mir-96 микроРНК

микроРНК mir-96
микроРНК mir-96
	Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности mir-96
Идентификаторы
Символ	мир-96
Альтернативные символы	МИР96
Рфам	РФ00669
miRBase	MI0000098
семейство miRBase	MIPF0000072
Другие данные
Тип РНК	Ген ; миРНК
Домены	Эукариоты
ИДТИ	GO:0035068 GO:0035195
ТАК	SO:0001244
Структуры PDB	ПДБе

РНК-семейство

Предшественник микроРНК miR-96 — это небольшая некодирующая РНК , которая регулирует экспрессию генов . МикроРНК транскрибируются как предшественники из ~80 нуклеотидов и впоследствии обрабатываются ферментом Dicer, давая продукты из ~23 нуклеотидов. В этом случае зрелая последовательность исходит из 5′ плеча предшественника. ^[1] Считается, что зрелые продукты играют регуляторную роль посредством комплементарности с мРНК.

Считается, что miR-96 сохраняется у Nephrozoa, то есть у Deuterostomes и Protostomes . ^[2]

Изменчивость в области семян зрелой miR-96 была связана с аутосомно-доминантной прогрессирующей потерей слуха у людей и мышей. Гомозиготные мутантные мыши были глубоко глухими, не показывая кохлеарных реакций. Гетерозиготные мыши и люди постепенно теряют способность слышать. ^[3]^[4]^[5] Пять генов из 132 предсказанных целей были экспериментально подтверждены как цели miR-96: Aqp5 , Celsr2 , Myrip, Odf2 и Ryk . ^[4]

Анализ микрочипов 4-дневных мышей дикого типа и мутантных мышей показал, что в 3′ UTR активированных генов наблюдалось значительное обогащение гептамерами, комплементарными miR-96, что подразумевает, что miR-96 обычно влияет на широкий спектр целевых генов, и что мутация приводит к потере нормальных мишеней. Среди подавленных генов наблюдается значительное обогащение гептамерами, комплементарными мутантному miR-96, поэтому мутантный miR-96 приобрел новые мишени. ^[4] Среди подавленных генов были пять, представляющих особый интерес: Ocm , Pitpnm1 , Prestin , Ptprq и Gfi1 , все из которых сильно и специфически экспрессируются в волосковых клетках. Мыши, мутантные по последним трем, демонстрируют глухоту и дегенерацию волосковых клеток. ^[6]^[7]^[8]

Ссылки

^ Mourelatos Z, Dostie J, Paushkin S, Sharma A, Charroux B, Abel L, Rappsilber J , Mann M, Dreyfuss G (2002). "miRNPs: a novel class of ribonucleoproteins contain multiple microRNAs". Genes Dev . 16 (6): 720– 728. doi :10.1101/gad.974702. PMC 155365 . PMID 11914277.
^ Wheeler BM, Heimberg AM, Moy VN, Sperling EA, Holstein TW, Heber S, Peterson KJ (2009). «Глубокая эволюция микроРНК метазойных организмов». Evol Dev . 11 (1): 50–68 . doi :10.1111/j.1525-142X.2008.00302.x. PMID 19196333.
^ Менсия А, Модамио-Хойбьор С, Редшоу Н, Морин М, Майо-Мерино Ф, Олаварриета Л, Агирре Л.А., дель Кастильо I, Стил КП, Далмай Т, Морено Ф, Морено-Пелайо М.А. (2009). «Мутации в семенной области человеческой миР-96 ответственны за несиндромальную прогрессирующую потерю слуха». Нат Жене . 41 (5): 609–613 . doi : 10.1038/ng.355. ПМИД 19363479.
^ abc Lewis MA, Quint E, Glazier AM, Fuchs H, De Angelis MH, Langford C, van Dongen S, Abreu-Goodger C, Piipari M, Redshaw N, Dalmay T, Moreno-Pelayo MA, Enright AJ, Steel KP (2009). "Индуцированная ENU мутация miR-96, связанная с прогрессирующей потерей слуха у мышей". Nat Genet . 41 (5): 614– 618. doi :10.1038/ng.369. PMC 2705913 . PMID 19363478.
^ Soukup GA (2009). «Маленький, но громкий: малые РНК оказывают оглушительное влияние [sic] на развитие уха». Brain Res . 1277 : 104–114 . doi :10.1016/j.brainres.2009.02.027. PMC 2700218. PMID 19245798 .
^ Liberman MC, Gao J, He DZ, Wu X, Jia S, Zuo J (2002). «Престин необходим для электроподвижности наружной волосковой клетки и для усилителя улитки». Nature . 419 (6904): 300– 304. Bibcode :2002Natur.419..300L. doi :10.1038/nature01059. PMID 12239568.
^ Goodyear RJ, Legan PK, Wright MB, Marcotti W, Oganesian A, Coats SA, Booth CJ, Kros CJ, Seifert RA, Bowen-Pope DF, Richardson GP (2003). «Подобная рецептору инозитоллипидфосфатаза необходима для созревания развивающихся пучков волосков улитки». J Neurosci . 23 (27): 9208– 9219. doi : 10.1523/jneurosci.23-27-09208.2003 . PMC 6740823 . PMID 14534255.
^ Wallis D, Hamblen M, Zhou Y, Venken KJ, Schumacher A, Grimes HL, Zoghbi HY , Orkin SH, Bellen HJ (2003). «Транскрипционный фактор цинкового пальца Gfi1, участвующий в лимфомагенезе, необходим для дифференциации и выживания волосковых клеток внутреннего уха». Development . 130 (1): 221– 232. doi : 10.1242/dev.00190 . PMID 12441305.

Сообщения СМИ

Пресс-релиз Сэнгера
Новые сведения о прогрессирующей потере слуха

Дальнейшее чтение

Kondkar AA, Bray MS, Leal SM и др. (2010). «VAMP8/эндобревин сверхэкспрессируется в гиперреактивных человеческих тромбоцитах: предполагаемая роль микроРНК тромбоцитов». J. Thromb. Haemost . 8 (2): 369– 378. doi :10.1111/j.1538-7836.2009.03700.x. PMC 3312605 . PMID 19943878.
Modamio-Høybjør S, Moreno-Pelayo MA, Mencía A, et al. (2004). "Новый локус для аутосомно-доминантной несиндромной потери слуха, DFNA50, отображается на хромосоме 7q32 между локусами глухоты DFNB17 и DFNB13". J. Med. Genet . 41 (2): 14e–14. doi :10.1136/jmg.2003.012500. PMC 1735673. PMID 14757864 .
Guttilla IK, White BA (2009). «Координированная регуляция FOXO1 с помощью miR-27a, miR-96 и miR-182 в клетках рака молочной железы». J. Biol. Chem . 284 (35): 23204– 23216. doi : 10.1074/jbc.M109.031427 . PMC 2749094. PMID 19574223 .

Внешние ссылки

Страница для семейства предшественников микроРНК mir-96 на сайте Rfam
Страница miRBase для семейства предшественников микроРНК mir-96
Страница HGNC для семейства предшественников микроРНК mir-96
Страница OMIM для семейства предшественников микроРНК mir-96
Страница ENTREZ для семейства предшественников микроРНК mir-96

[pmid11914277-1] Mourelatos Z, Dostie J, Paushkin S, Sharma A, Charroux B, Abel L, Rappsilber J , Mann M, Dreyfuss G (2002). "miRNPs: a novel class of ribonucleoproteins contain multiple microRNAs". Genes Dev . 16 (6): 720– 728. doi :10.1101/gad.974702. PMC 155365 . PMID 11914277.

[pmid19196333-2] Wheeler BM, Heimberg AM, Moy VN, Sperling EA, Holstein TW, Heber S, Peterson KJ (2009). «Глубокая эволюция микроРНК метазойных организмов». Evol Dev . 11 (1): 50–68 . doi :10.1111/j.1525-142X.2008.00302.x. PMID 19196333.

[pmid19363479-3] Менсия А, Модамио-Хойбьор С, Редшоу Н, Морин М, Майо-Мерино Ф, Олаварриета Л, Агирре Л.А., дель Кастильо I, Стил КП, Далмай Т, Морено Ф, Морено-Пелайо М.А. (2009). «Мутации в семенной области человеческой миР-96 ответственны за несиндромальную прогрессирующую потерю слуха». Нат Жене . 41 (5): 609–613 . doi : 10.1038/ng.355. ПМИД 19363479.

[pmid19363478-4] Lewis MA, Quint E, Glazier AM, Fuchs H, De Angelis MH, Langford C, van Dongen S, Abreu-Goodger C, Piipari M, Redshaw N, Dalmay T, Moreno-Pelayo MA, Enright AJ, Steel KP (2009). "Индуцированная ENU мутация miR-96, связанная с прогрессирующей потерей слуха у мышей". Nat Genet . 41 (5): 614– 618. doi :10.1038/ng.369. PMC 2705913 . PMID 19363478.

[pmid19245798-5] Soukup GA (2009). «Маленький, но громкий: малые РНК оказывают оглушительное влияние [sic] на развитие уха». Brain Res . 1277 : 104–114 . doi :10.1016/j.brainres.2009.02.027. PMC 2700218. PMID 19245798 .

[pmid12239568-6] Liberman MC, Gao J, He DZ, Wu X, Jia S, Zuo J (2002). «Престин необходим для электроподвижности наружной волосковой клетки и для усилителя улитки». Nature . 419 (6904): 300– 304. Bibcode :2002Natur.419..300L. doi :10.1038/nature01059. PMID 12239568.

[pmid14534255-7] Goodyear RJ, Legan PK, Wright MB, Marcotti W, Oganesian A, Coats SA, Booth CJ, Kros CJ, Seifert RA, Bowen-Pope DF, Richardson GP (2003). «Подобная рецептору инозитоллипидфосфатаза необходима для созревания развивающихся пучков волосков улитки». J Neurosci . 23 (27): 9208– 9219. doi : 10.1523/jneurosci.23-27-09208.2003 . PMC 6740823 . PMID 14534255.

[pmid12441305-8] Wallis D, Hamblen M, Zhou Y, Venken KJ, Schumacher A, Grimes HL, Zoghbi HY , Orkin SH, Bellen HJ (2003). «Транскрипционный фактор цинкового пальца Gfi1, участвующий в лимфомагенезе, необходим для дифференциации и выживания волосковых клеток внутреннего уха». Development . 130 (1): 221– 232. doi : 10.1242/dev.00190 . PMID 12441305.