ПЛХНБ1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ПЛХНБ1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPLXNB1 , PLEXIN-B1, PLXN5, SEP, плексин B1
Внешние идентификаторыОМИМ : 601053; МГИ : 2154238; Гомологен : 130508; GeneCards : PLXNB1; OMA :PLXNB1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

5364

235611

Ансамбль

ENSG00000164050

ENSMUSG00000053646

UniProt

О43157

Q8CJH3

РефСек (мРНК)

NM_001130082
NM_002673

NM_172775

RefSeq (белок)

NP_001123554
NP_002664

NP_766363

Местоположение (UCSC)Хр 3: 48,4 – 48,43 МбХр 9: 108.92 – 108.95 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Плексин B1 — это белок семейства плексинов , который у человека кодируется геном PLXNB1 . [ 5] [6] [7]

Функция

В нервных тканях семейство плексинов служит трансмембранными рецепторами для семафоринов . [8] За пределами нервных тканей плексин B1 участвует в контроле миграции клеток. [9]

Взаимодействия

Было показано, что PLXNB1 взаимодействует с ARHGEF12 , [10] Rnd1 [11] и ARHGEF11 . [10] [11] [12] [13]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000164050 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000053646 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Maestrini E, Tamagnone L, Longati P, Cremona O, Gulisano M, Bione S, Tamanini F, Neel BG, Toniolo D, Comoglio PM (март 1996). «Семейство трансмембранных белков с гомологией с рецептором фактора роста гепатоцитов MET». Proc Natl Acad Sci USA . 93 (2): 674– 8. Bibcode :1996PNAS...93..674M. doi : 10.1073/pnas.93.2.674 . PMC 40111 . PMID  8570614. 
  6. ^ Vikis HG, Li W, He Z, Guan KL (ноябрь 2000 г.). «Семафориновый рецептор плексин-B1 специфически взаимодействует с активным Rac в зависимости от лиганда». Proc Natl Acad Sci USA . 97 (23): 12457– 62. Bibcode :2000PNAS...9712457V. doi : 10.1073/pnas.220421797 . PMC 18785 . PMID  11035813. 
  7. ^ "Ген Энтреза: PLXNB1 плексин B1".
  8. ^ Дриссенс М.Х., Оливо С., Нагата К., Инагаки М., Коллард Дж.Г. (9 октября 2002 г.). «Плексины B активируют Rho через PDZ-RhoGEF». Письма ФЭБС . 529 ( 2–3 ): 168–72 . doi : 10.1016/s0014-5793(02)03323-9 . PMID  12372594. S2CID  26525009.
  9. ^ Basile JR, Afkhami T, Gutkind JS (август 2005 г.). «Семафорин 4D/плексин-B1 индуцирует миграцию эндотелиальных клеток посредством активации PYK2, Src и пути фосфатидилинозитол 3-киназы-Akt». Молекулярная и клеточная биология . 25 (16): 6889– 98. doi :10.1128/mcb.25.16.6889-6898.2005. PMC 1190270. PMID  16055703 . 
  10. ^ ab Hirotani M, Ohoka Y, Yamamoto T, Nirasawa H, Furuyama T, Kogo M, Matsuya T, Inagaki S (сентябрь 2002 г.). "Взаимодействие плексина-B1 с факторами обмена нуклеотидов Rho-гуанина, содержащими домен PDZ". Biochem. Biophys. Res. Commun . 297 (1): 32– 7. doi :10.1016/S0006-291X(02)02122-8. PMID  12220504.
  11. ^ ab Oinuma I, Katoh H, Harada A, Negishi M (июль 2003 г.). «Прямое взаимодействие Rnd1 с Plexin-B1 регулирует PDZ-RhoGEF-опосредованную активацию Rho Plexin-B1 и вызывает сокращение клеток COS-7». J. Biol. Chem . 278 (28): 25671– 7. doi : 10.1074/jbc.M303047200 . PMID  12730235.
  12. ^ Perrot V, Vazquez-Prado J, Gutkind JS (ноябрь 2002 г.). «Плексин B регулирует Rho через факторы обмена гуаниновых нуклеотидов лейкемия-ассоциированного Rho GEF (LARG) и PDZ-RhoGEF». J. Biol. Chem . 277 (45): 43115– 20. doi : 10.1074/jbc.M206005200 . PMID  12183458.
  13. ^ Swiercz JM, Kuner R, Behrens J, Offermanns S (июль 2002 г.). «Plexin-B1 напрямую взаимодействует с PDZ-RhoGEF/LARG для регулирования RhoA и морфологии конуса роста». Neuron . 35 (1): 51– 63. doi : 10.1016/S0896-6273(02)00750-X . PMID  12123608. S2CID  18981429.
  • Чаповал С.П., Хритцо М., Ци Х, Таманьон Л., Голдинг А. и Киган А.Д. «Семафорин 4А стабилизирует фенотип регуляторных Т-клеток человека посредством плексина B1». ImmunoHorizons, 1 февраля 2019 г., 3 (2) 71–87; doi :10.4049/immunohorizons.1800026

Дальнейшее чтение

  • Ishikawa K, Nagase T, Nakajima D, Seki N, Ohira M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1998). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных человеческих генов. VIII. 78 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Res . 4 (5): 307– 13. doi : 10.1093/dnares/4.5.307 . PMID  9455477.
  • Tamagnone L, Artigiani S, Chen H, He Z, Ming GI, Song H, Chedotal A, Winberg ML, Goodman CS, Poo M, Tessier-Lavigne M, Comoglio PM (1999). «Плексины — это большое семейство рецепторов для трансмембранных, секретируемых и GPI-заякоренных семафоринов у позвоночных». Cell . 99 (1): 71– 80. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80063-X . PMID  10520995. S2CID  17386412.
  • Vikis HG, Li W, Guan KL (2002). «Взаимодействие плексин-B1/Rac ингибирует активацию PAK и усиливает связывание лиганда Sema4D». Genes Dev . 16 (7): 836–45 . doi :10.1101/gad.966402. PMC  186329. PMID  11937491 .
  • Swiercz JM, Kuner R, Behrens J, Offermanns S (2002). «Plexin-B1 напрямую взаимодействует с PDZ-RhoGEF/LARG для регулирования RhoA и морфологии конуса роста». Neuron . 35 (1): 51– 63. doi : 10.1016/S0896-6273(02)00750-X . PMID  12123608. S2CID  18981429.
  • Perrot V, Vazquez-Prado J, Gutkind JS (2003). "Plexin B регулирует Rho через факторы обмена гуаниновых нуклеотидов лейкемия-ассоциированного Rho GEF (LARG) и PDZ-RhoGEF". J. Biol. Chem . 277 (45): 43115– 20. doi : 10.1074/jbc.M206005200 . PMID  12183458.
  • Aurandt J, Vikis HG, Gutkind JS, Ahn N, Guan KL (2002). "Символ рецептора семафорина плексин-B1 передает сигналы посредством прямого взаимодействия с фактором обмена нуклеотидов Rho-специфическим, LARG". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (19): 12085– 90. Bibcode :2002PNAS...9912085A. doi : 10.1073/pnas.142433199 . PMC  129402 . PMID  12196628.
  • Giordano S, Corso S, Conrotto P, Artigiani S, Gilestro G, Barberis D, Tamagnone L, Comoglio PM (2002). «Рецептор семафорина 4D контролирует инвазивный рост путем связывания с Met». Nat. Cell Biol . 4 (9): 720– 4. doi :10.1038/ncb843. PMID  12198496. S2CID  130071.
  • Hirotani M, Ohoka Y, Yamamoto T, Nirasawa H, Furuyama T, Kogo M, Matsuya T, Inagaki S (2002). "Взаимодействие плексина-B1 с факторами обмена нуклеотидов Rho-гуанина, содержащими домен PDZ". Biochem. Biophys. Res. Commun . 297 (1): 32– 7. doi :10.1016/S0006-291X(02)02122-8. PMID  12220504.
  • Granziero L, Circosta P, Scielzo C, Frisaldi E, Stella S, Geuna M, Giordano S, Ghia P, Caligaris-Cappio F (2003). "Взаимодействия CD100/Plexin-B1 поддерживают пролиферацию и выживание нормальных и лейкозных CD5+ B-лимфоцитов". Blood . 101 (5): 1962– 9. doi : 10.1182/blood-2002-05-1339 . PMID  12406905.
  • Artigiani S, Barberis D, Fazzari P, Longati P, Angelini P, van de Loo JW, Comoglio PM, Tamagnone L (2003). «Функциональная регуляция рецепторов семафорина пропротеиновыми конвертазами». J. Biol. Chem . 278 (12): 10094– 101. doi : 10.1074/jbc.M210156200 . PMID  12533544.
  • Usui H, Taniguchi M, Yokomizo T, Shimizu T (2003). «Плексин-A1 и плексин-B1 специфически взаимодействуют в своих цитоплазматических доменах». Biochem. Biophys. Res. Commun . 300 (4): 927– 31. doi :10.1016/S0006-291X(02)02966-2. PMID  12559962.
  • Ойнума И, Като Х, Харада А, Негиши М (2003). «Прямое взаимодействие Rnd1 с плексином-B1 регулирует PDZ-RhoGEF-опосредованную активацию Rho плексином-B1 и вызывает сокращение клеток COS-7». J. Biol. Chem . 278 (28): 25671– 7. doi : 10.1074/jbc.M303047200 . PMID  12730235.
  • Conrotto P, Corso S, Gamberini S, Comoglio PM, Giordano S (2004). «Взаимодействие между рецепторами фактора рассеивания и B-плексинами контролирует инвазивный рост». Oncogene . 23 (30): 5131– 7. doi :10.1038/sj.onc.1207650. PMID  15184888. S2CID  24596233.
  • Swiercz JM, Kuner R, Offermanns S (2004). "Plexin-B1/RhoGEF-опосредованная активация RhoA включает рецепторную тирозинкиназу ErbB-2". J. Cell Biol . 165 (6): 869– 80. doi : 10.1083/jcb.200312094. PMC  2172401. PMID  15210733.
  • Оинума И., Исикава Ю., Като Х., Негиши М. (2004). «Рецептор семафорина 4D Плексин-B1 представляет собой белок, активирующий ГТФазу для R-Ras». Наука . 305 (5685): 862–5 . Бибкод : 2004Sci...305..862O. дои : 10.1126/science.1097545. PMID  15297673. S2CID  39544623.
  • Конротто П., Вальдембри Д., Корсо С., Серини Дж., Таманьоне Л., Комольо П.М., Буссолино Ф., Джордано С. (2005). «Sema4D индуцирует ангиогенез посредством рекрутирования Met с помощью плексина B1». Кровь . 105 (11): 4321– 9. doi : 10.1182/blood-2004-07-2885 . ПМИД  15632204.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O43157 (Plexin-B1) в PDBe-KB .


Значок заглушки

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 3 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=PLXNB1&oldid=1191554944"