Молекулярное силовое поле Merck
Молекулярное силовое поле Merck (MMFF) — это семейство химических силовых полей, разработанных исследовательскими лабораториями Merck . Они основаны на силовом поле MM3. MMFF не оптимизировано для одного использования, например, для моделирования белков или малых молекул , но пытается хорошо работать для широкого спектра расчетов органической химии . Параметры в силовом поле были получены из вычислительных данных, состоящих из приблизительно 2800 структур, охватывающих широкий спектр химических классов. [1]
Первое опубликованное силовое поле в этом семействе — MMFF94. [1] Набор молекулярных структур и соответствующий вывод реализации MMFF94 Халгрена представлен в Computational Chemistry List для проверки других реализаций MMFF. [2]
Одним из вариантов MMFF94 является MMFF94s, который имеет другие параметры изгиба вне плоскости и двугранного кручения для того, чтобы сделать планарными делокализованные тригональные атомы азота, например, в анилине. [3] «S» в MMFF94s означает «статический», поскольку MMFF94s лучше отражает усредненные по времени геометрии, чем MMFF94.
Смотрите также
Ссылки
- ^ ab Merck молекулярное силовое поле. I. Основа, форма, область применения, параметризация и производительность MMFF94, Thomas A. Halgren, J. Comput. Chem. ; 1996 ; 490-519, doi :10.1002/(SICI)1096-987X(199604)17:5/6<490::AID-JCC1>3.0.CO;2-P
- ^ Кирсли, Саймон (июнь 1999 г.). «MMFF94 Validation Suite». CCL.net . Computational Chemistry List, Ltd . Получено 17 сентября 2016 г. .
- ^ MMFF VI. Вариант MMFF94s для исследований минимизации энергии, Thomas A. Halgren, J. Comput. Chem. ; 1999 ; 720-729, doi :10.1002/(SICI)1096-987X(199905)20:7<720::AID-JCC7>3.0.CO;2-X
 | Эта статья по вычислительной химии является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее. |
