SIAH2

SIAH2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	5H9M
Идентификаторы
Псевдонимы	SIAH2 , hSiah2, siah E3 убиквитинпротеинлигаза 2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602213; МГИ : 108062; гомологен : 21053; GeneCards : SIAH2; OMA :SIAH2 – ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 3 (человек)
Конец	150,763,477 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 3 (мышь)
Конец	58,599,821 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	кора правого надпочечника; ; левый надпочечник; ; кора левого надпочечника; ; моноцит; ; эктоцервикс; ; правая доля печени; ; кровь; ; канал шейки матки; ; костный мозг; ; стромальная клетка эндометрия;
	Верх выражен в
	вторичный ооцит; ; зигота; ; первичный ооцит; ; семенной каналец; ; сперматид; ; обонятельный эпителий; ; голеностопный сустав; ; околоушная железа; ; правая почка; ; островок Лангерганса;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	активность корепрессора транскрипции; связывание ионов цинка; связывание ионов металлов; связывание белков; связывание фермента конъюгации убиквитина; трансферазная активность; активность убиквитин-протеинтрансферазы; активность убиквитин-протеинлигазы;
Клеточный компонент	цитоплазма; цитозоль; внутриклеточная мембранно-связанная органелла; нуклеоплазма; сома; ранняя эндосома; проекция нейрона; ядро;
Биологический процесс	негативная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в процессе апоптоза; передача сигнала, опосредованная малой ГТФазой; регуляция убиквитинирования белков; негативная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути; негативная регуляция процесса апоптоза; аксонное руководство; развитие многоклеточного организма; убиквитинирование белка; клеточный цикл; негативная регуляция канонического сигнального пути Wnt; апоптотический процесс; негативная регуляция транскрипции, основанной на шаблонах нуклеиновых кислот; полиубиквитинирование белков; деубиквитинирование белков; убиквитин-зависимый процесс катаболизма белка; негативная регуляция нетрино-активируемого сигнального пути; опосредованный протеасомой убиквитин-зависимый процесс катаболизма белка; регуляция циркадного ритма; ритмический процесс;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	6478
	20439
	ENSG00000181788
	ENSMUSG00000036432
	О43255
	Q06986
	NM_005067
	NM_009174
	NP_005058
	NP_033200
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Убиквитин-протеинлигаза E3 SIAH2 — это фермент , который у людей кодируется геном SIAH2 . ^[5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует белок, который является членом семейства семи гомологов in missingia (SIAH). Белок является лигазой E3 и участвует в убиквитинировании и протеасомно-опосредованной деградации определенных белков. Активность этой убиквитинлигазы вовлечена в регуляцию клеточного ответа на гипоксию . ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что SIAH2 взаимодействует с PEG10 , ^[7] синаптофизином , ^[8] PEG3 ^[9] и VAV1 . ^[10]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000181788 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000036432 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ху Г, Чжан С., Видал М., Баер Дж.Л., Сюй Т., Фирон Э.Р. (октябрь 1997 г.). «Гомологи семи млекопитающих заочно регулируют DCC через путь убиквитин-протеасома». Гены и развитие . 11 (20): 2701– 14. doi :10.1101/gad.11.20.2701. ПМК 316613 . ПМИД 9334332.
^ ab "Ген Entrez: SIAH2 семь отсутствующих гомологов 2 (Drosophila)".
^ Окабе Х., Сато С., Фурукава Ю., Като Т., Хасэгава С., Накадзима Ю., Ямаока Ю., Накамура Ю. (июнь 2003 г.). «Участие PEG10 в гепатоцеллюлярном канцерогенезе человека посредством взаимодействия с SIAH1». Исследования рака . 63 (12): 3043–8 . PMID 12810624.
^ Wheeler TC, Chin LS, Li Y, Roudabush FL, Li L (март 2002 г.). «Регулирование деградации синаптофизина гомологами млекопитающих семи in missingia». Журнал биологической химии . 277 (12): 10273– 82. doi : 10.1074/jbc.M107857200 . PMID 11786535.
^ Relaix F, Wei XJ, Li W, Pan J, Lin Y, Bowtell DD, Sassoon DA, Wu X (февраль 2000 г.). «Pw1/Peg3 является потенциальным медиатором клеточной смерти и сотрудничает с Siah1a в апоптозе, опосредованном p53». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (5): 2105– 10. Bibcode : 2000PNAS ...97.2105R. doi : 10.1073/pnas.040378897 . PMC 15761. PMID 10681424.
^ Германи А., Ромеро Ф., Хоулард М., Камонис Дж., Гиссельбрехт С., Фишер С., Варин-Бланк Н. (май 1999 г.). "hSiah2 — это новый белок, связывающий Vav, который ингибирует сигнальные пути, опосредованные Vav". Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3798– 807. doi :10.1128/mcb.19.5.3798. PMC 84217. PMID 10207103.

Дальнейшее чтение

Маруяма К, Сугано С (январь 1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Research . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Hu G, Chung YL, Glover T, Valentine V, Look AT, Fearon ER (ноябрь 1997 г.). «Характеристика человеческих гомологов гена Drosophila seven in missingia (sina)». Геномика . 46 (1): 103– 11. doi : 10.1006/geno.1997.4997 . PMID 9403064.
Hu G, Fearon ER (январь 1999). "Siah-1 N-концевой RING-домен необходим для функции протеолиза, а C-концевые последовательности регулируют олигомеризацию и связывание с целевыми белками". Молекулярная и клеточная биология . 19 (1): 724– 32. doi :10.1128/mcb.19.1.724. PMC 83929. PMID 9858595.
Germani A, Romero F, Houlard M, Camonis J, Gisselbrecht S, Fischer S, Varin-Blank N (май 1999). "hSiah2 — это новый белок, связывающий Vav, который ингибирует сигнальные пути, опосредованные Vav". Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3798– 807. doi :10.1128/mcb.19.5.3798. PMC 84217. PMID 10207103.
Relaix F, Wei XJ, Li W, Pan J, Lin Y, Bowtell DD, Sassoon DA, Wu X (февраль 2000 г.). «Pw1/Peg3 является потенциальным медиатором клеточной смерти и взаимодействует с Siah1a в апоптозе, опосредованном p53». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (5): 2105– 10. Bibcode : 2000PNAS...97.2105R. doi : 10.1073/pnas.040378897 . PMC 15761. PMID 10681424 .
Joensuu T, Hämäläinen R, Lehesjoki AE, de la Chapelle A, Sankila EM (февраль 2000 г.). «Готовая к последовательности карта критической области синдрома Ашера III типа на хромосоме 3q». Genomics . 63 (3): 409– 16. doi :10.1006/geno.1999.6096. PMID 10704288.
Matsuzawa SI, Reed JC (май 2001 г.). «Siah-1, SIP и Ebi сотрудничают в новом пути деградации бета-катенина, связанном с ответами p53». Molecular Cell . 7 (5): 915– 26. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00242-8 . PMID 11389839.
Boehm J, He Y, Greiner A, Staudt L, Wirth T (август 2001 г.). «Регулирование стабильности BOB.1/OBF.1 с помощью SIAH». The EMBO Journal . 20 (15): 4153– 62. doi :10.1093/emboj/20.15.4153. PMC 149152. PMID 11483518 .
Wheeler TC, Chin LS, Li Y, Roudabush FL, Li L (март 2002 г.). «Регулирование деградации синаптофизина гомологами млекопитающих семи in missingia». Журнал биологической химии . 277 (12): 10273– 82. doi : 10.1074/jbc.M107857200 . PMID 11786535.
Куценко АС, Гизатуллин РЗ, Аль-Амин АН, Ванг Ф, Кваша СМ, Подовский РМ, Матушкин ЮГ, Гьянчандани А, Муравенко ОВ, Левицкий ВГ, Колчанов НА, Протопопов АИ, Кашуба ВИ, Киселев ЛЛ, Вассерман В, Валестедт К, Забаровский ЭР (июль 2002 г.). "NotI-фланкирующие последовательности: инструмент для обнаружения и проверки генома человека". Nucleic Acids Research . 30 (14): 3163– 70. doi :10.1093/nar/gkf428. PMC 135748 . PMID 12136098.
Habelhah H, Frew IJ, Laine A, Janes PW, Relaix F, Sassoon D, Bowtell DD, Ronai Z (ноябрь 2002 г.). "Стресс-индуцированное снижение стабильности TRAF2 опосредовано Siah2". The EMBO Journal . 21 (21): 5756– 65. doi :10.1093/emboj/cdf576. PMC 131073 . PMID 12411493.
Окабе Х., Сато С., Фурукава Ю., Като Т., Хасегава С., Накадзима Ю., Ямаока Ю., Накамура Ю. (июнь 2003 г.). «Участие PEG10 в гепатоцеллюлярном канцерогенезе человека посредством взаимодействия с SIAH1». Исследования рака . 63 (12): 3043–8 . PMID 12810624.
Fanelli M, Fantozzi A, De Luca P, Caprodossi S, Matsuzawa S, Lazar MA, Pelicci PG, Minucci S (февраль 2004 г.). "Спирально-спиральный домен является структурным детерминантом для гомологов млекопитающих Drosophila Sina-опосредованной деградации белка промиелоцитарного лейкоза и других трехкомпонентных мотивных белков протеасомой". Журнал биологической химии . 279 (7): 5374– 9. doi : 10.1074/jbc.M306407200 . PMID 14645235.
Джермани А., Прабэль А., Мура С., Подгорняк М.П., Ди Карло А., Эрлих Р., Гиссельбрехт С., Варин-Бланк Н., Кальво Ф., Брузцони-Джованелли Х. (декабрь 2003 г.). «SIAH-1 взаимодействует с CtIP и способствует его деградации по протеасомному пути». Онкоген . 22 (55): 8845– 51. doi : 10.1038/sj.onc.1206994 . ПМИД 14654780.
Накаяма К., Фрю И.Дж., Хагенсен М., Скалс М., Хабельха Х., Бумик А., Кадоя Т., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Фраппелл П.Б., Боутелл Д.Д., Ронай З. (июнь 2004 г.). «Siah2 регулирует стабильность пролилгидроксилаз, контролирует численность HIF1-альфа и модулирует физиологические реакции на гипоксию». Клетка . 117 (7): 941–52 . doi : 10.1016/j.cell.2004.06.001 . PMID 15210114. S2CID 1447980.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000181788 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000036432 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9334332-5] Ху Г, Чжан С., Видал М., Баер Дж.Л., Сюй Т., Фирон Э.Р. (октябрь 1997 г.). «Гомологи семи млекопитающих заочно регулируют DCC через путь убиквитин-протеасома». Гены и развитие . 11 (20): 2701– 14. doi :10.1101/gad.11.20.2701. ПМК 316613 . ПМИД 9334332.

[entrez-6] "Ген Entrez: SIAH2 семь отсутствующих гомологов 2 (Drosophila)".

[pmid12810624-7] Окабе Х., Сато С., Фурукава Ю., Като Т., Хасэгава С., Накадзима Ю., Ямаока Ю., Накамура Ю. (июнь 2003 г.). «Участие PEG10 в гепатоцеллюлярном канцерогенезе человека посредством взаимодействия с SIAH1». Исследования рака . 63 (12): 3043–8 . PMID 12810624.

[pmid11786535-8] Wheeler TC, Chin LS, Li Y, Roudabush FL, Li L (март 2002 г.). «Регулирование деградации синаптофизина гомологами млекопитающих семи in missingia». Журнал биологической химии . 277 (12): 10273– 82. doi : 10.1074/jbc.M107857200 . PMID 11786535.

[pmid10681424-9] Relaix F, Wei XJ, Li W, Pan J, Lin Y, Bowtell DD, Sassoon DA, Wu X (февраль 2000 г.). «Pw1/Peg3 является потенциальным медиатором клеточной смерти и сотрудничает с Siah1a в апоптозе, опосредованном p53». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (5): 2105– 10. Bibcode : 2000PNAS ...97.2105R. doi : 10.1073/pnas.040378897 . PMC 15761. PMID 10681424.

[pmid10207103-10] Германи А., Ромеро Ф., Хоулард М., Камонис Дж., Гиссельбрехт С., Фишер С., Варин-Бланк Н. (май 1999 г.). "hSiah2 — это новый белок, связывающий Vav, который ингибирует сигнальные пути, опосредованные Vav". Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3798– 807. doi :10.1128/mcb.19.5.3798. PMC 84217. PMID 10207103.