Программа «Атлас биомолекулярных структур человека»

3 ветви HuBMAP: разработка преобразующих технологий, центр картирования тканей и интеграция, визуализация и взаимодействие HuBMAP. [1]

Программа Human Biomolecular Atlas Program ( HuBMAP ) — это программа, финансируемая Национальным институтом здравоохранения США , для характеристики человеческого тела с разрешением на уровне отдельных клеток, интегрированная с другими проектами, такими как Human Cell Atlas . [1] Среди продуктов программы — референтные наборы данных Azimuth для данных секвенирования РНК отдельных клеток [2] [3] и ASCT+B Reporter, инструмент визуализации анатомических структур, типов клеток и биомаркеров . [4] [5]

Миллитомы используются для создания однородных по размеру блоков тканей, которые соответствуют форме и размеру органов из библиотеки 3D-референсных объектов HuBMAP. [6]

HuBMAP получил 27 миллионов долларов США финансирования от NIH в 2020 году и около 28,5 миллионов в 2021 году. [7]

Технологии и подходы, используемые консорциумом HuBMAP, включая секвенирование РНК отдельных клеток и пространственную транскриптомику . [1]

Ссылки

  1. ^ abc Snyder MP, Lin S, Posgai A, Atkinson M, Regev A, Rood J, et al. (Консорциум HuBMAP) (октябрь 2019 г.). «Человеческое тело на клеточном уровне разрешения: программа NIH Human Biomolecular Atlas». Nature . 574 (7777): 187– 192. Bibcode :2019Natur.574..187H. doi :10.1038/S41586-019-1629-X. PMC  6800388 . PMID  31597973.
  2. ^ Hao Y, Hao S, Andersen-Nissen E, Mauck WM, Zheng S, Butler A и др. (июнь 2021 г.). «Комплексный анализ мультимодальных данных по отдельным ячейкам». Cell . 184 (13): 3573–3587.e29. doi :10.1016/j.cell.2021.04.048. PMC 8238499 . PMID  34062119. 
  3. ^ "Азимут". azimuth.hubmapconsortium.org . Архивировано из оригинала 2022-07-06 . Получено 2022-07-11 .
  4. ^ "ASCT+B Reporter". ccf-asctb-reporter-v2.netlify.app . Архивировано из оригинала 22 октября 2021 г. Получено 2022-07-11 .
  5. ^ Боппана А., Ли С., Малхотра Р., Халушка М., Квардокус Э.М., Херр Б.В., Бёрнер К., Вебер Г.М. (2022-03-01). «Анатомические структуры, типы клеток и биомаркеры здоровой сосудистой системы человека». bioRxiv . doi :10.1101/2022.02.28.482302. S2CID  247231648.
  6. ^ Команда HIVE MC-IU. "HuBMAP: CCF Portal". hubmapconsortium.github.io . Получено 27.08.2022 .
  7. ^ "NIH Common Fund CONGRESSIONAL JUSTIFICATION FY 2022" (PDF) . Архивировано (PDF) из оригинала 2021-11-05 . Получено 2022-07-11 .
  • Официальный сайт
  • «Программа атласа биомолекулярных клеток человека». Природа . 2023-07-19.


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Программа_Биомолекулярного_Атласа_Человека&oldid=1271901077"