КАФАСП
CAFASP , или Критическая оценка полностью автоматизированного прогнозирования структуры, представляет собой крупномасштабный слепой эксперимент по прогнозированию структуры белка , который изучает производительность веб-серверов автоматизированного прогнозирования структуры в моделировании гомологии , распознавании складок и прогнозировании третичных структур белка ab initio только на основе аминокислотной последовательности . [1] Эксперимент проводится раз в два года параллельно с CASP , который фокусируется на прогнозах, включающих человеческое вмешательство и экспертизу. [2] По сравнению с родственными методами сравнительного анализа LiveBench и EVA , которые еженедельно проводятся с недавно решенными структурами белка, размещенными в Банке данных белков , CAFASP генерирует гораздо меньше данных, но имеет преимущество в создании прогнозов, которые напрямую сопоставимы с прогнозами, сделанными экспертами по прогнозированию людьми. Недавно CAFASP был запущен по существу интегрированным в результаты CASP, а не как отдельный эксперимент.
Ссылки
- ^ Фишер, Д.; Баррет, К.; Брайсон, К.; Элофссон, А.; Годзик, А.; Джонс, Д.; Карплус, К.Дж.; Келли, Л.А.; МакКаллум, Р.М.; Павовски, К.; Рост, Б.; Рыхлевски, Л.; Стернберг, М. (1999). "CAFASP-1: Критическая оценка полностью автоматизированных методов прогнозирования структуры". Proteins . Suppl 3: 209– 217. doi :10.1002/(SICI)1097-0134(1999)37:3+<209::AID-PROT27>3.0.CO;2-Y. PMID 10526371.
- ^ Bourne, PE (2003). «Эксперименты CASP и CAFASP и их результаты». Методы биохимического анализа . 44 : 501–507 . PMID 12647401.
Внешние ссылки
- Центр прогнозирования структуры белка
- CAFASP4 (2004)
- CAFASP5 (2006)
  | Эта статья по биоинформатике — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее. |
