МСМ6

МСМ6
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2КЛК, 2ЛЕ8
Идентификаторы
Псевдонимы	MCM6 , MCG40308, Mis5, P105MCM, компонент 6 комплекса обслуживания минихромосом
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 601806; МГИ : 1298227; гомологен : 4322; Генные карты : MCM6; OMA :MCM6 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 2 (человек)
Конец	135,876,443 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 1 (мышь)
Конец	128,287,401 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	желудочковая зона; ; эмбрион; ; ганглионарное возвышение; ; трабекулярная кость; ; эндотелиальная клетка; ; гонада; ; клубочек; ; вторичный ооцит; ; метанефрический клубочек; ; костный мозг;
	Верх выражен в
	сомит; ; Ячейка Панета; ; выступ нижней челюсти; ; брюшная стенка; ; рука; ; верхнечелюстной выступ; ; фетальная печеночная гемопоэтическая клетка-предшественник; ; примитивная черта; ; Гонадный гребень; ; выносящий проток;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	идентичное связывание белков; связывание одноцепочечной ДНК; связывание нуклеотидов; ДНК-хеликазная активность; связывание ДНК; связывание белков; гидролазная активность; Связывание АТФ; активность хеликазы; Связывание с точкой начала репликации ДНК; активность одноцепочечной 3'-5' ДНК-хеликазы;
Клеточный компонент	МСМ комплекс; ядро; нуклеоплазма;
Биологический процесс	Фаза G1; репликация ДНК; клеточный цикл; Инициация репликации ДНК; Раскручивание ДНК, участвующее в репликации ДНК; Переход G1/S митотического клеточного цикла; Репарация двухцепочечных разрывов посредством репликации, вызванной разрывом; сборка пререпликативного комплекса, участвующего в ядерном клеточном цикле репликации ДНК; митотическая репликация ДНК;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	4175
	17219
	ENSG00000076003
	ENSMUSG00000026355
	Q14566
	Р97311
	NM_005915
	NM_008567 ; NM_001313695
	NP_005906
	NP_001300624 ; NP_032593
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор лицензирования репликации ДНК MCM6 — это белок , который у людей кодируется геном MCM6 . ^[5] MCM6 — один из высококонсервативных белков поддержания мини-хромосом ( MCM ), которые необходимы для инициации репликации эукариотического генома .

Функция

Комплекс MCM, состоящий из MCM6 (этот белок) и MCM2 , 4 и 7 , обладает ДНК- хеликазной активностью и может действовать как фермент раскручивания ДНК . Гексамерный белковый комплекс, образованный белками MCM, является ключевым компонентом пререпликационного комплекса (пре-RC) и может участвовать в формировании репликационных вилок и в привлечении других белков, связанных с репликацией ДНК. Фосфорилирование комплекса киназой CDC2 снижает активность геликазы, что предполагает его роль в регуляции репликации ДНК. ^[6] Недавно было показано, что Mcm 6 сильно взаимодействует с Cdt1 в определенных остатках, мутируя эти целевые остатки. Вэй и др . наблюдали отсутствие привлечения Cdt1 Mcm2-7 в пре-RC. ^[7]

Ген

Ген MCM6, MCM6 , экспрессируется на очень высоком уровне. MCM6 содержит 18 интронов . Есть 2 неперекрывающихся альтернативных последних экзона . Транскрипты , по-видимому, отличаются усечением 3'-конца, наличием или отсутствием 2 кассетных экзонов, общими экзонами с разными границами.

MCM6 производит путем альтернативного сплайсинга 3 различных транскрипта, все с интронами, предположительно кодирующих 3 различные изоформы белка .

MCM6 содержит две регуляторные области для LCT , гена, кодирующего белок лактазу , расположенные в двух интронах MCM6 , примерно в 14 кб и 22 кб выше LCT . ^[8] В частности, было показано, что замена тимина на цитозин в первой области (в -13910) функционирует in vitro как элемент- энхансер , способный дифференциально активировать транскрипцию промотора LCT . ^[9]

Мутации в этих регионах связаны с толерантностью к лактозе во взрослой жизни. ^[8]^[10]

Взаимодействия

Было показано, что MCM6 взаимодействует с:

Белок, связанный с CDC45 , ^[11]
МСМ2 , ^[11]^[12]^[13]^[14]^[15]
МСМ4 , ^[12]^[13]^[16]
МСМ7 , ^[13]^[17]
ORC1L , ^[11]
ORC2L , ^[11]
ORC4L , ^[11] и
Репликационный белок А1 . ^[11]

Смотрите также

Мини-поддержание хромосом

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000076003 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000026355 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Harvey CB, Wang Y, Darmoul D, Phillips A, Mantei N, Swallow DM (декабрь 1996 г.). «Характеристика человеческого гомолога гена цикла деления дрожжевых клеток, MCM6, расположенного рядом с 5'-концом гена лактазы на хромосоме 2q21». FEBS Lett . 398 (2–3): 135–40. doi : 10.1016/S0014-5793(96)01189-1 . PMID 8977093. S2CID 1323113.
^ "Ген Entrez: гомолог 6 с дефицитом поддержания минихромосомы MCM6 (S. cerevisiae)".
^ Wei Z, Liu C, Wu X, Xu N, Zhou B, Liang C, Zhu G (март 2010 г.). «Характеристика и определение структуры домена связывания Cdt1 поддержания минихромосомы человека (Mcm) 6». J Biol Chem . 285 (17): 12469–73. doi : 10.1074/jbc.C109.094599 . PMC 2857124. PMID 20202939 .
^ аб Энаттах Н.С., Сахи Т., Савилахти Э., Тервиллигер Дж.Д., Пелтонен Л., Ярвела I (февраль 2002 г.). «Идентификация варианта, связанного с гиполактазией взрослого типа». Нат. Жене . 30 (2): 233–7. дои : 10.1038/ng826. PMID 11788828. S2CID 21430931.
^ Olds LC, Sibley E (сентябрь 2003 г.). «Вариант ДНК, обеспечивающий устойчивость лактазы, усиливает активность промотора лактазы in vitro: функциональная роль в качестве цис-регуляторного элемента». Hum. Mol. Genet . 12 (18): 2333–40. doi : 10.1093/hmg/ddg244 . PMID 12915462.
^ Маттар Р., де Кампос Мазо Д.Ф., Каррильо Ф.Дж. (2012). «Непереносимость лактозы: диагностика, генетические и клинические факторы». Clin Exp Гастроэнтерол . 5 : 113–21. дои : 10.2147/CEG.S32368 . ПМК 3401057 . ПМИД 22826639. «Два варианта были связаны с устойчивостью лактазы...»
^ abcdef Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка белков пререпликативного комплекса мышей в клетках дрожжей и мышей». J. Mol. Biol . 327 (1): 111–28. doi :10.1016/s0022-2836(03)00079-2. PMID 12614612.
^ аб Ябута Н., Кадзимура Н., Маянаги К., Сато М., Готоу Т., Утияма Ю., Исими Ю., Нодзима Х. (май 2003 г.). «Комплекс Mcm2/4/6/7 млекопитающих образует тороидальную структуру». Генные клетки . 8 (5): 413–21. дои : 10.1046/j.1365-2443.2003.00645.x . PMID 12694531. S2CID 27707848.
^ abc You Z, Ishimi Y, Masai H, Hanaoka F (ноябрь 2002 г.). «Роль субъединиц Mcm7 и Mcm4 в активности ДНК-хеликазы комплекса мыши Mcm4/6/7». J. Biol. Chem . 277 (45): 42471–9. doi : 10.1074/jbc.M205769200 . PMID 12207017.
^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал. М (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ You Z, Komamura Y, Ishimi Y (декабрь 1999 г.). «Биохимический анализ внутренней активности ДНК-хеликазы Mcm4-Mcm6-mcm7». Mol. Cell. Biol . 19 (12): 8003–15. doi :10.1128/MCB.19.12.8003. PMC 84885. PMID 10567526 .
^ Ishimi Y, Ichinose S, Omori A, Sato K, Kimura H (сентябрь 1996 г.). «Связывание белков поддержания минихромосом человека с гистоном H3». J. Biol. Chem . 271 (39): 24115–22. doi : 10.1074/jbc.271.39.24115 . PMID 8798650.
^ Fujita M, Kiyono T, Hayashi Y, Ishibashi M (апрель 1997 г.). «Взаимодействие гетерогексамерных комплексов человеческого MCM с хроматином in vivo. Возможное участие АТФ». J. Biol. Chem . 272 (16): 10928–35. doi : 10.1074/jbc.272.16.10928 . PMID 9099751.

Дальнейшее чтение

Ishimi Y, Ichinose S, Omori A, Sato K, Kimura H (1996). "Связывание белков поддержания минихромосом человека с гистоном H3". J. Biol. Chem . 271 (39): 24115–22. doi : 10.1074/jbc.271.39.24115 . PMID 8798650.
Holthoff HP, Hameister H, Knippers R (1997). «Новый человеческий белок Mcm: гомология с репликативным белком дрожжей Mis5 и хромосомное расположение». Genomics . 37 (1): 131–4. doi :10.1006/geno.1996.0530. PMID 8921380.
Tsuruga H, Yabuta N, Hosoya S, Tamura K, Endo Y, Nojima H (1997). "HsMCM6: новый член семейства человеческих MCM/P1 кодирует белок, гомологичный делящимся дрожжам Mis5". Genes Cells . 2 (6): 381–99. doi : 10.1046/j.1365-2443.1997.1290327.x . PMID 9286856. S2CID 12997515.
Ishimi Y (1997). «Активность ДНК-хеликазы связана с комплексом белков MCM4, -6 и -7». J. Biol. Chem . 272 (39): 24508–13. doi : 10.1074/jbc.272.39.24508 . PMID 9305914.
Holthoff HP, Baack M, Richter A, Ritzi M, Knippers R (1998). "Человеческий белок MCM6 на хроматине клеток HeLa". J. Biol. Chem . 273 (13): 7320–5. doi : 10.1074/jbc.273.13.7320 . PMID 9516426.
Отани К., Иванага Р., Накамура М., Икеда М., Ябута Н., Цуруга Х., Нодзима Х. (1999). «Экспрессия генов MCM5 и MCM6 млекопитающих, регулируемая ростом клеток, опосредованная транскрипционным фактором E2F». Онкоген . 18 (14): 2299–309. дои : 10.1038/sj.onc.1202544 . ПМИД 10327050.
You Z, Komamura Y, Ishimi Y (2000). «Биохимический анализ внутренней активности ДНК-хеликазы Mcm4-Mcm6-mcm7». Mol. Cell. Biol . 19 (12): 8003–15. doi :10.1128/MCB.19.12.8003. PMC 84885. PMID 10567526 .
Ishimi Y, Komamura-Kohno Y, You Z, Omori A, Kitagawa M (2000). «Ингибирование активности геликазы Mcm4,6,7 путем фосфорилирования циклином A/Cdk2». J. Biol. Chem . 275 (21): 16235–41. doi : 10.1074/jbc.M909040199 . PMID 10748114.
Izumi M, Yanagi K, Mizuno T, Yokoi M, Kawasaki Y, Moon KY, Hurwitz J, Yatagai F, Hanaoka F (2001). «Человеческий гомолог Saccharomyces cerevisiae Mcm10 взаимодействует с факторами репликации и диссоциирует от ядерных структур, устойчивых к нуклеазе, в фазе G(2)». Nucleic Acids Res . 28 (23): 4769–77. doi :10.1093/nar/28.23.4769. PMC 115166. PMID 11095689 .
Lee JK, Hurwitz J (2001). "Процессивная ДНК-хеликазная активность комплекса белков поддержания минихромосом 4, 6 и 7 требует разветвленных структур ДНК". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (1): 54–9. Bibcode :2001PNAS...98...54L. doi : 10.1073/pnas.98.1.54 . PMC 14543 . PMID 11136247.
Энаттах Н.С., Сахи Т., Савилахти Э., Тервиллигер Дж.Д., Пелтонен Л., Ярвела I (2002). «Идентификация варианта, связанного с гиполактазией взрослого типа». Нат. Жене . 30 (2): 233–7. дои : 10.1038/ng826. PMID 11788828. S2CID 21430931.
Yanagi K, Mizuno T, You Z, Hanaoka F (2002). «Мышиный геминин ингибирует не только взаимодействия Cdt1-MCM6, но и новую внутреннюю активность связывания ДНК Cdt1». J. Biol. Chem . 277 (43): 40871–80. doi : 10.1074/jbc.M206202200 . PMID 12192004.
You Z, Ishimi Y, Masai H, Hanaoka F (2003). «Роль субъединиц Mcm7 и Mcm4 в активности ДНК-хеликазы комплекса мыши Mcm4/6/7». J. Biol. Chem . 277 (45): 42471–9. doi : 10.1074/jbc.M205769200 . PMID 12207017.
Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (2003). «Взаимодействие и сборка белков пререпликативного комплекса мышей в клетках дрожжей и мышей». J. Mol. Biol . 327 (1): 111–28. doi :10.1016/S0022-2836(03)00079-2. PMID 12614612.
Ябута Н., Кадзимура Н., Маянаги К., Сато М., Готоу Т., Утияма Ю., Исими Ю., Нодзима Х. (2004). «Комплекс Mcm2/4/6/7 млекопитающих образует тороидальную структуру». Генные клетки . 8 (5): 413–21. дои : 10.1046/j.1365-2443.2003.00645.x . PMID 12694531. S2CID 27707848.
Джонсон EM, Киносита Y, Дэниел DC (2003). «Новый член семейства белков MCM, кодируемый геном MCM8 человека, расположенным контраподально GCD10 на хромосомном участке 20p12.3-13». Nucleic Acids Res . 31 (11): 2915–25. doi :10.1093/nar/gkg395. PMC 156728. PMID 12771218 .
Рамачандран Н., Хейнсворт Э., Бхуллар Б., Эйзенштейн С., Розен Б., Лау А.Ю., Уолтер Дж.К., ЛаБэр Дж. (2004). «Самособирающиеся белковые микрочипы». Наука . 305 (5680): 86–90. Бибкод : 2004Sci...305...86R. дои : 10.1126/science.1097639. PMID 15232106. S2CID 20936301.
Ю З, Фэн Д, Лян Ч (2004). «Парные взаимодействия шести субъединиц белка MCM человека». J. Mol. Biol . 340 (5): 1197–206. doi :10.1016/j.jmb.2004.05.024. PMID 15236977.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000076003 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000026355 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8977093-5] Harvey CB, Wang Y, Darmoul D, Phillips A, Mantei N, Swallow DM (декабрь 1996 г.). «Характеристика человеческого гомолога гена цикла деления дрожжевых клеток, MCM6, расположенного рядом с 5'-концом гена лактазы на хромосоме 2q21». FEBS Lett . 398 (2–3): 135–40. doi : 10.1016/S0014-5793(96)01189-1 . PMID 8977093. S2CID 1323113.

[entrez-6] "Ген Entrez: гомолог 6 с дефицитом поддержания минихромосомы MCM6 (S. cerevisiae)".

[pmid20202939-7] Wei Z, Liu C, Wu X, Xu N, Zhou B, Liang C, Zhu G (март 2010 г.). «Характеристика и определение структуры домена связывания Cdt1 поддержания минихромосомы человека (Mcm) 6». J Biol Chem . 285 (17): 12469–73. doi : 10.1074/jbc.C109.094599 . PMC 2857124. PMID 20202939 .

[Enattah_2002-8] аб Энаттах Н.С., Сахи Т., Савилахти Э., Тервиллигер Дж.Д., Пелтонен Л., Ярвела I (февраль 2002 г.). «Идентификация варианта, связанного с гиполактазией взрослого типа». Нат. Жене . 30 (2): 233–7. дои : 10.1038/ng826. PMID 11788828. S2CID 21430931.

[pmid12915462-9] Olds LC, Sibley E (сентябрь 2003 г.). «Вариант ДНК, обеспечивающий устойчивость лактазы, усиливает активность промотора лактазы in vitro: функциональная роль в качестве цис-регуляторного элемента». Hum. Mol. Genet . 12 (18): 2333–40. doi : 10.1093/hmg/ddg244 . PMID 12915462.

[10] Маттар Р., де Кампос Мазо Д.Ф., Каррильо Ф.Дж. (2012). «Непереносимость лактозы: диагностика, генетические и клинические факторы». Clin Exp Гастроэнтерол . 5 : 113–21. дои : 10.2147/CEG.S32368 . ПМК 3401057 . ПМИД 22826639. «Два варианта были связаны с устойчивостью лактазы...»

[pmid12614612-11] Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка белков пререпликативного комплекса мышей в клетках дрожжей и мышей». J. Mol. Biol . 327 (1): 111–28. doi :10.1016/s0022-2836(03)00079-2. PMID 12614612.

[pmid12694531-12] аб Ябута Н., Кадзимура Н., Маянаги К., Сато М., Готоу Т., Утияма Ю., Исими Ю., Нодзима Х. (май 2003 г.). «Комплекс Mcm2/4/6/7 млекопитающих образует тороидальную структуру». Генные клетки . 8 (5): 413–21. дои : 10.1046/j.1365-2443.2003.00645.x . PMID 12694531. S2CID 27707848.

[pmid12207017-13] You Z, Ishimi Y, Masai H, Hanaoka F (ноябрь 2002 г.). «Роль субъединиц Mcm7 и Mcm4 в активности ДНК-хеликазы комплекса мыши Mcm4/6/7». J. Biol. Chem . 277 (45): 42471–9. doi : 10.1074/jbc.M205769200 . PMID 12207017.

[pmid16189514-14] Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал. М (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid10567526-15] You Z, Komamura Y, Ishimi Y (декабрь 1999 г.). «Биохимический анализ внутренней активности ДНК-хеликазы Mcm4-Mcm6-mcm7». Mol. Cell. Biol . 19 (12): 8003–15. doi :10.1128/MCB.19.12.8003. PMC 84885. PMID 10567526 .

[pmid8798650-16] Ishimi Y, Ichinose S, Omori A, Sato K, Kimura H (сентябрь 1996 г.). «Связывание белков поддержания минихромосом человека с гистоном H3». J. Biol. Chem . 271 (39): 24115–22. doi : 10.1074/jbc.271.39.24115 . PMID 8798650.

[pmid9099751-17] Fujita M, Kiyono T, Hayashi Y, Ishibashi M (апрель 1997 г.). «Взаимодействие гетерогексамерных комплексов человеческого MCM с хроматином in vivo. Возможное участие АТФ». J. Biol. Chem . 272 (16): 10928–35. doi : 10.1074/jbc.272.16.10928 . PMID 9099751.