Малая ядрышковая РНК SNORD47

Малая ядрышковая РНК SNORD47
Малая ядрышковая РНК SNORD47
	Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD47
Идентификаторы
Символ	СНОРД47
Альтернативные символы	У47
Рфам	РФ00281
Другие данные
Тип РНК	Ген ; мяРНК ; мРНК ; C/D-box
Домены	Эукариоты
ИДТИ	GO:0006396 GO:0005730
ТАК	SO:0000593
Структуры PDB	ПДБе

РНК-семейство

В молекулярной биологии SNORD47 ( также известный как U47 ) представляет собой некодирующую молекулу РНК (нкРНК), которая функционирует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мяРНК) и также часто называется направляющей РНК.

snoRNA U57 принадлежит к классу snoRNA C/D box , которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C box (UGAUGA) и D box (CUGA). Большинство членов семейства box C/D выполняют функцию управления сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. ^[1]

Эта snoRNA была первоначально клонирована из клеток HeLa , а экспрессия подтверждена с помощью нозерн-блоттинга . ^[2] Предсказано, что она будет направлять метилирование 2'O-рибозы рибосомальной РНК (рРНК) 28S в остатке C3866. Мышиный ортолог также был клонирован ^[3]

Эта snoRNA кодируется в интронах тех же генов, что и другие snoRNA C/D-box U44, U74, U75, U76, U77, U78, U79, U80 и U81. ^[4]

Ссылки

^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные snoRNP C/D box способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Molecular and Cellular Biology . 22 (19): 6663– 8. doi :10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041 . PMID 12215523.
^ Kiss-László Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (июнь 1996 г.). "Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция для малых ядрышковых РНК". Cell . 85 (7): 1077– 88. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81308-2 . PMID 8674114. S2CID 10418885.
^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (июнь 2001 г.). «RNomics: an experimental approach that identifys 201 candidate for novel, small, non-messenger RNAs in mouse». The EMBO Journal . 20 (11): 2943– 53. doi :10.1093/emboj/20.11.2943. PMC 125495. PMID 11387227 .
^ Lestrade L, Weber MJ (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H/ACA и C/D snoRNAs". Nucleic Acids Research . 34 (выпуск базы данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . doi :10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836 .

Внешние ссылки

Страница для малой ядрышковой РНК SNORD47 в Rfam
Запись для SNORD47 на snoRNABase

Эта статья по молекулярной или клеточной биологии — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[1] Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные snoRNP C/D box способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Molecular and Cellular Biology . 22 (19): 6663– 8. doi :10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041 . PMID 12215523.

[pmid8674114-2] Kiss-László Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (июнь 1996 г.). "Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция для малых ядрышковых РНК". Cell . 85 (7): 1077– 88. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81308-2 . PMID 8674114. S2CID 10418885.

[pmid11387227-3] Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (июнь 2001 г.). «RNomics: an experimental approach that identifys 201 candidate for novel, small, non-messenger RNAs in mouse». The EMBO Journal . 20 (11): 2943– 53. doi :10.1093/emboj/20.11.2943. PMC 125495. PMID 11387227 .

[pmid16381836-4] Lestrade L, Weber MJ (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H/ACA и C/D snoRNAs". Nucleic Acids Research . 34 (выпуск базы данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . doi :10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836 .