Белок, содержащий повтор WD 77

WDR77
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	4GQB, 4X60, 4X61, 4X63, 5EMJ, 5EML, 5EMM, 5FA5, 5EMK, 5C9Z
Идентификаторы
Псевдонимы	WDR77 , MEP-50, MEP50, Nbla10071, p44, p44/Mep50, HKMT1069, повтор домена WD 77
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 611734; МГИ : 1917715; гомологен : 11466; Генные карты : WDR77; OMA :WDR77 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 1 (человек)
Конец	111,449,256 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 3 (мышь)
Конец	105,877,353 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	правая маточная труба; ; верхушка сердца; ; икроножная мышца; ; кора правого надпочечника; ; мышца бедра; ; слизистая оболочка пищевода; ; тело желудка; ; левый желудочек; ; левый надпочечник; ; прямая кишка;
	Верх выражен в
	примитивная черта; ; эпибласт; ; сомит; ; хвост эмбриона; ; брюшная стенка; ; эндокардиальная подушка; ; Гонадный гребень; ; эмбрион; ; эмбрион; ; выступ нижней челюсти;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание метил-CpG; связывание белков; активность ядерного рецептора коактиватора; активность протеин-аргинин N-метилтрансферазы;
Клеточный компонент	цитоплазма; цитозоль; аппарат Гольджи; метилосома; нуклеоплазма; ядро;
Биологический процесс	регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; дифференцировка секреторных столбчатых люминарных эпителиальных клеток, участвующих в развитии ацинуса предстательной железы; негативная регуляция пролиферации эпителиальных клеток, участвующих в развитии предстательной железы; позитивная регуляция пролиферации клеточной популяции; негативная регуляция пролиферации клеточной популяции; N-метилирование пептидил-аргинина; позитивная регуляция транскрипции, основанной на шаблонах нуклеиновых кислот; сплайсосомная сборка snRNP;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	79084
	70465
	ENSG00000116455
	ENSMUSG00000000561
	Q9BQA1
	Q99J09
	NM_024102 ; NM_001317062 ; NM_001317063 ; NM_001317064
	NM_027432
	НП_001303991 ; НП_001303992 ; НП_001303993 ; НП_077007
	NP_081708
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Метилосомный белок 50 — это белок , который у людей кодируется геном WDR77 . ^[5]^[6]^[7]

Взаимодействия

Было показано, что белок 77, содержащий повтор WD, взаимодействует с CTDP1 ^[8] и протеин-аргининметилтрансферазой 5 ^[5] .

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000116455 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000000561 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ ab Friesen WJ, Wyce A, Paushkin S, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (март 2002 г.). "Новый компонент белка повтора WD метилосомы связывает белки Sm". J Biol Chem . 277 (10): 8243– 7. doi : 10.1074/jbc.M109984200 . PMID 11756452.
^ Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (июнь 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшенного построения библиотеки дробовика». Anal Biochem . 236 (1): 107– 13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
^ "Ген Энтреза: WDR77 WD повторяющийся домен 77".
^ Licciardo P, Amente Stefano, Ruggiero Luca, Monti Maria, Pucci Piero, Lania Luigi, Majello Barbara (февраль 2003 г.). «Фосфатаза FCP1 взаимодействует с РНК-полимеразой II и с MEP50, компонентом комплекса метилосомы, участвующим в сборке snRNP». Nucleic Acids Res . 31 (3). England: 999–1005 . doi :10.1093/nar/gkg197. PMC 149217. PMID 12560496 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Yu W, Andersson B, Worley KC и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование ДНК». Genome Res . 7 (4): 353– 8. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K и др. (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Licciardo P, Amente S, Ruggiero L, et al. (2003). «Фосфатаза FCP1 взаимодействует с РНК-полимеразой II и с MEP50, компонентом комплекса метилосомы, участвующим в сборке snRNP». Nucleic Acids Res . 31 (3): 999–1005 . doi :10.1093/nar/gkg197. PMC 149217. PMID 12560496 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Ямада С., Охира М., Хори Х. и др. (2004). «Профилирование экспрессии и дифференциальный скрининг между гепатобластомами и соответствующей нормальной печенью: идентификация высокой экспрессии онкогена PLK1 как плохого прогностического индикатора гепатобластом». Онкоген . 23 (35): 5901– 11. doi :10.1038/sj.onc.1207782. PMID 15221005. S2CID 3114318.
Jin J, Smith FD, Stark C и др. (2004). «Протеомный, функциональный и основанный на доменах анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Biol . 14 (16): 1436–50 . doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660. S2CID 2371325.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Amente S, Napolitano G, Licciardo P и др. (2005). «Идентификация белков, взаимодействующих с фосфатазой RNAPII FCP1: FCP1 образует комплекс с аргининметилтрансферазой PRMT5 и является субстратом для метилирования, опосредованного PRMT5». FEBS Lett . 579 (3): 683– 9. doi : 10.1016/j.febslet.2004.12.045 . PMID 15670829.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация человеческой хромосомы 1». Nature . 441 (7091): 315– 21. Bibcode :2006Natur.441..315G. doi : 10.1038/nature04727 . PMID 16710414.
Furuno K, Masatsugu T, Sonoda M и др. (2006). «Ассоциация группы Polycomb SUZ12 с белком WD-повторов MEP50, который селективно связывается с гистоном H2A in vitro». Biochem. Biophys. Res. Commun . 345 (3): 1051– 8. doi :10.1016/j.bbrc.2006.05.014. PMID 16712789.
Zhou L, Wu H, Lee P, Wang Z (2007). «Роль кофактора андрогенового рецептора p44 в росте эпителиальных клеток простаты». J. Mol. Endocrinol . 37 (2): 283–300 . doi : 10.1677/jme.1.02062 . PMID 17032745.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.
Liang JJ, Wang Z, Chiriboga L, et al. (2007). «Экспрессия и функция коактиватора андрогенового рецептора p44 и белка аргининметилтрансферазы 5 в развивающихся опухолях яичек и яичек». J. Urol . 177 (5): 1918– 22. doi :10.1016/j.juro.2007.01.017. PMID 17437848.

Rengasamy, M, Zhang, F, Vashisht, A, Song, WM, et al. (2017). «Комплекс PRMT5/WDR77 регулирует альтернативный сплайсинг через ZNF326 при раке груди». Nucleic Acids Res . 45 (19): 11106– 11120. doi : 10.1093/nar/gkx727 . PMC 5737218. PMID 28977470 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9BQA1 (белок метилосомы 50) на сайте PDBe-KB .

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 1 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000116455 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000000561 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11756452-5] Friesen WJ, Wyce A, Paushkin S, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (март 2002 г.). "Новый компонент белка повтора WD метилосомы связывает белки Sm". J Biol Chem . 277 (10): 8243– 7. doi : 10.1074/jbc.M109984200 . PMID 11756452.

[pmid8619474-6] Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (июнь 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшенного построения библиотеки дробовика». Anal Biochem . 236 (1): 107– 13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.

[entrez-7] "Ген Энтреза: WDR77 WD повторяющийся домен 77".

[pmid12560496-8] Licciardo P, Amente Stefano, Ruggiero Luca, Monti Maria, Pucci Piero, Lania Luigi, Majello Barbara (февраль 2003 г.). «Фосфатаза FCP1 взаимодействует с РНК-полимеразой II и с MEP50, компонентом комплекса метилосомы, участвующим в сборке snRNP». Nucleic Acids Res . 31 (3). England: 999–1005 . doi :10.1093/nar/gkg197. PMC 149217. PMID 12560496 .