snRNP70
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
SNRNP70
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSNRNP70 , RNPU1Z, RPU1, SNRP70, Snp1, U1-70K, U170K, U1AP, U1RNP, SnRNP70, субъединица 70 малого ядерного рибонуклеопротеина U1
Внешние идентификаторыОМИМ : 180740; МГИ : 98341; гомологен : 20672; GeneCards : SNRNP70; OMA :SNRNP70 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

6625

20637

Ансамбль

ENSG00000104852

ENSMUSG00000063511

UniProt

Р08621

Q62376

РефСек (мРНК)

НМ_001009820
НМ_001301069
НМ_003089

NM_009224

RefSeq (белок)

NP_001287998
NP_003080

NP_033250

Местоположение (UCSC)Хр 19: 49.09 – 49.11 МбХр 7: 45.03 – 45.05 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

snRNP70, также известный как U1 малый ядерный рибонуклеопротеин 70 кДа, представляет собой белок [5] , который у людей кодируется геном SNRNP70 . [ 6] [7] snRNP70 представляет собой малый ядерный рибонуклеопротеин , который ассоциируется с U1 сплайсосомной РНК , образуя U1snRNP — основной компонент сплайсосомы . Белок U1-70K и другие компоненты комплекса сплайсосомы образуют нерастворимые в детергентах агрегаты как в спорадических, так и в семейных случаях болезни Альцгеймера у людей . [8] [9] U1-70K локализуется совместно с тау в нейрофибриллярных клубках при болезни Альцгеймера .

Взаимодействия

Было показано, что snRNP70 взаимодействует с ASF/SF2 , [10] [11] SRPK1 , [12] [13] и ZRANB2 . [14]

Роль в аутоиммунитете

Антитела к snRNP70 связаны со смешанным заболеванием соединительной ткани . [15]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000104852 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000063511 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Spritz RA, Strunk K, Surowy CS, Hoch SO, Barton DE, Francke U (декабрь 1987 г.). "Человеческий белок snRNP U1-70K: клонирование кДНК, локализация в хромосомах, экспрессия, альтернативный сплайсинг и связывание РНК". Nucleic Acids Research . 15 (24): 10373– 91. doi :10.1093/nar/15.24.10373. PMC 339950. PMID  2447561 . 
  6. ^ "Ген Энтреза: полипептид малого ядерного рибонуклеопротеина SNRP70 массой 70 кДа (антиген РНП)".
  7. ^ Spritz RA, Strunk K, Surowy CS, Mohrenweiser HW (октябрь 1990 г.). "Ген антигена рибонуклеопротеина U1-70K человека: организация, нуклеотидная последовательность и сопоставление с локусом 19q13.3". Genomics . 8 (2): 371– 9. doi :10.1016/0888-7543(90)90295-6. PMID  2147422.
  8. ^ Diner I, Hales CM, Bishof I, Rabenold L, Duong DM, Yi H, Laur O, Gearing M, Troncoso J, Thambisetty M, Lah JJ, Levey AI, Seyfried NT (декабрь 2014 г.). «Агрегационные свойства малого ядерного рибонуклеопротеина U1-70K при болезни Альцгеймера». Журнал биологической химии . 289 (51): 35296– 313. doi : 10.1074/jbc.M114.562959 . PMC 4271217. PMID  25355317 . 
  9. ^ Hales CM, Seyfried NT, Dammer EB, Duong D, Yi H, Gearing M, Troncoso JC, Mufson EJ, Thambisetty M, Levey AI, Lah JJ (апрель 2014 г.). "U1 small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs)gregate in Alzheimer's disease due to autosomal until genetic mutations and trisomy 21". Молекулярная нейродегенерация . 9 : 15. doi : 10.1186/1750-1326-9-15 . PMC 4022210. PMID  24773620 . 
  10. ^ Xiao SH, Manley JL (ноябрь 1998 г.). «Фосфорилирование-дефосфорилирование дифференцированно влияет на активность фактора сплайсинга ASF/SF2». The EMBO Journal . 17 (21): 6359– 67. doi :10.1093/emboj/17.21.6359. PMC 1170960. PMID  9799243 . 
  11. ^ Cao W, Garcia-Blanco MA (август 1998 г.). «Домен, богатый серином/аргинином, в человеческом белке U1 70k необходим и достаточен для связывания ASF/SF2». Журнал биологической химии . 273 (32): 20629– 35. doi : 10.1074/jbc.273.32.20629 . PMID  9685421.
  12. ^ Wang HY, Lin W, Dyck JA, Yeakley JM, Songyang Z, Cantley LC, Fu XD (февраль 1998 г.). "SRPK2: дифференциально экспрессируемая специфическая к белку SR киназа, участвующая в опосредовании взаимодействия и локализации факторов сплайсинга пре-мРНК в клетках млекопитающих". Журнал клеточной биологии . 140 (4): 737– 50. doi :10.1083/jcb.140.4.737. PMC 2141757. PMID  9472028 . 
  13. ^ Kamachi M, Le TM, Kim SJ, Geiger ME, Anderson P, Utz PJ (ноябрь 2002 г.). «Человеческие аутоиммунные сыворотки как молекулярные зонды для идентификации сигнального пути аутоантигенкиназы». Журнал экспериментальной медицины . 196 (9): 1213– 25. doi :10.1084/jem.20021167. PMC 2194102. PMID  12417631 . 
  14. ^ Адамс DJ, ван дер Вейден L, Майеда A, Стамм S, Моррис BJ, Раско JE (июль 2001 г.). "ZNF265 — новый сплайсосомный белок, способный вызывать альтернативный сплайсинг". Журнал клеточной биологии . 154 (1): 25–32 . doi :10.1083/jcb.200010059. PMC 2196870. PMID  11448987 . 
  15. ^ Sato T, Fujii T, Yokoyama T, Fujita Y, Imura Y, Yukawa N, Kawabata D, Nojima T, Ohmura K, Usui T, Mimori T (декабрь 2010 г.). «Антитела к RNP U1 в спинномозговой жидкости связаны с центральными нейропсихиатрическими проявлениями при системной красной волчанке и смешанном заболевании соединительной ткани». Артрит и ревматизм . 62 (12): 3730– 40. doi :10.1002/art.27700. hdl : 2433/142082 . PMID  20722023.

Дальнейшее чтение

  • Wilk HE, Schaefer KP, Agris PF, Boak AM, Kovacs SA (июль 1991 г.). «Ассоциация U1 SnRNP с HnRNP включает начальное неспецифическое независимое от сайта сплайсинга взаимодействие белка U1 SnRNP с HnRNA». Молекулярная и клеточная биохимия . 106 (1): 55– 66. doi :10.1007/BF00231189. PMID  1833625. S2CID  22696966.
  • Запрос CC, Bentley RC, Keene JD (апрель 1989). "Общий мотив распознавания РНК, идентифицированный в определенном домене связывания РНК U1 белка 70K U1 snRNP". Cell . 57 (1): 89– 101. doi :10.1016/0092-8674(89)90175-X. PMID  2467746. S2CID  22127152.
  • Du Clos TW (октябрь 1989). «C-реактивный белок реагирует с малым ядерным рибонуклеопротеином U1». Журнал иммунологии . 143 (8): 2553– 9. doi : 10.4049/jimmunol.143.8.2553 . PMID  2477447. S2CID  84070596.
  • Theissen H, Etzerodt M, Reuter R, Schneider C, Lottspeich F, Argos P, Lührmann R, Philipson L (декабрь 1986 г.). «Клонирование человеческой кДНК для белка 70K, связанного с РНК U1». The EMBO Journal . 5 (12): 3209– 17. doi :10.1002/j.1460-2075.1986.tb04631.x. PMC  1167314 . PMID  3028775.
  • Romac JM, Graff DH, Keene JD (июль 1994). "Белок U1 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) 70K транспортируется независимо от частиц U1 snRNP через сигнал ядерной локализации в домене связывания РНК". Molecular and Cellular Biology . 14 (7): 4662– 70. doi :10.1128/MCB.14.7.4662. PMC  358839 . PMID  7516470.
  • Wu JY, Maniatis T (декабрь 1993 г.). «Специфические взаимодействия между белками, участвующими в выборе сайта сплайсинга и регулируемом альтернативном сплайсинге». Cell . 75 (6): 1061– 70. doi :10.1016/0092-8674(93)90316-I. PMID  8261509. S2CID  22951690.
  • Woppmann A, Will CL, Kornstädt U, Zuo P, Manley JL, Lührmann R (июнь 1993 г.). «Идентификация киназы, связанной с snRNP, которая фосфорилирует домены, богатые аргинином/серином, типичные для факторов сплайсинга». Nucleic Acids Research . 21 (12): 2815– 22. doi :10.1093/nar/21.12.2815. PMC  309659 . PMID  8332490.
  • Northemann W, Berg H, Stahnke G, Walter M, Hunt N, Fenning S (декабрь 1995 г.). «Идентификация ингибирующего элемента в рибонуклеопротеиновом антигене человека 68-кДа (U1)». Protein Expression and Purification . 6 (6): 748–56 . doi :10.1006/prep.1995.0005. PMID  8746626.
  • Zhang WJ, Wu JY (октябрь 1996 г.). «Функциональные свойства p54, нового белка SR, активного в конститутивном и альтернативном сплайсинге». Молекулярная и клеточная биология . 16 (10): 5400– 8. doi :10.1128/MCB.16.10.5400. PMC  231539. PMID  8816452 .
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Research . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID  8889548.
  • Hong W, Bennett M, Xiao Y, Feld Kramer R, Wang C, Reed R (январь 1997 г.). «Связь U2 snRNP со сплайсосомным комплексом E». Nucleic Acids Research . 25 (2): 354– 61. doi :10.1093/nar/25.2.354. PMC  146436. PMID  9016565 .
  • Кляйн Гунневик Дж. М., ван Арссен Ю., ван дер Кемп А., Нелиссен Р., Пруйн Г. Дж., ван Венрой В. Дж. (август 1997 г.). «Ядерное накопление белка C, специфичного для мяРНП U1, происходит за счет диффузии и удержания в ядре». Экспериментальные исследования клеток . 235 (1): 265–73 . doi :10.1006/excr.1997.3663. ПМИД  9281376.
  • Zhang WJ, Wu JY (февраль 1998 г.). "Sip1, новый белок, содержащий домен RS, необходимый для сплайсинга пре-мРНК". Молекулярная и клеточная биология . 18 (2): 676– 84. doi :10.1128/MCB.18.2.676. PMC  108778. PMID  9447963.
  • Blencowe BJ, Issner R, Nickerson JA, Sharp PA (апрель 1998 г.). «Коактиватор сплайсинга пре-мРНК». Genes & Development . 12 (7): 996–1009 . doi :10.1101/gad.12.7.996. PMC 316672.  PMID 9531537  .
  • Cao W, Garcia-Blanco MA (август 1998 г.). «Домен, богатый серином/аргинином, в человеческом белке U1 70k необходим и достаточен для связывания ASF/SF2». Журнал биологической химии . 273 (32): 20629– 35. doi : 10.1074/jbc.273.32.20629 . PMID  9685421.
  • Neubauer G, King A, Rappsilber J, Calvio C, Watson M, Ajuh P, Sleeman J, Lamond A, Mann M (сентябрь 1998 г.). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать многобелковый сплайсосомный комплекс». Nature Genetics . 20 (1): 46– 50. doi :10.1038/1700. PMID  9731529. S2CID  585778.
  • Xiao SH, Manley JL (ноябрь 1998 г.). «Фосфорилирование-дефосфорилирование дифференцированно влияет на активность фактора сплайсинга ASF/SF2». The EMBO Journal . 17 (21): 6359– 67. doi :10.1093/emboj/17.21.6359. PMC  1170960. PMID  9799243 .
  • Dumortier H, Klein Gunnewiek J, Roussel JP, van Aarssen Y, Briand JP, van Venrooij WJ, Muller S (декабрь 1998 г.). «По крайней мере три линейных региона, но не домен цинкового пальца белка U1C, экспонируются на поверхности белка в растворе и на человеческой сплайсосомной частице snRNP U1». Nucleic Acids Research . 26 (23): 5486– 91. doi :10.1093/nar/26.23.5486. PMC  147990 . PMID  9826776.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=SnRNP70&oldid=1189381818"