ОРК4

ОРК4
Идентификаторы
Псевдонимы	ORC4 , ORC4L, ORC4P, субъединица комплекса распознавания происхождения 4
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 603056; МГИ : 1347043; гомологен : 8059; Генные карты : ORC4; OMA :ORC4 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 2 (человек)
Конец	148,021,604 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	48,840,289 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верхний выражен в
	Ахиллово сухожилие; ; ооцит; ; островок Лангерганса; ; ганглионарное возвышение; ; почечный каналец; ; бронхиальная эпителиальная клетка; ; мозолистое тело; ; эндотелиальная клетка; ; желудочковая зона; ; правая маточная труба;
	Верхний выражен в
	слуховая плакода; ; мешочек; ; слуховой пузырек; ; сперматоцит; ; хвост эмбриона; ; желудочковая зона; ; нервный слой сетчатки; ; эмбрион; ; эпибласт; ; верхняя лобная извилина;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание нуклеотидов; связывание ДНК; Связывание с точкой начала репликации ДНК; связывание белков; Связывание АТФ;
Клеточный компонент	комплекс распознавания ядерного начала репликации; ядрышко; комплекс распознавания происхождения; ядро; нуклеоплазма; цитозоль;
Биологический процесс	Фаза G1; репликация ДНК; Инициация репликации ДНК; Переход G1/S митотического клеточного цикла;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	5000
	26428
	ENSG00000115947
	ENSMUSG00000026761
	О43929
	О88708
NM_001190879 ; NM_001190881 ; NM_001190882 ; NM_002552 ; NM_181741;
	НМ_181742 ; НМ_001374270 ; НМ_001374272
	НМ_001177313 ; НМ_011958 ; НМ_001355296
NP_001177808 ; NP_001177810 ; NP_001177811 ; NP_002543 ; NP_859525;
	NP_859526 ; NP_001361199 ; NP_001361201
	НП_001170784 ; НП_036088 ; НП_001342225
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Субъединица 4 комплекса распознавания происхождения представляет собой белок , который у людей кодируется геном ORC4 ( ORC4L) . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Комплекс распознавания начала (ORC) представляет собой высококонсервативный комплекс из шести субъединиц белка, необходимый для инициации репликации ДНК в эукариотических клетках. Исследования на дрожжах показали, что ORC специфически связывается с началами репликации и служит платформой для сборки дополнительных факторов инициации, таких как белки Cdc6 и Mcm. Белок, кодируемый этим геном, является субъединицей комплекса ORC. Было показано, что он образует основной комплекс с ORC2L, -3L и -5L. Сообщалось о трех альтернативно сплайсированных вариантах транскрипта, кодирующих один и тот же белок. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что ORC4 взаимодействует с:

МСМ2 , ^[8]
МСМ3 , ^[8]
МСМ4 , ^[8]
МСМ6 , ^[8]
ORC1 , ^[8]
ORC2 , ^[5]^[8]^[9]^[10]
ORC3 , ^[9]^[10]^[11]
ORC5 , ^[8]^[9]^[12] и
ORC6 . ^[8]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000115947 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000026761 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ ab Quintana DG, Hou ZH, Thome KC, Hendricks M, Saha P, Dutta A (ноябрь 1997 г.). «Идентификация HsORC4, члена комплекса распознавания начала репликации человека». Журнал биологической химии . 272 (45): 28247– 51. doi : 10.1074/jbc.272.45.28247 . PMID 9353276.
^ Eki T, Dean FB, Kohda A, Okumura K, Abe M, Murakami Y, Ishiai M, Satomoto K, Hurwitz J, O'Donnell M, Hanaoka F (октябрь 1998 г.). «Присвоение гомолога комплекса распознавания происхождения дрожжей ORC4 (ORC4L) полосе хромосомы человека 2q22→q23 с помощью гибридизации in situ и гибридного анализа соматических клеток». Цитогенетика и клеточная генетика . 81 (1): 89– 90. doi :10.1159/000014997. PMID 9691185. S2CID 46878915.
^ ab "Ген Entrez: комплекс распознавания начала ORC4L, подобный субъединице 4 (дрожжи)".
^ abcdefgh Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка белков пререпликативного комплекса мышей в клетках дрожжей и мышей». Журнал молекулярной биологии . 327 (1): 111– 28. doi :10.1016/s0022-2836(03)00079-2. PMID 12614612.
^ abc Dhar SK, Delmolino L, Dutta A (август 2001 г.). «Архитектура комплекса распознавания происхождения человека». Журнал биологической химии . 276 (31): 29067– 71. doi : 10.1074/jbc.M103078200 . PMID 11395502.
^ ab Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (июль 2001 г.). «Сборка комплекса распознавания человеческого происхождения». Журнал биологической химии . 276 (28): 26666– 73. doi : 10.1074/jbc.M102493200 . PMID 11323433.
^ Pinto S, Quintana DG, Smith P, Mihalek RM, Hou ZH, Boynton S, Jones CJ, Hendricks M, Velinzon K, Wohlschlegel JA, Austin RJ, Lane WS, Tully T, Dutta A (май 1999). "latheo кодирует субъединицу комплекса распознавания происхождения и нарушает нейрональную пролиферацию и обонятельную память у взрослых при мутации". Neuron . 23 (1): 45– 54. doi : 10.1016/s0896-6273(00)80752-7 . PMID 10402192. S2CID 781511.
^ Quintana DG, Thome KC, Hou ZH, Ligon AH, Morton CC, Dutta A (октябрь 1998 г.). «ORC5L, новый член комплекса распознавания человеческого происхождения, удаляется при лейомиомах матки и злокачественных миелоидных заболеваниях». Журнал биологической химии . 273 (42): 27137– 45. doi : 10.1074/jbc.273.42.27137 . PMID 9765232.

Дальнейшее чтение

Маруяма К, Сугано С (январь 1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика библиотеки ДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Tugal T, Zou-Yang XH, Gavin K, Pappin D, Canas B, Kobayashi R, Hunt T, Stillman B (декабрь 1998 г.). «Субъединицы Orc4p и Orc5p комплекса распознавания происхождения Xenopus и человека связаны с Orc1p и Cdc6p». Журнал биологической химии . 273 (49): 32421– 9. doi : 10.1074/jbc.273.49.32421 . PMID 9829972.
Springer J, Kneissl M, Pütter V, Grummt F (август 1999 г.). «Идентификация и характеристика MmORC4 и MmORC5, двух субъединиц комплекса распознавания начала репликации у мышей». Chromosoma . 108 (4): 243– 9. doi :10.1007/s004120050374. PMID 10460412. S2CID 8689588.
Jiang W, McDonald D, Hope TJ, Hunter T (октябрь 1999 г.). «Комплекс протеинкиназы млекопитающих Cdc7-Dbf4 необходим для инициации репликации ДНК». The EMBO Journal . 18 (20): 5703– 13. doi :10.1093/emboj/18.20.5703. PMC 1171637. PMID 10523313 .
Thome KC, Dhar SK, Quintana DG, Delmolino L, Shahsafaei A, Dutta A (ноябрь 2000 г.). «Подмножества субъединиц комплекса распознавания происхождения человека (ORC) экспрессируются в непролиферирующих клетках и ассоциируются с белками, не относящимися к ORC». Журнал биологической химии . 275 (45): 35233– 41. doi : 10.1074/jbc.M005765200 . PMID 10954718.
Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (июль 2001 г.). «Сборка комплекса распознавания происхождения человека». Журнал биологической химии . 276 (28): 26666– 73. doi : 10.1074/jbc.M102493200 . PMID 11323433.
Dhar SK, Delmolino L, Dutta A (август 2001 г.). «Архитектура комплекса распознавания происхождения человека». Журнал биологической химии . 276 (31): 29067– 71. doi : 10.1074/jbc.M103078200 . PMID 11395502.
Okuno Y, McNairn AJ, den Elzen N, Pines J, Gilbert DM (август 2001 г.). «Стабильность, ассоциация хроматина и функциональная активность белков пререпликационного комплекса млекопитающих во время клеточного цикла». The EMBO Journal . 20 (15): 4263–77 . doi :10.1093/emboj/20.15.4263. PMC 149150. PMID 11483529 .
Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка белков пререпликативного комплекса мышей в клетках дрожжей и мышей». Журнал молекулярной биологии . 327 (1): 111– 28. doi :10.1016/S0022-2836(03)00079-2. PMID 12614612.
Рамачандран Н., Хейнсворт Э., Бхуллар Б., Эйзенштейн С., Розен Б., Лау А.Ю., Уолтер Дж.К., ЛаБэр Дж. (июль 2004 г.). «Самособирающиеся белковые микрочипы». Наука . 305 (5680): 86–90 . Бибкод : 2004Sci...305...86R. дои : 10.1126/science.1097639. PMID 15232106. S2CID 20936301.
Sibani S, Price GB, Zannis-Hadjopoulos M (май 2005). "Ku80 связывается с человеческими точками начала репликации до сборки комплекса ORC". Биохимия . 44 (21): 7885–96 . doi :10.1021/bi047327n. PMID 15910003.
Руаль Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Эта статья о гене на хромосоме 2 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000115947 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000026761 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9353276-5] Quintana DG, Hou ZH, Thome KC, Hendricks M, Saha P, Dutta A (ноябрь 1997 г.). «Идентификация HsORC4, члена комплекса распознавания начала репликации человека». Журнал биологической химии . 272 (45): 28247– 51. doi : 10.1074/jbc.272.45.28247 . PMID 9353276.

[pmid9691185-6] Eki T, Dean FB, Kohda A, Okumura K, Abe M, Murakami Y, Ishiai M, Satomoto K, Hurwitz J, O'Donnell M, Hanaoka F (октябрь 1998 г.). «Присвоение гомолога комплекса распознавания происхождения дрожжей ORC4 (ORC4L) полосе хромосомы человека 2q22→q23 с помощью гибридизации in situ и гибридного анализа соматических клеток». Цитогенетика и клеточная генетика . 81 (1): 89– 90. doi :10.1159/000014997. PMID 9691185. S2CID 46878915.

[entrez-7] "Ген Entrez: комплекс распознавания начала ORC4L, подобный субъединице 4 (дрожжи)".

[pmid12614612-8] Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка белков пререпликативного комплекса мышей в клетках дрожжей и мышей». Журнал молекулярной биологии . 327 (1): 111– 28. doi :10.1016/s0022-2836(03)00079-2. PMID 12614612.

[pmid11395502-9] Dhar SK, Delmolino L, Dutta A (август 2001 г.). «Архитектура комплекса распознавания происхождения человека». Журнал биологической химии . 276 (31): 29067– 71. doi : 10.1074/jbc.M103078200 . PMID 11395502.

[pmid11323433-10] Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (июль 2001 г.). «Сборка комплекса распознавания человеческого происхождения». Журнал биологической химии . 276 (28): 26666– 73. doi : 10.1074/jbc.M102493200 . PMID 11323433.

[pmid10402192-11] Pinto S, Quintana DG, Smith P, Mihalek RM, Hou ZH, Boynton S, Jones CJ, Hendricks M, Velinzon K, Wohlschlegel JA, Austin RJ, Lane WS, Tully T, Dutta A (май 1999). "latheo кодирует субъединицу комплекса распознавания происхождения и нарушает нейрональную пролиферацию и обонятельную память у взрослых при мутации". Neuron . 23 (1): 45– 54. doi : 10.1016/s0896-6273(00)80752-7 . PMID 10402192. S2CID 781511.

[pmid9765232-12] Quintana DG, Thome KC, Hou ZH, Ligon AH, Morton CC, Dutta A (октябрь 1998 г.). «ORC5L, новый член комплекса распознавания человеческого происхождения, удаляется при лейомиомах матки и злокачественных миелоидных заболеваниях». Журнал биологической химии . 273 (42): 27137– 45. doi : 10.1074/jbc.273.42.27137 . PMID 9765232.