RcsR1 малая РНК
| RcsR1 мРНК | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности малой РНК RcsR1 | |
| Идентификаторы | |
| Рфам | РФ02552 |
| Другие данные | |
| Домены | Бактерии |
| ИДТИ | GO:0040033,SO:0032055 |
| ТАК | SO:0000370 |
| Структуры PDB | ПДБе |
RcsR1 (rhizobial cold and salinity stress riboregulator 1) транс-действующая sRNA, ранее известная как SmelC587, является стресс-связанным риборегулятором, сохраняющимся в Sinorhizobium , Rhizobium и Agrobacterium . Он содержит высококонсервативные стеблевые петли, участвующие во взаимодействии с несколькими целевыми мРНК (PhoR, MotE, анти-σE1, GntR, FgA, TrpC). В Sinorhizobium meliloti RcsR1 менее консервативная центральная область отвечает за видоспецифическое взаимодействие с 5'UTR аутоиндукторной синтазы, кодирующей мРНК sinI . Взаимодействие отрицательно влияет на трансляцию sinI . [1]
Смотрите также
Ссылки
- ^ Baumgardt K, Šmídová K, Rahn H, Lochnit G, Robledo M, Evguenieva-Hackenberg E (май 2016). «Стресс-связанная, ризобиальная малая РНК RcsR1 дестабилизирует аутоиндукторную синтазу, кодирующую мРНК sinI в Sinorhizobium meliloti». RNA Biology . 13 (5): 486– 499. doi :10.1080/15476286.2015.1110673. PMC 4962803 . PMID 26588798.
