Белок G
| GA-подобный домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ? | ||||||||
| Пфам | ПФ17573 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR035152 | ||||||||
| |||||||||
| Иммуноглобулин G-связывающий белок G | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||
| Организм | |||||||
| Символ | спг | ||||||
| UniProt | P06654 | ||||||
| |||||||
Белок G — это иммуноглобулин -связывающий белок, экспрессируемый в стрептококковых бактериях групп C и G, во многом похожий на белок A , но с различной специфичностью связывания. Это белок клеточной поверхности массой ~60 кДа (65 кДа для штамма G148 и 58 кДа для штамма C40) [1] , который нашел применение в очистке антител посредством связывания с Fab- и Fc- областями. Нативная молекула также связывает альбумин , но поскольку сывороточный альбумин является основным загрязнителем источников антител, сайт связывания альбумина был удален из рекомбинантных форм белка G. Этот рекомбинантный белок G, либо помеченный флуорофором, либо одноцепочечной цепью ДНК, использовался в качестве замены вторичных антител в иммунофлуоресценции и сверхразрешающей визуализации. [2]
Другие белки, связывающие антитела
Помимо белка G, для очистки, иммобилизации или обнаружения иммуноглобулинов обычно используются другие иммуноглобулинсвязывающие бактериальные белки, такие как белок A , белок A/G и белок L. Каждый из этих иммуноглобулинсвязывающих белков имеет различный профиль связывания антител с точки зрения части антитела, которая распознается, а также вида и типа антител, которые он будет связывать.
Сворачивание белка G, домен B1
Моделирование ab initio домена белка G B1 показывает, что, как и предполагалось в более ранних результатах, этот белок инициирует сворачивание посредством события нуклеации в гидрофобных остатках ядра , за которым следуют небольшие корректировки. [3] События сворачивания следующие:
- Образуется β-шпилька , стабилизированная остатками W43, Y45 и F52.
- Контакты между остатком F30 в α-спирали и β-шпилькой усиливаются.
- Происходит зарождение β-слоя , начиная с остатков L5 и F52.
- Последний остаток зародышеобразования, Y3, участвует в формировании центральной части β-слоя, в результате чего образуется глобулярный белок .
Домен белка G B1 (он же GB1) часто используется как часть белка слияния для поддержания других доменов в растворе во время экспериментов в растворе (например, ЯМР ). Многие ранее нерастворимые домены стали растворимыми при слиянии домена GB1. [4] Домен состоит из 56 остатков (приблизительно 8 кДа). В гелях SDS-PAGE домен GB1 имеет массу около 13,5 кДа, несмотря на то, что он всего 8 кДа. [5]
Смотрите также
Ссылки
- ^ Sjobring U, Bjorck L, Kastern W, et al. (1991). "Стрептококковый белок G. Структура гена и свойства связывания белка". J Biol Chem . 266 (1): 399– 405. doi : 10.1016/S0021-9258(18)52448-0 . PMID 1985908.
- ^ Шлихтэрле, Томас; Ганджи, Махипал; Ауэр, Александр; Уэйд, Орсоля Кимбу; Юнгманн, Ральф (2018). «Бактериальные связыватели антител как небольшие адаптеры для микроскопии ДНК-PAINT». ChemBioChem . 20 (8): 1032– 1038. doi : 10.1002/cbic.201800743. hdl : 21.11116/0000-0003-E68E-A . ISSN 1439-7633. PMID 30589198. S2CID 58547594.
- ^ Kmiecik S, Kolinski A (февраль 2008 г.). «Путь складывания домена b1 белка G, исследованный с помощью многомасштабного моделирования». Biophys J . 94 (3): 726– 36. Bibcode :2008BpJ....94..726K. doi :10.1529/biophysj.107.116095. PMC 2186257 . PMID 17890394.
- ^ Ченг, Юань; Патель, Диншоу Дж. (2004). «Эффективная система для экспрессии и рефолдинга небольших белков». Biochemical and Biophysical Research Communications . 317 (2): 401– 405. doi :10.1016/j.bbrc.2004.03.068. PMC 4693640. PMID 15063772 .
- ^ Hartl MJ, Mayr F, Rethwilm A, Wöhrl BM (2010). "Биофизические и ферментативные свойства обратных транскриптаз обезьяньего и прототипного пенистого вируса". Retrovirology . 7 : 5. doi : 10.1186/1742-4690-7-5 . PMC 2835651. PMID 20113504 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
