Пи-укладка
Привлекательные взаимодействия между ароматическими кольцами
Три представительные конформации димера бензола

В химии пи-стэкинг (также называемый π–π-стэкингом ) относится к предположительно притягивающим, нековалентным пи-взаимодействиям между пи-связями ароматических колец из-за перекрытия орбиталей . [1] По мнению некоторых авторов , прямое стэкингование ароматических колец («сэндвич-взаимодействие») является электростатически отталкивающим.

Чаще всего наблюдается (см. рисунок справа) либо ступенчатая укладка (параллельно смещенная), либо пи-ти (перпендикулярно Т-образная) взаимодействие, оба из которых являются электростатически притягивающими [2] [3] Например, наиболее часто наблюдаемое взаимодействие между ароматическими кольцами аминокислотных остатков в белках — это ступенчатая укладка, за которой следует перпендикулярная ориентация. Сэндвич-ориентации встречаются относительно редко. [4]

Укладка пи отталкивающая, поскольку она помещает атомы углерода с частичными отрицательными зарядами из одного кольца поверх других частично отрицательно заряженных атомов углерода из второго кольца и атомы водорода с частичными положительными зарядами поверх других атомов водорода, которые также несут частичные положительные заряды. [2] При шахматной укладке одно из двух ароматических колец смещено вбок, так что атомы углерода с частичным отрицательным зарядом в первом кольце помещаются над атомами водорода с частичным положительным зарядом во втором кольце, так что электростатические взаимодействия становятся притягивающими. Аналогично, взаимодействия пи-ти, в которых два кольца ориентированы перпендикулярно друг другу, являются электростатически притягивающими, поскольку они помещают частичные положительно заряженные атомы водорода в непосредственной близости от частично отрицательно заряженных атомов углерода. Альтернативное объяснение предпочтения шахматной укладки связано с балансом между взаимодействиями Ван-дер-Ваальса (притягивающая дисперсия плюс отталкивание Паули ). [5]

Эти ступенчатые укладки и π-тройные взаимодействия между ароматическими кольцами важны для укладки нуклеиновых оснований в молекулах ДНК и РНК , сворачивания белков , синтеза, направленного на шаблон , материаловедения и молекулярного распознавания . Несмотря на широкое использование термина pi-укладка в научной литературе, теоретического обоснования его использования не существует. [2]

Доказательства против укладки числа Пи

Димер бензола является прототипической системой для изучения pi-стекинга и экспериментально связан 8–12 кДж/моль (2–3 ккал/моль) в газовой фазе с разделением 4,96 Å между центрами масс для T-образного димера. Малая энергия связи затрудняет экспериментальное изучение димера бензола, а сам димер стабилен только при низких температурах и склонен к кластеризации. [6]

Другие доказательства против pi-стекинга получены из рентгеновской кристаллографии . Перпендикулярные и смещенные параллельные конфигурации можно наблюдать в кристаллических структурах многих простых ароматических соединений. [6] Аналогичные смещенные параллельные или перпендикулярные геометрии наблюдались в обзоре высокоразрешающих рентгеновских структур кристаллов белков в Protein Data Bank . [7] Анализ ароматических аминокислот фенилаланина, тирозина, гистидина и триптофана показывает, что димеры этих боковых цепей имеют много возможных стабилизирующих взаимодействий на расстояниях, больших, чем средние радиусы Ван-дер-Ваальса. [4]

Предпочтительные геометрии димера бензола были смоделированы на высоком уровне теории с помощью вычислений MP2-R12/A и очень больших базисных наборов aug-cc-PVTZ с поправкой на противовес. [6] Две наиболее стабильные конформации — это параллельно смещенная и T-образная, которые по сути изоэнергетичны. Напротив, конфигурация сэндвича максимизирует перекрытие системы pi, что дестабилизирует взаимодействие. Конфигурация сэндвича представляет собой энергетическую седловую точку, что согласуется с относительной редкостью этой конфигурации в данных рентгеновского кристалла. [ необходима цитата ]

Квадрупольные моменты бензола и гексафторбензола. Полярность инвертирована из-за различий в электроотрицательности водорода и фтора относительно углерода.

Относительные энергии связи этих трех геометрических конфигураций димера бензола можно объяснить балансом квадрупольных/квадрупольных и лондоновских дисперсионных сил . Хотя бензол не имеет дипольного момента, он имеет сильный квадрупольный момент . [8] Локальный диполь C–H означает, что на атомах в кольце есть положительный заряд и, соответственно, отрицательный заряд, представляющий электронное облако над и под кольцом. Квадрупольный момент меняет знак для гексафторбензола из-за электроотрицательности фтора. Димер бензола в конфигурации сэндвича стабилизируется лондоновскими дисперсионными силами, но дестабилизируется отталкивающими квадрупольными/квадрупольными взаимодействиями. Смещая одно из бензольных колец, параллельная смещенная конфигурация уменьшает эти отталкивающие взаимодействия и стабилизируется. Большая поляризуемость ароматических колец приводит к дисперсионным взаимодействиям как основному вкладу в эффекты стекирования. Они играют важную роль во взаимодействиях азотистых оснований, например, в ДНК . [9] T-образная конфигурация имеет благоприятные квадруполь/квадрупольные взаимодействия, поскольку положительный квадруполь одного бензольного кольца взаимодействует с отрицательным квадруполем другого. Бензольные кольца находятся дальше всего друг от друга в этой конфигурации, поэтому благоприятные квадруполь/квадрупольные взаимодействия, очевидно, компенсируют уменьшенные дисперсионные силы.

Замещающие эффекты

Возможность тонкой настройки pi-стекинговых взаимодействий была бы полезна в многочисленных синтетических попытках. Одним из примеров может быть увеличение сродства связывания ингибитора с небольшой молекулой с ферментным карманом, содержащим ароматические остатки. Влияние гетероатомов [7] и заместителей на pi-стекинговые взаимодействия трудно моделировать, и это предмет дискуссий.

Электростатическая модель

Ранняя модель роли заместителей во взаимодействиях pi-стэкинга была предложена Хантером и Сандерсом. [10] Они использовали простую математическую модель, основанную на сигма- и пи-атомных зарядах, относительной ориентации и ван-дер-ваальсовых взаимодействиях, чтобы качественно определить, что электростатика доминирует в эффектах заместителей. Согласно их модели, электроноакцепторные группы уменьшают отрицательный квадруполь ароматического кольца и тем самым благоприятствуют параллельным смещенным и сэндвичевым конформациям. Напротив, электронодонорные группы увеличивают отрицательный квадруполь, что может увеличить силу взаимодействия в Т-образной конфигурации с надлежащей геометрией. Основываясь на этой модели, авторы предложили набор правил, управляющих пи-стэкинговыми взаимодействиями, которые преобладали до тех пор, пока не были применены более сложные вычисления. [ необходима цитата ]

Экспериментальные доказательства модели Хантера-Сандерса были предоставлены Сигелом и др. с использованием серии замещенных син- и анти-1,8-ди -о -толилнафталинов. [11] В этих соединениях арильные группы «сталкиваются» в сложенной геометрии из-за стерической скученности, а барьер эпимеризации был измерен с помощью спектроскопии ядерного магнитного резонанса . Авторы сообщили, что арильные кольца с электроноакцепторными заместителями имели более высокие барьеры для вращения. Интерпретация этого результата состояла в том, что эти группы снижали электронную плотность ароматических колец, допуская более благоприятные сэндвичевые пи-стекинговые взаимодействия и, таким образом, более высокий барьер. Другими словами, электроноакцепторные группы приводили к «менее неблагоприятным» электростатическим взаимодействиям в основном состоянии. [ необходима цитата ]

Двойной мутантный цикл, использованный Хантером и др. [12] для исследования взаимодействий T-образной π-стекинга

Хантер и др. применили более сложный химический двойной мутантный цикл с водородно-связанной «молнией» к вопросу эффектов заместителей во взаимодействиях pi-стэкинга. [12] Этот метод использовался для изучения множества нековалентных взаимодействий. Одиночная мутация, в данном случае изменение заместителя в ароматическом кольце, приводит к вторичным эффектам, таким как изменение прочности водородной связи . Двойная мутация количественно определяет эти вторичные взаимодействия, так что даже слабое взаимодействие, представляющее интерес, может быть выделено из массива. Их результаты показывают, что более электроноакцепторные заместители имеют менее отталкивающие взаимодействия pi-стэкинга. Соответственно, эта тенденция была точно инвертирована для взаимодействий с пентафторфенилбензолом, который имеет квадрупольный момент, равный по величине, но противоположный по знаку, как у бензола. [8] Результаты предоставляют прямые доказательства в пользу модели Хантера–Сандерса. Однако взаимодействия стекирования, измеренные с использованием метода двойных мутантов, оказались на удивление малыми, и авторы отмечают, что эти значения, возможно, не будут переноситься на другие системы.

В последующем исследовании Хантер и др. подтвердили в первом приближении, что энергии взаимодействия взаимодействующих ароматических колец в двойном мутантном цикле определяются электростатическими эффектами. [13] Однако авторы отмечают, что прямые взаимодействия с заместителями кольца, обсуждаемые ниже, также вносят важный вклад. Действительно, взаимодействие этих двух факторов может привести к сложному поведению взаимодействий pi-стэкинга, зависящему от заместителя и геометрии.

Модель прямого взаимодействия

Модель Хантера-Сандерса подверглась критике со стороны многочисленных исследовательских групп, предлагающих противоречивые экспериментальные и вычислительные доказательства взаимодействия пи-стекинга, которые не регулируются в первую очередь электростатическими эффектами. [14]

Наиболее четкие экспериментальные доказательства против эффектов электростатических заместителей были представлены Рашкиным и Уотерсом. [15] Они использовали мета- и пара-замещенные бромиды N-бензил-2-(2-фторфенил)-пиридиния, которые укладываются в параллельной смещенной конформации, в качестве модельной системы для взаимодействий pi-стэкинга. В их системе метиленовый линкер запрещает благоприятные T-образные взаимодействия. Как и в предыдущих моделях, относительная сила взаимодействий pi-стэкинга измерялась с помощью ЯМР как скорость вращения вокруг биарильной связи, поскольку взаимодействия pi-стэкинга нарушаются в переходном состоянии . Пара-замещенные кольца имели небольшие вращательные барьеры, которые увеличивались с увеличением числа электроноакцепторных групп, что согласуется с предыдущими выводами. Однако мета-замещенные кольца имели гораздо большие барьеры вращения, несмотря на почти одинаковую электронную плотность в ароматическом кольце. Авторы объясняют это несоответствие как прямое взаимодействие края атомов водорода одного кольца с электроотрицательными заместителями на другом кольце. Это утверждение подтверждается данными о химическом сдвиге рассматриваемого протона. [ необходима ссылка ]

Большая часть детального анализа относительного вклада факторов в pi-стекинг была подтверждена вычислениями. Шерилл и Синнокрот сообщили об удивительном открытии, используя теорию высокого уровня, что все замещенные димеры бензола имеют более благоприятные связывающие взаимодействия, чем димер бензола в конфигурации сэндвича. [16] Более поздняя вычислительная работа группы Шерилла показала, что эффекты заместителей для конфигурации сэндвича являются аддитивными, что указывает на сильное влияние дисперсионных сил и прямых взаимодействий между заместителями. [17] Было отмечено, что взаимодействия между замещенными бензолами в T-образной конфигурации были более сложными. Наконец, Шерилл и Синнокрот утверждают в своей обзорной статье, что любое подобие тенденции, основанной на электрон-донорных или оттягивающих заместителях, можно объяснить обменно-отталкивающими и дисперсионными терминами. [18]

Вычислительная модель Хоука и Уиллера [19] прямых взаимодействий заместителей в пи-стекинге.

Хоук и Уилер также предоставляют убедительные вычислительные доказательства важности прямого взаимодействия в пи-стекинге. [19] В своем анализе замещенных димеров бензола в сэндвич-конформации они смогли повторить свои выводы, используя чрезвычайно простую модель, в которой замещенный бензол, Ph–X, был заменен на H–X. Примечательно, что эта грубая модель привела к той же тенденции в относительных энергиях взаимодействия и сильно коррелировала со значениями, рассчитанными для Ph–X. Это открытие предполагает, что эффекты заместителей в димере бензола обусловлены прямым взаимодействием заместителя с ароматическим кольцом, и что пи-система замещенного бензола не участвует. Этот последний момент подробно рассматривается ниже.

Подводя итог, можно сказать, что относительный вклад электростатики, дисперсии и прямых взаимодействий в эффекты заместителей, наблюдаемые во взаимодействиях pi-стэкинга, в значительной степени зависит от геометрии и экспериментального дизайна. Отсутствие консенсуса по этому вопросу может просто отражать сложность проблемы.

Требование ароматичности

Традиционное понимание pi-стекинга подразумевает квадрупольные взаимодействия между делокализованными электронами в p-орбиталях. Другими словами, для возникновения этого взаимодействия должна быть необходима ароматичность. Однако несколько групп предоставили противоположные доказательства, поставив под сомнение, является ли pi-стекинг уникальным явлением или он распространяется на другие нейтральные молекулы с закрытой оболочкой.

В эксперименте, не отличающемся от других, упомянутых выше, Паливал и соавторы построили молекулярный торсионный баланс из арильного эфира с двумя конформационными состояниями. [20] Свернутое состояние имело четко определенное пи-стекинговое взаимодействие с Т-образной геометрией, тогда как развернутое состояние не имело арил-арильных взаимодействий. Химические сдвиги ЯМР двух конформаций были различны и могли быть использованы для определения соотношения двух состояний, которое было интерпретировано как мера внутримолекулярных сил. Авторы сообщают, что предпочтение свернутого состояния не является уникальным для арильных эфиров. Например, циклогексиловый эфир отдавал предпочтение свернутому состоянию больше, чем фениловый эфир, а трет-бутиловый эфир отдавал предпочтение свернутому состоянию с большим предпочтением, чем любой арильный эфир. Это говорит о том, что ароматичность не является строгим требованием для благоприятного взаимодействия с ароматическим кольцом.

Другие доказательства результатов неароматических пи-стекинговых взаимодействий включают критические исследования в области теоретической химии, объясняющие основные механизмы эмпирических наблюдений. Гримме сообщил, что энергии взаимодействия более мелких димеров, состоящих из одного или двух колец, очень похожи как для ароматических, так и для насыщенных соединений. [21] Это открытие имеет особое значение для биологии и предполагает, что вклад пи-систем в такие явления, как стекированные нуклеиновые основания, может быть переоценен. Однако было показано, что для больших ароматических димеров наблюдается повышенное стабилизирующее взаимодействие. Как отмечалось ранее, эта энергия взаимодействия сильно зависит от геометрии. Действительно, большие ароматические димеры стабилизируются только относительно своих насыщенных аналогов в геометрии сэндвича, в то время как их энергии схожи в Т-образном взаимодействии.

а) Замещенные нафталины и б) Гомодесмотическое рассечение бензола, использованное Блумом и Уиллером [22] для количественной оценки эффектов делокализации на укладку пи.

Более прямой подход к моделированию роли ароматичности был предпринят Блумом и Уиллером. [22] Авторы сравнили взаимодействия между бензолом и 2-метилнафталином или его неароматическим изомером, 2-метилен-2,3-дигидронафталином. Последнее соединение обеспечивает средство сохранения числа p-электронов, однако устраняя эффекты делокализации. Удивительно, но энергии взаимодействия с бензолом выше для неароматического соединения, что предполагает, что локализация pi-связи благоприятна во взаимодействиях pi-стэкинга. Авторы также рассмотрели гомодесмотическое разделение бензола на этилен и 1,3-бутадиен и сравнили эти взаимодействия в сэндвиче с бензолом. Их расчет показывает, что энергия взаимодействия между бензолом и гомодесмотическим бензолом выше, чем у димера бензола как в сэндвичевой, так и в параллельно смещенной конформации, что снова подчеркивает благоприятность локализованных взаимодействий пи-связей. Эти результаты убедительно свидетельствуют о том, что ароматичность не требуется для взаимодействий пи-стэкинга в этой модели.

Даже в свете этих доказательств Гримме приходит к выводу, что пи-стэкинг действительно существует. [21] Однако он предупреждает, что меньшие кольца, особенно в Т-образных конформациях, не ведут себя существенно иначе, чем их насыщенные аналоги, и что этот термин следует указать для более крупных колец в стэкинговых конформациях, которые, по-видимому, демонстрируют кооперативный пи-электронный эффект.

Примеры

Фуллерен связан в бакикэтчере посредством ароматических стекинг-взаимодействий. [23]

Одна из демонстраций укладки найдена в buckycatcher . [23] Этот молекулярный пинцет основан на двух вогнутых buckybowls с идеальной посадкой для одной выпуклой молекулы фуллерена . Комплексообразование происходит просто путем испарения раствора толуола, содержащего оба соединения. В растворе константа ассоциации 8600 M −1 измеряется на основе изменений химических сдвигов ЯМР . [ требуется цитата ]

Такрин связан с ацетилхолинэстеразой (PDB 1ACJ). Предполагается взаимодействие pi-стекинга между такрином (синий) и Trp84 (красный).

Укладка Pi распространена в кристаллических структурах белков, а также способствует взаимодействиям между малыми молекулами и белками. В результате взаимодействия pi–pi и катион–pi являются важными факторами в рациональном дизайне лекарств. [24] Одним из примеров является одобренный FDA ингибитор ацетилхолинэстеразы (AChE) такрин , который используется при лечении болезни Альцгеймера . Предполагается, что такрин имеет взаимодействие pi-укладки с индольным кольцом Trp84, и это взаимодействие было использовано в рациональном дизайне новых ингибиторов AChE. [25]

Супрамолекулярная сборка

Рисунок 2. Синтез Стоддарта [2] катенана...

π-системы являются строительными блоками в супрамолекулярной сборке , поскольку они часто участвуют в нековалентных взаимодействиях. Примером π–π-взаимодействий в супрамолекулярной сборке является синтез катенана . Основной проблемой для синтеза катенана является контролируемое связывание молекул. Стоддарт и его коллеги разработали ряд систем, использующих сильные π–π-взаимодействия между богатыми электронами производными бензола и бедными электронами пиридиниевыми кольцами. [26] [2]Катанен был синтезирован путем реакции бис(пиридиния) ( A ), биспарафенилен-34-краун-10 ( B ) и 1,4-бис(бромметил)бензола ( C ) (рис. 2). π–π-взаимодействие между A и B направляло образование взаимосвязанного промежуточного шаблона, который далее циклизовался реакцией замещения с соединением C для получения продукта [2]катенана.

Соли переноса заряда

Вид с ребра части кристаллической структуры гексаметиленовой соли переноса заряда TTF /TCNQ, подчеркивающий сегрегированную укладку. [27]
Вид с торца части кристаллической структуры соли переноса заряда гексаметилен TTF /TCNQ. Расстояние между плоскостями TTF составляет 3,55 Å.

Комбинация тетрацианохинодиметана (TCNQ) и тетратиафульвалена (TTF) образует сильный комплекс переноса заряда, называемый TTF-TCNQ . [28] Твердое вещество показывает почти металлическую электропроводность. В кристалле TTF-TCNQ молекулы TTF и TCNQ расположены независимо в отдельных параллельно выровненных стопках, и перенос электронов происходит от донорных (TTF) к акцепторным (TCNQ) стопкам. [29]

Графит

Вид сбоку на укладку слоев ABA в графите

Графит состоит из сложенных листов ковалентно связанного углерода. [30] [31] Отдельные слои называются графеном . В каждом слое каждый атом углерода связан с тремя другими атомами, образуя непрерывный слой sp 2 связанных углеродных шестиугольников, как сотовая решетка с длиной связи 0,142 нм, а расстояние между плоскостями составляет 0,335 нм. [32]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Смит, Майкл Б.; Марч, Джерри (2007), Advanced Organic Chemistry: Reactions, Mechanisms, and Structure (6-е изд.), Нью-Йорк: Wiley-Interscience, стр. 114, ISBN 978-0-471-72091-1
  2. ^ abc Martinez CR, Iverson BL (2012). «Переосмысление термина «пи-стакинг»». Chemical Science . 3 (7): 2191. doi : 10.1039/c2sc20045g. hdl : 2152/41033 . ISSN  2041-6520. S2CID  95789541.
  3. ^ Льюис М., Бэгвилл С., Хардебек Л., Вайредуа С. (2016). «Современные вычислительные подходы к пониманию взаимодействий ароматических соединений». В Джонсон Д. В., Хоф Ф. (ред.). Ароматические взаимодействия: границы знаний и применения . Англия: Королевское химическое общество. стр.  1–17 . ISBN 978-1-78262-662-6.
  4. ^ ab McGaughey GB, Gagné M, Rappé AK (июнь 1998 г.). "пи-стэкинговые взаимодействия. Живы и здоровы в белках". Журнал биологической химии . 273 (25): 15458– 63. doi : 10.1074/jbc.273.25.15458 . PMID  9624131.
  5. ^ Carter-Fenk K, Herbert JM (ноябрь 2020 г.). «Переосмысление π-стекинга». Physical Chemistry Chemical Physics . 22 (43): 24870– 24886. Bibcode :2020PCCP...2224870C. doi :10.1039/d0cp05039c. PMID  33107520. S2CID  225083299.
  6. ^ abc Синнокрот М.О., Валеев Э.Ф., Шерил CD (сентябрь 2002 г.). «Оценки ab initio предела для пи-пи-взаимодействий: димер бензола». Журнал Американского химического общества . 124 (36): 10887–10893 . doi :10.1021/ja025896h. ПМИД  12207544.
  7. ^ ab Huber RG, Margreiter MA, Fuchs JE, von Grafenstein S, Tautermann CS, Liedl KR, Fox T (май 2014). «Heteroaromatic π-stacking energy landscapes». Journal of Chemical Information and Modeling . 54 (5): 1371– 1379. doi : 10.1021 /ci500183u . PMC 4037317. PMID  24773380. 
  8. ^ ab Battaglia MR, Buckingham AD, Williams JH (1981). «Электрические квадрупольные моменты бензола и гексафторбензола». Chem. Phys. Lett . 78 (3): 421– 423. Bibcode :1981CPL....78..421B. doi :10.1016/0009-2614(81)85228-1.
  9. ^ Райли К. Э., Хобза П. (апрель 2013 г.). «О важности и происхождении ароматических взаимодействий в химии и биодисциплинах». Accounts of Chemical Research . 46 (4): 927– 936. doi :10.1021/ar300083h. PMID  22872015.
  10. ^ Хантер CA, Сандерс JK (1990). «Природа π–π взаимодействий». J. Am. Chem. Soc . 112 (14): 5525– 5534. Bibcode : 1990JAChS.112.5525H. doi : 10.1021/ja00170a016.
  11. ^ Cozzi F, Cinquini M, Annuziata R, Siegel JS (1993). "Доминирование полярных/.pi. Эффекты переноса заряда в стекированных фенильных взаимодействиях". J. Am. Chem. Soc . 115 (12): 5330– 5331. Bibcode : 1993JAChS.115.5330C. doi : 10.1021/ja00065a069.
  12. ^ ab Cockroft SL, Hunter CA, Lawson KR, Perkins J, Urch CJ (июнь 2005 г.). «Электростатический контроль ароматических стековых взаимодействий». Журнал Американского химического общества . 127 (24): 8594– 8595. Bibcode : 2005JAChS.127.8594C. doi : 10.1021/ja050880n. PMID  15954755.
  13. ^ Cockroft SL, Perkins J, Zonta C, Adams H, Spey SE, Low CM и др. (апрель 2007 г.). «Влияние заместителей на ароматические стековые взаимодействия». Органическая и биомолекулярная химия . 5 (7): 1062– 1080. doi :10.1039/b617576g. PMID  17377660. S2CID  37409177.
  14. ^ Мартинес, Челси Р.; Айверсон, Брент Л. (2012). «Переосмысление термина «пи-стекинг»". Химическая наука . 3 (7): 2191. doi :10.1039/C2SC20045G. hdl : 2152/41033 .
  15. ^ Рашкин М.Дж., Уотерс М.Л. (март 2002 г.). «Неожиданные эффекты заместителей в смещенных пи-пи-стековых взаимодействиях в воде». Журнал Американского химического общества . 124 (9): 1860– 1861. doi :10.1021/ja016508z. PMID  11866592.
  16. ^ Sinnokrot MO, Sherrill CD (2003). «Неожиданные эффекты заместителей в π-стэкинговых взаимодействиях лицом к лицу». J. Phys. Chem. A. 107 ( 41): 8377– 8379. Bibcode : 2003JPCA..107.8377S. doi : 10.1021/jp030880e.
  17. ^ Ringer AL, Sinnokrot MO, Lively RP, Sherrill CD (май 2006). «Влияние множественных заместителей на сэндвичевые и Т-образные пи-пи взаимодействия». Химия: Европейский журнал . 12 (14): 3821– 3828. doi :10.1002/chem.200501316. PMID  16514687.
  18. ^ Sinnokrot MO, Sherrill CD (сентябрь 2006 г.). «Высокоточные квантово-механические исследования пи-пи взаимодействий в димерах бензола». Журнал физической химии A. 110 ( 37): 10656– 10668. Bibcode : 2006JPCA..11010656S. doi : 10.1021/jp0610416. PMID  16970354.
  19. ^ ab Wheeler SE, Houk KN (август 2008 г.). «Эффекты заместителей в димере бензола обусловлены прямым взаимодействием заместителей с незамещенным бензолом». Журнал Американского химического общества . 130 (33): 10854– 10855. Bibcode : 2008JAChS.13010854W. doi : 10.1021/ja802849j. PMC 2655233. PMID  18652453 . 
  20. ^ Paliwal S, Geib S, Wilcox CS (1994). «Молекулярный торсионный баланс для слабых сил молекулярного распознавания. Эффекты ароматических взаимодействий «наклонного Т» края к грани на конформационный отбор и структуру твердого тела». J. Am. Chem. Soc . 116 (10): 4497– 4498. Bibcode : 1994JAChS.116.4497P. doi : 10.1021/ja00089a057.
  21. ^ ab Grimme S (2008). «Существуют ли на самом деле особые нековалентные пи-пи-стекинговые взаимодействия?». Angewandte Chemie . 47 (18): 3430– 3434. doi : 10.1002/anie.200705157 . PMID  18350534.
  22. ^ ab Bloom JW, Wheeler SE (2011). «Устранение ароматичности из ароматических взаимодействий». Angew. Chem . 123 (34): 7993– 7995. Bibcode : 2011AngCh.123.7993B. doi : 10.1002/ange.201102982.
  23. ^ ab Sygula A, Fronczek FR, Sygula R, Rabideau PW, Olmstead MM (апрель 2007 г.). "Двойной вогнутый углеводородный бакикетчер". Журнал Американского химического общества . 129 (13): 3842– 3843. Bibcode : 2007JAChS.129.3842S. doi : 10.1021/ja070616p. PMID  17348661. S2CID  25154754.
  24. ^ Бабин RE, Бендер SL (август 1997). «Молекулярное распознавание комплексов белок-минус-лиганд: применение в разработке лекарств». Chemical Reviews . 97 (5): 1359– 1472. doi :10.1021/cr960370z. PMID  11851455.
  25. ^ da Silva CH, Campo VL, Carvalho I, Taft CA (октябрь 2006 г.). «Молекулярное моделирование, стыковка и исследования ADMET, примененные к разработке нового гибрида для лечения болезни Альцгеймера». Журнал молекулярной графики и моделирования . 25 (2): 169– 175. doi :10.1016/j.jmgm.2005.12.002. PMID  16413803.
  26. ^ Эштон П.Р., Гуднау Т.Т., Кайфер А.Е., Реддингтон М.В., Славин А.М., Спенсер Н. и др. (1989). «А [2] Катенан на заказ». Дж. Энджью. хим. Межд. Эд . 28 (10): 1396–1399 . doi :10.1002/anie.198913961.
  27. ^ Д. Шассо; Г. Комбертон; Ж. Готье; К. Хау (1978). «Исследование структуры комплекса гексаметилен-тетратиафульвален-тетрацианохинодиметан». Acta Crystallographica Раздел B. 34 (2): 689. Бибкод : 1978AcCrB..34..689C. дои : 10.1107/S0567740878003830.
  28. ^ PW Anderson; PA Lee; M. Saitoh (1973). «Замечания о гигантской проводимости в TTF-TCNQ». Solid State Communications . 13 (5): 595– 598. Bibcode : 1973SSCom..13..595A. doi : 10.1016/S0038-1098(73)80020-1.
  29. ^ Ван Де Ву, Хайди Л.; Чаморро, Хуан; Кинтеро, Майкл; Клаузен, Ребекка С. (2015). «Противоположности притягиваются: органические соли с переносом заряда». Журнал химического образования . 92 (12): 2134– 2139. Bibcode : 2015JChEd..92.2134V. doi : 10.1021/acs.jchemed.5b00340.
  30. ^ Delhaes, Pierre (2000). «Полиморфизм углерода». В Delhaes, Pierre (ред.). Графит и прекурсоры . Gordon & Breach. стр.  1– 24. ISBN 9789056992286.
  31. ^ Пирсон, Хью О. (2012). Справочник по углероду, графиту, алмазу и фуллеренам: свойства, обработка и применение . Noyes Publications. С.  40–41 . ISBN 9780815517399.
  32. ^ Delhaes, P. (2001). Графит и прекурсоры. CRC Press. ISBN 978-90-5699-228-6.
  • Luo R, Gilson HS, Potter MJ, Gilson MK (январь 2001 г.). «Физическая основа укладки оснований нуклеиновых кислот в воде». Biophysical Journal . 80 (1): 140– 148. Bibcode :2001BpJ....80..140L. doi :10.1016/S0006-3495(01)76001-8. PMC  1301220 . PMID  11159389.
  • Ларри Вольф (2011): Взаимодействия π-π (π-стекинг): происхождение и модуляция
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Pi-stacking&oldid=1266451293"