Экзорибонуклеаза

Класс ферментов, расщепляющих РНК
Диаграммы реакций гидролитической (слева) и фосфоролитической (справа) 3'-5' экзорибонуклеазной деградации РНК.

Экзорибонуклеаза — это экзонуклеаза рибонуклеаза , которая представляет собой ферменты, которые расщепляют РНК , удаляя терминальные нуклеотиды либо с 5'-конца , либо с 3'-конца молекулы РНК. Ферменты, которые удаляют нуклеотиды с 5'-конца, называются 5' -3'-экзорибонуклеазами , а ферменты, которые удаляют нуклеотиды с 3'-конца, называются 3'-5'-экзорибонуклеазами .

Экзорибонуклеазы могут использовать либо воду для расщепления связи нуклеотид-нуклеотид (что называется гидролитической активностью), либо неорганический фосфат (что называется фосфоролитической активностью). Гидролитические экзорибонуклеазы классифицируются под номером EC 3.1, а фосфоролитические экзорибонуклеазы под номером EC 2.7.7. Поскольку фосфоролитические ферменты используют неорганический фосфат для расщепления связей, они высвобождают нуклеотиддифосфаты , тогда как гидролитические ферменты (которые используют воду) высвобождают нуклеотидмонофосфаты .

Экзорибонуклеазы существуют во всех царствах жизни, бактериях , археях и эукариотах . Экзорибонуклеазы участвуют в деградации многих различных видов РНК, включая информационную РНК , транспортную РНК , рибосомальную РНК и микроРНК . Экзорибонуклеазы могут быть отдельными белками (например, РНКаза D или РНКаза PH ), но также могут быть комплексами из нескольких белков, например, комплексом экзосом (в котором представлены четыре основных семейства экзорибонуклеаз).

Основные семьи

СемьяПримеры членовРаспределениеКаталитическая активность
РНРРНКаза RБольшинство бактерий, все эукариоты3'-5' гидролитический
РНКаза II
Ррп44
ДЕДДРНКаза DНекоторые бактерии, все эукариоты3'-5' гидролитический
РНКаза Т
ПМ/Скл-100
Олигорибонуклеаза
РБНРНКаза BNОпределенные бактерии3'-5' гидролитический
ПДКСПНФазаВсе королевства3'-5' фосфоролитический
ПМ/Скл-75
РНКаза PH
РРЦ4Ррп4Все эукариоты, большинство архей3'-5' гидролитический
5PXЭкзорибонуклеаза IВсе эукариоты5'-3' гидролитический
Экзорибонуклеаза II

Смотрите также

Ссылки

  • Zuo Y; Deutscher MP. (2001). «Суперсемейства экзорибонуклеаз: структурный анализ и филогенетическое распределение». Nucleic Acids Res . 29 (5): 1017–26. doi :10.1093/nar/29.5.1017. PMC  56904. PMID  11222749.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Экзорибонуклеаза&oldid=1059191808"