Малая ядрышковая РНК SNORD79

Малая ядрышковая РНК SNORD79
Малая ядрышковая РНК SNORD79
	Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD79
Идентификаторы
Символ	СНОРД79
Альтернативные символы	У79
Рфам	РФ00152
Другие данные
Тип РНК	Ген ; мяРНК ; мРНК ; C/D-box
Домены	Эукариоты
ИДТИ	GO:0006396 GO:0005730
ТАК	SO:0000593
Структуры PDB	ПДБе

Молекула РНК

РНК-семейство

В молекулярной биологии snoRNA U79 (также известная как SNORD79 или Z22 ) представляет собой некодирующую молекулу РНК (ncRNA), которая функционирует в модификации других малых ядерных РНК (snRNA). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза snRNA. Она известна как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто называется направляющей РНК.

U79 принадлежит к классу C/D-боксов snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства C/D-боксов функционируют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. ^[1]

snoRNA U79 обнаружена в интроне 7 гена GAS5 у людей, а также присутствует у мышей. ^[2] Предполагается, что U79 управляет метилированием 2'O-рибозы остатка 28S рибосомальной РНК (рРНК) A3809. ^[3]

Ссылки

^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные snoRNP C/D box способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Molecular and Cellular Biology . 22 (19): 6663– 8. doi :10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041 . PMID 12215523.
^ Smith CM, Steitz JA (декабрь 1998 г.). «Классификация gas5 как гена-хозяина с несколькими малыми ядрышковыми РНК (snoRNA) и члена семейства 5'-концевых олигопиримидиновых генов выявляет общие черты генов-хозяев snoRNA». Молекулярная и клеточная биология . 18 (12): 6897– 909. doi :10.1128/mcb.18.12.6897. PMC 109273. PMID 9819378 .
^ Lestrade L, Weber MJ (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H/ACA и C/D snoRNAs". Nucleic Acids Research . 34 (выпуск базы данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . doi :10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836 .

Внешние ссылки

Страница для малой ядрышковой РНК SNORD79 в Rfam
Запись для SNORD79 на snoRNABase

Эта статья по молекулярной или клеточной биологии — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[1] Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные snoRNP C/D box способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Molecular and Cellular Biology . 22 (19): 6663– 8. doi :10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041 . PMID 12215523.

[pmid9819378-2] Smith CM, Steitz JA (декабрь 1998 г.). «Классификация gas5 как гена-хозяина с несколькими малыми ядрышковыми РНК (snoRNA) и члена семейства 5'-концевых олигопиримидиновых генов выявляет общие черты генов-хозяев snoRNA». Молекулярная и клеточная биология . 18 (12): 6897– 909. doi :10.1128/mcb.18.12.6897. PMC 109273. PMID 9819378 .

[pmid16381836-3] Lestrade L, Weber MJ (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H/ACA и C/D snoRNAs". Nucleic Acids Research . 34 (выпуск базы данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . doi :10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836 .