенных ингибиторов SRPK1» (PDF) .

[8] «Молекулярный прорыв может остановить распространение рака простаты». ScienceDaily .

[Mavrou2014-9] Mavrou A, Brakspear K, Hamdollah-Zadeh M, Damodaran G, Babaei-Jadidi R, Oxley J, Gillatt DA, Ladomery MR, Harper SJ, Bates DO, Oltean S (2014). «Ингибирование серин-аргининовой протеинкиназы 1 (SRPK1) как потенциальная новая целевая терапевтическая стратегия при раке простаты». Oncogene . 34 (33): 4311–9. doi :10.1038/onc.2014.360. PMC 4351909 . PMID 25381816.

[10] Batson, Jennifer; Toop, Hamish D.; Redondo, Clara; Babaei-Jadidi, Roya; Chaikuad, Apirat; Wearmouth, Stephen F.; Gibbons, Brian; Allen, Claire; Tallant, Cynthia (17 марта 2017 г.). «Разработка эффективных селективных ингибиторов SRPK1 в качестве потенциальных местных терапевтических средств для неоваскулярных заболеваний глаз». ACS Chemical Biology . 12 (3): 825–832. doi : 10.1021/acschembio.6b01048 . hdl : 1983/805bd6f0-5220-4592-a3d2-9a58543c0bd9 . ISSN 1554-8937. PMID 28135068.

[11] Василиу, Джордж С.; Кузаридес, Тони; Юса, Косуке; Бейтс, Дэвид О.; Джеремиас, Ирмела; Брэдли, Аллан; Пина, Кристина; Моррис, Джонатан К.; Батсон, Дженнифер (19.12.2018). "SRPK1 поддерживает острый миелоидный лейкоз посредством воздействия на использование изоформ эпигенетических регуляторов, включая BRD4". Nature Communications . 9 (1): 5378. Bibcode :2018NatCo...9.5378T. doi :10.1038/s41467-018-07620-0. ISSN 2041-1723. PMC 6300607 . PMID 30568163.

[pmid9472028-12] Wang HY, Lin W, Dyck JA, Yeakley JM, Songyang Z, Cantley LC, Fu XD (февраль 1998 г.). "SRPK2: дифференциально экспрессируемая специфическая к белку SR киназа, участвующая в опосредовании взаимодействия и локализации факторов сплайсинга пре-мРНК в клетках млекопитающих". J. Cell Biol . 140 (4): 737–50. doi :10.1083/jcb.140.4.737. PMC 2141757. PMID 9472028 .

[pmid17517895-13] Lukasiewicz R, Velazquez-Dones A, Huynh N, Hagopian J, Fu XD, Adams J, Ghosh G (август 2007 г.). «Структурно уникальные дрожжевые и млекопитающие серин-аргининовые протеинкиназы катализируют эволюционно консервативные реакции фосфорилирования». J. Biol. Chem . 282 (32): 23036–43. doi : 10.1074/jbc.M611305200 . PMID 17517895.

[pmid12565863-14] Умехара Х, Нишии Ю, Моришима М, Какехи Ю, Киока Н, Амачи Т, Коидзуми Дж, Хагивара М, Уэда К (февраль 2003 г.). «Влияние лечения цисплатином на пятнистое распределение богатого серином/аргинином ядерного белка CROP/Luc7A». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 301 (2): 324–9. дои : 10.1016/s0006-291x(02)03017-6. ПМИД 12565863.

[pmid10196197-15] Koizumi J, Okamoto Y, Onogi H, Mayeda A, Krainer AR, Hagiwara M (апрель 1999 г.). «Субклеточная локализация SF2/ASF регулируется прямым взаимодействием с протеинкиназами SR (SRPK)». J. Biol. Chem . 274 (16): 11125–31. doi : 10.1074/jbc.274.16.11125 . PMID 10196197.

[pmid12417631-16] Kamachi M, Le TM, Kim SJ, Geiger ME, Anderson P, Utz PJ (ноябрь 2002 г.). «Человеческие аутоиммунные сыворотки как молекулярные зонды для идентификации сигнального пути аутоантигенкиназы». J. Exp. Med . 196 (9): 1213–25. doi :10.1084/jem.20021167. PMC 2194102. PMID 12417631 .

[17] Варьосало, Маркку; Кескитало, Салла; Ван Дроген, Одри; Нурккала, Хелка; Вичалковский, Антон; Эберсольд, Руди; Гстайгер, Матиас (апрель 2013 г.). «Пейзаж белкового взаимодействия группы киназ CMGC человека». Отчеты по ячейкам . 3 (4): 1306–1320. дои : 10.1016/j.celrep.2013.03.027 . hdl : 20.500.11850/70524 . ПМИД 23602568.