Пуриновая нуклеозидфосфорилаза
Фермент
пурин-нуклеозидфосфорилаза
пурин-нуклеозидфосфорилаза. PDB 1rct. [1]
Идентификаторы
Номер ЕС2.4.2.1
Номер CAS9030-21-1
Базы данных
ИнтЭнзIntEnz вид
БРЕНДАзапись BRENDA
ExPASyNiceZyme вид
КЕГГзапись KEGG
МетаЦикметаболический путь
ПРИАМпрофиль
Структуры PDBRCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmiGO / QuickGO
Поиск
ЧВКстатьи
PubMedстатьи
NCBIбелки
Пуриновая нуклеозидфосфорилаза
Идентификаторы
ПсевдонимыПуриновая_фосфорилазаIPR011268
Внешние идентификаторыGeneCards : [1]; OMA :- ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

н/д

н/д

Ансамбль

н/д

н/д

UniProt

н
а

н/д

РефСек (мРНК)

н/д

н/д

RefSeq (белок)

н/д

н/д

Местоположение (UCSC)н/дн/д
Поиск в PubMedн/дн/д
Викиданные
Просмотр/редактирование человека

Пуриннуклеозидфосфорилаза , PNP , PNPase или инозинфосфорилаза ( EC 2.4.2.1) — это фермент , который у человека кодируется геном NP . [2] Он катализирует химическую реакцию

пуриновый нуклеозид + фосфат пурин + альфа-D-рибозо-1-фосфат ⇌ {\displaystyle \rightleftharpoons}

Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются пуриновый нуклеозид и фосфат , тогда как его продуктами являются пурин и альфа-D-рибозо-1-фосфат.

Номенклатура

Этот фермент принадлежит к семейству гликозилтрансфераз , а именно пентозилтрансфераз. Систематическое название этого класса ферментов — пурин-нуклеозид:фосфат рибозилтрансфераза .

Другие часто используемые названия включают:

  • инозинфосфорилаза
  • ПНФаза
  • ПУНПИ
  • ПУНПII
  • инозин-гуанозин фосфорилаза
  • нуклеотидфосфатаза
  • пуриновая дезоксинуклеозидфосфорилаза
  • пуриновая дезоксирибонуклеозидфосфорилаза
  • пуриновая нуклеозидфосфорилаза
  • пуриновые рибонуклеозидфосфорилазы

Этот фермент участвует в трех метаболических путях : метаболизме пуринов , метаболизме пиримидинов , а также метаболизме никотината и никотинамида .

Функция

Пуриннуклеозидфосфорилаза — фермент, участвующий в метаболизме пуринов . PNP метаболизирует инозин в гипоксантин , а гуанозин в гуанин , в каждом случае создавая рибозофосфат . Примечание: аденозин сначала метаболизируется в инозин с помощью фермента аденозиндезаминазы. [3]

Одна из реакций, катализируемых пуриновой нуклеозидфосфорилазой в метаболизме пуринов

Нуклеозидфосфорилаза — это фермент, который расщепляет нуклеозид, фосфорилируя рибозу, чтобы получить нуклеиновое основание и рибозо-1-фосфат. Это один из ферментов путей спасения нуклеотидов . Эти пути позволяют клетке производить нуклеотидмонофосфаты, когда путь синтеза de novo был прерван или отсутствует (как в случае с мозгом). Часто путь de novo прерывается в результате химиотерапевтических препаратов, таких как метотрексат или аминоптерин .

Всем ферментам пути спасения требуется донор фосфата с высоким содержанием энергии, такой как АТФ или PRPP .

Аденозин использует фермент аденозинкиназу , который является очень важным ферментом в клетке. Предпринимаются попытки разработать ингибитор фермента для использования в химиотерапии рака .

Регуляция ферментов

Этот белок может использовать модель аллостерической регуляции морфеина . [4]

Клиническое значение

PNPase, вместе с аденозиндезаминазой (ADA), играет ключевую роль в катаболизме пуринов, называемом путем спасения. Мутации в ADA приводят к накоплению (d)ATP, который ингибирует рибонуклеотидредуктазу , что приводит к дефициту (d)CTP и (d)TTP, что, в свою очередь, вызывает апоптоз в T-лимфоцитах и ​​B-лимфоцитах, что приводит к тяжелому комбинированному иммунодефициту (SCID). [ необходима цитата ]

У пациентов с дефицитом PNP будет проблема иммунодефицита. Она влияет только на Т-клетки; В-клетки дефицитом не затронуты.

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Canduri F, dos Santos DM, Silva RG, Mendes MA, Basso LA, Palma MS, de Azevedo WF, Santos DS (январь 2004 г.). «Структуры человеческой пуриновой нуклеозидфосфорилазы в комплексе с инозином и ddI». Biochemical and Biophysical Research Communications . 313 (4): 907–14. doi :10.1016/j.bbrc.2003.11.179. PMID  14706628.
  2. ^ «Ген Энтреза: нуклеозидфосфорилаза NP».
  3. ^ Обзор биохимии Kaplan USMLE
  4. ^ Selwood T, Jaffe EK (март 2012). «Динамические диссоциирующие гомоолигомеры и контроль функции белка». Архивы биохимии и биофизики . 519 (2): 131–43. doi :10.1016/j.abb.2011.11.020. PMC 3298769. PMID 22182754  . 

Дальнейшее чтение

  • Маркерт МЛ (1991). «Дефицит пуриновой нуклеозидфосфорилазы». Обзоры иммунодефицита . 3 (1): 45–81. PMID  1931007.
  • Боргерс М., Верхаген Х., Де Брабандер М., Де Кри Дж., Де Кок В., Тоне Ф., Геуэнс Г. (ноябрь 1978 г.). «Пуриннуклеозидфосфорилаза при хроническом лимфоцитарном лейкозе (ХЛЛ)». Кровь . 52 (5): 886–95. дои : 10.1182/blood.V52.5.886.886 . ПМИД  100152.
  • Aust MR, Andrews LG, Barrett MJ, Norby-Slycord CJ, Markert ML (октябрь 1992 г.). «Молекулярный анализ мутаций у пациента с дефицитом пуриновой нуклеозидфосфорилазы». American Journal of Human Genetics . 51 (4): 763–72. PMC  1682776. PMID  1384322 .
  • Andrews LG, Markert ML (апрель 1992 г.). «Пропуск экзонов при обработке мРНК пуриновой нуклеозидфосфорилазой, приводящий к тяжелому иммунодефициту». Журнал биологической химии . 267 (11): 7834–8. doi : 10.1016/S0021-9258(18)42589-6 . PMID  1560016.
  • Jonsson JJ, Williams SR, McIvor RS (сентябрь 1991 г.). «Последовательность и функциональная характеристика промотора пуриновой нуклеозидфосфорилазы человека». Nucleic Acids Research . 19 (18): 5015–20. doi :10.1093/nar/19.18.5015. PMC  328804. PMID  1923769 .
  • Ealick SE, Rule SA, Carter DC, Greenhough TJ, Babu YS, Cook WJ, Habash J, Helliwell JR , Stoeckler JD, Parks RE (январь 1990 г.). «Трехмерная структура человеческой эритроцитарной пуриновой нуклеозидфосфорилазы при разрешении 3,2 А». Журнал биологической химии . 265 (3): 1812–20. doi :10.2210/pdb2pnp/pdb. PMID  2104852.
  • Williams SR, Gekeler V, McIvor RS, Martin DW (февраль 1987 г.). «Дефицит фосфорилазы пуриновых нуклеозидов человека, вызванный заменой одного основания». Журнал биологической химии . 262 (5): 2332–8. doi : 10.1016/S0021-9258(18)61658-8 . PMID  3029074.
  • Williams SR, Goddard JM, Martin DW (июль 1984). "Последовательность ДНК пуриновой нуклеозидфосфорилазы человека и характеристика геномного клона". Nucleic Acids Research . 12 (14): 5779–87. doi :10.1093/nar/12.14.5779. PMC  320030. PMID  6087295 .
  • Pannicke U, Tuchschmid P, Friedrich W, Bartram CR, Schwarz K (декабрь 1996 г.). «Две новые мутации миссенс и сдвига рамки считывания в экзонах 5 и 6 гена пуриновой нуклеозидфосфорилазы (PNP) у пациента с тяжелым комбинированным иммунодефицитом (SCID)». Human Genetics . 98 (6): 706–9. doi :10.1007/s004390050290. PMID  8931706. S2CID  5657916.
  • Markert ML, Finkel BD, McLaughlin TM, Watson TJ, Collard HR, McMahon CP, Andrews LG, Barrett MJ, Ward FE (1997). "Мутации при дефиците пуриновой нуклеозидфосфорилазы". Human Mutation . 9 (2): 118–21. doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(1997)9:2<118::AID-HUMU3>3.0.CO;2-5 . PMID  9067751. S2CID  46243170.
  • Erion MD, Takabayashi K, Smith HB, Kessi J, Wagner S, Hönger S, Shames SL, Ealick SE (сентябрь 1997 г.). "Пуриновая нуклеозидфосфорилаза. 1. Структурно-функциональные исследования". Биохимия . 36 (39): 11725–34. doi :10.1021/bi961969w. PMID  9305962.
  • Erion MD, Stoeckler JD, Guida WC, Walter RL, Ealick SE (сентябрь 1997 г.). "Пуриновая нуклеозидфосфорилаза. 2. Каталитический механизм". Биохимия . 36 (39): 11735–48. doi :10.1021/bi961970v. PMID  9305963.
  • Stoeckler JD, Poirot AF, Smith RM, Parks RE, Ealick SE, Takabayashi K, Erion MD (сентябрь 1997 г.). "Пуриновая нуклеозидфосфорилаза. 3. Изменение специфичности пуриновых оснований с помощью направленного мутагенеза". Biochemistry . 36 (39): 11749–56. doi :10.1021/bi961971n. PMID  9305964.
  • Sasaki Y, Iseki M, Yamaguchi S, Kurosawa Y, Yamamoto T, Moriwaki Y, Kenri T, Sasaki T, Yamashita R (июль 1998 г.). «Прямое доказательство аутосомно-рецессивного наследования Arg24 к терминирующему кодону в гене пуриновой нуклеозидфосфорилазы в семье с пациентом с тяжелым комбинированным иммунодефицитом». Генетика человека . 103 (1): 81–5. doi :10.1007/s004390050787. PMID  9737781. S2CID  8373698.
  • Sheppard TL, Ordoukhanian P, Joyce GF (июль 2000 г.). "ДНК-фермент с активностью N-гликозилазы". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (14): 7802–7. Bibcode :2000PNAS...97.7802S. doi : 10.1073/pnas.97.14.7802 . PMC  16625 . PMID  10884411.
  • Dalal I, Grunebaum E, Cohen A, Roifman CM (июнь 2001 г.). «Две новые мутации у пациента с дефицитом пуриновой нуклеозидфосфорилазы (PNP)». Clinical Genetics . 59 (6): 430–7. doi :10.1034/j.1399-0004.2001.590608.x. PMID  11453975. S2CID  24624559.
  • Ivings L, Pennington SR, Jenkins R, Weiss JL, Burgoyne RD (май 2002 г.). «Идентификация Ca2+-зависимых партнеров по связыванию для нейронального белка-сенсора кальция нейрокальцина дельта: взаимодействие с актином, клатрином и тубулином». The Biochemical Journal . 363 (Pt 3): 599–608. doi :10.1042/0264-6021:3630599. PMC  1222513 . PMID  11964161.
  • Falkenberg M , Gaspari M, Rantanen A, Trifunovic A, Larsson NG, Gustafsson CM (июль 2002 г.). «Митохондриальные факторы транскрипции B1 и B2 активируют транскрипцию человеческой мтДНК». Nature Genetics . 31 (3): 289–94. doi :10.1038/ng909. PMID  12068295. S2CID  11164308.
  • Стойчев Г, Киердажук Б, Шугар Д (август 2002 г.). «Ксантозин и ксантин. Свойства субстрата с пуриновыми нуклеозидфосфорилазами и их связь с другими ферментными системами». European Journal of Biochemistry . 269 (16): 4048–57. doi : 10.1046/j.1432-1033.2002.03097.x . PMID  12180982.
  • Агарвал РП, Паркс Р. Э. (1969). «Пуриновая нуклеозидфосфорилаза из эритроцитов человека. IV Кристаллизация и некоторые свойства». J. Biol. Chem . 244 (4): 644–7. doi : 10.1016/S0021-9258(18)94403-0 . PMID  5768862.
  • Бойер, П. Д., Ларди, Х. и Мирбак, К. (редакторы), Ферменты, 2-е изд., т. 5, Academic Press, Нью-Йорк, 1961, стр. 237-255.
  • HEPPEL LA, HILMOE RJ (1952). "[Фосфоролиз и гидролиз пуриновых рибозидов ферментами дрожжей.]". J. Biol. Chem . 198 (2): 683–94. doi : 10.1016/S0021-9258(18)55525-3 . PMID  12999785.
  • Kalckar HM (1947). «Ферментативный синтез пуриновых рибозидов». J. Biol. Chem . 167 (2): 477–486. doi : 10.1016/S0021-9258(17)31000-1 . PMID  20285042.
  • Saunders PP, Wilson BA, Saunders GF (1969). «Очистка и сравнительные свойства пиримидиновой нуклеозидфосфорилазы из Bacillus stearothermophilus». J. Biol. Chem . 244 (13): 3691–7. doi : 10.1016/S0021-9258(18)83424-X . PMID  4978445.
  • Tsuboi KK, Hudson PB (1957). «Ферменты эритроцитов человека. I. Пуриновая нуклеозидфосфорилаза; процедура выделения». J. Biol. Chem . 224 (2): 879–887. doi : 10.1016/S0021-9258(18)64980-4 . PMID  13405917.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Пуриновая_нуклеозид_фосфорилаза&oldid=1172359017"