Экзорибонуклеаза — это экзонуклеаза рибонуклеаза , которая представляет собой ферменты, которые расщепляют РНК , удаляя терминальные нуклеотиды либо с 5'-конца , либо с 3'-конца молекулы РНК. Ферменты, которые удаляют нуклеотиды с 5'-конца, называются 5' -3'-экзорибонуклеазами , а ферменты, которые удаляют нуклеотиды с 3'-конца, называются 3'-5'-экзорибонуклеазами .
Экзорибонуклеазы могут использовать либо воду для расщепления связи нуклеотид-нуклеотид (что называется гидролитической активностью), либо неорганический фосфат (что называется фосфоролитической активностью). Гидролитические экзорибонуклеазы классифицируются под номером EC 3.1, а фосфоролитические экзорибонуклеазы под номером EC 2.7.7. Поскольку фосфоролитические ферменты используют неорганический фосфат для расщепления связей, они высвобождают нуклеотиддифосфаты , тогда как гидролитические ферменты (которые используют воду) высвобождают нуклеотидмонофосфаты .
Экзорибонуклеазы существуют во всех царствах жизни, бактериях , археях и эукариотах . Экзорибонуклеазы участвуют в деградации многих различных видов РНК, включая информационную РНК , транспортную РНК , рибосомальную РНК и микроРНК . Экзорибонуклеазы могут быть отдельными белками (например, РНКаза D или РНКаза PH ), но также могут быть комплексами из нескольких белков, например, комплексом экзосом (в котором представлены четыре основных семейства экзорибонуклеаз).
Семья | Примеры членов | Распределение | Каталитическая активность |
---|---|---|---|
РНР | РНКаза R | Большинство бактерий, все эукариоты | 3'-5' гидролитический |
РНКаза II | |||
Ррп44 | |||
ДЕДД | РНКаза D | Некоторые бактерии, все эукариоты | 3'-5' гидролитический |
РНКаза Т | |||
ПМ/Скл-100 | |||
Олигорибонуклеаза | |||
РБН | РНКаза BN | Определенные бактерии | 3'-5' гидролитический |
ПДКС | ПНФаза | Все королевства | 3'-5' фосфоролитический |
ПМ/Скл-75 | |||
РНКаза PH | |||
РРЦ4 | Ррп4 | Все эукариоты, большинство архей | 3'-5' гидролитический |
5PX | Экзорибонуклеаза I | Все эукариоты | 5'-3' гидролитический |
Экзорибонуклеаза II |