Атлас клеток человека
Глобальный проект по науке о здоровье
Атлас клеток человека
Содержание
ОписаниеАтлас клеток человека — это глобальный консорциум, который создает подробные карты клеток человеческого тела, чтобы изменить понимание здоровья и болезней.
ОрганизмыЧеловек
Контакт
Первичная ссылкаРегев, Авив и др. (Организационный комитет Атласа клеток человека) (2018). «Белая книга Атласа клеток человека». arXiv : 1810.05192 [q-bio.TO].
Доступ
Веб-сайтwww.humancellatlas.org

Атлас клеток человека — это глобальный проект по описанию всех типов клеток в организме человека . [1] Инициатива была объявлена ​​консорциумом после его инаугурационной встречи в Лондоне в октябре 2016 года, которая установила первую фазу проекта. [2] [3] Авив Регев и Сара Тейхманн определили цели проекта на этой встрече, [4] которая была созвана Институтом Брода , Wellcome Trust, Институтом Сэнгера и Wellcome Trust . [5] Регев и Тейхманн возглавляют проект. [6]

Описание

Атлас клеток человека каталогизирует клетки на основе нескольких критериев, в частности, типа клеток , их состояния, их расположения в организме, переходов, которые они претерпевают, и их происхождения. [7] Он будет собирать данные из существующих исследований и интегрировать их с данными, собранными в будущих исследовательских проектах. [3] Среди данных, которые он будет собирать, есть флюксом , геном , метаболом , протеом и транскриптом . [3]

Его цель — классифицировать 37 триллионов клеток человеческого тела, чтобы определить, какие гены экспрессирует каждая клетка, путем отбора образцов клеток из всех частей тела. [8]

Все аспекты проекта будут «доступны для общественности бесплатно», включая программное обеспечение и результаты. [9]

К апрелю 2018 года в проекте участвовало более 480 исследователей, выполнявших 185 проектов. [10]

Финансирование

В октябре 2017 года Инициатива Чан-Цукерберга объявила о финансировании 38 проектов, связанных с Атласом клеток человека. [11] Среди них был грант, стоимость которого не разглашается, Институту Цукермана Медицинского центра Колумбийского университета в Колумбийском университете . [9] Грант под названием «Стратегия картирования спинного мозга человека с разрешением на уровне одной клетки» будет финансировать исследования по выявлению и каталогизации активности генов во всех клетках спинного мозга . [9] Научно-исследовательский институт трансляционной геномики получил грант на разработку стандарта для «обработки и хранения твердых тканей для секвенирования РНК отдельных клеток », по сравнению с типичной практикой, когда полагаются на среднее значение секвенирования нескольких клеток. [11] Домашние страницы проектов доступны на веб-сайте Инициативы Чан-Цукерберга. [12]

Программу также поддерживают Европейский Союз , Национальные институты здравоохранения США и Фонд Мэнтона. [8]

Данные

В апреле 2018 года был опубликован первый набор данных проекта, представляющий собой 530 000 клеток иммунной системы, собранных из костного мозга и пуповинной крови . [10]

Исследовательская программа Института иммунобиологии и эпигенетики Общества Макса Планка опубликовала атлас клеток печени , используя секвенирование РНК отдельных клеток на 10 000 нормальных клеток, полученных от девяти доноров. [13]

Данные Tabula Sapiens были опубликованы на специальном сайте. [14]

Смотрите также

Примечания

  1. ^ Регев и др. 2018.
  2. ^ Прейдт 2016.
  3. ^ abc Да, 2017.
  4. ^ Образец 2016 г.
  5. ^ Wellcome Trust Институт Сэнгера 2016.
  6. ^ Новогродский 2017.
  7. ↑ Регев, стр. 4.
  8. ^ ab Apple 2018.
  9. ^ abc Сильва 2017.
  10. ^ ab Дейли 2018.
  11. ^ ab AZ Big Media 2017.
  12. ^ из https://www.czbiohub.org/tabula-projects/
  13. ^ Айзарани и др. 2019.
  14. ^ Консорциум Tabula Sapiens 2022.

Ссылки

  • Айзарани, Надим; Савиано, Антонио; Сагар, Лоран Майи; Дюран, Сара; Герман, Йосип С.; Пессо, Патрик; Баумерт, Томас Ф.; Грюн, Доминик (10 июля 2019 г.). «Атлас клеток печени человека выявляет гетерогенность и эпителиальные предшественники». Nature . 572 (7768): 199–204. doi :10.1038/s41586-019-1373-2. PMC  6687507 . PMID  31292543.
  • Apple, Сэм (22 августа 2018 г.). «Картограф клеток». MIT Technology Review (опубликовано в сентябре 2018 г.).
  • Дейли, Джейсон (19 апреля 2018 г.). «Human Cell Atlas выпускает первый крупный набор данных». Smithsonian Magazine . Получено 26 декабря 2019 г. .
  • Фаривар, Сайрус (30 сентября 2017 г.). «Чтобы лучше понять, как работают все 37 триллионов человеческих клеток, нам нужны новые инструменты». Ars Technica . Получено 1 октября 2017 г.
  • Консорциум Tabula Sapiens; и др. (май 2022 г.). «Tabula Sapiens: многоорганный одноклеточный транскриптомный атлас людей». Science . 376 (6594): eabl4896. doi :10.1126/science.abl4896. PMC  9812260 . PMID  35549404. S2CID  248748505.
  • Новогродски, Анна (5 июля 2017 г.). «Как построить атлас клеток человека». Nature . 547 (7661): 24–26. Bibcode :2017Natur.547...24N. doi : 10.1038/547024a . PMID  28682347. S2CID  211067156.
  • Preidt, Robert (17 октября 2016 г.). «Ученые планируют картировать каждую клетку человеческого тела». CBS News . Получено 1 октября 2017 г. .
  • Регев, Авив. «Атлас человеческой клетки» (PDF) . Кафедра биологии, Массачусетский технологический институт. Архивировано из оригинала (PDF) 13 апреля 2021 г. . Получено 1 октября 2017 г. .
  • Регев, Авив и др. (Организационный комитет Атласа клеток человека) (2018). «Белая книга Атласа клеток человека». arXiv : 1810.05192 [q-bio.TO].
  • Sample, Ian (14 октября 2016 г.). «Проект Human Cell Atlas нацелен на картирование 35 триллионов клеток человеческого тела». The Guardian . Получено 1 октября 2017 г. .
  • Сильва, Катарина (20 октября 2017 г.). «Исследователи из Колумбии получают финансирование от основателя Facebook для создания атласа клеток спинного мозга». ALS News Today . Получено 20 октября 2017 г.
  • Да, Санг (26 июня 2017 г.). «Атлас клеток человека открывает новое окно в мир здоровья и болезней». Scientific American . Получено 1 октября 2017 г.
  • «TGen разрабатывает процедуры обработки для секвенирования «отдельных клеток». AZ Big Media. 19 октября 2017 г. Получено 20 октября 2017 г.
  • "International Human Cell Atlas Initiative" (пресс-релиз). Wellcome Trust Sanger Institute . 14 октября 2016 г. Получено 1 октября 2017 г.

Дальнейшее чтение

  • Розенблатт-Розен, О.; Стаббингтон, MJT; Регев, А.; Тайхманн, SA (18 октября 2017 г.). «Атлас клеток человека: от видения к реальности». Природа . 550 (7677): 451–453. Бибкод :2017Natur.550..451R. дои : 10.1038/550451a . PMID  29072289. S2CID  205095818.
  • Официальный сайт
  • Регев А., Тейхманн СА., Ландер ЭС., Амит И., Бенуа К., Бирни Э. и др. (Участники встречи по Атласу клеток человека) (8 мая 2017 г.). «Атлас клеток человека». bioRxiv  10.1101/121202 .
  • Ледфорд, Хайди (23 февраля 2017 г.). «Гонка за картографирование человеческого тела — по одной клетке за раз». Nature . 542 (7642): 404–405. Bibcode :2017Natur.542..404L. doi : 10.1038/nature.2017.21508 . PMID  28230136.
  • Cepelewicz, Jordana (12 июля 2017 г.). «Cell Atlases Reveal Biology's Frontiers». Журнал Quanta . Получено 1 октября 2017 г.
  • «Платформа данных Human Cell Atlas запускается при поддержке CZI» (пресс-релиз). Chan Zuckerberg Initiative . 1 июня 2017 г. Получено 4 октября 2017 г.
  • Регев, Авив (июнь 2017 г.). «Создание переписи человеческих клеток». Nautilus . Архивировано из оригинала 14 апреля 2021 г. . Получено 4 октября 2017 г. .
  • Йонг, Эд (14 октября 2016 г.). «Карты Google для человеческого тела». The Atlantic . Получено 4 октября 2017 г. .
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Атлас_клеток_человека&oldid=1248141460"