SEMA4D

SEMA4D
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1ОЛЗ, 3ОЛ2
Идентификаторы
Псевдонимы	SEMA4D , C9orf164, CD100, M-sema-G, SEMAJ, coll-4, семафорин 4D, COLL4, A8, GR3, BB18
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 601866; МГИ : 109244; гомологен : 21282; GeneCards : SEMA4D; OMA :SEMA4D — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 9 (человек)
Конец	89,498,130 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 13 (мышь)
Конец	51,793,747 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	Сегмент С1; ; гранулоцит; ; мозолистое тело; ; кровь; ; моноцит; ; нижний ганглий блуждающего нерва; ; лимфатический узел; ; мышца бедра; ; внутренний бледный шар; ; черная субстанция;
	Верх выражен в
	гранулоцит; ; мышца бедра; ; брыжеечные лимфатические узлы; ; тимус; ; поясничный субсегмент спинного мозга; ; кучевые ячейки; ; большеберцово-бедренный сустав; ; кровь; ; зубчатая извилина гиппокампа гранулярная клетка образования; ; селезенка;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание сигнальных рецепторов; трансмембранная сигнальная активность рецептора; связывание белков; связывание с рецептором семафорина; связывание нейропилина; идентичное связывание белков; сигнальная активность рецептора; химиоотталкивающая активность;
Клеточный компонент	неотъемлемый компонент мембраны; неотъемлемый компонент плазматической мембраны; мембрана; плазматическая мембрана; внеклеточное пространство;
Биологический процесс	регуляция морфогенеза дендритов; негативная регуляция процесса апоптоза; позитивная регуляция сигнализации фосфатидилинозитол 3-киназы; развитие многоклеточного организма; агрегация лейкоцитов; развитие нервной системы; негативная регуляция клеточной адгезии; позитивная регуляция фосфорилирования пептидил-тирозина; позитивная регуляция аксоногенеза; сигнальный путь семафорин-плексин, участвующий в морфогенезе костной трабекулы; регуляция организации клеточной проекции; негативная регуляция дифференцировки остеобластов; позитивная регуляция коллатерального прорастания; регуляция формы клеток; негативная регуляция фосфорилирования пептидил-тирозина; дифференциация клеток; позитивная регуляция фосфорилирования белков; семафорин-плексиновый сигнальный путь; адгезия клеток; иммунный ответ; окостенение, участвующее в созревании костей; позитивная регуляция миграции клеток; отрицательная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; положительная регуляция активности ГТФазы; отрицательная регуляция активности щелочной фосфатазы; отрицательный хемотаксис; миграция клеток нервного гребня; отрицательная регуляция расширения аксонов, участвующая в управлении аксонами; позитивная регуляция сборки ингибирующего синапса;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	10507
	20354
	ENSG00000187764
	ENSMUSG00000021451
	Q92854
	О09126
NM_001142287 ; NM_006378 ; NM_182635 ; NM_001371194 ; NM_001371195;
	NM_001371196 ; NM_001371197 ; NM_001371198 ; NM_001371199 ; NM_001371200 ; NM_001371201 ; NM_001371202
	NM_001281880 ; NM_013660
NP_001135759 ; NP_006369 ; NP_001358123 ; NP_001358124 ; NP_001358125;
	NP_001358126 ; NP_001358127 ; NP_001358128 ; NP_001358129 ; NP_001358130 ; NP_001358131
NP_001268809 ; NP_038688 ; NP_001365242 ; NP_001365243 ; NP_001365246;
	NP_001365247 ; NP_001365248 ; NP_001365249 ; NP_001365251 ; NP_001365252 ; NP_001365253 ; NP_001365244 ; NP_001365245 ; NP_001365250 ; НП_001365254
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок, обнаруженный у Homo sapiens

Семафорин-4D ( SEMA4D ), также известный как кластер дифференцировки 100 ( CD100 ), представляет собой белок семейства семафоринов , который у человека кодируется геном SEMA4D . ^[5 ]

Функция

Семафорин 4D (Sema 4D) — это молекула управления аксоном , которая секретируется олигодендроцитами и вызывает коллапс конуса роста в центральной нервной системе . Связываясь с рецептором плексина B1, он функционирует как белок, активирующий ГТФазу R-Ras (GAP), и отталкивает конусы роста аксона как в зрелой центральной нервной системе. ^[6]

В иммунной системе CD100 связывается с CD72 для активации В-клеток и дендритных клеток , хотя многое в этом взаимодействии все еще изучается. ^[7]^[8]

Во время восстановления повреждений кожи SEMA4D взаимодействует с плексином B2 на гамма-дельта-Т-клетках, играя роль в процессе заживления. ^[9]

Смотрите также

Кластер дифференциации

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000187764 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000021451 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Entrez: домен sema SEMA4D, домен иммуноглобулина (Ig), трансмембранный домен (TM) и короткий цитоплазматический домен, (семафорин) 4D».
^ Ito Y, Oinuma I, Katoh H, Kaibuchi K, Negishi M (июль 2006 г.). «Sema4D/plexin-B1 активирует GSK-3β через активность R-Ras GAP, вызывая коллапс конуса роста». EMBO Reports . 7 (7): 704– 9. doi :10.1038/sj.embor.7400737. PMC 1500830. PMID 16799460 .
^ Куманого А, Ватанабе С, Ли И, Ван X, Ши В, Араки Х, Хирата Х, Ивахори К, Учида Дж, Ясуи Т, Мацумото М, Ёсида К, Якура Х, Пан С, Парнс-младший, Кикутани Х (ноябрь 2000 г.). «Идентификация CD72 как лимфоцитного рецептора семафорина CD100 класса IV: новый механизм регуляции передачи сигналов В-клеток». Иммунитет . 13 (5): 621–31 . doi : 10.1016/S1074-7613(00)00062-5 . ПМИД 11114375.
^ Ishida I, Kumanogoh A, Suzuki K, Akahani S, Noda K, Kikutani H (август 2003 г.). «Участие CD100, семафорина лимфоцитов, в активации иммунной системы человека через CD72: последствия для регуляции иммунных и воспалительных реакций». Int. Immunol . 15 (8): 1027–34 . doi : 10.1093/intimm/dxg098 . PMID 12882840.
^ Дебора А. Уизерден, Мегуми Ватанабэ, Оливия Гариджо, Стефани Э. Ридер, Гор Саркисян, Шейн Дж. Ф. Кронин, Петра Вердино, Ян А. Уилсон, Ацуши Куманого, Хитоши Кикутани, Люк Тейтон, Вольфганг Х. Фишер, Венди Л. Хавран (август 2012 г.). «Рецептор CD100 взаимодействует со своим лигандом плексина B2, регулируя функцию эпидермальных γδ Т-клеток». Иммунитет . 37 (2): 314–25 . doi :10.1016/j.immuni.2012.05.026. ПМК 3430606 . ПМИД 22902232.

Дальнейшее чтение

Bougeret C, Mansur IG, Dastot H и др. (1992). «Повышенная поверхностная экспрессия недавно идентифицированного димера 150 кДа вскоре после активации человеческих Т-лимфоцитов». J. Immunol . 148 (2): 318–23 . doi : 10.4049/jimmunol.148.2.318 . PMID 1530858. S2CID 29224711.
Hall KT, Boumsell L, Schultze JL и др. (1996). «Человеческий CD100, новый лейкоцитарный семафорин, способствующий агрегации и дифференцировке В-клеток». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (21): 11780– 5. Bibcode : 1996PNAS...9311780H. doi : 10.1073 /pnas.93.21.11780 . PMC 38135. PMID 8876214.
Herold C, Elhabazi A, Bismuth G и др. (1997). «CD100 связан с CD45 на поверхности человеческих Т-лимфоцитов. Роль в гомотипической адгезии Т-клеток». J. Immunol . 157 (12): 5262– 8. doi : 10.4049/jimmunol.157.12.5262 . PMID 8955171. S2CID 36341775.
Фуруяма Т., Инагаки С., Косуги А. и др. (1997). «Идентификация нового трансмембранного семафорина, экспрессируемого на лимфоцитах». Ж. Биол. Хим . 271 (52): 33376– 81. doi : 10.1074/jbc.271.52.33376 . ПМИД 8969198.
Tamagnone L, Artigiani S, Chen H, et al. (1999). «Плексины — это большое семейство рецепторов для трансмембранных, секретируемых и GPI-заякоренных семафоринов у позвоночных». Cell . 99 (1): 71– 80. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80063-X . PMID 10520995. S2CID 17386412.
Elhabazi A, Delaire S, Bensussan A и др. (2001). «Биологическая активность растворимого CD100. I. Внеклеточная область CD100 высвобождается с поверхности Т-лимфоцитов путем регулируемого протеолиза». J. Immunol . 166 (7): 4341– 7. doi : 10.4049/jimmunol.166.7.4341 . PMID 11254687.
Delaire S, Billard C, Tordjman R и др. (2001). «Биологическая активность растворимого CD100. II. Растворимый CD100, подобно H-SemaIII, ингибирует миграцию иммунных клеток». J. Immunol . 166 (7): 4348– 54. doi : 10.4049/jimmunol.166.7.4348 . PMID 11254688.
Vikis HG, Li W, Guan KL (2002). «Взаимодействие Plexin-B1/Rac ингибирует активацию PAK и усиливает связывание лиганда Sema4D». Genes Dev . 16 (7): 836–45 . doi :10.1101/gad.966402. PMC 186329. PMID 11937491 .
Granziero L, Circosta P, Scielzo C и др. (2003). «Взаимодействия CD100/Plexin-B1 поддерживают пролиферацию и выживание нормальных и лейкозных CD5+ B-лимфоцитов». Blood . 101 (5): 1962– 9. doi : 10.1182/blood-2002-05-1339 . PMID 12406905.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Измайлова Е., Бертли Ф.М., Хуан К. и др. (2003). «ВИЧ-1 Tat перепрограммирует незрелые дендритные клетки для экспрессии хемоаттрактантов для активированных Т-клеток и макрофагов». Nat. Med . 9 (2): 191– 7. doi :10.1038/nm822. PMID 12539042. S2CID 26145639.
Love CA, Harlos K, Mavaddat N и др. (2003). «Лиганд-связывающая поверхность семафоринов, выявленная с помощью кристаллической структуры высокого разрешения SEMA4D». Nat. Struct. Biol . 10 (10): 843– 8. doi :10.1038/nsb977. PMID 12958590. S2CID 24468463.
Giraudon P, Vincent P, Vuaillat C и др. (2004). «Семафорин CD100 из активированных Т-лимфоцитов вызывает коллапс расширения процесса в олигодендроцитах и гибель незрелых нервных клеток». J. Immunol . 172 (2): 1246–55 . doi : 10.4049/jimmunol.172.2.1246 . PMID 14707103.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Deaglio S, Vaisitti T, Bergui L и др. (2005). «CD38 и CD100 возглавляют сеть поверхностных рецепторов, передающих положительные сигналы для роста и выживания B-CLL». Blood . 105 (8): 3042– 50. doi : 10.1182/blood-2004-10-3873 . PMID 15613544.
Conrotto P, Valdembri D, Corso S и др. (2005). «Sema4D индуцирует ангиогенез посредством привлечения Met плексином B1». Blood . 105 (11): 4321– 9. doi : 10.1182/blood-2004-07-2885 . PMID 15632204.
Basile JR, Afkhami T, Gutkind JS (2005). «Семафорин 4D/Plexin-B1 индуцирует миграцию эндотелиальных клеток посредством активации PYK2, Src и пути фосфатидилинозитол 3-киназы-Akt». Mol. Cell. Biol . 25 (16): 6889– 98. doi :10.1128/MCB.25.16.6889-6898.2005. PMC 1190270. PMID 16055703 .
Lewandrowski U, Moebius J, Walter U, Sickmann A (2006). "Выяснение участков N-гликозилирования на белках тромбоцитов человека: гликопротеомный подход". Mol. Cell. Proteomics . 5 (2): 226– 33. doi : 10.1074/mcp.M500324-MCP200 . PMID 16263699.
Нкиимбенг-Такви Э.Х., Чаповал С.П. (2011). «Биология и функция нейроиммунных семафоринов 4A и 4D». Иммунол. Рез . 50 (1): 10–21 . doi :10.1007/s12026-010-8201-y. ПМК 3366695 . ПМИД 21203905.
Smith EP, Shanks K, Lipsky MM, DeTolla LJ, Keegan AD, Chapoval SP (2011). «Экспрессия нейроиммунных семафоринов 4A и 4D и их рецепторов в легких усиливается аллергеном и фактором роста эндотелия сосудов». BMC Immunol . 12 : 30. doi : 10.1186/1471-2172-12-30 . PMC 3118960. PMID 21595947 .
Shanks K, Nkyimbeng-Takwi EH, Smith EP, Lipsky MM, DeTolla LJ, Keegan AD, Chapoval SP (2013). «Нейроиммунный семафорин 4D необходим для оптимального аллергического воспаления легких». Mol. Immunol . 56 (4): 480– 7. doi :10.1016/j.molimm.2013.05.228. PMC 3783523. PMID 23911404 .

Внешние ссылки

SEMA4D+белок,+человек в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья о мембранных белках является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000187764 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000021451 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Entrez: домен sema SEMA4D, домен иммуноглобулина (Ig), трансмембранный домен (TM) и короткий цитоплазматический домен, (семафорин) 4D».

[pmid16799460-6] Ito Y, Oinuma I, Katoh H, Kaibuchi K, Negishi M (июль 2006 г.). «Sema4D/plexin-B1 активирует GSK-3β через активность R-Ras GAP, вызывая коллапс конуса роста». EMBO Reports . 7 (7): 704– 9. doi :10.1038/sj.embor.7400737. PMC 1500830. PMID 16799460 .

[pmid11114375-7] Куманого А, Ватанабе С, Ли И, Ван X, Ши В, Араки Х, Хирата Х, Ивахори К, Учида Дж, Ясуи Т, Мацумото М, Ёсида К, Якура Х, Пан С, Парнс-младший, Кикутани Х (ноябрь 2000 г.). «Идентификация CD72 как лимфоцитного рецептора семафорина CD100 класса IV: новый механизм регуляции передачи сигналов В-клеток». Иммунитет . 13 (5): 621–31 . doi : 10.1016/S1074-7613(00)00062-5 . ПМИД 11114375.

[pmid12882840-8] Ishida I, Kumanogoh A, Suzuki K, Akahani S, Noda K, Kikutani H (август 2003 г.). «Участие CD100, семафорина лимфоцитов, в активации иммунной системы человека через CD72: последствия для регуляции иммунных и воспалительных реакций». Int. Immunol . 15 (8): 1027–34 . doi : 10.1093/intimm/dxg098 . PMID 12882840.

[Witherden-9] Дебора А. Уизерден, Мегуми Ватанабэ, Оливия Гариджо, Стефани Э. Ридер, Гор Саркисян, Шейн Дж. Ф. Кронин, Петра Вердино, Ян А. Уилсон, Ацуши Куманого, Хитоши Кикутани, Люк Тейтон, Вольфганг Х. Фишер, Венди Л. Хавран (август 2012 г.). «Рецептор CD100 взаимодействует со своим лигандом плексина B2, регулируя функцию эпидермальных γδ Т-клеток». Иммунитет . 37 (2): 314–25 . doi :10.1016/j.immuni.2012.05.026. ПМК 3430606 . ПМИД 22902232.