LiveBench

LiveBench — это постоянно действующий проект по оценке качества методов прогнозирования структуры белка и вторичной структуры . LiveBench в основном фокусируется на моделировании гомологии и потоковой передаче белков , но также включает в себя прогнозирование вторичной структуры , сравнивая общедоступные выходные данные веб-сервера с недавно размещенными структурами белков в банке данных белков . Как и проект EVA и в отличие от связанных с ним экспериментов CASP и CAFASP , LiveBench предназначен для изучения точности прогнозов, которые могут быть получены неспециалистами, использующими общедоступные методы прогнозирования. Главным преимуществом LiveBench и EVA перед проектами CASP, которые запускаются раз в два года, является их сравнительно большой набор данных.

Ссылки

  • Bujnicki JM, Elofsson A, Fischer D, Rychlewski L. (2001). LiveBench-1: непрерывный бенчмаркинг серверов предсказания структуры белка. Protein Sci 10(2):352-61. PMID  11266621
  • Рыхлевский Л., Фишер Д. (2005). LiveBench-8: крупномасштабная непрерывная оценка автоматизированного прогнозирования структуры белка. Protein Sci 14(1):240-5. PMID  15608124
  • Основной сайт LiveBench
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=LiveBench&oldid=818536871"