CLNS1A

CLNS1A
Идентификаторы
Псевдонимы	CLNS1A , CLCI, CLNS1B, ICln, канал 1A, чувствительный к нуклеотидам хлорида
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602158; МГИ : 109638; гомологен : 990; GeneCards : CLNS1A; OMA :CLNS1A — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 11 (человек)
Конец	77,637,794 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 7 (мышь)
Конец	97,370,003 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	желудочковая зона; ; Ахиллово сухожилие; ; ганглионарное возвышение; ; тело поджелудочной железы; ; правый надпочечник; ; кора правого надпочечника; ; левый яичник; ; Сегмент С1; ; левый надпочечник; ; моноцит;
	Верх выражен в
	двигательный нейрон; ; примитивная черта; ; медиальное ганглиозное возвышение; ; мыщелок; ; ямка; ; вестибулярная мембрана улиткового протока; ; волосяной фолликул; ; Ростральный миграционный поток; ; почечное тельце; ; внутренняя сонная артерия;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	активность гетеродимеризации белка; связывание белков; Связывание РНК;
Клеточный компонент	плазматическая мембрана; цитоскелет; нуклеоплазма; ядро; метилосома; белковый комплекс pICln-Sm; цитозоль; цитоплазма;
Биологический процесс	гомеостаз объема клеток; транспорт хлорида; сплайсосомная сборка snRNP;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	1207
	12729
	ENSG00000074201
	ENSMUSG00000025439
	Р54105
	Q61189 ; Q923F1
	NM_001311202 ; NM_001293 ; NM_001311199 ; NM_001311200 ; NM_001311201
	NM_023671
	NP_001284 ; NP_001298128 ; NP_001298129 ; NP_001298130 ; NP_001298131
	NP_076160
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у человека

Субъединица метилосомы pICln — это белок , который у людей кодируется геном CLNS1A . ^[5]^[6]^[7]

Взаимодействия

Было показано, что CLNS1A взаимодействует с:

ITGA2B , ^[8]
PRMT5 , ^[9]^[10]^[11]^[12]
SNRPD1 , ^[9] и
SNRPD3 . ^[9]

Смотрите также

Хлоридный канал

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000074201 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000025439 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Anguita J, Chalfant ML, Civan MM, Coca-Prados M (апрель 1995 г.). «Молекулярное клонирование человеческого объемно-чувствительного регуляторного белка проводимости хлорида, pICln, из цилиарного эпителия глаза». Biochem Biophys Res Commun . 208 (1): 89– 95. doi :10.1006/bbrc.1995.1309. PMID 7887970.
^ Nagl UO, Erdel M, Schmarda A, Seri M, Pinggera GM, Gschwentner M, Duba C, Galietta LJ, Deetjen P, Utermann G, Paulmichl M (март 1997). "Хромосомная локализация генов (CLNS1A и CLNS1B), кодирующих зависящий от набухания хлоридный канал ICln". Genomics . 38 (3): 438– 41. doi :10.1006/geno.1996.0651. PMID 8975725.
^ "Ген Энтреза: хлоридный канал CLNS1A, чувствительный к нуклеотидам, 1A".
^ Ларкин Д., Мерфи Д., Рейли Д.Ф., Кэхилл М., Саттлер Э., Харриотт П., Кэхилл DJ, Моран Н. (июнь 2004 г.). «ICln, новый белок, связанный с интегрином альфаIIbbeta3, функционально регулирует активацию тромбоцитов». Ж. Биол. Хим . 279 (26): 27286–93 . doi : 10.1074/jbc.M402159200 . ПМИД 15075326.
^ abc Friesen WJ, Paushkin S, Wyce A, Massenet S, Pesiridis GS, Van Duyne G, Rappsilber J , Mann M, Dreyfuss G (декабрь 2001 г.). «Метилосома, комплекс 20S, содержащий JBP1 и pICln, производит модифицированные диметиларгинином белки Sm». Mol. Cell. Biol . 21 (24): 8289– 300. doi :10.1128/MCB.21.24.8289-8300.2001. PMC 99994 . PMID 11713266.
^ Крапивинский Г., Пу В., Викман К., Крапивинский Л., Клэпхэм Д. Э. (май 1998 г.). "pICln связывается с гомологом млекопитающего белка дрожжей, участвующим в регуляции морфологии клеток". J. Biol. Chem . 273 (18): 10811– 4. doi : 10.1074/jbc.273.18.10811 . PMID 9556550.
^ Friesen WJ, Wyce A, Paushkin S, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (март 2002 г.). «Новый компонент белка повтора WD метилосомы связывает белки Sm». J. Biol. Chem . 277 (10): 8243– 7. doi : 10.1074/jbc.M109984200 . PMID 11756452.
^ Кржижановски А., Гаспер Р., Адихоу Х., 'т Харт П., Вальдманн Х. (февраль 2021 г.). «Биохимическое исследование взаимодействия pICln, RioK1 и COPR5 с комплексом PRMT5-MEP50». ChemBioChem . 22 (11): 1908–1914 . doi : 10.1002/cbic.202100079 . PMC 8252068. PMID 33624332 .

Дальнейшее чтение

Calinisan V, Gravem D, Chen RP, Brittin S, Mohandas N, Lecomte MC, Gascard P (2006). «Новые идеи о потенциальных функциях суперсемейства белков 4.1 в эпителии почек». Front. Biosci . 11 : 1646–66 . doi : 10.2741/1911 . PMID 16368544. S2CID 26325962.
Буйс Г., де Гриф С., Раймакерс Л., Другаманс Г., Нилиус Б., Эггермонт Дж. (1996). «Повсеместно экспрессируемый белок pICln образует гомомерные комплексы in vitro». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 218 (3): 822–7 . doi : 10.1006/bbrc.1996.0146 . ПМИД 8579598.
Schwartz RS, Rybicki AC, Nagel RL (1997). «Молекулярное клонирование и экспрессия белка pICln, ассоциированного с хлоридным каналом, в молодых эритроцитах человека: связь с актином». Biochem. J . 327 (2): 609– 16. doi :10.1042/bj3270609. PMC 1218836 . PMID 9359436.
Bekri S, Adélaïde J, Merscher S, Grosgeorge J, Caroli-Bosc F, Perucca-Lostanlen D, Kelley PM, Pébusque MJ, Theillet C, Birnbaum D, Gaudray P (1998). "Подробная карта региона, обычно амплифицируемого в 11q13→q14 при карциноме молочной железы человека". Cytogenet. Cell Genet . 79 ( 1– 2): 125– 31. doi :10.1159/000134699. PMID 9533029.
Крапивинский Г., Пу В., Викман К., Крапивинский Л., Клэпхэм Д. Э. (1998). "pICln связывается с млекопитающим гомологом дрожжевого белка, участвующего в регуляции морфологии клеток". J. Biol. Chem . 273 (18): 10811– 4. doi : 10.1074/jbc.273.18.10811 . PMID 9556550.
Tang CJ, Tang TK (1998). «30-кДа домен белка 4.1 опосредует его связывание с карбоксильным концом pICln, белка, участвующего в регуляции клеточного объема». Blood . 92 (4): 1442– 7. doi :10.1182/blood.V92.4.1442. PMID 9694734.
Pu WT, Krapivinsky GB, Krapivinsky L, Clapham DE (1999). "pICln ингибирует биогенез snRNP, связывая основные сплайсосомные белки". Mol. Cell. Biol . 19 (6): 4113– 20. doi :10.1128/MCB.19.6.4113. PMC 104370. PMID 10330151 .
Hubert MD, Levitan I, Hoffman MM, Zraggen M, Hofreiter ME, Garber SS (2000). "Модуляция регулируемого объемом анионного тока с помощью I(Cln)". Biochim. Biophys. Acta . 1466 ( 1– 2): 105– 14. doi : 10.1016/S0005-2736(00)00177-2 . PMID 10825435.
Friesen WJ, Paushkin S, Wyce A, Massenet S, Pesiridis GS, Van Duyne G, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (2001). "Метилосома, комплекс 20S, содержащий JBP1 и pICln, производит модифицированные диметиларгинином белки Sm". Mol. Cell. Biol . 21 (24): 8289– 300. doi :10.1128/MCB.21.24.8289-8300.2001. PMC 99994. PMID 11713266 .
Meister G, Eggert C, Bühler D, Brahms H, Kambach C, Fischer U (2002). «Метилирование белков Sm комплексом, содержащим PRMT5 и предполагаемый фактор сборки U snRNP pICln». Curr. Biol . 11 (24): 1990– 4. doi :10.1016/S0960-9822(01)00592-9. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F501-7 . PMID 11747828. S2CID 14742376.
Friesen WJ, Wyce A, Paushkin S, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (2002). "Новый компонент белка повтора WD метилосомы связывает белки Sm". J. Biol. Chem . 277 (10): 8243– 7. doi : 10.1074/jbc.M109984200 . PMID 11756452.
Мейер Г., Родигьеро С., Гуиццарди Ф., Баззини С., Ботта Г., Бертокки С., Гаравалья Л., Доссена С., Манфреди Р., Сирони С., Катания А., Паульмихл М. (2004). «Объемно-регулируемые Cl ^- каналы в клетках мезотелиомы плевры человека». ФЭБС Летт . 559 ( 1–3 ): 45–50 . Бибкод : 2004FEBSL.559...45M. дои : 10.1016/S0014-5793(04)00020-1. PMID 14960305. S2CID 24747269.
Larkin D, Murphy D, Reilly DF, Cahill M, Sattler E, Harriott P, Cahill DJ, Moran N (2004). "ICln, новый белок, связанный с интегрином alphaIIbbeta3, функционально регулирует активацию тромбоцитов". J. Biol. Chem . 279 (26): 27286– 93. doi : 10.1074/jbc.M402159200 . PMID 15075326.
Fürst J, Schedlbauer A, Gandini R, Garavaglia ML, Saino S, Gschwentner M, Sarg B, Lindner H, Jakab M, Ritter M, Bazzini C, Botta G, Meyer G, Kontaxis G, Tilly BC, Konrat R, Paulmichl M (2005). "ICln159 сворачивается в структуру, похожую на домен гомологии плекстрина. Взаимодействие с киназами и фактором сплайсинга LSm4". J. Biol. Chem . 280 (35): 31276– 82. doi : 10.1074/jbc.M500541200 . PMID 15905169.
Azzouz TN, Pillai RS, Däpp C, Chari A, Meister G, Kambach C, Fischer U, Schümperli D (2005). «На пути к сборочной линии для U7 snRNP: взаимодействия специфичных для U7 Lsm-белков с комплексами PRMT5 и SMN». J. Biol. Chem . 280 (41): 34435– 40. doi : 10.1074/jbc.M505077200 . hdl : 21.11116/0000-0007-E5F1-6 . PMID 16087681.

Внешние ссылки

CLNS1A+белок,+человек в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Расположение генома человека CLNS1A и страница с подробностями гена CLNS1A в браузере геномов UCSC .

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 11 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000074201 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000025439 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7887970-5] Anguita J, Chalfant ML, Civan MM, Coca-Prados M (апрель 1995 г.). «Молекулярное клонирование человеческого объемно-чувствительного регуляторного белка проводимости хлорида, pICln, из цилиарного эпителия глаза». Biochem Biophys Res Commun . 208 (1): 89– 95. doi :10.1006/bbrc.1995.1309. PMID 7887970.

[pmid8975725-6] Nagl UO, Erdel M, Schmarda A, Seri M, Pinggera GM, Gschwentner M, Duba C, Galietta LJ, Deetjen P, Utermann G, Paulmichl M (март 1997). "Хромосомная локализация генов (CLNS1A и CLNS1B), кодирующих зависящий от набухания хлоридный канал ICln". Genomics . 38 (3): 438– 41. doi :10.1006/geno.1996.0651. PMID 8975725.

[entrez-7] "Ген Энтреза: хлоридный канал CLNS1A, чувствительный к нуклеотидам, 1A".

[pmid15075326-8] Ларкин Д., Мерфи Д., Рейли Д.Ф., Кэхилл М., Саттлер Э., Харриотт П., Кэхилл DJ, Моран Н. (июнь 2004 г.). «ICln, новый белок, связанный с интегрином альфаIIbbeta3, функционально регулирует активацию тромбоцитов». Ж. Биол. Хим . 279 (26): 27286–93 . doi : 10.1074/jbc.M402159200 . ПМИД 15075326.

[pmid11713266-9] Friesen WJ, Paushkin S, Wyce A, Massenet S, Pesiridis GS, Van Duyne G, Rappsilber J , Mann M, Dreyfuss G (декабрь 2001 г.). «Метилосома, комплекс 20S, содержащий JBP1 и pICln, производит модифицированные диметиларгинином белки Sm». Mol. Cell. Biol . 21 (24): 8289– 300. doi :10.1128/MCB.21.24.8289-8300.2001. PMC 99994 . PMID 11713266.

[pmid9556550-10] Крапивинский Г., Пу В., Викман К., Крапивинский Л., Клэпхэм Д. Э. (май 1998 г.). "pICln связывается с гомологом млекопитающего белка дрожжей, участвующим в регуляции морфологии клеток". J. Biol. Chem . 273 (18): 10811– 4. doi : 10.1074/jbc.273.18.10811 . PMID 9556550.

[pmid11756452-11] Friesen WJ, Wyce A, Paushkin S, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (март 2002 г.). «Новый компонент белка повтора WD метилосомы связывает белки Sm». J. Biol. Chem . 277 (10): 8243– 7. doi : 10.1074/jbc.M109984200 . PMID 11756452.

[pmid33624332-12] Кржижановски А., Гаспер Р., Адихоу Х., 'т Харт П., Вальдманн Х. (февраль 2021 г.). «Биохимическое исследование взаимодействия pICln, RioK1 и COPR5 с комплексом PRMT5-MEP50». ChemBioChem . 22 (11): 1908–1914 . doi : 10.1002/cbic.202100079 . PMC 8252068. PMID 33624332 .