ГАЗ5

ГАЗ5
Идентификаторы
Псевдонимы	GAS5 , NCRNA00030, SNHG2, специфический для остановки роста 5 (не кодирующий белок)
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 608280; Генные карты : GAS5; OMA :GAS5 – ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 1 (человек)
Конец	173,868,882 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	левый яичник; ; тело поджелудочной железы; ; правый яичник; ; хрящевая ткань; ; правая маточная труба; ; канал шейки матки; ; кожа живота; ; ганглионарное возвышение; ; кожа руки; ; тело матки;
	н/д
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Ортологи
	60674
	н/д
	ENSG00000234741
	н/д
	н ; а
	н/д
	н/д
	н/д
	н/д
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека

Некодирующая РНК у вида Homo sapiens

Ген 5, специфичный для остановки роста, представляет собой некодирующую белок РНК , которая у людей кодируется геном GAS5 . [ ^3]^[4]

Некодирующая РНК GAS5 , которая накапливается в клетках с остановкой роста, действует как ложный элемент гормонального ответа для глюкокортикоидного рецептора (GR) и, следовательно, блокирует повышение регуляции экспрессии генов активированным GR. ^[5]^[6]

Ряд исследований связывают GAS5 с апоптозом , и он может играть роль в прогрессировании некоторых видов рака . ^[7]^[8]^[9]

Интроны GAS5 содержат несколько последовательностей snoRNA , включая SNORD81 , SNORD47 , SNORD80 , SNORD79 , SNORD78 , SNORD44 , SNORD77 , SNORD76 , SNORD75 и SNORD74 . ^[4]^[10]^[11]^[12] Эти интронные последовательности более консервативны, чем экзоны гена-хозяина, такие гены часто называют «генами наизнанку». ^[13]

Недавно было обнаружено, что путь деградации, опосредованный нонсенсом, может регулировать функцию GAS5 в клетках млекопитающих. ^[14]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000234741 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Ген Энтреза: специфичный для остановки роста 5 (не кодирующий белок)".
^ ab Smith CM, Steitz JA (декабрь 1998 г.). «Классификация gas5 как гена-хозяина с несколькими малыми ядрышковыми РНК (snoRNA) и члена семейства 5'-концевых олигопиримидиновых генов выявляет общие черты генов-хозяев snoRNA». Молекулярная и клеточная биология . 18 (12): 6897– 6909. doi :10.1128/mcb.18.12.6897. PMC 109273. PMID 9819378 .
^ Кино Т., Хёрт Д.Е., Ичиджо Т., Надер Н., Хроусос Г.П. (2010). «Некодирующая РНК Gas5 — это репрессор глюкокортикоидного рецептора, вызывающий остановку роста и связанный с голоданием». Sci Signal . 3 (107): ra8. doi :10.1126/scisignal.2000568. PMC 2819218. PMID 20124551 .
^ Гарабедян М.Дж., Логан СК (2010). «Приманка для связывания ДНК глюкокортикоидного рецептора — это газ». Sci Signal . 3 (108): pe5. doi :10.1126/scisignal.3108pe5. PMID 20145207. S2CID 21089519.
^ Mourtada-Maarabouni M, Pickard MR, Hedge VL, Farzaneh F, Williams GT (2009). «GAS5, некодирующая белок РНК, контролирует апоптоз и подавляется при раке груди». Oncogene . 28 (2): 195– 208. doi :10.1038/onc.2008.373. PMID 18836484. S2CID 9209496.
^ Nakamura Y, Takahashi N, Kakegawa E, Yoshida K, Ito Y, Kayano H, Niitsu N, Jinnai I, Bessho M (2008). "Ген GAS5 (транскрипт 5, специфичный для остановки роста) сливается с BCL6 в результате t(1;3)(q25;q27) у пациента с В-клеточной лимфомой". Cancer Genet Cytogenet . 182 (2): 144– 9. doi :10.1016/j.cancergencyto.2008.01.013. PMID 18406879.
^ Mourtada-Maarabouni M, Hedge VL, Kirkham L, Farzaneh F, Williams GT (2008). «Остановка роста в человеческих Т-клетках контролируется некодирующим РНК-специфическим транскриптом 5 (GAS5)». J Cell Sci . 121 (Pt 7): 939–46 . doi :10.1242/jcs.024646. PMID 18354083. S2CID 218512.
^ Tanaka R, Satoh H, Moriyama M, Satoh K, Morishita Y, Yoshida S, Watanabe T, Nakamura Y, Mori S (2000). "Интронный ген хозяина малой ядрышковой РНК (snoRNA) U50 без потенциала кодирования белка картирован в точке разрыва хромосомы t(3;6)(q27;q15) человеческой В-клеточной лимфомы". Genes Cells . 5 (4): 277– 87. doi : 10.1046/j.1365-2443.2000.00325.x . PMID 10792466.
^ Raho G, Barone V, Rossi D, Philipson L, Sorrentino V (2000). «Ген gas 5 демонстрирует четыре альтернативных паттерна сплайсинга без кодирования белка». Gene . 256 ( 1– 2): 13– 7. doi :10.1016/S0378-1119(00)00363-2. PMID 11054530.
^ Hirose T, Steitz JA (2001). «Положение внутри интрона хозяина имеет решающее значение для эффективной обработки snoRNA-боксов C/D в клетках млекопитающих». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (23): 12914– 9. Bibcode : 2001PNAS...9812914H. doi : 10.1073 /pnas.231490998 . PMC 60799. PMID 11606788.
^ Эдди SR (1999). «Некодирующие РНК-гены». Current Opinion in Genetics & Development . 9 (6): 695– 9. doi :10.1016/S0959-437X(99)00022-2. PMID 10607607.
^ Tani H, Torimura M, Akimitsu N (2013). «Путь деградации РНК регулирует функцию GAS5 a некодирующей РНК в клетках млекопитающих». PLOS ONE . 8 (1): e556884. Bibcode :2013PLoSO...855684T. doi : 10.1371/journal.pone.0055684 . PMC 3559549 . PMID 23383264.

Дальнейшее чтение

Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2002). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 1 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000234741 – Ensembl , май 2017 г.

[2] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-3] "Ген Энтреза: специфичный для остановки роста 5 (не кодирующий белок)".

[pmid9819378-4] Smith CM, Steitz JA (декабрь 1998 г.). «Классификация gas5 как гена-хозяина с несколькими малыми ядрышковыми РНК (snoRNA) и члена семейства 5'-концевых олигопиримидиновых генов выявляет общие черты генов-хозяев snoRNA». Молекулярная и клеточная биология . 18 (12): 6897– 6909. doi :10.1128/mcb.18.12.6897. PMC 109273. PMID 9819378 .

[pmid20124551-5] Кино Т., Хёрт Д.Е., Ичиджо Т., Надер Н., Хроусос Г.П. (2010). «Некодирующая РНК Gas5 — это репрессор глюкокортикоидного рецептора, вызывающий остановку роста и связанный с голоданием». Sci Signal . 3 (107): ra8. doi :10.1126/scisignal.2000568. PMC 2819218. PMID 20124551 .

[pmid20145207-6] Гарабедян М.Дж., Логан СК (2010). «Приманка для связывания ДНК глюкокортикоидного рецептора — это газ». Sci Signal . 3 (108): pe5. doi :10.1126/scisignal.3108pe5. PMID 20145207. S2CID 21089519.

[pmid18836484-7] Mourtada-Maarabouni M, Pickard MR, Hedge VL, Farzaneh F, Williams GT (2009). «GAS5, некодирующая белок РНК, контролирует апоптоз и подавляется при раке груди». Oncogene . 28 (2): 195– 208. doi :10.1038/onc.2008.373. PMID 18836484. S2CID 9209496.

[pmid18406879-8] Nakamura Y, Takahashi N, Kakegawa E, Yoshida K, Ito Y, Kayano H, Niitsu N, Jinnai I, Bessho M (2008). "Ген GAS5 (транскрипт 5, специфичный для остановки роста) сливается с BCL6 в результате t(1;3)(q25;q27) у пациента с В-клеточной лимфомой". Cancer Genet Cytogenet . 182 (2): 144– 9. doi :10.1016/j.cancergencyto.2008.01.013. PMID 18406879.

[pmid18354083-9] Mourtada-Maarabouni M, Hedge VL, Kirkham L, Farzaneh F, Williams GT (2008). «Остановка роста в человеческих Т-клетках контролируется некодирующим РНК-специфическим транскриптом 5 (GAS5)». J Cell Sci . 121 (Pt 7): 939–46 . doi :10.1242/jcs.024646. PMID 18354083. S2CID 218512.

[pmid10792466-10] Tanaka R, Satoh H, Moriyama M, Satoh K, Morishita Y, Yoshida S, Watanabe T, Nakamura Y, Mori S (2000). "Интронный ген хозяина малой ядрышковой РНК (snoRNA) U50 без потенциала кодирования белка картирован в точке разрыва хромосомы t(3;6)(q27;q15) человеческой В-клеточной лимфомы". Genes Cells . 5 (4): 277– 87. doi : 10.1046/j.1365-2443.2000.00325.x . PMID 10792466.

[pmid11054530-11] Raho G, Barone V, Rossi D, Philipson L, Sorrentino V (2000). «Ген gas 5 демонстрирует четыре альтернативных паттерна сплайсинга без кодирования белка». Gene . 256 ( 1– 2): 13– 7. doi :10.1016/S0378-1119(00)00363-2. PMID 11054530.

[pmid11606788-12] Hirose T, Steitz JA (2001). «Положение внутри интрона хозяина имеет решающее значение для эффективной обработки snoRNA-боксов C/D в клетках млекопитающих». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (23): 12914– 9. Bibcode : 2001PNAS...9812914H. doi : 10.1073 /pnas.231490998 . PMC 60799. PMID 11606788.

[pmid10607607-13] Эдди SR (1999). «Некодирующие РНК-гены». Current Opinion in Genetics & Development . 9 (6): 695– 9. doi :10.1016/S0959-437X(99)00022-2. PMID 10607607.

[pmid23383264-14] Tani H, Torimura M, Akimitsu N (2013). «Путь деградации РНК регулирует функцию GAS5 a некодирующей РНК в клетках млекопитающих». PLOS ONE . 8 (1): e556884. Bibcode :2013PLoSO...855684T. doi : 10.1371/journal.pone.0055684 . PMC 3559549 . PMID 23383264.