Ингибитор диссоциации гуанозиновых нуклеотидов
| ингибитор диссоциации GDP | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 структура дважды пренилированного комплекса ypt1:gdi | |||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | ГДИ | ||||||||||
| Пфам | ПФ00996 | ||||||||||
| Клан ПФАМ | CL0063 | ||||||||||
| ИнтерПро | ИПР018203 | ||||||||||
| СКОП2 | 1gnd / SCOPe / SUPFAM | ||||||||||
| |||||||||||
В молекулярной биологии ингибиторы диссоциации гуанозина ( GDI ) представляют собой семейство малых ГТФаз , которые выполняют регуляторную роль в везикулярном мембранном транспорте. GDI связываются с GDP-связанной формой малых ГТФаз Rho и Rab и не только предотвращают обмен (поддерживая малую ГТФазу в выключенном состоянии), но и не дают малой ГТФазе локализоваться на мембране, которая является местом их действия. Это ингибирование может быть устранено действием фактора смещения GDI. [1] GDI также ингибируют cdc42 , связываясь с его хвостом и предотвращая его вставку в мембраны; следовательно, он не может запустить WASP и не может привести к зарождению F- актина .
С-концевое геранилгеранирование GDI имеет решающее значение для их мембранной ассоциации и функционирования. [2] [3] Эта посттрансляционная модификация катализируется Rab-геранилгеранилтрансферазой (Rab-GGTase), многосубъединичным ферментом , который содержит каталитический гетеродимер и вспомогательный компонент, называемый Rab-эскорт-белком (REP)-1. [2] REP-1 представляет вновь синтезированные Rab- белки каталитическому компоненту и образует стабильный комплекс с пренилированными белками после реакции переноса. Механизм REP-1-опосредованной мембранной ассоциации Rab5 аналогичен механизму, опосредованному ингибитором диссоциации GDP Rab (GDI). REP-1 и Rab GDI также имеют другие общие функциональные свойства, включая способность ингибировать высвобождение GDP и удалять Rab-белки из мембран.
Кристаллическая структура бычьей альфа- изоформы Rab GDI была определена с разрешением 1,81 ангстрема . [4] Белок состоит из двух основных структурных единиц: большого сложного многослойного домена I и меньшего альфа-спирального домена II.
Структурная организация домена I тесно связана с монооксигеназами и оксидазами , содержащими FAD . [4] Консервативные регионы, общие для GDI и продукта гена choroideraemia , который доставляет Rab к каталитическим субъединицам Rab геранилгеранилтрансферазы II, сгруппированы на одной стороне домена. [3] Два наиболее консервативных региона образуют компактную структуру на вершине молекулы; направленный мутагенез показал, что эти регионы играют решающую роль в связывании белков Rab. [4]
Ссылки
- ^ Dirac-Svejstrup AB, Sumizawa T, Pfeffer SR (февраль 1997). «Идентификация фактора смещения GDI, который высвобождает эндосомальные Rab GTPases из Rab-GDI». The EMBO Journal . 16 (3): 465–72 . doi :10.1093/emboj/16.3.465. PMC 1169650. PMID 9034329 .
- ^ ab Alexandrov K, Horiuchi H, Steele-Mortimer O, Seabra MC, Zerial M (ноябрь 1994 г.). "Rab escort protein-1 — это многофункциональный белок, который сопровождает недавно пренилированные белки rab к их целевым мембранам". EMBO J . 13 (22): 5262– 73. doi :10.1002/j.1460-2075.1994.tb06860.x. PMC 395482 . PMID 7957092.
- ^ ab Nishimura N, Goji J, Nakamura H, Orita S, Takai Y, Sano K (ноябрь 1995 г.). «Клонирование изоформы человеческого Rab GDI мозгового типа и ее экспрессия в клеточных линиях нейробластомы человека и образцах опухолей». Cancer Res . 55 (22): 5445–50 . PMID 7585614.
- ^ abc Schalk I, Zeng K, Wu SK, Stura EA, Matteson J, Huang M, Tandon A, Wilson IA, Balch WE (май 1996). "Структура и мутационный анализ ингибитора диссоциации Rab GDP". Nature . 381 (6577): 42– 8. Bibcode :1996Natur.381...42S. doi :10.1038/381042a0. PMID 8609986. S2CID 4249512.
Внешние ссылки
- Гуанин+Нуклеотид+Диссоциация+Ингибиторы в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
