Член 2 семейства AF4/FMR2 — это белок , который у людей кодируется геном AFF2 . [ 5] Мутации в AFF2 связаны со случаями рака молочной железы . [6]
Экспансии повторов CCG в этом гене связаны с Х-сцепленной интеллектуальной недостаточностью и, в частности, с синдромом, известным как умственная отсталость Fragile XE (FRAXE). FRAXE является одной из наиболее распространенных форм несиндромной Х-сцепленной интеллектуальной недостаточности. Ген также известен как FMR2 (Fragile Mental Retardation 2) в честь этого состояния. [7]
Геномика
Этот ген расположен на длинном плече хромосомы X (Xq27.3-Xq28). Он имеет 22 экзона, охватывающих не менее 500 кб. Может происходить альтернативный сплайсинг, включающий экзоны 2, 3, 5, 7 и 21. Нормальный кодируемый белок имеет длину 1311 кодонов . Он экспрессируется как транскрипт длиной 8,7 кб в плаценте и мозге взрослого человека . [ необходима цитата ]
Нормальная 5' нетранслируемая область имеет 10-35 повторов CCG и чаще 15-20. Патогенные расширения обычно имеют более 200 повторов и метилированы. [ необходима цитата ]
Этот ген принадлежит к семейству генов AFF, которое в настоящее время насчитывает четыре члена: AFF1 /AF4, AFF2/FMR2, AFF3 /LAF4 и AFF4/AF5q31. [8] Все белки AFF локализованы в ядре и играют роль транскрипционных активаторов с положительным действием на удлинение РНК. AFF2/FMR2, AFF3/LAF4 и AFF4/AF5q31 локализуются в ядерных спеклах (субъядерных структурах, которые считаются участками хранения/модификации факторов сплайсинга пре-мРНК) и способны связывать РНК с высоким очевидным сродством к структуре G-квадруплекса. Они, по-видимому, модулируют альтернативный сплайсинг посредством взаимодействия с G-квадруплексной структурой, образующей РНК.
Сообщалось, что другие члены этого семейства образуют гены слияния в результате транслокаций хромосом и участвуют в патогенезе миелоидного/лимфоидного лейкоза или лейкоза смешанного типа .
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000155966 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000031189 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Ген Энтреза: семейство AFF2 AF4/FMR2, член 2".
^ Сеть атласа генома рака (октябрь 2012 г.). «Комплексные молекулярные портреты опухолей молочной железы человека». Nature . 490 (7418): 61– 70. Bibcode :2012Natur.490...61T. doi :10.1038/nature11412. PMC 3465532 . PMID 23000897.
^ Stettner GM, Shoukier M, Höger C, Brockmann K, Auber B (август 2011 г.). «Семейная интеллектуальная инвалидность и аутистическое поведение, вызванные небольшой делецией гена FMR2». Американский журнал медицинской генетики. Часть A. 155A ( 8): 2003–7 . doi :10.1002/ajmg.a.34122. PMID 21739600. S2CID 9568277.
^ Мелько М, Дуге Д, Бенсаид М, Зонгаро С, Верхегген С, Геч Дж, Бардони Б (май 2011 г.). «Функциональная характеристика семейства РНК-связывающих белков AFF (AF4/FMR2): понимание молекулярной патологии умственной отсталости FRAXE». Молекулярная генетика человека . 20 (10): 1873–85 . doi : 10.1093/hmg/ddr069 . ПМИД 21330300.
Дальнейшее чтение
Малли Дж.К., Ю.С., Леш Д.З., Хэй Д.А., Доннелли А., Гедеон А.К., Карбонелл П., Лопес И., Гловер Г., Габаррон I (март 1995 г.). «FRAXE и умственная отсталость». Журнал медицинской генетики . 32 (3): 162–9 . doi :10.1136/jmg.32.3.162. ПМК 1050310 . ПМИД 7783162.
Gecz J, Gedeon AK, Sutherland GR , Mulley JC (май 1996 г.). «Идентификация гена FMR2, связанного с умственной отсталостью FRAXE». Nature Genetics . 13 (1): 105– 8. doi :10.1038/ng0596-105. PMID 8673085. S2CID 40161014.
Gu Y, Shen Y, Gibbs RA, Nelson DL (май 1996 г.). «Идентификация FMR2, нового гена, связанного с повтором FRAXE CCG и островом CpG». Nature Genetics . 13 (1): 109– 13. doi :10.1038/ng0596-109. PMID 8673086. S2CID 6781698.
Chakrabarti L, Knight SJ, Flannery AV, Davies KE (февраль 1996 г.). «Ген-кандидат на легкую умственную отсталость на хрупком участке FRAXE». Human Molecular Genetics . 5 (2): 275– 82. doi : 10.1093/hmg/5.2.275 . PMID 8824884.
Gécz J, Oostra BA, Hockey A, Carbonell P, Turner G, Haan EA, Sutherland GR , Mulley JC (март 1997 г.). "Экспрессия FMR2 в семьях с умственной отсталостью FRAXE". Human Molecular Genetics . 6 (3): 435– 41. doi : 10.1093/hmg/6.3.435 . PMID 9147647.
Gecz J, Bielby S, Sutherland GR , Mulley JC (сентябрь 1997 г.). «Структура гена и субклеточная локализация FMR2, члена нового семейства предполагаемых активаторов транскрипции». Genomics . 44 (2): 201– 13. doi :10.1006/geno.1997.4867. PMID 9299237.
Chakrabarti L, Bristulf J, Foss GS, Davies KE (март 1998). «Экспрессия мышиного гомолога FMR2 в мозге мыши и во время развития». Human Molecular Genetics . 7 (3): 441– 8. doi : 10.1093/hmg/7.3.441 . PMID 9467002.
Gecz J, Mulley JC (1999). "Характеристика и экспрессия большой изоформы FMR2 размером 13,7 кб". European Journal of Human Genetics . 7 (2): 157– 62. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200279 . PMID 10196698.
Murray A, Webb J, Dennis N, Conway G, Morton N (октябрь 1999 г.). «Микроделеции в FMR2 могут быть значимой причиной преждевременной недостаточности яичников». Журнал медицинской генетики . 36 (10): 767– 70. doi :10.1136/jmg.36.10.767. PMC 1734234. PMID 10528856 .
Диас Нето Э, Корреа Р.Г., Вержовски-Алмейда С., Брионес М.Р., Нагаи М.А., да Силва В., Заго М.А., Бордин С., Коста ФФ, Голдман Г.Х., Карвалью А.Ф., Мацукума А., Бая Г.С., Симпсон Д.Х., Брунштейн А., де Оливейра П.С., Бушер П., Джонджинил К.В., О'Хара М.Дж., Соареш Ф., Брентани Р.Р., Рейс Л.Ф., де Соуза С.Дж., Симпсон А.Дж. (март 2000 г.). «Секвенирование транскриптома человека с помощью меток последовательности, экспрессируемых ORF». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (7): 3491– 6. Бибкод : 2000PNAS...97.3491D. doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267. PMID 10737800 .
Lo Nigro C, Faravelli F, Cavani S, Perroni L, Novello P, Vitali M, Bricarelli FD, Grasso M (март 2000 г.). «Мутация FRAXE у умственно отсталого субъекта и у его фенотипически нормального брата-близнеца». European Journal of Human Genetics . 8 (3): 157– 62. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200425 . PMID 10780779.
Tzeng CC, Tzeng PY, Sun HS, Chen RM, Lin SJ (июнь 2000 г.). «Значение скрининга мутаций генов FMR1 и FMR2 у лиц с неспецифической умственной отсталостью в Тайване». Diagnostic Molecular Pathology . 9 (2): 75– 80. doi :10.1097/00019606-200006000-00002. PMID 10850542.
Мусумечи С.А., Скудери К., Ферри Р., Анелло Дж., Саллуццо Р., Боско П., Элия М. (сентябрь 2000 г.). «Существует ли особая картина ЭЭГ при умственной отсталости FRAXE?». Клиническая нейрофизиология . 111 (9): 1632–6 . doi :10.1016/S1388-2457(00)00367-9. PMID 10964075. S2CID 42912350.
Hillman MA, Gecz J (2001). «Связанный с хрупкой XE семейный белок умственной отсталости 2 (FMR2) действует как мощный активатор транскрипции». Журнал генетики человека . 46 (5): 251– 9. doi : 10.1007/s100380170074 . PMID 11355014.
Kitano T, Schwarz C, Nickel B, Pääbo S (август 2003 г.). «Паттерны разнообразия генов в 10 локусах X-хромосомы у людей и шимпанзе». Молекулярная биология и эволюция . 20 (8): 1281– 9. doi : 10.1093/molbev/msg134 . PMID 12777533.
Brylawski BP, Chastain PD, Cohen SM, Cordeiro-Stone M, Kaufman DG (апрель 2007 г.). «Картирование начала репликации ДНК в промоторе гена хрупкой X FMR1». Experimental and Molecular Pathology . 82 (2): 190– 6. doi :10.1016/j.yexmp.2006.10.004. PMC 1934615 . PMID 17196195.
Внешние ссылки
Расположение генома человека AFF2 и страница с подробностями гена AFF2 в браузере геномов UCSC .
Эта статья о гене на человеческой Х-хромосоме и/или связанном с ним белке является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.
