SDHAF1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
SDHAF1
Идентификаторы
ПсевдонимыSDHAF1 , LYRM8, фактор сборки комплекса сукцинатдегидрогеназы 1, MC2DN2
Внешние идентификаторыОМИМ : 612848; МГИ : 1915582; гомологен : 67970; GeneCards : SDHAF1; OMA :SDHAF1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_001042631

NM_001033140

RefSeq (белок)

NP_001036096

NP_001028312

Местоположение (UCSC)Хр 19: 36 – 36 МбХр 7: 30.02 – 30.02 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Фактор сборки комплекса сукцинатдегидрогеназы 1 (SDHAF1), также известный как белок 8, содержащий мотив LYR (LYRM8), — это белок , который у людей кодируется геном SDHAF1 или LYRM8 . SDHAF1 — это белок-шаперон, участвующий в сборке комплекса сукцинатдегидрогеназы (SDH) ( комплекс II ). Мутации в этом гене связаны с детской лейкоэнцефалопатией , дефектной по SDH , и дефицитом митохондриального комплекса II. [5] [6] [7]

Структура

SDHAF1 расположен на плече q хромосомы 19 в позиции 13.12 и имеет 1 экзон . [5] Ген SDHAF1 производит белок массой 12,8 кДа, состоящий из 115 аминокислот . [8] [9] SDHAF1 экспрессируется повсеместно и принадлежит к комплексу I семейства LYR и подсемейству SDHAF1. [6] Таким образом, SDHAF1 является одним из по крайней мере восьми белков, имеющих трипептидный мотив LYR, который считается важным для метаболизма Fe-S. [7] SDHAF1 также содержит N-концевую митохондриальную целевую последовательность, которая не расщепляется после импорта в митохондрии. Кодируемый белок довольно гидрофильный и не содержит трансмембранного домена . [10]

Функция

SDHAF1 необходим для сборки комплекса сукцинатдегидрогеназы (SDH) ( комплекс II ), ферментного комплекса, который является компонентом как цикла трикарбоновых кислот (TCA), так и митохондриальной цепи переноса электронов , и который связывает окисление сукцината в фумарат с восстановлением убихинона (кофермента Q) в убихинол . [6] Комплекс сукцинатдегидрогеназы (SDH) митохондриальной дыхательной цепи состоит из 4 отдельных субъединиц. Белок, кодируемый геном SDHAF1 , находится в митохондриях и необходим для сборки SDH, но физически не ассоциируется с комплексом in vivo . [5] В частности, SDHAF1 опосредует и способствует созреванию субъединицы SDHB каталитического димера SDH. Субъединица белка железа и серы (Fe-S) SDHB необходима для функциональной сукцинатдегидрогеназы. Защищая SDHB от повреждающих окислителей , SDHAF1 играет жизненно важную роль в сборке и стабильности сукцинатдегидрогеназы (SDH). [11] [10] [6] В качестве альтернативы SDHAF1 может способствовать приобретению кластера Fe-S SDHB путем прямого связывания с ко-шапероном HSC20, который является важным компонентом механизма биогенеза Fe-S, который облегчает перенос простетической группы Fe-S из основного белка-скеффолда ISCU в апо-белки-реципиенты (т. е. SDHB), [7]

Клиническое значение

Варианты SDHAF1 связаны с дефицитом митохондриального комплекса II и детской лейкоэнцефалопатией . Дефицит митохондриального комплекса II является расстройством митохондриальной дыхательной цепи с гетерогенными клиническими проявлениями. Клинические признаки включают психомоторную регрессию у младенцев, плохой рост с отсутствием речевого развития, тяжелую спастическую квадриплегию , дистонию , прогрессирующую лейкоэнцефалопатию, мышечную слабость, непереносимость физических нагрузок и кардиомиопатию . У некоторых пациентов проявляется синдром Лея или синдром Кернса-Сейра . Миссенс-мутации c.164 G > C, p.Arg55Pro и c.170 G > A, p.Gly57Glu, гомозиготная трансверсия 169G-C, p. Gly57-Arg, гомозиготная бессмысленная мутация c.103G>T (p.Glu35X) и гомозиготная бессмысленная мутация c.22C > T, p.Gln8X связаны с дефицитом митохондриального комплекса II из-за дисфункции SDHAF1. [6] [10] [12] [7]

Взаимодействия

SDHAF1 имеет 27 белок-белковых взаимодействий, 15 из которых являются ко-комплексными взаимодействиями. Было обнаружено, что HSCB, SDHB , ccdc136, KRT27 , CIDEB , HSPA9 и ISCU взаимодействуют с SDHAF1. [13] [7]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000205138 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000074211 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ abc "Ген Энтреза: фактор сборки комплекса сукцинатдегидрогеназы 1" . Получено 30 июля 2018 г. .
  6. ^ abcde Универсальный номер доступа к белковому ресурсу A6NFY7 для "SDHAF1" в UniProt . Консорциум UniProt (январь 2017 г.). "UniProt: универсальная база знаний по белкам". Nucleic Acids Research . 45 (D1): D158–D169. doi :10.1093/nar/gkw1099. PMC 5210571. PMID  27899622 . 
  7. ^ abcde Майо Н., Гецци Д., Верриньи Д., Рицца Т., Бертини Э., Мартинелли Д., Зевиани М., Сингх А., Карроццо Р., Руо Т.А. (февраль 2016 г.). «Вызывающие заболевания мутации SDHAF1 ухудшают перенос кластеров Fe-S в SDHB». Клеточный метаболизм . 23 (2): 292–302. doi :10.1016/j.cmet.2015.12.005. ПМЦ 4749439 . ПМИД  26749241. 
  8. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS и др. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний». Circulation Research . 113 (9): 1043–53. doi :10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID  23965338 . 
  9. ^ Яо Д. «База знаний атласа белков сердечной органеллы (COPaKB) —— Информация о белках». amino.heartproteome.org . Получено 30 июля 2018 г.
  10. ^ abc Гецци Д., Гоффрини П., Узиэль Г., Хорват Р., Клопсток Т., Лохмюллер Х., Д'Адамо П., Гаспарини П., Стром Т.М., Прокиш Х., Инверницци Ф., Ферреро И., Зевиани М. (июнь 2009 г.). «SDHAF1, кодирующий специфический фактор сборки комплекса LYR-II, мутирует при SDH-дефектной детской лейкоэнцефалопатии». Природная генетика . 41 (6): 654–6. дои : 10.1038/ng.378. PMID  19465911. S2CID  11595312.
  11. ^ Na U, Yu W, Cox J, Bricker DK, Brockmann K, Rutter J, Thummel CS, Winge DR (август 2014 г.). «Факторы LYR SDHAF1 и SDHAF3 опосредуют созревание железо-серной субъединицы сукцинатдегидрогеназы». Cell Metabolism . 20 (2): 253–66. doi :10.1016/j.cmet.2014.05.014. PMC 4126850 . PMID  24954417. 
  12. ^ Оленбуш А., Эдвардсон С., Скорпен Дж., Бьорнстад А., Саада А., Элпелег О., Гертнер Дж., Брокманн К. (сентябрь 2012 г.). «Лейкоэнцефалопатия с накопленным сукцинатом является признаком дефицита комплекса II, связанного с SDHAF1». Orphanet Journal of Rare Diseases . 7 : 69. doi : 10.1186/1750-1172-7-69 . PMC 3492161. PMID  22995659. 
  13. ^ "Найдено 27 бинарных взаимодействий для поискового термина SDHAF1". База данных молекулярных взаимодействий IntAct . EMBL-EBI . Получено 25-08-2018 .

Дальнейшее чтение

  • Хоекстра А.С., Бэйли Дж.П. (май 2013 г.). «Роль комплекса II в заболевании». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Биоэнергетика . 1827 (5): 543–51. дои : 10.1016/j.bbabio.2012.11.005 . ПМИД  23174333.

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=SDHAF1&oldid=1218473412"