QKI
Белок
QKI
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыQKI , Hqk, QK, QK1, QK3, hqkI, домен KH, содержащий связывание РНК, домен KH, содержащий связывание РНК
Внешние идентификаторыОМИМ : 609590; МГИ : 97837; гомологен : 11059; Генные карты : QKI; OMA :QKI – ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

9444

19317

Ансамбль

ENSG00000112531

ENSMUSG00000062078

UniProt

Q96PU8

Q9QYS9

РефСек (мРНК)

NM_001301085
NM_006775
NM_206853
NM_206854
NM_206855

НМ_001159516
НМ_001159517
НМ_021881

RefSeq (белок)

НП_001288014
НП_006766
НП_996735
НП_996736
НП_996737

НП_001152988
НП_001152989
НП_068681

Местоположение (UCSC)Хр 6: 163.41 – 163.58 МбХр 17: 10.42 – 10.54 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Гомолог Quaking, связывающий РНК домена KH (мышиный) , также известный как QKI , представляет собой белок , который у людей кодируется геном QKI . [5] [6]

QKI принадлежит к семейству РНК-связывающих белков, называемых белками STAR для S -сигнальной трансдукции и активации РНК . [7] Они имеют домен гомологии HNRNPK (KH), встроенный в 200-аминокислотный регион, называемый доменом GSG. Другие члены этого семейства включают SAM68 ( KHDRBS1 ) и SF1 . [8] Еще два новых члена — KHDRBS3 [9] и KHDRBS2. [10]

Ген QKI считается важным при шизофрении [11] [12] , и QKI контролирует трансляцию многих генов, связанных с олигодендроцитами.

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000112531 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000062078 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Ген Entrez: гомолог QKI quaking, связывание РНК домена KH (мышь)» .
  6. ^ Saccomanno L, Loushin C, Jan E, Punkay E, Artzt K, Goodwin EB (октябрь 1999 г.). «Белок STAR QKI-6 является репрессором трансляции». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (22): 12605– 10. Bibcode :1999PNAS...9612605S. doi : 10.1073/pnas.96.22.12605 . PMC 23011 . PMID  10535969. 
  7. ^ Vernet C, Artzt K (декабрь 1997 г.). "STAR, семейство генов, участвующих в передаче сигнала и активации РНК". Trends Genet . 13 (12): 479– 84. doi :10.1016/S0168-9525(97)01269-9. PMID  9433137.
  8. ^ Чен Т., Ричард С. (август 1998 г.). «Структурно-функциональный анализ Qk1: ​​летальная точечная мутация при дрожании мышей предотвращает гомодимеризацию». Mol. Cell. Biol . 18 (8): 4863– 71. doi : 10.1128/MCB.18.8.4863. PMC 109071. PMID  9671495. 
  9. ^ Venables JP, Vernet C, Chew SL, Elliott DJ, Cowmeadow RB, Wu J, Cooke HJ, Artzt K, Eperon IC (июнь 1999 г.). "T-STAR/ETOILE: новый родственник SAM68, который взаимодействует с РНК-связывающим белком, участвующим в сперматогенезе". Hum. Mol. Genet . 8 (6): 959– 69. doi : 10.1093/hmg/8.6.959 . PMID  10332027.
  10. ^ Wang L, Xu J, Zeng L, Ye X, Wu Q, Dai J, Ji C, Gu S, Zhao C, Xie Y, Mao Y (декабрь 2002 г.). «Клонирование и характеристика нового человеческого домена STAR, содержащего кДНК KHDRBS2». Mol. Biol. Rep . 29 (4): 369–75 . doi :10.1023/A:1021246109101. PMID  12549823. S2CID  21864405.
  11. ^ Aberg K, Saetre P, Jareborg N, Jazin E (май 2006 г.). "Человеческий QKI, потенциальный регулятор экспрессии мРНК генов, связанных с олигодендроцитами человека и вовлеченных в шизофрению". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 103 (19): 7482– 7. Bibcode : 2006PNAS..103.7482A. doi : 10.1073/pnas.0601213103 . PMC 1464365. PMID  16641098 . 
  12. ^ Арутюнян В., Кацел П., Драчева С., Дэвис КЛ. (октябрь 2006 г.). «Человеческий гомолог гена QKI, затронутый при тяжелой дисмиелинизации «трясущегося» фенотипа мыши: подавленный в нескольких регионах мозга при шизофрении». Am J Psychiatry . 163 (10): 1834– 7. doi :10.1176/ajp.2006.163.10.1834. PMID  17012699.

Дальнейшее чтение

  • Робертсон НГ, Кхетарпал У, Гутьеррес-Эспелета ГА и др. (1995). «Выделение новых и известных генов из библиотеки ДНК человеческого плода с использованием субтрактивной гибридизации и дифференциального скрининга». Геномика . 23 (1): 42– 50. doi :10.1006/geno.1994.1457. PMID  7829101.
  • Saccomanno L, Loushin C, Jan E и др. (1999). «Белок STAR QKI-6 является репрессором трансляции». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (22): 12605– 10. Bibcode :1999PNAS...9612605S. doi : 10.1073/pnas.96.22.12605 . PMC  23011 . PMID  10535969.
  • Li ZZ, Kondo T, Murata T и др. (2002). «Экспрессия Hqk, кодирующего белок связывания РНК KH, изменена при глиоме человека». Jpn. J. Cancer Res . 93 (2): 167– 77. doi :10.1111/j.1349-7006.2002.tb01255.x. PMC  5926958. PMID  11856480 .
  • Wu JI, Reed RB, Grabowski PJ, Artzt K (2002). "Функция дрожания в миелинизации: регуляция альтернативного сплайсинга". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (7): 4233– 8. Bibcode :2002PNAS...99.4233W. doi : 10.1073/pnas.072090399 . PMC  123631 . PMID  11917126.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Moore FL, Jaruzelska J, Fox MS и др. (2003). «Человеческий Pumilio-2 экспрессируется в эмбриональных стволовых клетках и зародышевых клетках и взаимодействует с DAZ (удалено при AZoospermia) и DAZ-подобными белками». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (2): 538– 43. Bibcode :2003PNAS..100..538M. doi : 10.1073/pnas.0234478100 . PMC  141031 . PMID  12511597.
  • Côté J, Boisvert FM, Boulanger MC и др. (2003). "Sam68 РНК-связывающий белок является субстратом in vivo для белка аргинин N-метилтрансферазы 1". Mol. Biol. Cell . 14 (1): 274– 87. doi :10.1091/mbc.E02-08-0484. PMC  140244. PMID  12529443 .
  • Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ человеческой хромосомы 6». Nature . 425 (6960): 805– 11. Bibcode :2003Natur.425..805M. doi : 10.1038/nature02055 . PMID  14574404.
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Ichimura K, Mungall AJ, Fiegler H и др. (2006). «Небольшие области перекрывающихся делеций на 6q26 в человеческих астроцитарных опухолях, выявленные с помощью массива путей плитки хромосомы 6-CGH». Онкоген . 25 (8): 1261– 71. doi :10.1038/sj.onc.1209156. PMC  2760128 . PMID  16205629.
  • Aberg K, Saetre P, Lindholm E и др. (2006). «Человеческий QKI, новый ген-кандидат шизофрении, участвующий в миелинизации». Am. J. Med. Genet. B Neuropsychiatr. Genet . 141 (1): 84– 90. doi :10.1002/ajmg.b.30243. PMID  16342280. S2CID  11733591.
  • Aberg K, Saetre P, Jareborg N, Jazin E (2006). "Человеческий QKI, потенциальный регулятор экспрессии мРНК генов, связанных с человеческими олигодендроцитами и участвующих в шизофрении". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 103 (19): 7482– 7. Bibcode : 2006PNAS..103.7482A. doi : 10.1073/pnas.0601213103 . PMC  1464365. PMID  16641098 .
  • Lim J, Hao T, Shaw C и др. (2006). «Сеть взаимодействия белок-белок при наследственных атаксиях и расстройствах дегенерации клеток Пуркинье у человека». Cell . 125 (4): 801– 14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID  16713569. S2CID  13709685.
  • Арутюнян В., Кацел П., Драчева С., Дэвис КЛ. (2006). «Человеческий гомолог гена QKI, затронутый при тяжелой дисмиелинизации «трясущегося» фенотипа мыши: подавленный в нескольких регионах мозга при шизофрении». Американский журнал психиатрии . 163 (10): 1834– 7. doi :10.1176/ajp.2006.163.10.1834. PMID  17012699.
  • Zhao L, Tian D, Xia M и др. (2006). «Спасение дисмиелинизации qkV с помощью одной изоформы селективного РНК-связывающего белка QKI». J. Neurosci . 26 (44): 11278– 86. doi : 10.1523/JNEUROSCI.2677-06.2006 . PMC  6674528 . PMID  17079655.


Значок заглушки

Эта статья о гене на хромосоме 6 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=QKI&oldid=1136448570"