Эволюция фотосинтеза относится к происхождению и последующей эволюции фотосинтеза , процесса, при котором энергия света используется для сборки сахаров из углекислого газа и источника водорода и электронов, такого как вода. Считается, что пигменты, используемые для фотосинтеза, изначально использовались для защиты от вредного воздействия света, особенно ультрафиолетового света. Процесс фотосинтеза был открыт Яном Ингенхаузом , британским врачом и ученым голландского происхождения, впервые опубликовавшим его в 1779 году. [1]
Первые фотосинтезирующие организмы, вероятно, появились на ранних этапах эволюционной истории жизни и , скорее всего, использовали восстановители, такие как водород, а не воду. [2] Существует три основных метаболических пути , по которым осуществляется фотосинтез: фотосинтез C3 , фотосинтез C4 и фотосинтез CAM . Фотосинтез C3 является самой старой и наиболее распространенной формой. Растение C3 использует цикл Кальвина для начальных этапов, которые включают CO2 в органический материал. Растение C4 предваряет цикл Кальвина реакциями, которые включают CO2 в четырехуглеродные соединения. Растение CAM использует метаболизм толстянковой кислоты , адаптацию для фотосинтеза в засушливых условиях. Растения C4 и CAM имеют специальные адаптации, которые экономят воду. [3]
−4500 — – — – −4000 — – — – −3500 — – — – −3000 — – — – −2500 — – — – −2000 — – — – −1500 — – — – −1000 — – — – −500 — – — – 0 — | Фотосинтез |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Имеющиеся данные геобиологических исследований архейских (>2500 млн лет) осадочных пород указывают на то, что жизнь существовала 3500 млн лет назад. Окаменелости того, что считается нитчатыми фотосинтетическими организмами, датируются возрастом 3,4 миллиарда лет, [4] [5] что согласуется с недавними исследованиями фотосинтеза. [6] [7] Ранние фотосинтетические системы, такие как системы зеленых и пурпурных серных и зеленых и пурпурных несерных бактерий , как полагают, были аноксигенными, используя различные молекулы в качестве доноров электронов . Считается, что зеленые и пурпурные серные бактерии использовали водород и сероводород в качестве доноров электронов и водорода. Зеленые несерные бактерии использовали различные амино- и другие органические кислоты . Пурпурные несерные бактерии использовали различные неспецифические органические и неорганические молекулы. [8] Предполагается, что фотосинтез, вероятно, возник при низковолновом геотермальном свете из кислых гидротермальных источников, Zn-тетрапирролы были первыми фотохимически активными пигментами, фотосинтетические организмы были анаэробными и полагались на H 2 S, не полагаясь на H 2 , выделяемый щелочными гидротермальными источниками. Расхождение аноксигенных фотосинтетических организмов в фотической зоне могло привести к способности более эффективно отрывать электроны от H 2 S под действием ультрафиолетового излучения. Существуют геохимические свидетельства, которые предполагают, что анаэробный фотосинтез возник 3,3–3,5 миллиарда лет назад. Позднее организмы развили синтазу хлорофилла F. Они также могли отрывать электроны от растворимых ионов металлов, хотя это неизвестно. [9]
Предполагается, что первые оксигенные фотосинтетические организмы зависят от H 2 S. [9] Также предполагается, что фотосинтез возник под воздействием солнечного света с использованием H 2 S , выделяемого вулканами и гидротермальными источниками, что положило конец потребности в дефицитном H 2, выделяемом щелочными гидротермальными источниками. [10] Оксигенный фотосинтез использует воду в качестве донора электронов, которая окисляется до молекулярного кислорода ( O
2) в фотосинтетическом реакционном центре . Биохимическая способность к оксигенному фотосинтезу развилась у общего предка современных цианобактерий . [11] Первое появление свободного кислорода в атмосфере иногда называют кислородной катастрофой . Геологические данные указывают на то, что это преобразующее событие произошло в палеопротерозойскую эру по крайней мере 2450–2320 миллионов лет назад (млн лет назад), и, как предполагается, гораздо раньше. [12] [13] Ясное палеонтологическое окно в эволюцию цианобактерий открылось около 2000 млн лет назад, обнаружив уже разнообразную биоту сине-зеленых. Цианобактерии оставались основными первичными продуцентами на протяжении всего протерозойского эона (2500–543 млн лет назад), отчасти потому, что окислительно-восстановительная структура океанов благоприятствовала фотоавтотрофам, способным фиксировать азот . [14] Зеленые водоросли присоединились к сине-зеленым в качестве основных первичных производителей на континентальных шельфах ближе к концу протерозоя , но только с мезозойской (251–65 млн лет) радиацией динофлагеллят, кокколитофорид и диатомовых водорослей первичное производство в морских шельфовых водах приняло современную форму. Цианобактерии остаются критически важными для морских экосистем как первичные производители в океанических круговоротах, как агенты биологической фиксации азота и, в измененной форме, как пластиды морских водорослей. [15] Современный фотосинтез у растений и большинства фотосинтезирующих прокариот является оксигенным.
4,6 миллиарда лет назад | Формы Земли |
3,4 миллиарда лет назад | Появляются первые фотосинтезирующие бактерии |
2,7 миллиарда лет назад | Цианобактерии становятся первыми производителями кислорода |
2,4 – 2,3 миллиарда лет назад | Самые ранние доказательства (из горных пород) наличия кислорода в атмосфере |
1,2 миллиарда лет назад | Красные и бурые водоросли становятся структурно более сложными, чем бактерии |
0,75 миллиарда лет назад | Зеленые водоросли превосходят красные и бурые водоросли при ярком освещении на мелководье. |
0,475 миллиарда лет назад | Первые наземные растения – мхи и печеночники |
0,423 миллиарда лет назад | Сосудистые растения развиваются |
Источник: [16]
Несколько групп животных сформировали симбиотические отношения с фотосинтезирующими водорослями. Они наиболее распространены у кораллов , губок и морских анемонов . Предполагается, что это связано с особенно простым строением тела и большой площадью поверхности этих животных по сравнению с их объемами. [17] Кроме того, несколько морских моллюсков Elysia viridis и Elysia chlorotica также поддерживают симбиотические отношения с хлоропластами, которые они захватывают из водорослей в своем рационе, а затем хранят в своих телах. Это позволяет моллюскам выживать исключительно за счет фотосинтеза в течение нескольких месяцев подряд. [18] [19] Некоторые гены из ядра растительной клетки были даже перенесены в слизней, так что хлоропласты могут быть снабжены белками, которые им необходимы для выживания. [20]
Еще более близкая форма симбиоза может объяснить происхождение хлоропластов. Хлоропласты имеют много общего с фотосинтетическими бактериями , включая кольцевую хромосому , рибосомы прокариотического типа и похожие белки в фотосинтетическом реакционном центре. [21] [22] Эндосимбиотическая теория предполагает, что фотосинтетические бактерии были приобретены (посредством эндоцитоза ) ранними эукариотическими клетками для формирования первых растительных клеток. Следовательно, хлоропласты могут быть фотосинтетическими бактериями, которые приспособились к жизни внутри растительных клеток. Как и митохондрии , хлоропласты по-прежнему обладают собственной ДНК, отдельной от ядерной ДНК их растительных клеток-хозяев, и гены в этой хлоропластной ДНК напоминают гены в цианобактериях . [23] ДНК в хлоропластах кодирует окислительно-восстановительные белки, такие как фотосинтетические реакционные центры. Гипотеза CoRR предполагает, что это совместное расположение необходимо для окислительно - восстановительной регуляции.
В своей простейшей форме фотосинтез — это добавление воды к CO2 для получения сахаров и кислорода, но в этом участвует сложный химический путь, облегчаемый по ходу дела рядом ферментов и коферментов. Фермент RuBisCO отвечает за «фиксацию» CO2 — то есть, он присоединяет его к молекуле на основе углерода для образования сахара, который может использоваться растением, высвобождая по пути молекулу кислорода. Однако фермент, как известно, неэффективен и так же эффективно будет фиксировать кислород вместо CO2 в процессе, называемом фотодыхание . Это энергетически затратно, поскольку растению приходится использовать энергию для превращения продуктов фотодыхания обратно в форму, которая может реагировать с CO2 . [ необходима цитата ] [24]
Метаболический путь C 4 является ценным недавним эволюционным новшеством в растениях, включающим сложный набор адаптивных изменений в физиологии и моделях экспрессии генов . [25] Около 7600 видов растений используют фиксацию углерода C 4 , что составляет около 3% всех наземных видов растений. Все эти 7600 видов являются покрытосеменными .
Растения C 4 развили механизмы концентрации углерода. Они работают за счет увеличения концентрации CO 2 вокруг RuBisCO, тем самым облегчая фотосинтез и уменьшая фотодыхание. Процесс концентрации CO 2 вокруг RuBisCO требует больше энергии, чем разрешение газам диффундировать , но при определенных условиях — например, при высоких температурах (>25 °C), низких концентрациях CO 2 или высоких концентрациях кислорода — окупается с точки зрения снижения потери сахаров через фотодыхание. [ необходима цитата ]
Один из типов метаболизма C 4 использует так называемую анатомию Кранца . Она транспортирует CO 2 через внешний слой мезофилла, через ряд органических молекул, в клетки центральной обкладки пучка, где высвобождается CO 2. Таким образом, CO 2 концентрируется вблизи места работы RuBisCO. Поскольку RuBisCO работает в среде с гораздо большим количеством CO 2 , чем это было бы в противном случае, он работает более эффективно. [ необходима цитата ] [26] В фотосинтезе C 4 углерод фиксируется ферментом, называемым PEP-карбоксилазой, который, как и все ферменты, участвующие в фотосинтезе C 4 , произошел от нефотосинтетических предковых ферментов. [27] [28]
Второй механизм, фотосинтез CAM , представляет собой путь фиксации углерода , который развился у некоторых растений в качестве адаптации к засушливым условиям. [29] [30] Самым важным преимуществом CAM для растения является способность оставлять большинство устьиц листьев закрытыми в течение дня. [31] Это снижает потерю воды из-за эвапотранспирации . Устьица открываются ночью для сбора CO2 , который хранится в виде четырехуглеродной кислоты малата , а затем используется во время фотосинтеза в течение дня. Предварительно собранный CO2 концентрируется вокруг фермента RuBisCO , увеличивая эффективность фотосинтеза . Затем больше CO2 собирается из атмосферы, когда устьица открыты, в прохладные, влажные ночи, что снижает потерю воды. [ необходима цитата ]
CAM много раз эволюционировал конвергентно . [32] Он встречается у 16 000 видов (около 7% растений), принадлежащих к более чем 300 родам и около 40 семействам , но считается, что это значительно заниженная оценка. [33] Он обнаружен у иглоносых (родственников плаунов ), у папоротников и у голосеменных , но подавляющее большинство растений, использующих CAM, являются покрытосеменными (цветковыми растениями). [ требуется ссылка ]
Эти два пути, с одинаковым эффектом на RuBisCO, развивались несколько раз независимо - действительно, C 4 один возникал 62 раза в 18 различных семействах растений . Ряд «преадаптаций», по-видимому, проложил путь для C 4 , что привело к его кластеризации в определенных кладах: он чаще всего развивался в растениях, которые уже имели такие особенности, как обширная ткань оболочки сосудистых пучков. [34] Полногеномная и отдельная дупликация генов также связаны с эволюцией C 4 . [35] Многие потенциальные эволюционные пути, приводящие к фенотипу C 4 , возможны и были охарактеризованы с помощью байесовского вывода , [25] подтверждая, что нефотосинтетические адаптации часто обеспечивают эволюционные ступени для дальнейшей эволюции C 4 .
Конструкция C 4 наиболее известна тем, что используется подмножеством злаков, в то время как CAM используется многими суккулентами и кактусами . Эта черта, по-видимому, появилась в олигоцене , около 25–32 миллионов лет назад ; [36] однако, они не стали экологически значимыми до миоцена , 6–7 миллионов лет назад . [37] Примечательно, что некоторые обугленные окаменелости сохраняют ткани, организованные в анатомию Кранца, с неповрежденными клетками оболочки пучков, [38] что позволяет без сомнений идентифицировать присутствие метаболизма C 4 в это время. Изотопные маркеры используются для определения их распределения и значимости.
Растения C 3 преимущественно используют более легкий из двух изотопов углерода в атмосфере, 12 C, который легче вовлекается в химические пути, связанные с его фиксацией. Поскольку метаболизм C 4 включает в себя еще один химический шаг, этот эффект усиливается. Растительный материал можно проанализировать , чтобы вывести соотношение более тяжелого 13 C к 12 C. Это соотношение обозначается δ 13 C. Растения C 3 в среднем примерно на 14‰ (частей на тысячу) легче атмосферного соотношения, тогда как растения C 4 примерно на 28‰ легче. δ 13 Cрастений CAM зависят от процента углерода, фиксируемого ночью, по сравнению с тем, что фиксируется днем, будучи ближе к растениям C3, если они фиксируют большую часть углерода днем, и ближе к растениям C4, если они фиксируют весь свой углерод ночью. [39]
Трудно добыть оригинальный ископаемый материал в достаточном количестве для анализа самой травы, но, к счастью, есть хороший заместитель: лошади. Лошади были широко распространены по всему миру в интересующий нас период и питались почти исключительно травой. В изотопной палеонтологии есть старая фраза: «ты то, что ты ешь (плюс немного)» — это относится к тому факту, что организмы отражают изотопный состав всего, что они едят, плюс небольшой поправочный коэффициент. Есть хорошие данные о зубах лошадей по всему миру, и их δ 13 Cбыло измерено. Запись показывает резкий отрицательный перегиб около 6-7 миллионов лет назад , во время мессинского периода, и это интерпретируется как рост растений C 4 в глобальном масштабе. [37]
В то время как C 4 повышает эффективность RuBisCO, концентрация углерода является очень энергоемкой. Это означает, что растения C 4 имеют преимущество перед организмами C 3 только в определенных условиях: а именно, при высоких температурах и малом количестве осадков. Растениям C 4 также требуется много солнечного света для процветания. [40] Модели предполагают, что без лесных пожаров, уничтожающих деревья и кустарники, отбрасывающие тень, не было бы места для растений C 4. [41] Но лесные пожары происходили в течение 400 миллионов лет — почему C 4 потребовалось так много времени, чтобы возникнуть, а затем независимо появлялись так много раз? Каменноугольный период (~ 300 миллионов лет назад ) имел печально известный высокий уровень кислорода — почти достаточный для того, чтобы допустить самовозгорание [42] — и очень низкий уровень CO 2 , но изотопная сигнатура C 4 не обнаружена. И, похоже, нет внезапного триггера для миоценового подъема. [ необходима цитата ]
В миоцене атмосфера и климат были относительно стабильными. Если говорить точнее, то CO2 постепенно увеличивался с 14 до 9 миллионов лет назад , прежде чем стабилизировался до концентраций, аналогичных голоценовым. [43] Это говорит о том, что он не играл ключевой роли в инициировании эволюции C4 . [ 36] Сами травы (группа, которая дала начало большинству случаев C4 ) , вероятно, существовали около 60 миллионов лет или более, поэтому у них было достаточно времени для эволюции C4 , [ 44] [45] который, в любом случае, присутствует в разнообразном диапазоне групп и, таким образом, развивался независимо. Существует сильный сигнал об изменении климата в Южной Азии; [36] увеличение засушливости — следовательно, увеличение частоты и интенсивности пожаров — могло привести к увеличению важности лугов. [46] Однако это трудно согласовать с североамериканскими записями. [36] Возможно, что сигнал является полностью биологическим, вызванным ускорением эволюции трав, вызванным пожарами и травоядными [47] , что, как за счет усиления выветривания, так и за счет включения большего количества углерода в отложения, снизило уровень CO 2 в атмосфере . [47] Наконец, есть доказательства того, что начало C 4 от 9 до 7 миллионов лет назад является предвзятым сигналом, который справедлив только для Северной Америки, откуда происходит большинство образцов; появляющиеся доказательства свидетельствуют о том, что луга эволюционировали до доминирующего состояния по крайней мере на 15 млн лет раньше в Южной Америке. [ необходима ссылка ]