EVA (эталонный показатель)

EVA был непрерывно работающим эталонным проектом для оценки качества и ценности методов прогнозирования структуры белка и вторичной структуры . Методы прогнозирования как вторичной структуры , так и третичной структуры , включая моделирование гомологии , белковую нить и прогнозирование порядка контактов , сравнивались с результатами, полученными из еженедельно новых решенных структур белков, размещенных в Protein Data Bank . Целью проекта было определение точности прогнозирования, которую можно было бы ожидать от неэкспертных пользователей обычных общедоступных веб-серверов прогнозирования ; это похоже на связанный проект LiveBench и отличается от двухгодичного эталонного CASP , целью которого является определение максимальной точности, достижимой экспертами по прогнозированию.

Ссылки

  • Рост Б., Эйрих ВА. (2001). EVA: крупномасштабный анализ предсказания вторичной структуры. Proteins Suppl 5:192-9. PMID  11835497
  • Eyrich VA, Marti-Renom MA, Przybylski D, Madhusudhan MS, Fiser A, Pazos F, Valencia A, Sali A, Rost B. (2001). EVA: непрерывная автоматическая оценка серверов предсказания структуры белка. Bioinformatics 17(12):1242-3. PMID  11751240
  • Koh IY, Eyrich VA, Marti-Renom MA, Przybylski D, Madhusudhan MS, Eswar N, Grana O, Pazos F, Valencia A, Sali A, Rost B. (2003). EVA: Оценка серверов предсказания структуры белка. Nucleic Acids Res 31(13):3311-5. PMID  12824315
  • Основной сайт EVA
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=EVA_(benchmark)&oldid=840509875"