Белок аргинин N-метилтрансфераза 5 — это фермент , который у людей кодируется геном PRMT5 . [5] [6] PRMT5 симметрично диметилирует H2AR3, H4R3, H3R2 и H3R8 in vivo, каждый из которых связан с рядом событий регуляции транскрипции. [7]
PRMT5 — это высококонсервативная аргининметилтрансфераза, которая перемещается из цитоплазмы в ядро на эмбриональном дне ~E8.5 и во время предимплантационного развития на стадии ~4 клеток. [8]
Взаимодействия
Было показано, что протеинаргининметилтрансфераза 5 взаимодействует с:
Было показано, что PRMT5 взаимодействует с CLNS1A , RIOK1 и COPR5 через интерфейс, созданный неглубокой бороздкой, расположенной на домене бочкообразной формы TIM PRMT5, и консенсусной последовательностью GQF[D/E]DA[E/D], расположенной в терминальных областях адаптерных белков. [12] [16] Характеристика взаимодействий, происходящих в связывающей бороздке между PRMT5 и пептидами, полученными из адаптерных белков, привела к разработке ингибиторов белок-белкового взаимодействия (PPI) , модулирующих связывание между PRMT5 и адаптерными белками. [17] [18] Кроме того, Эсберри и его коллеги синтезировали первый в своем классе низкомолекулярный ингибитор PPI между PRMT5 и MEP50 . [19] Ингибиторы PPI дополняют множество соединений, напрямую подавляющих ферментативную активность PRMT5. [20]
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000100462 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000023110 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Gilbreth M, Yang P, Bartholomeusz G, et al. (Янв. 1999). «Отрицательная регуляция митоза у делящихся дрожжей с помощью взаимодействующего с shk1 белка skb1 и его человеческого гомолога Skb1Hs». Proc Natl Acad Sci USA . 95 (25): 14781–6. doi : 10.1073/pnas.95.25.14781 . PMC 24526. PMID 9843966 .
^ Stopa N, Krebs JE, Shechter D (июнь 2015 г.). «Аргининметилтрансфераза PRMT5: множество ролей в развитии, раке и не только». Cellular and Molecular Life Sciences . 72 (11): 2041–59. doi :10.1007/s00018-015-1847-9. PMC 4430368 . PMID 25662273.
^ Ким С., Гунесдоган, У. и др. (ноябрь 2014 г.). «PRMT5 защищает геномную целостность во время глобального деметилирования ДНК в первичных зародышевых клетках и преимплантационных эмбрионах». Molecular Cell . 56 (4): 564–579. doi :10.1016/j.molcel.2014.10.003. PMC 4250265 . PMID 25457166.
^ ab Friesen WJ, Wyce A, Paushkin S, et al. (март 2002). "Новый компонент белка повтора WD метилосомы связывает белки Sm". J. Biol. Chem . 277 (10): 8243–7. doi : 10.1074/jbc.M109984200 . PMID 11756452.
^ Крапивинский Г., Пу В., Викман К. и др. (май 1998 г.). «pICln связывается с гомологом млекопитающего белка дрожжей, участвующим в регуляции морфологии клеток». J. Biol. Chem . 273 (18): 10811–4. doi : 10.1074/jbc.273.18.10811 . PMID 9556550.
^ ab Friesen WJ, Paushkin S, Wyce A, et al. (декабрь 2001 г.). «Метилосома, комплекс 20S, содержащий JBP1 и pICln, производит модифицированные диметиларгинином белки Sm». Mol. Cell. Biol . 21 (24): 8289–300. doi :10.1128/MCB.21.24.8289-8300.2001. PMC 99994. PMID 11713266 .
^ abcd Кржижановски А., Гаспер Р., Адихоу Х. и др. (февраль 2021 г.). «Биохимическое исследование взаимодействия pICln, RioK1 и COPR5 с комплексом PRMT5-MEP50». ChemBioChem . 22 (11): 1908–1914. doi : 10.1002/cbic.202100079 . PMC 8252068. PMID 33624332 .
^ Pollack BP, Kotenko SV, He W, et al. (октябрь 1999 г.). «Человеческий гомолог дрожжевых белков Skb1 и Hsl7p взаимодействует с Jak-киназами и содержит активность метилтрансферазы белка». J. Biol. Chem . 274 (44): 31531–42. doi : 10.1074/jbc.274.44.31531 . PMID 10531356.
^ Kwak YT, Guo J, Prajapati S, et al. (Апр. 2003). «Метилирование SPT5 регулирует его взаимодействие с РНК-полимеразой II и свойства транскрипционной элонгации». Mol. Cell . 11 (4): 1055–66. doi : 10.1016/s1097-2765(03)00101-1 . PMID 12718890.
^ Guderian G, Peter C, Wiesner J, et al. (Январь 2011). "RioK1, новый интерактор белка аргинин метилтрансферазы 5 (PRMT5), конкурирует с pICln за связывание и модулирует состав комплекса PRMT5 и специфичность субстрата". J Biol Chem . 286 (3): 1976–86. doi : 10.1074/jbc.M110.148486 . PMC 3023494. PMID 21081503 .
^ Mulvaney KM, Blomquis C, Acharya N, et al. (август 2020 г.). «Молекулярная основа для привлечения субстрата в метилосому PRMT5 (препринт)». bioRxiv 10.1101/2020.08.22.256347 .
^ McKinney DC, McMillan BJ, Ranaghan MJ и др. (август 2021 г.). «Открытие первого в своем классе ингибитора взаимодействия PRMT5-адаптера субстрата». Журнал медицинской химии . 64 (15): 11148–11168. doi :10.1021/acs.jmedchem.1c00507. PMC 9036822. PMID 34342224. S2CID 236884799 .
^ Кржижановски А., Эссер Л.М., Виллауме А. и др. (ноябрь 2022 г.). «Разработка ингибиторов взаимодействия макроциклического PRMT5-адапторного белка». J. Med. Chem . 65 (22): 15300–15311. doi : 10.1021/acs.jmedchem.2c01273 . PMC 9706563. PMID 36378254 .
^ Asberry AM, Cai X, Deng X и др. (октябрь 2022 г.). «Открытие и биологическая характеристика ингибиторов белок-белкового взаимодействия PRMT5:MEP50». Журнал медицинской химии . 65 (20): 13793–13812. doi :10.1021/acs.jmedchem.2c01000. PMC 11167723. PMID 36206451. S2CID 252758808 .
^ Fu S, Zheng Q, Zhang D и др. (декабрь 2022 г.). «Стратегии медицинской химии, нацеленные на PRMT5 для терапии рака». Европейский журнал медицинской химии . 244 : 114842. doi : 10.1016/j.ejmech.2022.114842. PMID 36274274. S2CID 252956172.
Дальнейшее чтение
Schwärzler A, Kreienkamp HJ, Richter D (2000). «Взаимодействие рецептора соматостатина подтипа 1 с человеческим гомологом белка, связывающего киназу Shk1 из дрожжей». J. Biol. Chem . 275 (13): 9557–62. doi : 10.1074/jbc.275.13.9557 . PMID 10734105.
Rho J, Choi S, Seong YR и др. (2001). «Prmt5, который образует отдельные гомоолигомеры, является членом семейства протеин-аргининметилтрансфераз». J. Biol. Chem . 276 (14): 11393–401. doi : 10.1074/jbc.M008660200 . PMID 11152681.
Brahms H, Meheus L, de Brabandere V, et al. (2001). «Симметричное диметилирование остатков аргинина в сплайсосомальном Sm-белке B/B' и Sm-подобном белке LSm4 и их взаимодействие с белком SMN». РНК . 7 (11): 1531–42. doi :10.1017/S135583820101442X. PMC 1370196 . PMID 11720283.
Meister G, Eggert C, Bühler D и др. (2002). «Метилирование белков Sm комплексом, содержащим PRMT5 и предполагаемый фактор сборки U snRNP pICln». Curr. Biol . 11 (24): 1990–4. doi :10.1016/S0960-9822(01)00592-9. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F501-7 . PMID 11747828. S2CID 14742376.
Fabbrizio E, El Messaoudi S, Polanowska J, et al. (2003). "Отрицательная регуляция транскрипции аргининметилтрансферазой типа II PRMT5". EMBO Rep . 3 (7): 641–5. doi :10.1093/embo-reports/kvf136. PMC 1084190. PMID 12101096 .
Jiang LQ, Wen SJ, Wang HY и др. (2003). «Скрининг белков, взаимодействующих с кальпаином в библиотеке ДНК человеческого сердца с использованием дрожжевой двугибридной системы». Hypertens. Res . 25 (4): 647–52. doi : 10.1291/hypres.25.647 . PMID 12358155.
Геверт К, Геталс М, Мартенс Л и др. (2004). «Исследование протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Biotechnol . 21 (5): 566–9. doi :10.1038/nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Pal S, Yun R, Datta A и др. (2003). "Комплекс Brg1, содержащий mSin3A/гистондеацетилазу 2 и PRMT5, участвует в транскрипционной репрессии целевого гена Myc cad". Mol. Cell. Biol . 23 (21): 7475–87. doi : 10.1128/MCB.23.21.7475-7487.2003. PMC 207647. PMID 14559996.
Yanagida M, Hayano T, Yamauchi Y и др. (2004). «Человеческий фибрилларин образует субкомплекс с p32, связанным с фактором сплайсинга 2, протеиновыми аргининметилтрансферазами и тубулинами альфа 3 и бета 1, который не зависит от его ассоциации с прерибосомальными рибонуклеопротеиновыми комплексами». J. Biol. Chem . 279 (3): 1607–14. doi : 10.1074/jbc.M305604200 . PMID 14583623.
Jin J, Smith FD, Stark C и др. (2004). «Протеомный, функциональный и основанный на доменах анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Biol . 14 (16): 1436–50. Bibcode : 2004CBio...14.1436J. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660. S2CID 2371325.
Miranda TB, Khusial P, Cook JR и др. (2004). «Sm-белки сплайсосомы D1, D3 и B/B' асимметрично диметилированы по остаткам аргинина в ядре». Biochem. Biophys. Res. Commun . 323 (2): 382–7. doi :10.1016/j.bbrc.2004.08.107. PMID 15369763.
Pal S, Vishwanath SN, Erdjument-Bromage H и др. (2004). "Человеческий SWI/SNF-ассоциированный PRMT5 метилирует гистон H3 аргинин 8 и отрицательно регулирует экспрессию генов-супрессоров опухолей ST7 и NM23". Mol . Cell. Biol . 24 (21): 9630–45. doi :10.1128/MCB.24.21.9630-9645.2004. PMC 522266. PMID 15485929.