Репликационный белок А1

РПА1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1EWI, 1FGU, 1JMC, 1L1O, 2B29, 2B3G, 4IJH, 4IJL, 4IPC, 4IPD, 4IPG, 4IPH, 4LUO, 4LUV, 4LUZ, 4LW1, 4LWC, 4NB3, 4O0A, 4R4C, 4R4I, 4R4O, 4R4Q, 4R4T, 5E7N, 5EAY
Идентификаторы
Псевдонимы	RPA1 , HSSB, MST075, REPA1, RF-A, RP-A, RPA70, Репликационный белок A1, PFBMFT6
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 179835; МГИ : 1915525; гомологен : 2208; Генные карты : RPA1; OMA :RPA1 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 17 (человек)
Конец	1,900,082 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	75,239,150 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верхний выражен в
	вторичный ооцит; ; желудочковая зона; ; ганглионарное возвышение; ; париетальная плевра; ; висцеральная плевра; ; зародышевый эпителий; ; эпителий десны; ; трабекулярная кость; ; большеберцовая кость; ; околоушная железа;
	Верхний выражен в
	фетальная печеночная гемопоэтическая клетка-предшественник; ; пигментный эпителий сетчатки; ; цилиарное тело; ; примитивная черта; ; вестибулярная мембрана улиткового протока; ; ирис; ; Эпителий сосудистого сплетения; ; брюшная стенка; ; эндотелиальная клетка лимфатического сосуда; ; Ячейка Панета;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание ДНК; связывание ионов металлов; связывание одноцепочечной ДНК; поврежденное связывание ДНК; связывание белков; связывание нуклеиновых кислот; Связывание теломерной ДНК с богатой G цепью; связывание одноцепочечной теломерной ДНК; последовательность-специфическое связывание ДНК;
Клеточный компонент	тело ПМЛ; нуклеоплазма; Комплекс фактора репликации ДНК А; ядро; место повреждения ДНК;
Биологический процесс	ДНК-зависимая репликация ДНК; нуклеотид-эксцизионная репарация, заполнение пробелов в ДНК; рекомбинация ДНК; ремонт межцепочечных поперечных связей; безошибочный синтез транслезиона; Фаза G1; синтез транслезиона, подверженный ошибкам; клеточный ответ на повреждение ДНК; репликация ДНК; регуляция клеточного ответа на тепло; Ремонт несоответствий ДНК; синтез транслезиона; нуклеотидная эксцизионная репарация, связанная с транскрипцией; нуклеотид-эксцизионная репарация, разрез ДНК; нуклеотид-эксцизионная репарация, разрез ДНК, повреждение 3'-конца; нуклеотид-эксцизионная репарация, разрез ДНК, повреждение 5'-конца; нуклеотид-эксцизионная репарация, стабилизация преинцизионного комплекса; нуклеотид-эксцизионная репарация; восстановление ДНК; репарация с удалением оснований; регуляция передачи сигнала медиаторами класса p53; Репарация двухцепочечных разрывов посредством гомологичной рекомбинации; нуклеотид-эксцизионная репарация, сборка преинцизионного комплекса; локализация белка в хромосоме; поддержание теломер; поддержание теломер посредством полуконсервативной репликации; Переход G1/S митотического клеточного цикла; Раскручивание ДНК, участвующее в репликации ДНК; поддержание теломер посредством теломеразы; мейоз;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	6117
	68275
	ENSG00000132383
	ENSMUSG00000000751
	P27694
	Q8VEE4
	НМ_002945 ; НМ_001355120 ; НМ_001355121
	NM_001164223 ; NM_026653
	НП_002936 ; НП_001342049 ; НП_001342050
	NP_001157695 ; NP_080929
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Репликационный белок А, ДНК-связывающая субъединица массой 70 кДа, представляет собой белок , который у людей кодируется геном RPA1 . [ ^5]

Взаимодействия

Было показано, что белок репликации А1 взаимодействует с:

BRCA2 , ^[6]
БЛМ , ^[7]^[8]^[9]
МСМ2 , ^[10]
МСМ4 , ^[10]
МСМ6 , ^[10]
МСМ7 , ^[10]
МУТИХ , ^[11]
ORC2L , ^[10]
ORC6L , ^[10]
С53 , ^[12]^[13]
RPA2 , ^[14]^[15]
RPA3 , ^[15]^[16]
ТИПИН , ^[17]
TP53BP1 , ^[18] и
XPA . ^[19]

Смотрите также

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000132383 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000000751 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Umbricht CB, Erdile LF, Jabs EW, Kelly TJ (апрель 1993 г.). «Клонирование, сверхэкспрессия и геномное картирование субъединицы 14-кДа человеческого репликативного белка A». J Biol Chem . 268 (9): 6131–8. doi : 10.1016/S0021-9258(18)53229-4 . PMID 8454588.
^ Wong JM, Ionescu D, Ingles CJ (январь 2003 г.). «Взаимодействие между BRCA2 и репликативным белком A нарушается мутацией в BRCA2, предрасполагающей к раку». Онкоген . 22 (1): 28–33. doi : 10.1038/sj.onc.1206071 . PMID 12527904.
^ Brosh RM, Li JL, Kenny MK, Karow JK, Cooper MP, Kureekattil RP, Hickson ID, Bohr VA (август 2000 г.). «Репликационный белок A физически взаимодействует с белком синдрома Блума и стимулирует его геликазную активность». J. Biol. Chem . 275 (31): 23500–8. doi : 10.1074/jbc.M001557200 . hdl : 10026.1/10318 . PMID 10825162.
^ Opresko PL, von Kobbe C, Laine JP, Harrigan J, Hickson ID, Bohr VA (октябрь 2002 г.). «Теломер-связывающий белок TRF2 связывается с геликазами синдрома Вернера и Блума и стимулирует их». J. Biol. Chem . 277 (43): 41110–9. doi : 10.1074/jbc.M205396200 . PMID 12181313.
^ Moens PB, Kolas NK, Tarsounas M, Marcon E, Cohen PE, Spyropoulos B (апрель 2002 г.). «Ход времени и хромосомная локализация рекомбинационных белков в мейозе у мышей совместимы с моделями, которые могут разрешить ранние взаимодействия ДНК-ДНК без реципрокной рекомбинации». J. Cell Sci . 115 (Pt 8): 1611–22. doi :10.1242/jcs.115.8.1611. PMID 11950880.
^ abcdef Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка белков пререпликативного комплекса мышей в клетках дрожжей и мышей». J. Mol. Biol . 327 (1): 111–28. doi :10.1016/s0022-2836(03)00079-2. PMID 12614612.
^ Parker A, Gu Y, Mahoney W, Lee SH, Singh KK, Lu AL (февраль 2001 г.). «Человеческий гомолог белка репарации MutY (hMYH) физически взаимодействует с белками, участвующими в репарации эксцизионных оснований длинных участков ДНК». J. Biol. Chem . 276 (8): 5547–55. doi : 10.1074/jbc.M008463200 . PMID 11092888.
^ Романова LY, Виллерс H, Благосклонный MV, Пауэлл SN (декабрь 2004 г.). «Взаимодействие p53 с репликативным белком A опосредует подавление гомологичной рекомбинации». Онкоген . 23 (56): 9025–33. doi :10.1038/sj.onc.1207982. PMID 15489903. S2CID 23482723.
^ Riva F, Zuco V, Vink AA, Supino R, Prosperi E (декабрь 2001 г.). «УФ-индуцированное разрезание ДНК и привлечение ядерного антигена пролиферирующих клеток к сайтам восстановления происходят независимо от взаимодействия p53-репликационного белка A в клетках p53 дикого типа и мутантных клетках карциномы яичников». Carcinogenesis . 22 (12): 1971–8. doi :10.1093/carcin/22.12.1971. PMID 11751427.
^ Shao RG, Cao CX, Zhang H, Kohn KW, Wold MS, Pommier Y (март 1999). «Репликация-опосредованное повреждение ДНК камптотецином вызывает фосфорилирование RPA ДНК-зависимой протеинкиназой и диссоциирует комплексы RPA:DNA-PK». EMBO J . 18 (5): 1397–406. doi :10.1093/emboj/18.5.1397. PMC 1171229 . PMID 10064605.
^ ab Бочкарева Е, Королев С, Лис-Миллер СП, Бочкарев А (апрель 2002 г.). «Структура тримеризационного ядра RPA и его роль в многошаговом механизме связывания ДНК RPA». EMBO J . 21 (7): 1855–63. doi :10.1093/emboj/21.7.1855. PMC 125950 . PMID 11927569.
^ Бочкарева Е., Фраппье Л., Эдвардс А.М., Бочкарев А. (февраль 1998 г.). «Субъединица RPA32 человеческого репликативного белка А содержит одноцепочечный ДНК-связывающий домен». J. Biol. Chem . 273 (7): 3932–6. doi : 10.1074/jbc.273.7.3932 . PMID 9461578.
^ Unsal-Kaçmaz K, Chastain PD, Qu PP, Minoo P, Cordeiro-Stone M, Sancar A, Kaufmann WK (апрель 2007 г.). «Комплекс Tim/Tipin человека координирует реакцию контрольной точки Intra-S на УФ, которая замедляет смещение репликативной вилки». Mol. Cell. Biol . 27 (8): 3131–42. doi :10.1128/MCB.02190-06. PMC 1899931. PMID 17296725 .
^ Yoo E, Kim BU, Lee SY, Cho CH, Chung JH, Lee CH (август 2005 г.). «53BP1 связан с репликационным белком A и необходим для гиперфосфорилирования RPA2 после повреждения ДНК». Oncogene . 24 (35): 5423–30. doi : 10.1038/sj.onc.1208710 . PMID 15856006.
^ Li L, Lu X, Peterson CA, Legerski RJ (октябрь 1995 г.). «Взаимодействие между фактором репарации ДНК XPA и репликативным белком A, по-видимому, имеет важное значение для репарации нуклеотидов эксцизией». Mol. Cell. Biol . 15 (10): 5396–402. doi : 10.1128/mcb.15.10.5396. PMC 230789. PMID 7565690.

Дальнейшее чтение

Iftode C, Daniely Y, Borowiec JA (1999). "Репликационный белок A (RPA): эукариотический SSB". Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol . 34 (3): 141–80. doi :10.1080/10409239991209255. PMID 10473346.
Binz SK, Sheehan AM, Wold MS (2005). «Фосфорилирование белка репликации A и клеточный ответ на повреждение ДНК». DNA Repair (Amst.) . 3 (8–9): 1015–24. doi :10.1016/j.dnarep.2004.03.028. PMID 15279788.
Dornreiter I, Erdile LF, Gilbert IU, von Winkler D, Kelly TJ, Fanning E (1992). «Взаимодействие ДНК-полимеразы альфа-праймазы с клеточным репликационным белком A и антигеном T SV40». EMBO J . 11 (2): 769–76. doi :10.1002/j.1460-2075.1992.tb05110.x. PMC 556510 . PMID 1311258.
Erdile LF, Heyer WD, Kolodner R, Kelly TJ (1991). "Характеристика кДНК, кодирующей 70-кДа одноцепочечную ДНК-связывающую субъединицу человеческого репликационного белка A, и роль этого белка в репликации ДНК". J. Biol. Chem . 266 (18): 12090–8. doi : 10.1016/S0021-9258(18)99069-1 . PMID 2050703.
Li L, Lu X, Peterson CA, Legerski RJ (1995). «Взаимодействие между фактором репарации ДНК XPA и репликативным белком A, по-видимому, имеет важное значение для эксцизионной репарации нуклеотидов». Mol. Cell. Biol . 15 (10): 5396–402. doi :10.1128/mcb.15.10.5396. PMC 230789. PMID 7565690 .
Кешав КФ, Чен С, Дутта А (1995). "Rpa4, гомолог 34-килодальтонной субъединицы комплекса репликационного белка А". Mol. Cell. Biol . 15 (6): 3119–28. doi :10.1128/mcb.15.6.3119. PMC 230543. PMID 7760808 .
Umbricht CB, Griffin CA, Hawkins AL, Grzeschik KH, O'Connell P, Leach R, Green ED, Kelly TJ (1994). "Высокоразрешающее геномное картирование трех генов человеческого репликативного белка A (RPA1, RPA2 и RPA3)". Genomics . 20 (2): 249–57. doi : 10.1006/geno.1994.1161 . PMID 8020972.
Гомес XV, Уолд М.С. (1996). «Функциональные домены 70-килодальтонной субъединицы человеческого репликативного белка А». Биохимия . 35 (32): 10558–68. doi :10.1021/bi9607517. PMID 8756712.
Бочкарев А., Пфуцнер РА., Эдвардс А.М., Фраппье Л. (1997). «Структура домена связывания одноцепочечной ДНК репликационного белка А, связанного с ДНК». Nature . 385 (6612): 176–81. Bibcode :1997Natur.385..176B. doi :10.1038/385176a0. PMID 8990123. S2CID 4288187.
Амакер М., Хоттигер М., Мосси Р., Хюбшер У. (1997). «Нуклеокапсидный белок ВИЧ-1 и репликационный белок А влияют на синтез ДНК со смещением цепи лентивирусной обратной транскриптазы». AIDS . 11 (4): 534–6. PMID 9084803.
Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (1997). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека Tat взаимодействует с голоферментом РНК-полимеразы II». Mol. Cell. Biol . 17 (4): 1817–23. doi :10.1128/MCB.17.4.1817. PMC 232028 . PMID 9121429.
Loor G, Zhang SJ, Zhang P, Toomey NL, Lee MY (1998). «Идентификация репликации ДНК и белков клеточного цикла, которые взаимодействуют с PCNA». Nucleic Acids Res . 25 (24): 5041–6. doi :10.1093/nar/25.24.5041. PMC 147130. PMID 9396813 .
Бочкарева Е., Фраппье Л., Эдвардс А.М., Бочкарев А. (1998). «Субъединица RPA32 человеческого репликативного белка А содержит одноцепочечный ДНК-связывающий домен». J. Biol. Chem . 273 (7): 3932–6. doi : 10.1074/jbc.273.7.3932 . PMID 9461578.
Голуб EI, Гупта RC, Хааф T, Уолд MS, Раддинг CM (1999). "Взаимодействие человеческого рекомбинационного белка rad51 с одноцепочечным ДНК-связывающим белком, RPA". Nucleic Acids Res . 26 (23): 5388–93. doi :10.1093/nar/26.23.5388. PMC 148005. PMID 9826763.
Shao RG, Cao CX, Zhang H, Kohn KW, Wold MS, Pommier Y (1999). «Повреждение ДНК, опосредованное репликацией, камптотецином вызывает фосфорилирование RPA ДНК-зависимой протеинкиназой и диссоциирует комплексы RPA:DNA-PK». EMBO J . 18 (5): 1397–406. doi :10.1093/emboj/18.5.1397. PMC 1171229 . PMID 10064605.
Brosh RM, Orren DK, Nehlin JO, Ravn PH, Kenny MK, Machwe A, Bohr VA (1999). «Функциональное и физическое взаимодействие между геликазой WRN и человеческим репликативным белком A». J. Biol. Chem . 274 (26): 18341–50. doi : 10.1074/jbc.274.26.18341 . PMID 10373438.
Kim ST, Lim DS, Canman CE, Kastan MB (2000). «Субстратная специфичность и идентификация предполагаемых субстратов членов семейства киназ ATM». J. Biol. Chem . 274 (53): 37538–43. doi : 10.1074/jbc.274.53.37538 . PMID 10608806.
Brosh RM, Li JL, Kenny MK, Karow JK, Cooper MP, Kureekattil RP, Hickson ID, Bohr VA (2000). «Репликационный белок A физически взаимодействует с белком синдрома Блума и стимулирует его геликазную активность». J. Biol. Chem . 275 (31): 23500–8. doi : 10.1074/jbc.M001557200 . hdl : 10026.1/10318 . PMID 10825162.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000132383 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000000751 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8454588-5] Umbricht CB, Erdile LF, Jabs EW, Kelly TJ (апрель 1993 г.). «Клонирование, сверхэкспрессия и геномное картирование субъединицы 14-кДа человеческого репликативного белка A». J Biol Chem . 268 (9): 6131–8. doi : 10.1016/S0021-9258(18)53229-4 . PMID 8454588.

[pmid12527904-6] Wong JM, Ionescu D, Ingles CJ (январь 2003 г.). «Взаимодействие между BRCA2 и репликативным белком A нарушается мутацией в BRCA2, предрасполагающей к раку». Онкоген . 22 (1): 28–33. doi : 10.1038/sj.onc.1206071 . PMID 12527904.

[pmid10825162-7] Brosh RM, Li JL, Kenny MK, Karow JK, Cooper MP, Kureekattil RP, Hickson ID, Bohr VA (август 2000 г.). «Репликационный белок A физически взаимодействует с белком синдрома Блума и стимулирует его геликазную активность». J. Biol. Chem . 275 (31): 23500–8. doi : 10.1074/jbc.M001557200 . hdl : 10026.1/10318 . PMID 10825162.

[pmid12181313-8] Opresko PL, von Kobbe C, Laine JP, Harrigan J, Hickson ID, Bohr VA (октябрь 2002 г.). «Теломер-связывающий белок TRF2 связывается с геликазами синдрома Вернера и Блума и стимулирует их». J. Biol. Chem . 277 (43): 41110–9. doi : 10.1074/jbc.M205396200 . PMID 12181313.

[pmid11950880-9] Moens PB, Kolas NK, Tarsounas M, Marcon E, Cohen PE, Spyropoulos B (апрель 2002 г.). «Ход времени и хромосомная локализация рекомбинационных белков в мейозе у мышей совместимы с моделями, которые могут разрешить ранние взаимодействия ДНК-ДНК без реципрокной рекомбинации». J. Cell Sci . 115 (Pt 8): 1611–22. doi :10.1242/jcs.115.8.1611. PMID 11950880.

[pmid12614612-10] Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка белков пререпликативного комплекса мышей в клетках дрожжей и мышей». J. Mol. Biol . 327 (1): 111–28. doi :10.1016/s0022-2836(03)00079-2. PMID 12614612.

[pmid11092888-11] Parker A, Gu Y, Mahoney W, Lee SH, Singh KK, Lu AL (февраль 2001 г.). «Человеческий гомолог белка репарации MutY (hMYH) физически взаимодействует с белками, участвующими в репарации эксцизионных оснований длинных участков ДНК». J. Biol. Chem . 276 (8): 5547–55. doi : 10.1074/jbc.M008463200 . PMID 11092888.

[pmid15489903-12] Романова LY, Виллерс H, Благосклонный MV, Пауэлл SN (декабрь 2004 г.). «Взаимодействие p53 с репликативным белком A опосредует подавление гомологичной рекомбинации». Онкоген . 23 (56): 9025–33. doi :10.1038/sj.onc.1207982. PMID 15489903. S2CID 23482723.

[pmid11751427-13] Riva F, Zuco V, Vink AA, Supino R, Prosperi E (декабрь 2001 г.). «УФ-индуцированное разрезание ДНК и привлечение ядерного антигена пролиферирующих клеток к сайтам восстановления происходят независимо от взаимодействия p53-репликационного белка A в клетках p53 дикого типа и мутантных клетках карциномы яичников». Carcinogenesis . 22 (12): 1971–8. doi :10.1093/carcin/22.12.1971. PMID 11751427.

[pmid10064605-14] Shao RG, Cao CX, Zhang H, Kohn KW, Wold MS, Pommier Y (март 1999). «Репликация-опосредованное повреждение ДНК камптотецином вызывает фосфорилирование RPA ДНК-зависимой протеинкиназой и диссоциирует комплексы RPA:DNA-PK». EMBO J . 18 (5): 1397–406. doi :10.1093/emboj/18.5.1397. PMC 1171229 . PMID 10064605.

[pmid11927569-15] Бочкарева Е, Королев С, Лис-Миллер СП, Бочкарев А (апрель 2002 г.). «Структура тримеризационного ядра RPA и его роль в многошаговом механизме связывания ДНК RPA». EMBO J . 21 (7): 1855–63. doi :10.1093/emboj/21.7.1855. PMC 125950 . PMID 11927569.

[pmid9461578-16] Бочкарева Е., Фраппье Л., Эдвардс А.М., Бочкарев А. (февраль 1998 г.). «Субъединица RPA32 человеческого репликативного белка А содержит одноцепочечный ДНК-связывающий домен». J. Biol. Chem . 273 (7): 3932–6. doi : 10.1074/jbc.273.7.3932 . PMID 9461578.

[pmid17296725-17] Unsal-Kaçmaz K, Chastain PD, Qu PP, Minoo P, Cordeiro-Stone M, Sancar A, Kaufmann WK (апрель 2007 г.). «Комплекс Tim/Tipin человека координирует реакцию контрольной точки Intra-S на УФ, которая замедляет смещение репликативной вилки». Mol. Cell. Biol . 27 (8): 3131–42. doi :10.1128/MCB.02190-06. PMC 1899931. PMID 17296725 .

[pmid15856006-18] Yoo E, Kim BU, Lee SY, Cho CH, Chung JH, Lee CH (август 2005 г.). «53BP1 связан с репликационным белком A и необходим для гиперфосфорилирования RPA2 после повреждения ДНК». Oncogene . 24 (35): 5423–30. doi : 10.1038/sj.onc.1208710 . PMID 15856006.

[pmid7565690-19] Li L, Lu X, Peterson CA, Legerski RJ (октябрь 1995 г.). «Взаимодействие между фактором репарации ДНК XPA и репликативным белком A, по-видимому, имеет важное значение для репарации нуклеотидов эксцизией». Mol. Cell. Biol . 15 (10): 5396–402. doi : 10.1128/mcb.15.10.5396. PMC 230789. PMID 7565690.