Рибосомальный белок SA
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
РПСА
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыRPSA , 37LRP, 67LR, ICAS, LAMBR, LAMR1, LBP, LBP/p40, LRP, LRP/LR, NEM/1CHD4, SA, lamR, p40, Рибосомальный белок SA
Внешние идентификаторыОМИМ : 150370; МГИ : 105381; гомологен : 68249; GeneCards : RPSA; OMA :RPSA — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

3921

16785

Ансамбль

ENSG00000168028

ENSMUSG00000032518

UniProt

Р08865

Р14206

РефСек (мРНК)

NM_002295
NM_001304288

NM_011029

RefSeq (белок)

NP_001291217
NP_002286

NP_035159

Местоположение (UCSC)Хр 3: 39.41 – 39.41 МбХр 9: 119.96 – 119.96 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Рибосомальный белок 40S SA — это рибосомальный белок , который у людей кодируется геном RPSA . [ 5] [6] Он также действует как рецептор клеточной поверхности , в частности, для ламинина , и участвует в нескольких патогенных процессах.

Функция

Ламинины , семейство внеклеточных матричных гликопротеинов , являются основным неколлагеновым компонентом базальных мембран . Они участвуют в самых разных биологических процессах, включая клеточную адгезию , дифференциацию , миграцию , передачу сигналов , разрастание нейритов и метастазирование . Многие эффекты ламинина опосредуются через взаимодействие с рецепторами клеточной поверхности . Эти рецепторы включают в себя членов семейства интегринов , а также неинтегриновые ламинин-связывающие белки. Ген RPSA кодирует многофункциональный белок, который является как рибосомным белком, так и высокоаффинным неинтегриновым рецептором ламинина. Этот белок по-разному называют рибосомальным белком SA; RPSA; LamR; LamR1; предшественник рецептора ламинина 37 кДа; 37LRP; рецептор ламинина 67 кДа; 67LR; Рецептор ламинина 37/67 кДа; LRP/LR; LBP/p40; и белок, ассоциированный с рибосомой p40. Рибосомальный белок SA и RPSA являются утвержденным названием и символом. Аминокислотная последовательность RPSA в высокой степени консервативна в ходе эволюции , что предполагает ключевую биологическую функцию . Было замечено, что уровень транскрипта RPSA выше в тканях карциномы толстой кишки и клеточных линиях рака легких, чем в их нормальных аналогах. Кроме того, существует корреляция между повышением регуляции этого полипептида в раковых клетках и их инвазивным и метастатическим фенотипом . Существует несколько копий гена RPSA; однако большинство из них являются псевдогенами , предположительно возникшими в результате ретропозиционных событий. Для этого гена были обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующих один и тот же белок. [7]

Структура и устойчивость

Комплементарная ДНК (кДНК) гена RPSA образована сборкой семи экзонов, шесть из которых соответствуют кодирующей последовательности. [6] Аминокислотная последовательность RPSA, выведенная из последовательности его кДНК, включает 295 остатков. RPSA можно разделить на два основных домена: N-домен (остатки 1–209), который соответствует экзонам 2–5 гена, и C-домен (остатки 210–295), который соответствует экзонам 6–7. N-домен RPSA гомологичен рибосомальному белку S2 (RPS2) прокариот. Он содержит палиндромную последовательность 173LMWWML178, которая сохраняется у всех метазоа. Его C-домен высоко консервативен у позвоночных. Аминокислотная последовательность RPSA на 98% идентична у всех млекопитающих. RPSA — это рибосомальный белок, который в ходе эволюции приобрел функцию рецептора ламинина. [8] [9] Структура N-домена RPSA похожа на структуру прокариотического RPS2. [10] C-домен изначально неупорядочен в растворе. N-домен мономерен в растворе и разворачивается в соответствии с трехфазным равновесием. Промежуточное фолдинг-соединение преобладает при 37 °C. [11]

Взаимодействия

Несколько взаимодействий RPSA, которые первоначально были обнаружены методами клеточной биологии, впоследствии были подтверждены с использованием рекомбинантных производных и экспериментов in vitro. Последние показали, что свернутый N-домен и неупорядоченный C-домен RPSA имеют как общие, так и специфические функции. [12]

  • RPSA связывается с белками, которые участвуют в трансляции генетического кода. (i) Двугибридные скрининги дрожжей показали, что RPSA связывается с рибосомным белком S21 малой рибосомальной субъединицы 40S. [13] [14] (ii) Последовательные делеции RPSA показали, что сегмент остатков 236–262, включенный в C-домен, участвует во взаимодействии между RPSA и 40S субъединицей рибосомы. [15] (iii) Исследования, основанные на спектроскопии ядерного магнитного резонанса (ЯМР), показали, что домен связывания антикодона лизил-тРНК-синтетазы связывается непосредственно с C-доменом RPSA. [16]
  • Первоначально RPSA был идентифицирован как белок, связывающий ламинин. [17] [18] Как рекомбинантный N-домен, так и C-домен RPSA связывают ламинин in vitro, и они связываются с аналогичными константами диссоциации (300 нМ). [10] [12]
  • И RPSA, и ламинин принадлежат к интерактому гепарина/гепарансульфата. [19] Гепарин связывается in vitro с N-доменом RPSA, но не с его C-доменом. Более того, C-домен RPSA и гепарин конкурируют за связывание с ламинином, что показывает, что высококислотный C-домен RPSA имитирует гепарин (и потенциально гепарансульфаты) для связывания с ламинином. [12]
  • RPSA является потенциальным клеточным рецептором для нескольких патогенных флавивирусов , включая вирус денге (DENV), [20] [21] и альфавирусов , включая вирус Синдбис (SINV). [22] N-домен RPSA включает сайт связывания для SINV in vitro. [10] N-домен также включает слабые сайты связывания для рекомбинантного домена 3 (ED3, остатки 296–400) из белков оболочки двух флавивирусов , вируса Западного Нила и серотипа 2 DENV. C-домен включает слабые сайты связывания для домена 3 вируса желтой лихорадки (YFV) и серотипов 1 и 2 DENV. Напротив, домен 3 из вируса японского энцефалита, по-видимому, не связывает RPSA in vitro. [12]
  • RPSA также является рецептором для малых молекул. (i) RPSA связывает афлатоксин B1 как in vivo, так и in vitro. [23] (ii) RPSA является рецептором для эпигаллокатехин-галлата (EGCG), который является основным компонентом зеленого чая и имеет множество эффектов, связанных со здоровьем. [24] [25] EGCG связывается только с N-доменом RPSA in vitro с константой диссоциации 100 нМ, но не с его C-доменом. [12]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000168028 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000032518 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Satoh K, Narumi K, Sakai T, Abe T, Kikuchi T, Matsushima K, Sindoh S, Motomiya M (июль 1992 г.). «Клонирование кДНК рецептора ламинина 67 кДа и экспрессия генов в нормальных и злокачественных клеточных линиях легких человека». Cancer Lett . 62 (3): 199– 203. doi :10.1016/0304-3835(92)90096-E. PMID  1534510.
  6. ^ ab Jackers P, Minoletti F, Belotti D, Clausse N, Sozzi G, Sobel ME, Castronovo V (сентябрь 1996 г.). «Выделение из мультигенного семейства активного человеческого гена метастаз-ассоциированного многофункционального белка 37LRP/p40 на хромосоме 3p21.3». Oncogene . 13 (3): 495–503 . PMID  8760291.
  7. ^ DiGiacomo, Vincent; Meruelo, Daniel (май 2016). «Изучение рецептора ламинина: критическое обсуждение неинтегринового рецептора ламинина 37/67-кДа/белка RPSA». Biological Reviews . 91 (2): 288– 310. doi :10.1111/brv.12170. PMC 5249262 . PMID  25630983. 
  8. ^ Ардини Э., Песоле Г., Тальябуэ Э., Магнифико А., Кастроново В., Собель М.Е., Колнаги М.И., Менар С. (август 1998 г.). «Рецептор ламинина массой 67 кДа произошел из рибосомного белка, который в ходе эволюции приобрел двойную функцию». Молекулярная биология и эволюция . 15 (8): 1017–25 . doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a026000 . ПМИД  9718729.
  9. ^ Nelson J, McFerran NV, Pivato G, Chambers E, Doherty C, Steele D, Timson DJ (февраль 2008 г.). «Рецептор ламинина 67 кДа: структура, функция и роль в заболеваниях». Bioscience Reports . 28 (1): 33–48 . doi :10.1042/BSR20070004. PMID  18269348.
  10. ^ abc Jamieson KV, Wu J, Hubbard SR, Meruelo D (февраль 2008). «Кристаллическая структура предшественника рецептора ламинина человека». Журнал биологической химии . 283 (6): 3002– 5. doi : 10.1074/jbc.C700206200 . PMID  18063583.
  11. ^ Ульд-Абей, МБ; Пти-Топен, И; Зидан, Н; Барон, Б; Бедуэль, Хьюз (июнь 2012 г.). «Множественные состояния сворачивания и расстройство рибосомального белка SA, мембранного рецептора для ламинина, антиканцерогенов и патогенов». Биохимия . 51 (24): 4807– 4821. doi :10.1021/bi300335r. PMID  22640394.
  12. ^ abcde Зидан, Н; Ульд-Абей, МБ; Пти-Топен, И; Бедуэль, Х (2012). «Сложенные и неупорядоченные домены человеческого рибосомального белка SA имеют как идиосинкразические, так и общие функции в качестве мембранных рецепторов». Biosci. Rep . 33 (1): 113– 124. doi :10.1042/BSR20120103. PMC 4098866. PMID  23137297 . 
  13. ^ Стельцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг С, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е, Дрёге А, Кробич С, Корн Б, Бирхмайер В, Лерах Х, Ванкер Э.Э. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–968 . doi :10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID  16169070. S2CID  8235923.
  14. ^ Sato M, Saeki Y, Tanaka K, Kaneda Y (март 1999). «Связанный с рибосомой белок LBP/p40 связывается с белком S21 рибосомы 40S: анализ с использованием дрожжевой двухгибридной системы». Biochem. Biophys. Res. Commun . 256 (2): 385–390 . doi :10.1006/bbrc.1999.0343. PMID  10079194.
  15. ^ Малыгин, АА; Бабайлова, ЕС; Локтев, ВБ; Карпова, ГГ (2011). "Участок в С-концевом домене рибосомального белка SA, необходимый для связывания SA с человеческой 40S рибосомальной субъединицей". Biochimie . 93 (3): 612– 617. doi :10.1016/j.biochi.2010.12.005. PMID  21167900.
  16. ^ Cho, HY; Ul Mushtaq, A; Lee, JY; Kim, DG; Seok, MS; Jang, M; Han, BW; Kim, S; Jeon, YH (2014). «Характеристика взаимодействия лизил-тРНК-синтетазы и рецептора ламинина с помощью ЯМР». FEBS Lett . 588 (17): 2851– 2858. doi :10.1016/j.febslet.2014.06.048. PMID  24983501. S2CID  36128866.
  17. ^ Рао, NC; Барски, SH; Терранова, VP; Лиотта, LA (1983). «Выделение рецептора ламинина опухолевой клетки». Biochem. Biophys. Res. Commun . 111 (3): 804– 808. doi :10.1016/0006-291X(83)91370-0. PMID  6301485.
  18. ^ Лесот, Х.; Кюль, У.; Марк, К. (1983). «Выделение белка, связывающего ламинин, из мембран мышечных клеток». EMBO J. 2 ( 6): 861– 865. doi :10.1002/j.1460-2075.1983.tb01514.x. PMC 555201. PMID  16453457 . 
  19. ^ Ори, А.; Уилкинсон, М. К.; Ферниг, Д. Г. (2011). «Системный биологический подход к исследованию взаимодействия гепарина и гепарансульфата». J. Biol. Chem . 286 (22): 19892–19904 . doi : 10.1074/jbc.M111.228114 . PMC 3103365. PMID  21454685 . 
  20. ^ Thepparit, C; Smith, DR (2004). «Серотип-специфическое проникновение вируса денге в клетки печени: идентификация высокоаффинного рецептора ламинина 37-килодальтон/67-килодальтон как рецептора серотипа 1 вируса денге». J. Virol . 78 (22): 12647– 12656. doi :10.1128/jvi.78.22.12647-12656.2004. PMC 525075 . PMID  15507651. 
  21. ^ Tio, PH; Jong, WW; Cardosa, MJ (2005). «Двумерный VOPBA выявляет взаимодействие рецептора ламинина (LAMR1) с серотипами вируса денге 1, 2 и 3». Virol. J . 2 : 25. doi : 10.1186/1743-422X-2-25 . PMC 1079963 . PMID  15790424. 
  22. ^ Wang, KS; Kuhn, RJ; Strauss, EG; Ou, S; Strauss, JH (1992). «Высокоаффинный рецептор ламинина является рецептором для вируса Синдбис в клетках млекопитающих». J. Virol . 66 (8): 4992–5001 . doi :10.1128/JVI.66.8.4992-5001.1992. PMC 241351. PMID  1385835 . 
  23. ^ Чжуан, З.; Хуан, И.; Ян, И.; Ван, С. (2016). «Идентификация белков, взаимодействующих с AFB1, и взаимодействия между RPSA и AFB1». J. Hazard. Mater . 301 : 297–303 . doi :10.1016/j.jhazmat.2015.08.053. PMID  26372695.
  24. ^ Тачибана, Х.; Кога, К.; Фуджимура, И.; Ямада, К. (2004). «Рецептор полифенола зеленого чая EGCG». Nat. Struct. Mol. Biol . 11 (4): 380– 381. doi :10.1038/nsmb743. PMID  15024383. S2CID  27868813.
  25. ^ Тачибана, Х (2011). «Определение полифенолов зеленого чая». Proc. Jpn. Acad. Ser. B Phys. Biol. Sci . 87 (3): 66– 80. Bibcode :2011PJAB...87...66T. doi :10.2183/pjab.87.66. PMC 3066547 . PMID  21422740. 

Дальнейшее чтение

  • Белкин AM, Степп MA (2000). «Интегрины как рецепторы для ламининов». Microsc. Res. Tech . 51 (3): 280– 301. doi :10.1002/1097-0029(20001101)51:3<280::AID-JEMT7>3.0.CO;2-O. PMID  11054877. S2CID  45941383.
  • Wewer UM, Liotta LA, Jaye M, Ricca GA, Drohan WN, Claysmith AP, Rao CN, Wirth P, Coligan JE, Albrechtsen R (1986). «Измененные уровни мРНК рецептора ламинина в различных клетках человеческой карциномы, которые обладают различной способностью связывать ламинин». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 83 (19): 7137– 7141. Bibcode :1986PNAS...83.7137W. doi : 10.1073/pnas.83.19.7137 . PMC  386670 . PMID  2429301.
  • Ван ден Оувеланд А.М., Ван Дуйнховен Х.Л., Дайхманн К.А., Ван Гронинген Дж.Дж., де Лей Л., Ван де Вен У.Дж. (1989). «Характеристики многокопийного семейства генов, преимущественно состоящего из процессированных псевдогенов». Нуклеиновые кислоты Рез . 17 (10): 3829–3843 . doi :10.1093/nar/17.10.3829. ПМК  317862 . ПМИД  2543954.
  • Yow HK, Wong JM, Chen HS, Lee CG, Davis S, Steele GD, Chen LB (1988). "Повышенная экспрессия мРНК ламинин-связывающего белка при карциноме толстой кишки человека: полная последовательность полноразмерной кДНК, кодирующей белок" (PDF) . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 85 (17): 6394– 6398. Bibcode :1988PNAS...85.6394Y. doi : 10.1073/pnas.85.17.6394 . PMC  281978 . PMID  2970639.
  • Selvamurugan N, Eliceiri GL (1996). «Ген малой ядрышковой РНК человека E2 находится в интроне гена ламинин-связывающего белка». Genomics . 30 (2): 400–1 . PMID  8586453.
  • Владимиров СН, Иванов АВ, Карпова ГГ, Мусолямов АК, Егоров ТА, Тиеде Б, Виттманн-Либольд Б, Отто А (1996). "Характеристика белков малых рибосомальных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования и масс-спектрометрии". Eur. J. Biochem . 239 (1): 144– 149. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . PMID  8706699.
  • Clausse N, Jackers P, Jarès P, Joris B, Sobel ME, Castronovo V (1997). «Идентификация активного гена, кодирующего ассоциированный с метастазами многофункциональный белок 37LRP/p40». DNA Cell Biol . 15 (12): 1009– 1023. doi :10.1089/dna.1996.15.1009. PMID  8985115.
  • Daidone MG, Silvestrini R, Benini E, Grigioni WF, D'Errico A (1997). "Экспрессия высокоаффинных рецепторов ламинина 67-kDa при первичном раке молочной железы и метахронных метастатических поражениях или контралатеральных раках". Br. J. Cancer . 76 (1): 52– 3. doi :10.1038/bjc.1997.335. PMC  2223804 . PMID  9218732.
  • Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, Davis E, Goodman N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (1998). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека». Genome Res . 8 (5): 509–23 . doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID  9582194.
  • де Манцони Г, Гульельми А, Верлато Г, Томеццоли А, Пелоси Г, Скьявон И, Кордиано С (1998). «Прогностическое значение экспрессии рецептора ламинина 67 кДа при распространенном раке желудка». Онкология . 55 (5): 456–460 . doi : 10.1159/000011895. PMID  9732225. S2CID  46799166.
  • Sato M, Saeki Y, Tanaka K, Kaneda Y (1999). «Связанный с рибосомой белок LBP/p40 связывается с белком S21 рибосомы 40S: анализ с использованием дрожжевой двухгибридной системы». Biochem. Biophys. Res. Commun . 256 (2): 385–390 . doi :10.1006/bbrc.1999.0343. PMID  10079194.
  • Canfield SM, Khakoo AY (1999). «Неинтегриновый связывающий ламинин-белок (p67 LBP) экспрессируется на подмножестве активированных человеческих Т-лимфоцитов и вместе с интегриновым антигеном очень поздней активации-6 опосредует активное клеточное прилипание к ламинину». J. Immunol . 163 (6): 3430– 40. doi : 10.4049/jimmunol.163.6.3430 . PMID  10477615. S2CID  25203285.
  • Donaldson EA, McKenna DJ, McMullen CB, Scott WN, Stitt AW, Nelson J (2000). «Экспрессия мембранно-ассоциированного рецептора ламинина 67-кДа (67LR) модулируется in vitro ингибированием клеточного контакта». Mol. Cell Biol. Res. Commun . 3 (1): 53– 59. doi :10.1006/mcbr.2000.0191. PMID  10683318.
  • Педраса С., Геберхивот Т., Ингерпуу С., Ассефа Д., Вондиму З., Кортесмаа Дж., Трюггвасон К., Виртанен И., Патарройо М. (2000). «Моноцитарные клетки синтезируют, прикрепляются и мигрируют на ламинине-8 (альфа 4 бета 1 гамма 1)». Дж. Иммунол . 165 (10): 5831–8 . doi : 10.4049/jimmunol.165.10.5831 . ПМИД  11067943.
  • Ванде Брук И., Вандеркеркен К., Де Гриф С., Асосингх К., Стрэтманс Н., Ван Кэмп Б., Ван Рит I (2001). «Вызванная ламинином-1 миграция клеток множественной миеломы включает высокоаффинный рецептор ламинина массой 67 кДа». Бр. Дж. Рак . 85 (9): 1387–1395 . doi :10.1054/bjoc.2001.2078. ПМЦ  2375239 . ПМИД  11720479.
  • Waltregny D, de Leval L, Coppens L, Youssef E, de Leval J, Castronovo V (2002). «Обнаружение рецептора ламинина 67 кДа в биопсиях рака простаты как предиктора рецидива после радикальной простатэктомии». Eur. Urol . 40 (5): 495– 503. doi :10.1159/000049825. PMID  11752855. S2CID  22778829.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Рибосомальный_протеин_SA&oldid=1189340606"